RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547715.1

PTPRB-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRB, Length 639 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-205ENST00000547715 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa9.15□□□□□ -0.94
PTPRB-205ENST00000547715 A0A0J9YXV3 536 aa9.15□□□□□ -0.94
PTPRB-205ENST00000547715 M0R381 172 aa9.15□□□□□ -0.94
PTPRB-205ENST00000547715 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa9.15□□□□□ -0.94
PTPRB-205ENST00000547715 COX8CQ7Z4L0 72 aa9.15□□□□□ -0.94
PTPRB-205ENST00000547715 SPACA4Q8TDM5 124 aa9.15□□□□□ -0.94
PTPRB-205ENST00000547715 PRELID3AQ96N28 172 aa9.15□□□□□ -0.94
PTPRB-205ENST00000547715 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa9.15□□□□□ -0.94
PTPRB-205ENST00000547715 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRB-205ENST00000547715 LINC01549A6NIU2 74 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRB-205ENST00000547715 DPM2O94777 84 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRB-205ENST00000547715 FAM104BQ5XKR9 115 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRB-205ENST00000547715 LINC00269Q8N2A0 174 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRB-205ENST00000547715 PPDPFLQ8WWR9 84 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRB-205ENST00000547715 RAB37Q96AX2 223 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRB-205ENST00000547715 PRR34Q9NV39 138 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRB-205ENST00000547715 LPAP08519 4548 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRB-205ENST00000547715 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa9.13□□□□□ -0.95
PTPRB-205ENST00000547715 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
PTPRB-205ENST00000547715 APOMO95445 188 aa9.13□□□□□ -0.95
PTPRB-205ENST00000547715 PLNP26678 52 aa9.13□□□□□ -0.95
PTPRB-205ENST00000547715 FCER1GP30273 86 aa9.13□□□□□ -0.95
PTPRB-205ENST00000547715 KRTAP10-8P60410 259 aa9.13□□□□□ -0.95
PTPRB-205ENST00000547715 CACNG7P62955 275 aa9.13□□□□□ -0.95
PTPRB-205ENST00000547715 MAP1LC3AQ9H492 121 aa9.13□□□□□ -0.95
PTPRB-205ENST00000547715 PLAC8Q9NZF1 115 aa9.13□□□□□ -0.95
PTPRB-205ENST00000547715 IGKCP01834 107 aa9.12□□□□□ -0.95
PTPRB-205ENST00000547715 SPINK8P0C7L1 97 aa9.12□□□□□ -0.95
PTPRB-205ENST00000547715 NMUP48645 174 aa9.12□□□□□ -0.95
PTPRB-205ENST00000547715 FOXI1Q12951 378 aa9.12□□□□□ -0.95
PTPRB-205ENST00000547715 Q6Q795 121 aa9.12□□□□□ -0.95
PTPRB-205ENST00000547715 K7EMI3 77 aa9.11□□□□□ -0.95
PTPRB-205ENST00000547715 PRR3P79522 188 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
PTPRB-205ENST00000547715 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa9.11□□□□□ -0.95
PTPRB-205ENST00000547715 SLPIP03973 132 aa9.1□□□□□ -0.95
PTPRB-205ENST00000547715 ZNF56Q15929 161 aa9.1□□□□□ -0.95
PTPRB-205ENST00000547715 REG3GQ6UW15 175 aa9.1□□□□□ -0.95
PTPRB-205ENST00000547715 PRO0461Q9UI25 63 aa9.1□□□□□ -0.95
PTPRB-205ENST00000547715 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRB-205ENST00000547715 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRB-205ENST00000547715 CRIP1P50238 77 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRB-205ENST00000547715 REG3AQ06141 175 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRB-205ENST00000547715 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRB-205ENST00000547715 ANAPC13Q9BS18 74 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRB-205ENST00000547715 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRB-205ENST00000547715 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
PTPRB-205ENST00000547715 MUC2Q02817 5179 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRB-205ENST00000547715 A0A096LNJ9 63 aa9.08□□□□□ -0.96
PTPRB-205ENST00000547715 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa9.08□□□□□ -0.96
PTPRB-205ENST00000547715 NCR2O95944 276 aa9.08□□□□□ -0.96
PTPRB-205ENST00000547715 CKS2P33552 79 aa9.08□□□□□ -0.96
PTPRB-205ENST00000547715 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP9.08□□□□□ -0.96
PTPRB-205ENST00000547715 FXYD2P54710 66 aa9.08□□□□□ -0.96
PTPRB-205ENST00000547715 COX6A2Q02221 97 aa9.08□□□□□ -0.96
PTPRB-205ENST00000547715 ETDBQ3ZM63 59 aa9.08□□□□□ -0.96
PTPRB-205ENST00000547715 SH2D1AO60880 128 aa9.07□□□□□ -0.96
PTPRB-205ENST00000547715 SPINK6Q6UWN8 80 aa9.07□□□□□ -0.96
PTPRB-205ENST00000547715 Q6ZUT4 128 aa9.07□□□□□ -0.96
PTPRB-205ENST00000547715 TEN1Q86WV5 123 aa9.07□□□□□ -0.96
PTPRB-205ENST00000547715 CNFNQ9BYD5 112 aa9.07□□□□□ -0.96
PTPRB-205ENST00000547715 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa9.06□□□□□ -0.96
PTPRB-205ENST00000547715 D6R8Y8 96 aa9.06□□□□□ -0.96
PTPRB-205ENST00000547715 SNAI2O43623 268 aa9.06□□□□□ -0.96
PTPRB-205ENST00000547715 HIST1H4GQ99525 98 aa9.06□□□□□ -0.96
PTPRB-205ENST00000547715 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa9.05□□□□□ -0.96
PTPRB-205ENST00000547715 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa9.05□□□□□ -0.96
PTPRB-205ENST00000547715 PCP2Q8IVA1 136 aa9.05□□□□□ -0.96
PTPRB-205ENST00000547715 Q8N8P6 123 aa9.05□□□□□ -0.96
PTPRB-205ENST00000547715 F5H697 171 aa9.04□□□□□ -0.96
PTPRB-205ENST00000547715 AMN1Q8IY45 258 aa9.04□□□□□ -0.96
PTPRB-205ENST00000547715 TMEM126AQ9H061 195 aa9.04□□□□□ -0.96
PTPRB-205ENST00000547715 CDIP1Q9H305 208 aa9.04□□□□□ -0.96
PTPRB-205ENST00000547715 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
PTPRB-205ENST00000547715 TP73-AS1Q9UF72 201 aa9.03□□□□□ -0.96
PTPRB-205ENST00000547715 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa9.02□□□□□ -0.97
PTPRB-205ENST00000547715 H7C1H1 209 aa9.02□□□□□ -0.97
PTPRB-205ENST00000547715 C20orf203Q8NBC4 194 aa9.02□□□□□ -0.97
PTPRB-205ENST00000547715 PPP1R17O96001 155 aa9.01□□□□□ -0.97
PTPRB-205ENST00000547715 GAGE2BQ13066 116 aa9.01□□□□□ -0.97
PTPRB-205ENST00000547715 GAGE2EQ4V326 116 aa9.01□□□□□ -0.97
PTPRB-205ENST00000547715 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa9.01□□□□□ -0.97
PTPRB-205ENST00000547715 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
PTPRB-205ENST00000547715 GAGE2DQ9UEU5 116 aa9.01□□□□□ -0.97
PTPRB-205ENST00000547715 NPYP01303 97 aa9□□□□□ -0.97
PTPRB-205ENST00000547715 SCGB1C2P0DMR2 95 aa9□□□□□ -0.97
PTPRB-205ENST00000547715 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP9□□□□□ -0.97
PTPRB-205ENST00000547715 LYZL1Q6UWQ5 148 aa9□□□□□ -0.97
PTPRB-205ENST00000547715 C15orf56Q8N910 161 aa9□□□□□ -0.97
PTPRB-205ENST00000547715 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa8.99□□□□□ -0.97
PTPRB-205ENST00000547715 F8VRH5 84 aa8.99□□□□□ -0.97
PTPRB-205ENST00000547715 SNCGO76070 127 aa8.99□□□□□ -0.97
PTPRB-205ENST00000547715 HIGD2BQ4VC39 106 aa8.99□□□□□ -0.97
PTPRB-205ENST00000547715 ORMDL2Q53FV1 153 aa8.99□□□□□ -0.97
PTPRB-205ENST00000547715 A0A096LNI7 61 aa8.98□□□□□ -0.97
PTPRB-205ENST00000547715 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa8.98□□□□□ -0.97
PTPRB-205ENST00000547715 A0A1B0GUV1 79 aa8.98□□□□□ -0.97
PTPRB-205ENST00000547715 IGLC6P0CF74 106 aa8.98□□□□□ -0.97
PTPRB-205ENST00000547715 UBE2D1P51668 147 aa8.98□□□□□ -0.97
PTPRB-205ENST00000547715 HERVK_113P61574 105 aa8.98□□□□□ -0.97
PTPRB-205ENST00000547715 Q6ZRP5 223 aa8.98□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.4 ms