RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545204.1

MDM2-233, Transcript of MDM2 proto-oncogene, human

TSL 5 BASIC

Gene MDM2, Length 398 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MDM2-233	ENST00000545204	DEFB130A	P0DP74	79 aa		-0.86	□□□□□ -2.55
MDM2-233	ENST00000545204	S100A3	P33764	101 aa		-0.86	□□□□□ -2.55
MDM2-233	ENST00000545204	BTG2	P78543	158 aa		-0.86	□□□□□ -2.55
MDM2-233	ENST00000545204		Q6JHZ5	121 aa		-0.86	□□□□□ -2.55
MDM2-233	ENST00000545204	SLC48A1	Q6P1K1	146 aa		-0.86	□□□□□ -2.55
MDM2-233	ENST00000545204	C5orf38	Q86SI9	138 aa		-0.86	□□□□□ -2.55
MDM2-233	ENST00000545204	STX12	Q86Y82	276 aa		-0.86	□□□□□ -2.55
MDM2-233	ENST00000545204	TTC9C	Q8N5M4	171 aa		-0.86	□□□□□ -2.55
MDM2-233	ENST00000545204	PPDPFL	Q8WWR9	84 aa		-0.86	□□□□□ -2.55
MDM2-233	ENST00000545204	NPVF	Q9HCQ7	196 aa		-0.86	□□□□□ -2.55
MDM2-233	ENST00000545204	HIGD1B	Q9P298	99 aa		-0.86	□□□□□ -2.55
MDM2-233	ENST00000545204	LMO7	Q8WWI1	1683 aa		-0.86	□□□□□ -2.55
MDM2-233	ENST00000545204	ANKRD36	A6QL64	1941 aa		-0.86	□□□□□ -2.55
MDM2-233	ENST00000545204	ARHGEF10	O15013	1369 aa		-0.86	□□□□□ -2.55
MDM2-233	ENST00000545204	LRRC37A3	O60309	1634 aa		-0.86	□□□□□ -2.55
MDM2-233	ENST00000545204	NES	P48681	1621 aa		-0.86	□□□□□ -2.55
MDM2-233	ENST00000545204	KIF14	Q15058	1648 aa		-0.86	□□□□□ -2.55
MDM2-233	ENST00000545204	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		-0.86	□□□□□ -2.55
MDM2-233	ENST00000545204	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		-0.86	□□□□□ -2.55
MDM2-233	ENST00000545204	C1orf167	Q5SNV9	1468 aa		-0.86	□□□□□ -2.55
MDM2-233	ENST00000545204	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		-0.86	□□□□□ -2.55
MDM2-233	ENST00000545204	QSER1	Q2KHR3	1735 aa		-0.86	□□□□□ -2.55
MDM2-233	ENST00000545204	NUP188	Q5SRE5	1749 aa		-0.86	□□□□□ -2.55
MDM2-233	ENST00000545204	ABCA3	Q99758	1704 aa		-0.86	□□□□□ -2.55
MDM2-233	ENST00000545204	BTAF1	O14981	1849 aa		-0.87	□□□□□ -2.55
MDM2-233	ENST00000545204	SCN7A	Q01118	1682 aa		-0.87	□□□□□ -2.55
MDM2-233	ENST00000545204	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	-0.87	□□□□□ -2.55
MDM2-233	ENST00000545204	MAPKBP1	O60336	1514 aa		-0.87	□□□□□ -2.55
MDM2-233	ENST00000545204		A0A1W2PRE2	83 aa		-0.87	□□□□□ -2.55
MDM2-233	ENST00000545204		I3L3M4	83 aa		-0.87	□□□□□ -2.55
MDM2-233	ENST00000545204	UQCRQ	O14949	82 aa		-0.87	□□□□□ -2.55
MDM2-233	ENST00000545204	ARPC5	O15511	151 aa		-0.87	□□□□□ -2.55
MDM2-233	ENST00000545204	RPL22	P35268	128 aa	Known RBP	-0.87	□□□□□ -2.55
MDM2-233	ENST00000545204		Q6ZUT4	128 aa		-0.87	□□□□□ -2.55
MDM2-233	ENST00000545204	BRK1	Q8WUW1	75 aa		-0.87	□□□□□ -2.55
MDM2-233	ENST00000545204	THEM6	Q8WUY1	208 aa		-0.87	□□□□□ -2.55
MDM2-233	ENST00000545204	WFDC6	Q9BQY6	131 aa		-0.87	□□□□□ -2.55
MDM2-233	ENST00000545204	VPS25	Q9BRG1	176 aa		-0.87	□□□□□ -2.55
MDM2-233	ENST00000545204	NDUFA4L2	Q9NRX3	87 aa		-0.87	□□□□□ -2.55
MDM2-233	ENST00000545204	SMPX	Q9UHP9	88 aa		-0.87	□□□□□ -2.55
MDM2-233	ENST00000545204	SCP2D1	Q9UJQ7	156 aa		-0.87	□□□□□ -2.55
MDM2-233	ENST00000545204	TRAPPC2L	Q9UL33	140 aa		-0.87	□□□□□ -2.55
MDM2-233	ENST00000545204	PDCD11	Q14690	1871 aa	Known RBP	-0.87	□□□□□ -2.55
MDM2-233	ENST00000545204	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		-0.87	□□□□□ -2.55
MDM2-233	ENST00000545204	MON2	Q7Z3U7	1717 aa		-0.87	□□□□□ -2.55
MDM2-233	ENST00000545204	A2M	P01023	1474 aa		-0.87	□□□□□ -2.55
MDM2-233	ENST00000545204	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		-0.87	□□□□□ -2.55
MDM2-233	ENST00000545204	NLRP1	Q9C000	1473 aa		-0.87	□□□□□ -2.55
MDM2-233	ENST00000545204	MYH6	P13533	1939 aa		-0.87	□□□□□ -2.55
MDM2-233	ENST00000545204	CPSF1	Q10570	1443 aa	Known RBP	-0.88	□□□□□ -2.55
MDM2-233	ENST00000545204	EDC4	Q6P2E9	1401 aa	Known RBP	-0.88	□□□□□ -2.55
MDM2-233	ENST00000545204	UBR3	Q6ZT12	1888 aa		-0.88	□□□□□ -2.55
MDM2-233	ENST00000545204	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		-0.88	□□□□□ -2.55
MDM2-233	ENST00000545204	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	-0.88	□□□□□ -2.55
MDM2-233	ENST00000545204	TJP1	Q07157	1748 aa		-0.88	□□□□□ -2.55
MDM2-233	ENST00000545204	TRBV20-1	A0A075B6N2	111 aa		-0.88	□□□□□ -2.55
MDM2-233	ENST00000545204	PNMA8C	A0A1B0GUJ8	204 aa		-0.88	□□□□□ -2.55
MDM2-233	ENST00000545204	CLPSL1	A2RUU4	121 aa		-0.88	□□□□□ -2.55
MDM2-233	ENST00000545204		M0QY20	66 aa		-0.88	□□□□□ -2.55
MDM2-233	ENST00000545204	NDUFA3	O95167	84 aa		-0.88	□□□□□ -2.55
MDM2-233	ENST00000545204	FAM107A	O95990	144 aa		-0.88	□□□□□ -2.55
MDM2-233	ENST00000545204	PIP	P12273	146 aa	Predicted RBP	-0.88	□□□□□ -2.55
MDM2-233	ENST00000545204	PCBD1	P61457	104 aa		-0.88	□□□□□ -2.55
MDM2-233	ENST00000545204	MRPS15	P82914	257 aa	Known RBP	-0.88	□□□□□ -2.55
MDM2-233	ENST00000545204	C9orf116	Q5BN46	136 aa	Predicted RBP	-0.88	□□□□□ -2.55
MDM2-233	ENST00000545204	OR8I2	Q8N0Y5	310 aa		-0.88	□□□□□ -2.55
MDM2-233	ENST00000545204	C4orf33	Q8N1A6	199 aa		-0.88	□□□□□ -2.55
MDM2-233	ENST00000545204	C20orf197	Q8N268	126 aa		-0.88	□□□□□ -2.55
MDM2-233	ENST00000545204	CDC26	Q8NHZ8	85 aa		-0.88	□□□□□ -2.55
MDM2-233	ENST00000545204	VSTM2A	Q8TAG5	236 aa		-0.88	□□□□□ -2.55
MDM2-233	ENST00000545204	COX7B2	Q8TF08	81 aa		-0.88	□□□□□ -2.55
MDM2-233	ENST00000545204	DEFB104A	Q8WTQ1	72 aa		-0.88	□□□□□ -2.55
MDM2-233	ENST00000545204	SLC35B3	Q9H1N7	401 aa		-0.88	□□□□□ -2.55
MDM2-233	ENST00000545204	GID8	Q9NWU2	228 aa		-0.88	□□□□□ -2.55
MDM2-233	ENST00000545204	TIMM8B	Q9Y5J9	83 aa	Predicted RBP	-0.88	□□□□□ -2.55
MDM2-233	ENST00000545204		V9GYV3	84 aa		-0.88	□□□□□ -2.55
MDM2-233	ENST00000545204	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		-0.88	□□□□□ -2.55
MDM2-233	ENST00000545204	GLI2	P10070	1586 aa		-0.88	□□□□□ -2.55
MDM2-233	ENST00000545204	RGPD8	O14715	1765 aa	Predicted RBP	-0.88	□□□□□ -2.55
MDM2-233	ENST00000545204	RGPD5	Q99666	1765 aa		-0.88	□□□□□ -2.55
MDM2-233	ENST00000545204	CLIP1	P30622	1438 aa		-0.89	□□□□□ -2.55
MDM2-233	ENST00000545204	NEXMIF	Q5QGS0	1516 aa		-0.89	□□□□□ -2.55
MDM2-233	ENST00000545204	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		-0.89	□□□□□ -2.55
MDM2-233	ENST00000545204	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	-0.89	□□□□□ -2.55
MDM2-233	ENST00000545204	ITSN1	Q15811	1721 aa		-0.89	□□□□□ -2.55
MDM2-233	ENST00000545204	NRAP	Q86VF7	1730 aa		-0.89	□□□□□ -2.55
MDM2-233	ENST00000545204	ANKRD26	Q9UPS8	1709 aa		-0.89	□□□□□ -2.55
MDM2-233	ENST00000545204	SPEF2	Q9C093	1822 aa		-0.89	□□□□□ -2.55
MDM2-233	ENST00000545204		M0R135	149 aa		-0.89	□□□□□ -2.55
MDM2-233	ENST00000545204	PFDN1	O60925	122 aa		-0.89	□□□□□ -2.55
MDM2-233	ENST00000545204	SLC25A5	P05141	298 aa	Known RBP	-0.89	□□□□□ -2.55
MDM2-233	ENST00000545204	MGP	P08493	103 aa		-0.89	□□□□□ -2.55
MDM2-233	ENST00000545204	IAPP	P10997	89 aa		-0.89	□□□□□ -2.55
MDM2-233	ENST00000545204	UBE2D1	P51668	147 aa		-0.89	□□□□□ -2.55
MDM2-233	ENST00000545204	POLR2H	P52434	150 aa	Known RBP	-0.89	□□□□□ -2.55
MDM2-233	ENST00000545204	CCL18	P55774	89 aa		-0.89	□□□□□ -2.55
MDM2-233	ENST00000545204	SSBP1	Q04837	148 aa	Known RBP	-0.89	□□□□□ -2.55
MDM2-233	ENST00000545204	OR2T2	Q6IF00	324 aa		-0.89	□□□□□ -2.55
MDM2-233	ENST00000545204	LCN9	Q8WX39	176 aa		-0.89	□□□□□ -2.55
MDM2-233	ENST00000545204	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		-0.89	□□□□□ -2.55

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