RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544584.1

CLSTN3-215, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 546 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-215ENST00000544584 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa3.56□□□□□ -1.84
CLSTN3-215ENST00000544584 LINC01546A6NGU7 62 aa3.55□□□□□ -1.84
CLSTN3-215ENST00000544584 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa3.55□□□□□ -1.84
CLSTN3-215ENST00000544584 F8VRH5 84 aa3.55□□□□□ -1.84
CLSTN3-215ENST00000544584 ATP6V1G1O75348 118 aa3.55□□□□□ -1.84
CLSTN3-215ENST00000544584 HBDP02042 147 aa3.55□□□□□ -1.84
CLSTN3-215ENST00000544584 CHTF8P0CG12 524 aa3.55□□□□□ -1.84
CLSTN3-215ENST00000544584 NDUFA6P56556 154 aa3.55□□□□□ -1.84
CLSTN3-215ENST00000544584 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
CLSTN3-215ENST00000544584 SPINK6Q6UWN8 80 aa3.55□□□□□ -1.84
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CLSTN3-215ENST00000544584 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
CLSTN3-215ENST00000544584 CST9LQ9H4G1 147 aa3.54□□□□□ -1.84
CLSTN3-215ENST00000544584 GAGE2DQ9UEU5 116 aa3.54□□□□□ -1.84
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CLSTN3-215ENST00000544584 BAGE3Q86Y29 109 aa3.53□□□□□ -1.84
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CLSTN3-215ENST00000544584 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa3.53□□□□□ -1.84
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CLSTN3-215ENST00000544584 KIAA0087Q14695 138 aa3.52□□□□□ -1.85
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CLSTN3-215ENST00000544584 IGLC3P0DOY3 106 aa3.51□□□□□ -1.85
CLSTN3-215ENST00000544584 S100A12P80511 92 aa3.51□□□□□ -1.85
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CLSTN3-215ENST00000544584 TMEM170BQ5T4T1 132 aa3.51□□□□□ -1.85
CLSTN3-215ENST00000544584 C2orf82Q6UX34 121 aa3.51□□□□□ -1.85
CLSTN3-215ENST00000544584 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
CLSTN3-215ENST00000544584 NKAPP1Q8N9T2 125 aa3.51□□□□□ -1.85
CLSTN3-215ENST00000544584 FAM104AQ969W3 186 aa3.51□□□□□ -1.85
CLSTN3-215ENST00000544584 TP73-AS1Q9UF72 201 aa3.51□□□□□ -1.85
CLSTN3-215ENST00000544584 HSPB8Q9UJY1 196 aa3.51□□□□□ -1.85
CLSTN3-215ENST00000544584 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa3.5□□□□□ -1.85
CLSTN3-215ENST00000544584 SMIM1B2RUZ4 78 aa3.5□□□□□ -1.85
CLSTN3-215ENST00000544584 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
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CLSTN3-215ENST00000544584 HERVK_113P61574 105 aa3.49□□□□□ -1.85
CLSTN3-215ENST00000544584 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa3.49□□□□□ -1.85
CLSTN3-215ENST00000544584 LINC01600Q96MT4 127 aa3.49□□□□□ -1.85
CLSTN3-215ENST00000544584 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa3.49□□□□□ -1.85
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CLSTN3-215ENST00000544584 RPL28P46779 137 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
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CLSTN3-215ENST00000544584 C22orf24Q9Y442 160 aa3.48□□□□□ -1.85
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CLSTN3-215ENST00000544584 TNXBP22105 4242 aa3.47□□□□□ -1.85
CLSTN3-215ENST00000544584 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa3.47□□□□□ -1.85
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CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
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CLSTN3-215ENST00000544584 NMUP48645 174 aa3.47□□□□□ -1.85
CLSTN3-215ENST00000544584 LINC00158P58513 81 aa3.47□□□□□ -1.85
CLSTN3-215ENST00000544584 PMCHL1Q16048 86 aa3.47□□□□□ -1.85
CLSTN3-215ENST00000544584 CBLN2Q8IUK8 224 aa3.47□□□□□ -1.85
CLSTN3-215ENST00000544584 XAGE1AQ9HD64 81 aa3.47□□□□□ -1.85
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CLSTN3-215ENST00000544584 FAM168BA1KXE4 195 aa3.46□□□□□ -1.86
CLSTN3-215ENST00000544584 C11orf86A6NJI1 115 aa3.46□□□□□ -1.86
CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF861PO60384 105 aa3.46□□□□□ -1.86
CLSTN3-215ENST00000544584 UBE2AP49459 152 aa3.46□□□□□ -1.86
CLSTN3-215ENST00000544584 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP3.46□□□□□ -1.86
CLSTN3-215ENST00000544584 MEIG1Q5JSS6 88 aa3.46□□□□□ -1.86
CLSTN3-215ENST00000544584 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
CLSTN3-215ENST00000544584 PLEKHB2Q96CS7 222 aa3.46□□□□□ -1.86
CLSTN3-215ENST00000544584 ERG28Q9UKR5 140 aa3.46□□□□□ -1.86
CLSTN3-215ENST00000544584 H0Y8G0 127 aa3.45□□□□□ -1.86
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