RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541770.1

CLSTN3-212, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 3

Gene CLSTN3, Length 568 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-212ENST00000541770 A0A0J9YXV3 536 aa5.59□□□□□ -1.51
CLSTN3-212ENST00000541770 H0Y8G0 127 aa5.59□□□□□ -1.51
CLSTN3-212ENST00000541770 KRTDAPP60985 99 aa5.59□□□□□ -1.51
CLSTN3-212ENST00000541770 C9orf163Q8N9P6 203 aa5.59□□□□□ -1.51
CLSTN3-212ENST00000541770 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
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CLSTN3-212ENST00000541770 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP5.58□□□□□ -1.52
CLSTN3-212ENST00000541770 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa5.58□□□□□ -1.52
CLSTN3-212ENST00000541770 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa5.58□□□□□ -1.52
CLSTN3-212ENST00000541770 LEPROTL1O95214 131 aa5.58□□□□□ -1.52
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CLSTN3-212ENST00000541770 HIGD2BQ4VC39 106 aa5.58□□□□□ -1.52
CLSTN3-212ENST00000541770 HSPB8Q9UJY1 196 aa5.58□□□□□ -1.52
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CLSTN3-212ENST00000541770 ORAOV1Q8WV07 137 aa5.57□□□□□ -1.52
CLSTN3-212ENST00000541770 C2orf48Q96LS8 159 aa5.57□□□□□ -1.52
CLSTN3-212ENST00000541770 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa5.57□□□□□ -1.52
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CLSTN3-212ENST00000541770 SPAG11BQ08648 103 aa5.56□□□□□ -1.52
CLSTN3-212ENST00000541770 LINC00469Q8N7U9 141 aa5.56□□□□□ -1.52
CLSTN3-212ENST00000541770 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
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CLSTN3-212ENST00000541770 SCGB1D1O95968 90 aa5.55□□□□□ -1.52
CLSTN3-212ENST00000541770 SYCNQ0VAF6 134 aa5.55□□□□□ -1.52
CLSTN3-212ENST00000541770 KIAA0087Q14695 138 aa5.55□□□□□ -1.52
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CLSTN3-212ENST00000541770 LINC00526Q96FQ7 95 aa5.55□□□□□ -1.52
CLSTN3-212ENST00000541770 CARD19Q96LW7 228 aa5.55□□□□□ -1.52
CLSTN3-212ENST00000541770 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa5.55□□□□□ -1.52
CLSTN3-212ENST00000541770 C11orf86A6NJI1 115 aa5.54□□□□□ -1.52
CLSTN3-212ENST00000541770 SMIM1B2RUZ4 78 aa5.54□□□□□ -1.52
CLSTN3-212ENST00000541770 F8VRH5 84 aa5.54□□□□□ -1.52
CLSTN3-212ENST00000541770 C3orf79P0CE67 100 aa5.54□□□□□ -1.52
CLSTN3-212ENST00000541770 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
CLSTN3-212ENST00000541770 SDIM1Q6ZPB5 146 aa5.54□□□□□ -1.52
CLSTN3-212ENST00000541770 LINC00518Q8N0U6 118 aa5.54□□□□□ -1.52
CLSTN3-212ENST00000541770 CAMK2N2Q96S95 79 aa5.54□□□□□ -1.52
CLSTN3-212ENST00000541770 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
CLSTN3-212ENST00000541770 PKIGQ9Y2B9 76 aa5.54□□□□□ -1.52
CLSTN3-212ENST00000541770 C20orf202A1L168 122 aa5.53□□□□□ -1.52
CLSTN3-212ENST00000541770 NDUFA1O15239 70 aa5.53□□□□□ -1.52
CLSTN3-212ENST00000541770 PRSS2P07478 247 aa5.53□□□□□ -1.52
CLSTN3-212ENST00000541770 ODF1Q14990 250 aa5.53□□□□□ -1.52
CLSTN3-212ENST00000541770 RNF151Q2KHN1 245 aa5.53□□□□□ -1.52
CLSTN3-212ENST00000541770 Q6ZRU5 148 aa5.53□□□□□ -1.52
CLSTN3-212ENST00000541770 C12orf57Q99622 126 aa5.53□□□□□ -1.52
CLSTN3-212ENST00000541770 PMCHL2Q9BQD1 86 aa5.53□□□□□ -1.52
CLSTN3-212ENST00000541770 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa5.52□□□□□ -1.53
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CLSTN3-212ENST00000541770 TMEM170BQ5T4T1 132 aa5.52□□□□□ -1.53
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CLSTN3-212ENST00000541770 ATOH7Q8N100 152 aa5.52□□□□□ -1.53
CLSTN3-212ENST00000541770 DPH3Q96FX2 82 aa5.52□□□□□ -1.53
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CLSTN3-212ENST00000541770 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa5.51□□□□□ -1.53
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CLSTN3-212ENST00000541770 PLNP26678 52 aa5.51□□□□□ -1.53
CLSTN3-212ENST00000541770 C10orf25Q5T742 122 aa5.51□□□□□ -1.53
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CLSTN3-212ENST00000541770 COX7B2Q8TF08 81 aa5.51□□□□□ -1.53
CLSTN3-212ENST00000541770 TOMM7Q9P0U1 55 aa5.51□□□□□ -1.53
CLSTN3-212ENST00000541770 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa5.5□□□□□ -1.53
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CLSTN3-212ENST00000541770 LINC00474Q9P2X8 69 aa5.5□□□□□ -1.53
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CLSTN3-212ENST00000541770 LINC01545Q5VT33 79 aa5.49□□□□□ -1.53
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CLSTN3-212ENST00000541770 A0A096LNI7 61 aa5.48□□□□□ -1.53
CLSTN3-212ENST00000541770 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
CLSTN3-212ENST00000541770 PTTG1IPP53801 180 aa5.48□□□□□ -1.53
CLSTN3-212ENST00000541770 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa5.47□□□□□ -1.53
CLSTN3-212ENST00000541770 VAMP8Q9BV40 100 aa5.47□□□□□ -1.53
CLSTN3-212ENST00000541770 PAM16Q9Y3D7 125 aa5.47□□□□□ -1.53
CLSTN3-212ENST00000541770 LRP2P98164 4655 aa5.47□□□□□ -1.53
CLSTN3-212ENST00000541770 A0A087WYN8 130 aa5.46□□□□□ -1.54
CLSTN3-212ENST00000541770 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa5.46□□□□□ -1.54
CLSTN3-212ENST00000541770 HSBP1L1C9JCN9 74 aa5.46□□□□□ -1.54
CLSTN3-212ENST00000541770 CHTF8P0CG12 524 aa5.46□□□□□ -1.54
CLSTN3-212ENST00000541770 HERVK_113P61574 105 aa5.46□□□□□ -1.54
CLSTN3-212ENST00000541770 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
CLSTN3-212ENST00000541770 GAGE2BQ13066 116 aa5.46□□□□□ -1.54
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