RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000537686.5

GGA3-201, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GGA3, Length 4,069 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-201ENST00000537686 A0A087WZ39 114 aa7.27□□□□□ -1.25
GGA3-201ENST00000537686 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
GGA3-201ENST00000537686 TIMM17BO60830 172 aa7.26□□□□□ -1.25
GGA3-201ENST00000537686 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
GGA3-201ENST00000537686 ASPMQ8IZT6 3477 aa7.26□□□□□ -1.25
GGA3-201ENST00000537686 LAMA5O15230 3695 aa7.25□□□□□ -1.25
GGA3-201ENST00000537686 A0A0J9YWU9 116 aa7.25□□□□□ -1.25
GGA3-201ENST00000537686 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa7.25□□□□□ -1.25
GGA3-201ENST00000537686 RETNQ9HD89 108 aa7.25□□□□□ -1.25
GGA3-201ENST00000537686 CHD6Q8TD26 2715 aa7.25□□□□□ -1.25
GGA3-201ENST00000537686 A0A096LNJ9 63 aa7.25□□□□□ -1.25
GGA3-201ENST00000537686 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa7.25□□□□□ -1.25
GGA3-201ENST00000537686 IGKV2D-28P01615 120 aa7.25□□□□□ -1.25
GGA3-201ENST00000537686 C4orf48Q5BLP8 95 aa7.25□□□□□ -1.25
GGA3-201ENST00000537686 B9D2Q9BPU9 175 aa7.24□□□□□ -1.25
GGA3-201ENST00000537686 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
GGA3-201ENST00000537686 LINC00694P0DN24 101 aa7.24□□□□□ -1.25
GGA3-201ENST00000537686 SVIPQ8NHG7 77 aa7.24□□□□□ -1.25
GGA3-201ENST00000537686 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
GGA3-201ENST00000537686 Q6ZQY7 126 aa7.24□□□□□ -1.25
GGA3-201ENST00000537686 DCHS1Q96JQ0 3298 aa7.23□□□□□ -1.25
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GGA3-201ENST00000537686 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa7.23□□□□□ -1.25
GGA3-201ENST00000537686 M0R2N4 97 aa7.23□□□□□ -1.25
GGA3-201ENST00000537686 MP68P56378 58 aa7.23□□□□□ -1.25
GGA3-201ENST00000537686 CYSRT1A8MQ03 144 aa7.22□□□□□ -1.25
GGA3-201ENST00000537686 SS18L2Q9UHA2 77 aa7.22□□□□□ -1.25
GGA3-201ENST00000537686 H0Y9J4 135 aa7.22□□□□□ -1.25
GGA3-201ENST00000537686 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa7.22□□□□□ -1.25
GGA3-201ENST00000537686 SMIM1B2RUZ4 78 aa7.22□□□□□ -1.25
GGA3-201ENST00000537686 MT-ATP8P03928 68 aa7.22□□□□□ -1.25
GGA3-201ENST00000537686 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa7.22□□□□□ -1.25
GGA3-201ENST00000537686 C16orf95Q9H693 158 aa7.22□□□□□ -1.25
GGA3-201ENST00000537686 LRCOL1A6NCL2 159 aa7.22□□□□□ -1.25
GGA3-201ENST00000537686 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa7.21□□□□□ -1.25
GGA3-201ENST00000537686 Q8IZM0 81 aa7.21□□□□□ -1.25
GGA3-201ENST00000537686 CHCHD7Q9BUK0 85 aa7.21□□□□□ -1.25
GGA3-201ENST00000537686 FHL2Q14192 279 aa7.21□□□□□ -1.26
GGA3-201ENST00000537686 Q6ZTC4 211 aa7.21□□□□□ -1.26
GGA3-201ENST00000537686 Q6ZSN1 163 aa7.21□□□□□ -1.26
GGA3-201ENST00000537686 SMIM11BQ8TCY0 68 aa7.21□□□□□ -1.26
GGA3-201ENST00000537686 LST1O00453 97 aa7.2□□□□□ -1.26
GGA3-201ENST00000537686 BEAN1Q3B7T3 259 aa7.2□□□□□ -1.26
GGA3-201ENST00000537686 SCXQ7RTU7 201 aa7.2□□□□□ -1.26
GGA3-201ENST00000537686 SDIM1Q6ZPB5 146 aa7.2□□□□□ -1.26
GGA3-201ENST00000537686 TSPEAR-AS2P59090 65 aa7.2□□□□□ -1.26
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GGA3-201ENST00000537686 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
GGA3-201ENST00000537686 M0R378 163 aa7.18□□□□□ -1.26
GGA3-201ENST00000537686 COX6A2Q02221 97 aa7.18□□□□□ -1.26
GGA3-201ENST00000537686 UPK3BQ9BT76 320 aa7.18□□□□□ -1.26
GGA3-201ENST00000537686 LRBAP50851 2863 aa7.18□□□□□ -1.26
GGA3-201ENST00000537686 SMIM20Q8N5G0 67 aa7.18□□□□□ -1.26
GGA3-201ENST00000537686 AMELXQ99217 191 aa7.17□□□□□ -1.26
GGA3-201ENST00000537686 TMEM258P61165 79 aa7.17□□□□□ -1.26
GGA3-201ENST00000537686 PPDPFQ9H3Y8 114 aa7.17□□□□□ -1.26
GGA3-201ENST00000537686 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa7.17□□□□□ -1.26
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GGA3-201ENST00000537686 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
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GGA3-201ENST00000537686 C20orf197Q8N268 126 aa7.16□□□□□ -1.26
GGA3-201ENST00000537686 WFDC9Q8NEX5 89 aa7.16□□□□□ -1.26
GGA3-201ENST00000537686 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
GGA3-201ENST00000537686 COX17Q14061 63 aa7.15□□□□□ -1.26
GGA3-201ENST00000537686 LY6G6CO95867 125 aa7.15□□□□□ -1.26
GGA3-201ENST00000537686 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa7.15□□□□□ -1.26
GGA3-201ENST00000537686 ENHOQ6UWT2 76 aa7.15□□□□□ -1.26
GGA3-201ENST00000537686 Q8N2B8 174 aa7.15□□□□□ -1.27
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GGA3-201ENST00000537686 PRR3P79522 188 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
GGA3-201ENST00000537686 STAB1Q9NY15 2570 aa7.14□□□□□ -1.27
GGA3-201ENST00000537686 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa7.14□□□□□ -1.27
GGA3-201ENST00000537686 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa7.14□□□□□ -1.27
GGA3-201ENST00000537686 ITPR1Q14643 2758 aa7.13□□□□□ -1.27
GGA3-201ENST00000537686 C11orf72Q8NBR9 251 aa7.13□□□□□ -1.27
GGA3-201ENST00000537686 MUC7Q8TAX7 377 aa7.13□□□□□ -1.27
GGA3-201ENST00000537686 WFDC10BQ8IUB3 73 aa7.12□□□□□ -1.27
GGA3-201ENST00000537686 RELNP78509 3460 aa7.12□□□□□ -1.27
GGA3-201ENST00000537686 C5orf47Q569G3 176 aa7.12□□□□□ -1.27
GGA3-201ENST00000537686 LINC00315P59091 139 aa7.11□□□□□ -1.27
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GGA3-201ENST00000537686 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa7.11□□□□□ -1.27
GGA3-201ENST00000537686 C7orf33Q8WU49 177 aa7.11□□□□□ -1.27
GGA3-201ENST00000537686 C6orf223Q8N319 242 aa7.11□□□□□ -1.27
GGA3-201ENST00000537686 USP17L23D6RBM5 183 aa7.1□□□□□ -1.27
GGA3-201ENST00000537686 IGKV4-1P06312 121 aa7.1□□□□□ -1.27
GGA3-201ENST00000537686 TEX15Q9BXT5 2789 aa7.1□□□□□ -1.27
GGA3-201ENST00000537686 A0A096LNT2 108 aa7.1□□□□□ -1.27
GGA3-201ENST00000537686 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa7.1□□□□□ -1.27
GGA3-201ENST00000537686 SPINK6Q6UWN8 80 aa7.1□□□□□ -1.27
GGA3-201ENST00000537686 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
GGA3-201ENST00000537686 Q9UF83 564 aa7.09□□□□□ -1.27
GGA3-201ENST00000537686 UNC79Q9P2D8 2635 aa7.09□□□□□ -1.27
GGA3-201ENST00000537686 RPL28P46779 137 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
GGA3-201ENST00000537686 XGP55808 180 aa7.09□□□□□ -1.27
GGA3-201ENST00000537686 LYPD5Q6UWN5 251 aa7.09□□□□□ -1.27
GGA3-201ENST00000537686 FHL3Q13643 280 aa7.09□□□□□ -1.27
GGA3-201ENST00000537686 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa7.09□□□□□ -1.27
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