RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534160.1

GMDS-AS1-212, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene GMDS-AS1, Length 720 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDS-AS1-212ENST00000534160 DEFA3P59666 94 aa3.22□□□□□ -1.89
GMDS-AS1-212ENST00000534160 MT1HP80294 61 aa3.22□□□□□ -1.89
GMDS-AS1-212ENST00000534160 PYDC2Q56P42 97 aa3.22□□□□□ -1.89
GMDS-AS1-212ENST00000534160 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa3.22□□□□□ -1.89
GMDS-AS1-212ENST00000534160 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
GMDS-AS1-212ENST00000534160 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
GMDS-AS1-212ENST00000534160 SSPOA2VEC9 5147 aa3.22□□□□□ -1.89
GMDS-AS1-212ENST00000534160 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
GMDS-AS1-212ENST00000534160 SH2D1AO60880 128 aa3.21□□□□□ -1.9
GMDS-AS1-212ENST00000534160 MGPP08493 103 aa3.21□□□□□ -1.9
GMDS-AS1-212ENST00000534160 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
GMDS-AS1-212ENST00000534160 KRTAP12-3P60328 96 aa3.21□□□□□ -1.9
GMDS-AS1-212ENST00000534160 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa3.21□□□□□ -1.9
GMDS-AS1-212ENST00000534160 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
GMDS-AS1-212ENST00000534160 C11orf1Q9H5F2 150 aa3.21□□□□□ -1.9
GMDS-AS1-212ENST00000534160 EPDR1Q9UM22 224 aa3.21□□□□□ -1.9
GMDS-AS1-212ENST00000534160 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
GMDS-AS1-212ENST00000534160 MUC21A0A140T8X8 626 aa3.2□□□□□ -1.9
GMDS-AS1-212ENST00000534160 CCL25O15444 150 aa3.2□□□□□ -1.9
GMDS-AS1-212ENST00000534160 NDUFS5O43920 106 aa3.2□□□□□ -1.9
GMDS-AS1-212ENST00000534160 NDUFB6O95139 128 aa3.2□□□□□ -1.9
GMDS-AS1-212ENST00000534160 ARL14EPLP0DKL9 152 aa3.2□□□□□ -1.9
GMDS-AS1-212ENST00000534160 RPL12P30050 165 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
GMDS-AS1-212ENST00000534160 COTL1Q14019 142 aa3.2□□□□□ -1.9
GMDS-AS1-212ENST00000534160 SPANXN1Q5VSR9 72 aa3.2□□□□□ -1.9
GMDS-AS1-212ENST00000534160 Q86TA4 180 aa3.2□□□□□ -1.9
GMDS-AS1-212ENST00000534160 OR10AG1Q8NH19 301 aa3.2□□□□□ -1.9
GMDS-AS1-212ENST00000534160 C9JQL5 133 aa3.19□□□□□ -1.9
GMDS-AS1-212ENST00000534160 M0QXV9 152 aa3.19□□□□□ -1.9
GMDS-AS1-212ENST00000534160 M0R2T5 61 aa3.19□□□□□ -1.9
GMDS-AS1-212ENST00000534160 NUP35Q8NFH5 326 aa3.19□□□□□ -1.9
GMDS-AS1-212ENST00000534160 OR5A1Q8NGJ0 315 aa3.19□□□□□ -1.9
GMDS-AS1-212ENST00000534160 AP1S3Q96PC3 154 aa3.19□□□□□ -1.9
GMDS-AS1-212ENST00000534160 MED28Q9H204 178 aa3.19□□□□□ -1.9
GMDS-AS1-212ENST00000534160 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
GMDS-AS1-212ENST00000534160 C19orf71A6NCJ1 209 aa3.18□□□□□ -1.9
GMDS-AS1-212ENST00000534160 CXorf1O96002 111 aa3.18□□□□□ -1.9
GMDS-AS1-212ENST00000534160 CRIP1P50238 77 aa3.18□□□□□ -1.9
GMDS-AS1-212ENST00000534160 SCGB1C1Q8TD33 95 aa3.18□□□□□ -1.9
GMDS-AS1-212ENST00000534160 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP3.17□□□□□ -1.9
GMDS-AS1-212ENST00000534160 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa3.17□□□□□ -1.9
GMDS-AS1-212ENST00000534160 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP3.17□□□□□ -1.9
GMDS-AS1-212ENST00000534160 M0QY20 66 aa3.17□□□□□ -1.9
GMDS-AS1-212ENST00000534160 GCHFRP30047 84 aa3.17□□□□□ -1.9
GMDS-AS1-212ENST00000534160 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP3.17□□□□□ -1.9
GMDS-AS1-212ENST00000534160 SS18Q15532 418 aa3.17□□□□□ -1.9
GMDS-AS1-212ENST00000534160 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa3.17□□□□□ -1.9
GMDS-AS1-212ENST00000534160 NAP1L6A6NFF2 107 aa3.16□□□□□ -1.9
GMDS-AS1-212ENST00000534160 COX7A2LO14548 114 aa3.16□□□□□ -1.9
GMDS-AS1-212ENST00000534160 UBE2G1P62253 170 aa3.16□□□□□ -1.9
GMDS-AS1-212ENST00000534160 PMVKQ15126 192 aa3.16□□□□□ -1.9
GMDS-AS1-212ENST00000534160 TRIQKQ629K1 86 aa3.16□□□□□ -1.9
GMDS-AS1-212ENST00000534160 RASL11AQ6T310 242 aa3.16□□□□□ -1.9
GMDS-AS1-212ENST00000534160 FAM231DQ6ZW35 169 aa3.16□□□□□ -1.9
GMDS-AS1-212ENST00000534160 BTF3L4Q96K17 158 aa3.16□□□□□ -1.9
GMDS-AS1-212ENST00000534160 TMEM167BQ9NRX6 74 aa3.16□□□□□ -1.9
GMDS-AS1-212ENST00000534160 PRO0628Q9UI54 55 aa3.16□□□□□ -1.9
GMDS-AS1-212ENST00000534160 ZFP30Q9Y2G7 519 aa3.16□□□□□ -1.9
GMDS-AS1-212ENST00000534160 ATP6V1G2O95670 118 aa3.15□□□□□ -1.91
GMDS-AS1-212ENST00000534160 STAG3L2P0CL84 134 aa3.15□□□□□ -1.91
GMDS-AS1-212ENST00000534160 ESDP10768 282 aa3.15□□□□□ -1.91
GMDS-AS1-212ENST00000534160 RPL28P46779 137 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
GMDS-AS1-212ENST00000534160 SPAG11BQ08648 103 aa3.15□□□□□ -1.91
GMDS-AS1-212ENST00000534160 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
GMDS-AS1-212ENST00000534160 OR2D3Q8NGH3 330 aa3.15□□□□□ -1.91
GMDS-AS1-212ENST00000534160 FMC1Q96HJ9 113 aa3.15□□□□□ -1.91
GMDS-AS1-212ENST00000534160 IMMP2LQ96T52 175 aa3.15□□□□□ -1.91
GMDS-AS1-212ENST00000534160 SMIM3Q9BZL3 60 aa3.15□□□□□ -1.91
GMDS-AS1-212ENST00000534160 NIT2Q9NQR4 276 aa3.15□□□□□ -1.91
GMDS-AS1-212ENST00000534160 V9GYH0 126 aa3.15□□□□□ -1.91
GMDS-AS1-212ENST00000534160 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa3.14□□□□□ -1.91
GMDS-AS1-212ENST00000534160 A0A1B0GVG6 124 aa3.14□□□□□ -1.91
GMDS-AS1-212ENST00000534160 NUPR1O60356 82 aa3.14□□□□□ -1.91
GMDS-AS1-212ENST00000534160 OR5AL1P0C617 328 aa3.14□□□□□ -1.91
GMDS-AS1-212ENST00000534160 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
GMDS-AS1-212ENST00000534160 UBE2G2P60604 165 aa3.14□□□□□ -1.91
GMDS-AS1-212ENST00000534160 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa3.14□□□□□ -1.91
GMDS-AS1-212ENST00000534160 PDZD11Q5EBL8 140 aa3.14□□□□□ -1.91
GMDS-AS1-212ENST00000534160 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa3.14□□□□□ -1.91
GMDS-AS1-212ENST00000534160 A0A1W2PRE2 83 aa3.13□□□□□ -1.91
GMDS-AS1-212ENST00000534160 H3BQ85 93 aa3.13□□□□□ -1.91
GMDS-AS1-212ENST00000534160 LTAP01374 205 aa3.13□□□□□ -1.91
GMDS-AS1-212ENST00000534160 CXCL1P09341 107 aa3.13□□□□□ -1.91
GMDS-AS1-212ENST00000534160 KRTAP12-4P60329 112 aa3.13□□□□□ -1.91
GMDS-AS1-212ENST00000534160 CTAG1AP78358 180 aa3.13□□□□□ -1.91
GMDS-AS1-212ENST00000534160 HIST1H2BAQ96A08 127 aa3.13□□□□□ -1.91
GMDS-AS1-212ENST00000534160 HSPB11Q9Y547 144 aa3.13□□□□□ -1.91
GMDS-AS1-212ENST00000534160 NDUFA1O15239 70 aa3.12□□□□□ -1.91
GMDS-AS1-212ENST00000534160 NCR2O95944 276 aa3.12□□□□□ -1.91
GMDS-AS1-212ENST00000534160 S100A5P33763 92 aa3.12□□□□□ -1.91
GMDS-AS1-212ENST00000534160 C5orf38Q86SI9 138 aa3.12□□□□□ -1.91
GMDS-AS1-212ENST00000534160 SMDT1Q9H4I9 107 aa3.12□□□□□ -1.91
GMDS-AS1-212ENST00000534160 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
GMDS-AS1-212ENST00000534160 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa3.12□□□□□ -1.91
GMDS-AS1-212ENST00000534160 ALG5Q9Y673 324 aa3.12□□□□□ -1.91
GMDS-AS1-212ENST00000534160 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa3.11□□□□□ -1.91
GMDS-AS1-212ENST00000534160 C1orf196B1AJZ1 125 aa3.11□□□□□ -1.91
GMDS-AS1-212ENST00000534160 G3V3Q6 166 aa3.11□□□□□ -1.91
GMDS-AS1-212ENST00000534160 BCE1O60756 84 aa3.11□□□□□ -1.91
GMDS-AS1-212ENST00000534160 AKR1C3P42330 323 aa3.11□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 79.7 ms