RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524784.1

PACS1-202, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

TSL 4

Gene PACS1, Length 540 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-202ENST00000524784 TP73-AS1Q9UF72 201 aa6.99□□□□□ -1.29
PACS1-202ENST00000524784 LCE6AA0A183 80 aa6.98□□□□□ -1.29
PACS1-202ENST00000524784 LECT2O14960 151 aa6.98□□□□□ -1.29
PACS1-202ENST00000524784 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
PACS1-202ENST00000524784 TMEM238C9JI98 176 aa6.97□□□□□ -1.29
PACS1-202ENST00000524784 TIMM17BO60830 172 aa6.97□□□□□ -1.29
PACS1-202ENST00000524784 SYCNQ0VAF6 134 aa6.97□□□□□ -1.29
PACS1-202ENST00000524784 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP6.97□□□□□ -1.29
PACS1-202ENST00000524784 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa6.97□□□□□ -1.29
PACS1-202ENST00000524784 C2orf91Q6ZV80 131 aa6.97□□□□□ -1.29
PACS1-202ENST00000524784 LINC00158P58513 81 aa6.96□□□□□ -1.3
PACS1-202ENST00000524784 HIST1H4GQ99525 98 aa6.96□□□□□ -1.3
PACS1-202ENST00000524784 ERG28Q9UKR5 140 aa6.96□□□□□ -1.3
PACS1-202ENST00000524784 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa6.95□□□□□ -1.3
PACS1-202ENST00000524784 A0A0U1RRA0 63 aa6.95□□□□□ -1.3
PACS1-202ENST00000524784 SMIM13P0DJ93 91 aa6.95□□□□□ -1.3
PACS1-202ENST00000524784 PFN2P35080 140 aa6.95□□□□□ -1.3
PACS1-202ENST00000524784 CTAG1AP78358 180 aa6.95□□□□□ -1.3
PACS1-202ENST00000524784 TAL2Q16559 108 aa6.95□□□□□ -1.3
PACS1-202ENST00000524784 C10orf25Q5T742 122 aa6.95□□□□□ -1.3
PACS1-202ENST00000524784 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
PACS1-202ENST00000524784 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
PACS1-202ENST00000524784 LRCOL1A6NCL2 159 aa6.94□□□□□ -1.3
PACS1-202ENST00000524784 EREGO14944 169 aa6.94□□□□□ -1.3
PACS1-202ENST00000524784 GCSHP23434 173 aa6.94□□□□□ -1.3
PACS1-202ENST00000524784 HSD52Q0P140 79 aa6.94□□□□□ -1.3
PACS1-202ENST00000524784 COX17Q14061 63 aa6.94□□□□□ -1.3
PACS1-202ENST00000524784 WFDC2Q14508 124 aa6.94□□□□□ -1.3
PACS1-202ENST00000524784 Q6ZRU5 148 aa6.94□□□□□ -1.3
PACS1-202ENST00000524784 Q6ZVH6 145 aa6.94□□□□□ -1.3
PACS1-202ENST00000524784 CARD19Q96LW7 228 aa6.94□□□□□ -1.3
PACS1-202ENST00000524784 C6orf48Q9UBA6 75 aa6.94□□□□□ -1.3
PACS1-202ENST00000524784 A0A087WTM6 91 aa6.93□□□□□ -1.3
PACS1-202ENST00000524784 RNF151Q2KHN1 245 aa6.93□□□□□ -1.3
PACS1-202ENST00000524784 COPS9Q8WXC6 57 aa6.93□□□□□ -1.3
PACS1-202ENST00000524784 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
PACS1-202ENST00000524784 M0R143 59 aa6.92□□□□□ -1.3
PACS1-202ENST00000524784 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
PACS1-202ENST00000524784 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa6.92□□□□□ -1.3
PACS1-202ENST00000524784 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa6.92□□□□□ -1.3
PACS1-202ENST00000524784 LITAFQ99732 161 aa6.92□□□□□ -1.3
PACS1-202ENST00000524784 SPANXDQ9BXN6 97 aa6.92□□□□□ -1.3
PACS1-202ENST00000524784 SPANXCQ9NY87 97 aa6.92□□□□□ -1.3
PACS1-202ENST00000524784 STARD9Q9P2P6 4700 aa6.92□□□□□ -1.3
PACS1-202ENST00000524784 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
PACS1-202ENST00000524784 SLPIP03973 132 aa6.91□□□□□ -1.3
PACS1-202ENST00000524784 IFITM1P13164 125 aa6.91□□□□□ -1.3
PACS1-202ENST00000524784 Q8N814 137 aa6.91□□□□□ -1.3
PACS1-202ENST00000524784 DAND5Q8N907 189 aa6.91□□□□□ -1.3
PACS1-202ENST00000524784 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
PACS1-202ENST00000524784 PTTG1IPP53801 180 aa6.9□□□□□ -1.3
PACS1-202ENST00000524784 CNBPP62633 177 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
PACS1-202ENST00000524784 RPL24P83731 157 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
PACS1-202ENST00000524784 MUSTN1Q8IVN3 82 aa6.9□□□□□ -1.3
PACS1-202ENST00000524784 CEND1Q8N111 149 aa6.9□□□□□ -1.3
PACS1-202ENST00000524784 TGP01266 2768 aa6.9□□□□□ -1.31
PACS1-202ENST00000524784 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa6.89□□□□□ -1.31
PACS1-202ENST00000524784 NPC2P61916 151 aa6.89□□□□□ -1.31
PACS1-202ENST00000524784 LINC00308Q8TCZ7 52 aa6.89□□□□□ -1.31
PACS1-202ENST00000524784 PKIGQ9Y2B9 76 aa6.89□□□□□ -1.31
PACS1-202ENST00000524784 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa6.88□□□□□ -1.31
PACS1-202ENST00000524784 A6NJY4 79 aa6.88□□□□□ -1.31
PACS1-202ENST00000524784 RTL8CO15255 209 aa6.88□□□□□ -1.31
PACS1-202ENST00000524784 TLX1NBP0CAT3 122 aa6.88□□□□□ -1.31
PACS1-202ENST00000524784 TNP2Q05952 138 aa6.88□□□□□ -1.31
PACS1-202ENST00000524784 BATFQ16520 125 aa6.88□□□□□ -1.31
PACS1-202ENST00000524784 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa6.88□□□□□ -1.31
PACS1-202ENST00000524784 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa6.88□□□□□ -1.31
PACS1-202ENST00000524784 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
PACS1-202ENST00000524784 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa6.87□□□□□ -1.31
PACS1-202ENST00000524784 GAGE2EQ4V326 116 aa6.87□□□□□ -1.31
PACS1-202ENST00000524784 PPDPFQ9H3Y8 114 aa6.87□□□□□ -1.31
PACS1-202ENST00000524784 GAGE2DQ9UEU5 116 aa6.87□□□□□ -1.31
PACS1-202ENST00000524784 DNAH7Q8WXX0 4024 aa6.87□□□□□ -1.31
PACS1-202ENST00000524784 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
PACS1-202ENST00000524784 GAGE2BQ13066 116 aa6.86□□□□□ -1.31
PACS1-202ENST00000524784 C9orf163Q8N9P6 203 aa6.86□□□□□ -1.31
PACS1-202ENST00000524784 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa6.85□□□□□ -1.31
PACS1-202ENST00000524784 A4D1N5 150 aa6.85□□□□□ -1.31
PACS1-202ENST00000524784 A6NDN8 102 aa6.85□□□□□ -1.31
PACS1-202ENST00000524784 FXYD2P54710 66 aa6.85□□□□□ -1.31
PACS1-202ENST00000524784 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa6.85□□□□□ -1.31
PACS1-202ENST00000524784 Q6ZRP5 223 aa6.85□□□□□ -1.31
PACS1-202ENST00000524784 LINC00336Q6ZUF6 198 aa6.85□□□□□ -1.31
PACS1-202ENST00000524784 ARL17AQ8IVW1 177 aa6.85□□□□□ -1.31
PACS1-202ENST00000524784 XAGE1AQ9HD64 81 aa6.85□□□□□ -1.31
PACS1-202ENST00000524784 CSMD3Q7Z407 3707 aa6.84□□□□□ -1.31
PACS1-202ENST00000524784 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa6.84□□□□□ -1.31
PACS1-202ENST00000524784 SNHG12Q9BXW3 62 aa6.84□□□□□ -1.31
PACS1-202ENST00000524784 TENM2Q9NT68 2774 aa6.84□□□□□ -1.31
PACS1-202ENST00000524784 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
PACS1-202ENST00000524784 RAB37Q96AX2 223 aa6.83□□□□□ -1.32
PACS1-202ENST00000524784 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
PACS1-202ENST00000524784 VPS13DQ5THJ4 4388 aa6.83□□□□□ -1.32
PACS1-202ENST00000524784 C16orf90A8MZG2 172 aa6.82□□□□□ -1.32
PACS1-202ENST00000524784 NDUFC2O95298 119 aa6.82□□□□□ -1.32
PACS1-202ENST00000524784 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa6.82□□□□□ -1.32
PACS1-202ENST00000524784 A0A0B4J2C4 111 aa6.81□□□□□ -1.32
PACS1-202ENST00000524784 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa6.81□□□□□ -1.32
PACS1-202ENST00000524784 SDIM1Q6ZPB5 146 aa6.81□□□□□ -1.32
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