RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000518885.1

CNOT7-204, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 7, human

TSL 3

Gene CNOT7, Length 477 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CNOT7-204	ENST00000518885	SPINK6	Q6UWN8	80 aa		15.05	■□□□□ -0
CNOT7-204	ENST00000518885	C2orf82	Q6UX34	121 aa		15.05	■□□□□ -0
CNOT7-204	ENST00000518885	LINC00469	Q8N7U9	141 aa		15.05	■□□□□ -0
CNOT7-204	ENST00000518885	FAT3	Q8TDW7	4589 aa		15.05	■□□□□ -0
CNOT7-204	ENST00000518885	CXCL5	P42830	114 aa		15.04	■□□□□ -0
CNOT7-204	ENST00000518885	RAB5B	P61020	215 aa		15.04	■□□□□ -0
CNOT7-204	ENST00000518885	PMVK	Q15126	192 aa		15.04	■□□□□ -0
CNOT7-204	ENST00000518885	GAGE2E	Q4V326	116 aa		15.04	■□□□□ -0
CNOT7-204	ENST00000518885	GAGE2D	Q9UEU5	116 aa		15.04	■□□□□ -0
CNOT7-204	ENST00000518885	CST9L	Q9H4G1	147 aa		15.03	■□□□□ -0
CNOT7-204	ENST00000518885	REG3G	Q6UW15	175 aa		15.02	■□□□□ -0
CNOT7-204	ENST00000518885	LINC00614	P0C842	121 aa		15.01	□□□□□ -0.01
CNOT7-204	ENST00000518885		F8VRH5	84 aa		15	□□□□□ -0.01
CNOT7-204	ENST00000518885	PDZD11	Q5EBL8	140 aa		15	□□□□□ -0.01
CNOT7-204	ENST00000518885	C18orf32	Q8TCD1	76 aa		15	□□□□□ -0.01
CNOT7-204	ENST00000518885		H3BRM9	83 aa		14.99	□□□□□ -0.01
CNOT7-204	ENST00000518885	IGLV5-45	A0A087WSX0	123 aa		14.98	□□□□□ -0.01
CNOT7-204	ENST00000518885	HBD	P02042	147 aa		14.98	□□□□□ -0.01
CNOT7-204	ENST00000518885	PHF5A	Q7RTV0	110 aa	Known RBP	14.98	□□□□□ -0.01
CNOT7-204	ENST00000518885	FAM19A5	Q7Z5A7	132 aa	Predicted RBP	14.98	□□□□□ -0.01
CNOT7-204	ENST00000518885	PSORS1C2	Q9UIG4	136 aa		14.97	□□□□□ -0.01
CNOT7-204	ENST00000518885	SMIM1	B2RUZ4	78 aa		14.96	□□□□□ -0.01
CNOT7-204	ENST00000518885	COX7B2	Q8TF08	81 aa		14.95	□□□□□ -0.02
CNOT7-204	ENST00000518885	FAM168B	A1KXE4	195 aa		14.94	□□□□□ -0.02
CNOT7-204	ENST00000518885	ATP5L	O75964	103 aa		14.94	□□□□□ -0.02
CNOT7-204	ENST00000518885	NDUFA6	P56556	154 aa		14.94	□□□□□ -0.02
CNOT7-204	ENST00000518885	C1orf137	Q5JT78	98 aa		14.94	□□□□□ -0.02
CNOT7-204	ENST00000518885		M0QXV9	152 aa		14.93	□□□□□ -0.02
CNOT7-204	ENST00000518885	SRSF9	Q13242	221 aa	Known RBP eCLIP	14.93	□□□□□ -0.02
CNOT7-204	ENST00000518885	UBE2B	P63146	152 aa		14.92	□□□□□ -0.02
CNOT7-204	ENST00000518885	LINC01600	Q96MT4	127 aa		14.92	□□□□□ -0.02
CNOT7-204	ENST00000518885	MT1HL1	P0DM35	61 aa		14.9	□□□□□ -0.02
CNOT7-204	ENST00000518885		A0A096LNJ9	63 aa		14.89	□□□□□ -0.03
CNOT7-204	ENST00000518885	SPINK8	P0C7L1	97 aa		14.89	□□□□□ -0.03
CNOT7-204	ENST00000518885	IGLC3	P0DOY3	106 aa		14.89	□□□□□ -0.03
CNOT7-204	ENST00000518885	C9orf129	Q5T035	196 aa	Known RBP	14.89	□□□□□ -0.03
CNOT7-204	ENST00000518885	URB1-AS1	Q96HZ7	61 aa		14.89	□□□□□ -0.03
CNOT7-204	ENST00000518885	CHCHD1	Q96BP2	118 aa	Known RBP	14.88	□□□□□ -0.03
CNOT7-204	ENST00000518885	LBH	Q53QV2	105 aa	Predicted RBP	14.87	□□□□□ -0.03
CNOT7-204	ENST00000518885	ODF1	Q14990	250 aa		14.86	□□□□□ -0.03
CNOT7-204	ENST00000518885	PMCHL1	Q16048	86 aa		14.86	□□□□□ -0.03
CNOT7-204	ENST00000518885	DIRC1	Q969H9	104 aa		14.86	□□□□□ -0.03
CNOT7-204	ENST00000518885	YPEL4	Q96NS1	127 aa		14.86	□□□□□ -0.03
CNOT7-204	ENST00000518885	IGLV7-43	P04211	117 aa		14.85	□□□□□ -0.03
CNOT7-204	ENST00000518885	PLA2G2D	Q9UNK4	145 aa		14.85	□□□□□ -0.03
CNOT7-204	ENST00000518885	BAGE3	Q86Y29	109 aa		14.84	□□□□□ -0.03
CNOT7-204	ENST00000518885	XAGE1A	Q9HD64	81 aa		14.84	□□□□□ -0.03
CNOT7-204	ENST00000518885	SFTA2	Q6UW10	78 aa		14.83	□□□□□ -0.04
CNOT7-204	ENST00000518885	ZNF22	P17026	224 aa	Predicted RBP	14.81	□□□□□ -0.04
CNOT7-204	ENST00000518885	KRTAP7-1	Q8IUC3	87 aa		14.81	□□□□□ -0.04
CNOT7-204	ENST00000518885	CBLN2	Q8IUK8	224 aa		14.81	□□□□□ -0.04
CNOT7-204	ENST00000518885	TP73-AS1	Q9UF72	201 aa		14.81	□□□□□ -0.04
CNOT7-204	ENST00000518885	IGLV5-39	A0A0G2JS06	123 aa		14.8	□□□□□ -0.04
CNOT7-204	ENST00000518885	C22orf24	Q9Y442	160 aa		14.8	□□□□□ -0.04
CNOT7-204	ENST00000518885	TMEM170B	Q5T4T1	132 aa		14.79	□□□□□ -0.04
CNOT7-204	ENST00000518885	CHTOP	Q9Y3Y2	248 aa	Known RBP	14.78	□□□□□ -0.04
CNOT7-204	ENST00000518885	NUPR1	O60356	82 aa		14.77	□□□□□ -0.05
CNOT7-204	ENST00000518885	HSBP1	O75506	76 aa		14.77	□□□□□ -0.05
CNOT7-204	ENST00000518885	TRAV12-1	A0A0B4J245	112 aa		14.76	□□□□□ -0.05
CNOT7-204	ENST00000518885	MRPL55	Q7Z7F7	128 aa	Known RBP	14.76	□□□□□ -0.05
CNOT7-204	ENST00000518885	IFI27L1	Q96BM0	104 aa		14.76	□□□□□ -0.05
CNOT7-204	ENST00000518885	HMCN2	Q8NDA2	5059 aa		14.75	□□□□□ -0.05
CNOT7-204	ENST00000518885		H0Y9J4	135 aa		14.75	□□□□□ -0.05
CNOT7-204	ENST00000518885	COX17	Q14061	63 aa		14.75	□□□□□ -0.05
CNOT7-204	ENST00000518885	KRTAP11-1	Q8IUC1	163 aa		14.75	□□□□□ -0.05
CNOT7-204	ENST00000518885	C11orf86	A6NJI1	115 aa		14.74	□□□□□ -0.05
CNOT7-204	ENST00000518885	KRTAP10-8	P60410	259 aa		14.73	□□□□□ -0.05
CNOT7-204	ENST00000518885	NKAPP1	Q8N9T2	125 aa		14.73	□□□□□ -0.05
CNOT7-204	ENST00000518885	TRGC2	P03986	189 aa		14.71	□□□□□ -0.05
CNOT7-204	ENST00000518885	PFN2	P35080	140 aa		14.71	□□□□□ -0.05
CNOT7-204	ENST00000518885	SLC7A5P1	Q8MH63	180 aa		14.71	□□□□□ -0.05
CNOT7-204	ENST00000518885	ERG28	Q9UKR5	140 aa		14.71	□□□□□ -0.05
CNOT7-204	ENST00000518885	TNXB	P22105	4242 aa		14.7	□□□□□ -0.06
CNOT7-204	ENST00000518885	IGLV5-37	A0A075B6J1	123 aa		14.68	□□□□□ -0.06
CNOT7-204	ENST00000518885	ZNF861P	O60384	105 aa		14.67	□□□□□ -0.06
CNOT7-204	ENST00000518885	RPL24	P83731	157 aa	Known RBP	14.66	□□□□□ -0.06
CNOT7-204	ENST00000518885	TMEM223	A0PJW6	202 aa		14.65	□□□□□ -0.06
CNOT7-204	ENST00000518885	LEPROTL1	O95214	131 aa		14.65	□□□□□ -0.06
CNOT7-204	ENST00000518885	RPL28	P46779	137 aa	Known RBP	14.65	□□□□□ -0.06
CNOT7-204	ENST00000518885	FAM19A2	Q8N3H0	131 aa		14.65	□□□□□ -0.06
CNOT7-204	ENST00000518885	LINC00167	Q96N53	147 aa		14.65	□□□□□ -0.06
CNOT7-204	ENST00000518885	BCE1	O60756	84 aa		14.64	□□□□□ -0.07
CNOT7-204	ENST00000518885	IGLV1-50	A0A075B6I6	118 aa		14.63	□□□□□ -0.07
CNOT7-204	ENST00000518885	ZNF625	Q96I27	306 aa	Predicted RBP	14.63	□□□□□ -0.07
CNOT7-204	ENST00000518885	SND1-IT1	Q9HBX3	110 aa		14.63	□□□□□ -0.07
CNOT7-204	ENST00000518885	HSPB8	Q9UJY1	196 aa		14.63	□□□□□ -0.07
CNOT7-204	ENST00000518885	RPL37AP8	A6NKH3	93 aa		14.62	□□□□□ -0.07
CNOT7-204	ENST00000518885	SERF1A	O75920	110 aa		14.62	□□□□□ -0.07
CNOT7-204	ENST00000518885	GAGE10	A6NGK3	116 aa		14.61	□□□□□ -0.07
CNOT7-204	ENST00000518885	RPL13A	P40429	203 aa	Known RBP	14.61	□□□□□ -0.07
CNOT7-204	ENST00000518885		H0Y8G0	127 aa		14.6	□□□□□ -0.07
CNOT7-204	ENST00000518885	ATP6V1G1	O75348	118 aa		14.6	□□□□□ -0.07
CNOT7-204	ENST00000518885	COLCA2	A8K830	154 aa		14.59	□□□□□ -0.07
CNOT7-204	ENST00000518885	LINC00587	B1AMM8	73 aa		14.59	□□□□□ -0.07
CNOT7-204	ENST00000518885	LINC00158	P58513	81 aa		14.59	□□□□□ -0.07
CNOT7-204	ENST00000518885	PLN	P26678	52 aa		14.58	□□□□□ -0.08
CNOT7-204	ENST00000518885	HERV-K104	P63124	156 aa		14.58	□□□□□ -0.08
CNOT7-204	ENST00000518885	PRR26	Q8N8Z3	221 aa		14.58	□□□□□ -0.08
CNOT7-204	ENST00000518885	VPREB1	P12018	145 aa		14.55	□□□□□ -0.08
CNOT7-204	ENST00000518885	UBE2A	P49459	152 aa		14.55	□□□□□ -0.08

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