RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503638.1

PGGT1B-204, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 579 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-204ENST00000503638 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
PGGT1B-204ENST00000503638 Q6ZRU5 148 aa8.67□□□□□ -1.02
PGGT1B-204ENST00000503638 C9orf163Q8N9P6 203 aa8.67□□□□□ -1.02
PGGT1B-204ENST00000503638 DPH3Q96FX2 82 aa8.67□□□□□ -1.02
PGGT1B-204ENST00000503638 C2orf48Q96LS8 159 aa8.67□□□□□ -1.02
PGGT1B-204ENST00000503638 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa8.66□□□□□ -1.02
PGGT1B-204ENST00000503638 SMIM1B2RUZ4 78 aa8.66□□□□□ -1.02
PGGT1B-204ENST00000503638 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
PGGT1B-204ENST00000503638 S100A2P29034 98 aa8.66□□□□□ -1.02
PGGT1B-204ENST00000503638 PMCHL2Q9BQD1 86 aa8.66□□□□□ -1.02
PGGT1B-204ENST00000503638 KRTDAPP60985 99 aa8.65□□□□□ -1.02
PGGT1B-204ENST00000503638 HAMPP81172 84 aa8.65□□□□□ -1.02
PGGT1B-204ENST00000503638 ODF1Q14990 250 aa8.65□□□□□ -1.02
PGGT1B-204ENST00000503638 C2orf82Q6UX34 121 aa8.65□□□□□ -1.02
PGGT1B-204ENST00000503638 COX7B2Q8TF08 81 aa8.65□□□□□ -1.02
PGGT1B-204ENST00000503638 PKIGQ9Y2B9 76 aa8.65□□□□□ -1.02
PGGT1B-204ENST00000503638 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa8.64□□□□□ -1.03
PGGT1B-204ENST00000503638 PLNP26678 52 aa8.64□□□□□ -1.03
PGGT1B-204ENST00000503638 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa8.64□□□□□ -1.03
PGGT1B-204ENST00000503638 Q8IZM0 81 aa8.64□□□□□ -1.03
PGGT1B-204ENST00000503638 APOBP04114 4563 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
PGGT1B-204ENST00000503638 HERC1Q15751 4861 aa8.64□□□□□ -1.03
PGGT1B-204ENST00000503638 F8WDY8 70 aa8.63□□□□□ -1.03
PGGT1B-204ENST00000503638 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa8.63□□□□□ -1.03
PGGT1B-204ENST00000503638 DPM2O94777 84 aa8.63□□□□□ -1.03
PGGT1B-204ENST00000503638 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
PGGT1B-204ENST00000503638 KIAA0087Q14695 138 aa8.62□□□□□ -1.03
PGGT1B-204ENST00000503638 C10orf25Q5T742 122 aa8.62□□□□□ -1.03
PGGT1B-204ENST00000503638 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa8.61□□□□□ -1.03
PGGT1B-204ENST00000503638 C20orf202A1L168 122 aa8.61□□□□□ -1.03
PGGT1B-204ENST00000503638 IGKCP01834 107 aa8.61□□□□□ -1.03
PGGT1B-204ENST00000503638 CHTF8P0CG12 524 aa8.61□□□□□ -1.03
PGGT1B-204ENST00000503638 GAGE2BQ13066 116 aa8.61□□□□□ -1.03
PGGT1B-204ENST00000503638 SDIM1Q6ZPB5 146 aa8.61□□□□□ -1.03
PGGT1B-204ENST00000503638 FAM30AQ9NZY2 134 aa8.61□□□□□ -1.03
PGGT1B-204ENST00000503638 DNAH5Q8TE73 4624 aa8.6□□□□□ -1.03
PGGT1B-204ENST00000503638 CDK2AP2O75956 126 aa8.6□□□□□ -1.03
PGGT1B-204ENST00000503638 CXCL5P42830 114 aa8.6□□□□□ -1.03
PGGT1B-204ENST00000503638 HERVK_113P61574 105 aa8.6□□□□□ -1.03
PGGT1B-204ENST00000503638 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
PGGT1B-204ENST00000503638 MAJINQ3KP22 176 aa8.6□□□□□ -1.03
PGGT1B-204ENST00000503638 HIST3H2BBQ8N257 126 aa8.6□□□□□ -1.03
PGGT1B-204ENST00000503638 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa8.6□□□□□ -1.03
PGGT1B-204ENST00000503638 C6orf48Q9UBA6 75 aa8.6□□□□□ -1.03
PGGT1B-204ENST00000503638 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa8.59□□□□□ -1.03
PGGT1B-204ENST00000503638 TMEM223A0PJW6 202 aa8.59□□□□□ -1.03
PGGT1B-204ENST00000503638 C3orf79P0CE67 100 aa8.59□□□□□ -1.03
PGGT1B-204ENST00000503638 PET117Q6UWS5 81 aa8.59□□□□□ -1.03
PGGT1B-204ENST00000503638 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
PGGT1B-204ENST00000503638 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
PGGT1B-204ENST00000503638 A0A096LNI7 61 aa8.58□□□□□ -1.04
PGGT1B-204ENST00000503638 RNF151Q2KHN1 245 aa8.58□□□□□ -1.04
PGGT1B-204ENST00000503638 GAGE2EQ4V326 116 aa8.58□□□□□ -1.04
PGGT1B-204ENST00000503638 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
PGGT1B-204ENST00000503638 GAGE2DQ9UEU5 116 aa8.58□□□□□ -1.04
PGGT1B-204ENST00000503638 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa8.57□□□□□ -1.04
PGGT1B-204ENST00000503638 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
PGGT1B-204ENST00000503638 SCXQ7RTU7 201 aa8.57□□□□□ -1.04
PGGT1B-204ENST00000503638 HIST1H2BLQ99880 126 aa8.57□□□□□ -1.04
PGGT1B-204ENST00000503638 LINC00474Q9P2X8 69 aa8.57□□□□□ -1.04
PGGT1B-204ENST00000503638 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa8.56□□□□□ -1.04
PGGT1B-204ENST00000503638 PANO1I0J062 215 aa8.56□□□□□ -1.04
PGGT1B-204ENST00000503638 PTTG1IPP53801 180 aa8.56□□□□□ -1.04
PGGT1B-204ENST00000503638 LINC01545Q5VT33 79 aa8.56□□□□□ -1.04
PGGT1B-204ENST00000503638 Q6ZSA8 131 aa8.56□□□□□ -1.04
PGGT1B-204ENST00000503638 Q8N1X5 172 aa8.56□□□□□ -1.04
PGGT1B-204ENST00000503638 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
PGGT1B-204ENST00000503638 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
PGGT1B-204ENST00000503638 XGP55808 180 aa8.55□□□□□ -1.04
PGGT1B-204ENST00000503638 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa8.55□□□□□ -1.04
PGGT1B-204ENST00000503638 SPACA4Q8TDM5 124 aa8.55□□□□□ -1.04
PGGT1B-204ENST00000503638 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa8.54□□□□□ -1.04
PGGT1B-204ENST00000503638 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
PGGT1B-204ENST00000503638 PFN2P35080 140 aa8.54□□□□□ -1.04
PGGT1B-204ENST00000503638 STPG4Q8N801 248 aa8.54□□□□□ -1.04
PGGT1B-204ENST00000503638 PLEKHB2Q96CS7 222 aa8.54□□□□□ -1.04
PGGT1B-204ENST00000503638 A0A087WYN8 130 aa8.53□□□□□ -1.04
PGGT1B-204ENST00000503638 LEPROTO15243 131 aa8.53□□□□□ -1.04
PGGT1B-204ENST00000503638 SFTA2Q6UW10 78 aa8.53□□□□□ -1.04
PGGT1B-204ENST00000503638 Q6ZRP5 223 aa8.53□□□□□ -1.04
PGGT1B-204ENST00000503638 ATOH7Q8N100 152 aa8.53□□□□□ -1.04
PGGT1B-204ENST00000503638 C5orf52A6NGY3 159 aa8.52□□□□□ -1.05
PGGT1B-204ENST00000503638 NDUFA12Q9UI09 145 aa8.52□□□□□ -1.05
PGGT1B-204ENST00000503638 J3QQQ9 107 aa8.51□□□□□ -1.05
PGGT1B-204ENST00000503638 TLX1NBP0CAT3 122 aa8.51□□□□□ -1.05
PGGT1B-204ENST00000503638 MEIG1Q5JSS6 88 aa8.51□□□□□ -1.05
PGGT1B-204ENST00000503638 XAGE1AQ9HD64 81 aa8.51□□□□□ -1.05
PGGT1B-204ENST00000503638 ERG28Q9UKR5 140 aa8.51□□□□□ -1.05
PGGT1B-204ENST00000503638 A0A0U1RRA0 63 aa8.5□□□□□ -1.05
PGGT1B-204ENST00000503638 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa8.5□□□□□ -1.05
PGGT1B-204ENST00000503638 SCGB1D1O95968 90 aa8.5□□□□□ -1.05
PGGT1B-204ENST00000503638 AKR1D1P51857 326 aa8.5□□□□□ -1.05
PGGT1B-204ENST00000503638 LINC00158P58513 81 aa8.5□□□□□ -1.05
PGGT1B-204ENST00000503638 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
PGGT1B-204ENST00000503638 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
PGGT1B-204ENST00000503638 FAT1Q14517 4588 aa8.49□□□□□ -1.05
PGGT1B-204ENST00000503638 TSPEAR-AS2P59090 65 aa8.49□□□□□ -1.05
PGGT1B-204ENST00000503638 E9PLD3 99 aa8.48□□□□□ -1.05
PGGT1B-204ENST00000503638 HERV-K104P63124 156 aa8.48□□□□□ -1.05
PGGT1B-204ENST00000503638 C7orf33Q8WU49 177 aa8.48□□□□□ -1.05
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