RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495399.1

C9orf135-204, Transcript of chromosome 9 open reading frame 135, humanhuman

TSL 2

Gene C9orf135, Length 502 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135-204ENST00000495399 SS18Q15532 418 aa4.75□□□□□ -1.65
C9orf135-204ENST00000495399 LINC00242Q5T6M2 205 aa4.75□□□□□ -1.65
C9orf135-204ENST00000495399 CD164L2Q6UWJ8 174 aa4.75□□□□□ -1.65
C9orf135-204ENST00000495399 TEX43Q6ZNM6 134 aa4.75□□□□□ -1.65
C9orf135-204ENST00000495399 BAGE3Q86Y29 109 aa4.75□□□□□ -1.65
C9orf135-204ENST00000495399 LINC01600Q96MT4 127 aa4.75□□□□□ -1.65
C9orf135-204ENST00000495399 SCGB3A1Q96QR1 104 aa4.75□□□□□ -1.65
C9orf135-204ENST00000495399 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa4.74□□□□□ -1.65
C9orf135-204ENST00000495399 LINC01549A6NIU2 74 aa4.74□□□□□ -1.65
C9orf135-204ENST00000495399 C1orf196B1AJZ1 125 aa4.74□□□□□ -1.65
C9orf135-204ENST00000495399 PRSS1P07477 247 aa4.74□□□□□ -1.65
C9orf135-204ENST00000495399 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa4.74□□□□□ -1.65
C9orf135-204ENST00000495399 FAM19A2Q8N3H0 131 aa4.74□□□□□ -1.65
C9orf135-204ENST00000495399 VCX2Q9H322 139 aa4.74□□□□□ -1.65
C9orf135-204ENST00000495399 HSBP1O75506 76 aa4.73□□□□□ -1.65
C9orf135-204ENST00000495399 Q6ZN92 141 aa4.73□□□□□ -1.65
C9orf135-204ENST00000495399 CST9LQ9H4G1 147 aa4.73□□□□□ -1.65
C9orf135-204ENST00000495399 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
C9orf135-204ENST00000495399 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
C9orf135-204ENST00000495399 PMVKQ15126 192 aa4.72□□□□□ -1.65
C9orf135-204ENST00000495399 HIGD2BQ4VC39 106 aa4.72□□□□□ -1.65
C9orf135-204ENST00000495399 C5orf38Q86SI9 138 aa4.72□□□□□ -1.65
C9orf135-204ENST00000495399 LINC00526Q96FQ7 95 aa4.72□□□□□ -1.65
C9orf135-204ENST00000495399 C2orf88Q9BSF0 95 aa4.72□□□□□ -1.65
C9orf135-204ENST00000495399 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa4.71□□□□□ -1.66
C9orf135-204ENST00000495399 A0A0J9YXV3 536 aa4.71□□□□□ -1.66
C9orf135-204ENST00000495399 COX7A2LO14548 114 aa4.71□□□□□ -1.66
C9orf135-204ENST00000495399 ATP5LO75964 103 aa4.71□□□□□ -1.66
C9orf135-204ENST00000495399 C14orf177Q52M58 125 aa4.71□□□□□ -1.66
C9orf135-204ENST00000495399 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
C9orf135-204ENST00000495399 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa4.71□□□□□ -1.66
C9orf135-204ENST00000495399 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa4.71□□□□□ -1.66
C9orf135-204ENST00000495399 MUC17Q685J3 4493 aa4.7□□□□□ -1.66
C9orf135-204ENST00000495399 A0A087WZ39 114 aa4.7□□□□□ -1.66
C9orf135-204ENST00000495399 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa4.7□□□□□ -1.66
C9orf135-204ENST00000495399 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa4.7□□□□□ -1.66
C9orf135-204ENST00000495399 hDV102S1A0JD36 115 aa4.7□□□□□ -1.66
C9orf135-204ENST00000495399 PANO1I0J062 215 aa4.7□□□□□ -1.66
C9orf135-204ENST00000495399 CNBPP62633 177 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
C9orf135-204ENST00000495399 IFI27L1Q96BM0 104 aa4.7□□□□□ -1.66
C9orf135-204ENST00000495399 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa4.69□□□□□ -1.66
C9orf135-204ENST00000495399 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa4.69□□□□□ -1.66
C9orf135-204ENST00000495399 LEPROTL1O95214 131 aa4.69□□□□□ -1.66
C9orf135-204ENST00000495399 IGLC3P0DOY3 106 aa4.69□□□□□ -1.66
C9orf135-204ENST00000495399 NDUFA6P56556 154 aa4.69□□□□□ -1.66
C9orf135-204ENST00000495399 HERVK_113P63121 156 aa4.69□□□□□ -1.66
C9orf135-204ENST00000495399 KIAA0087Q14695 138 aa4.69□□□□□ -1.66
C9orf135-204ENST00000495399 CFAP161Q6P656 301 aa4.69□□□□□ -1.66
C9orf135-204ENST00000495399 C9orf163Q8N9P6 203 aa4.69□□□□□ -1.66
C9orf135-204ENST00000495399 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa4.68□□□□□ -1.66
C9orf135-204ENST00000495399 FABP4P15090 132 aa4.68□□□□□ -1.66
C9orf135-204ENST00000495399 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP4.68□□□□□ -1.66
C9orf135-204ENST00000495399 MALP21145 153 aa4.68□□□□□ -1.66
C9orf135-204ENST00000495399 SEC11AP67812 179 aa4.68□□□□□ -1.66
C9orf135-204ENST00000495399 LINC01561Q8N1V8 128 aa4.68□□□□□ -1.66
C9orf135-204ENST00000495399 OR10D4PQ8NGN7 298 aa4.68□□□□□ -1.66
C9orf135-204ENST00000495399 ORAOV1Q8WV07 137 aa4.68□□□□□ -1.66
C9orf135-204ENST00000495399 C11orf86A6NJI1 115 aa4.67□□□□□ -1.66
C9orf135-204ENST00000495399 SMIM1B2RUZ4 78 aa4.67□□□□□ -1.66
C9orf135-204ENST00000495399 APOMO95445 188 aa4.67□□□□□ -1.66
C9orf135-204ENST00000495399 SPAG11BQ08648 103 aa4.67□□□□□ -1.66
C9orf135-204ENST00000495399 LINC00469Q8N7U9 141 aa4.67□□□□□ -1.66
C9orf135-204ENST00000495399 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
C9orf135-204ENST00000495399 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
C9orf135-204ENST00000495399 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
C9orf135-204ENST00000495399 F8VRH5 84 aa4.66□□□□□ -1.66
C9orf135-204ENST00000495399 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa4.66□□□□□ -1.66
C9orf135-204ENST00000495399 SPINK8P0C7L1 97 aa4.66□□□□□ -1.66
C9orf135-204ENST00000495399 SYCNQ0VAF6 134 aa4.66□□□□□ -1.66
C9orf135-204ENST00000495399 C10orf25Q5T742 122 aa4.66□□□□□ -1.66
C9orf135-204ENST00000495399 SDIM1Q6ZPB5 146 aa4.66□□□□□ -1.66
C9orf135-204ENST00000495399 DPH3Q96FX2 82 aa4.66□□□□□ -1.66
C9orf135-204ENST00000495399 C2orf48Q96LS8 159 aa4.66□□□□□ -1.66
C9orf135-204ENST00000495399 HSPB8Q9UJY1 196 aa4.66□□□□□ -1.66
C9orf135-204ENST00000495399 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
C9orf135-204ENST00000495399 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa4.65□□□□□ -1.67
C9orf135-204ENST00000495399 H0Y8G0 127 aa4.65□□□□□ -1.67
C9orf135-204ENST00000495399 C2orf82Q6UX34 121 aa4.65□□□□□ -1.67
C9orf135-204ENST00000495399 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa4.65□□□□□ -1.67
C9orf135-204ENST00000495399 Q8IZM0 81 aa4.65□□□□□ -1.67
C9orf135-204ENST00000495399 HIST3H2BBQ8N257 126 aa4.65□□□□□ -1.67
C9orf135-204ENST00000495399 CARD19Q96LW7 228 aa4.65□□□□□ -1.67
C9orf135-204ENST00000495399 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
C9orf135-204ENST00000495399 CAMK2N2Q96S95 79 aa4.65□□□□□ -1.67
C9orf135-204ENST00000495399 PMCHL2Q9BQD1 86 aa4.65□□□□□ -1.67
C9orf135-204ENST00000495399 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa4.64□□□□□ -1.67
C9orf135-204ENST00000495399 C3orf79P0CE67 100 aa4.64□□□□□ -1.67
C9orf135-204ENST00000495399 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
C9orf135-204ENST00000495399 TOMM7Q9P0U1 55 aa4.64□□□□□ -1.67
C9orf135-204ENST00000495399 C6orf48Q9UBA6 75 aa4.64□□□□□ -1.67
C9orf135-204ENST00000495399 A0A096LNI7 61 aa4.63□□□□□ -1.67
C9orf135-204ENST00000495399 TMEM223A0PJW6 202 aa4.63□□□□□ -1.67
C9orf135-204ENST00000495399 F8WDY8 70 aa4.63□□□□□ -1.67
C9orf135-204ENST00000495399 H3BRM9 83 aa4.63□□□□□ -1.67
C9orf135-204ENST00000495399 NDUFA1O15239 70 aa4.63□□□□□ -1.67
C9orf135-204ENST00000495399 CHTF8P0CG12 524 aa4.63□□□□□ -1.67
C9orf135-204ENST00000495399 RNF151Q2KHN1 245 aa4.63□□□□□ -1.67
C9orf135-204ENST00000495399 TMEM170BQ5T4T1 132 aa4.63□□□□□ -1.67
C9orf135-204ENST00000495399 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa4.63□□□□□ -1.67
C9orf135-204ENST00000495399 A0A087WYN8 130 aa4.62□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.1 ms