RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491266.5

RABGGTB-212, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, human

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 961 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RABGGTB-212	ENST00000491266	CFC1	P0CG37	223 aa		4.04	□□□□□ -1.76
RABGGTB-212	ENST00000491266	TSPEAR-AS2	P59090	65 aa		4.04	□□□□□ -1.76
RABGGTB-212	ENST00000491266		Q6ZN92	141 aa		4.04	□□□□□ -1.76
RABGGTB-212	ENST00000491266	TEX43	Q6ZNM6	134 aa		4.04	□□□□□ -1.76
RABGGTB-212	ENST00000491266	CHCHD10	Q8WYQ3	142 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
RABGGTB-212	ENST00000491266	UBE2W	Q96B02	151 aa		4.04	□□□□□ -1.76
RABGGTB-212	ENST00000491266	CDKN2A-AS1	Q9UH64	79 aa		4.04	□□□□□ -1.76
RABGGTB-212	ENST00000491266	CHTOP	Q9Y3Y2	248 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
RABGGTB-212	ENST00000491266	DNAH10	Q8IVF4	4471 aa		4.03	□□□□□ -1.76
RABGGTB-212	ENST00000491266	HYDIN	Q4G0P3	5121 aa		4.03	□□□□□ -1.76
RABGGTB-212	ENST00000491266	TRAV8-3	A0A0A6YYJ7	113 aa		4.03	□□□□□ -1.76
RABGGTB-212	ENST00000491266	TINCR	A0A1B0GVN0	87 aa		4.03	□□□□□ -1.76
RABGGTB-212	ENST00000491266	TMEM223	A0PJW6	202 aa		4.03	□□□□□ -1.76
RABGGTB-212	ENST00000491266	LINC01549	A6NIU2	74 aa		4.03	□□□□□ -1.76
RABGGTB-212	ENST00000491266		M0R2N4	97 aa		4.03	□□□□□ -1.76
RABGGTB-212	ENST00000491266	G0S2	P27469	103 aa		4.03	□□□□□ -1.76
RABGGTB-212	ENST00000491266	XCL1	P47992	114 aa		4.03	□□□□□ -1.76
RABGGTB-212	ENST00000491266	NOTCH2NL	Q7Z3S9	236 aa		4.03	□□□□□ -1.76
RABGGTB-212	ENST00000491266	C5orf38	Q86SI9	138 aa		4.03	□□□□□ -1.76
RABGGTB-212	ENST00000491266	TMEM101	Q96IK0	257 aa		4.03	□□□□□ -1.76
RABGGTB-212	ENST00000491266	TTTY13	Q9BZ97	58 aa		4.03	□□□□□ -1.76
RABGGTB-212	ENST00000491266	KMT2A	Q03164	3969 aa		4.03	□□□□□ -1.76
RABGGTB-212	ENST00000491266	DNAH2	Q9P225	4427 aa		4.03	□□□□□ -1.76
RABGGTB-212	ENST00000491266	DNAH6	Q9C0G6	4158 aa		4.03	□□□□□ -1.77
RABGGTB-212	ENST00000491266	CDK2AP2	O75956	126 aa		4.02	□□□□□ -1.77
RABGGTB-212	ENST00000491266	DPM2	O94777	84 aa		4.02	□□□□□ -1.77
RABGGTB-212	ENST00000491266	LY6G6C	O95867	125 aa		4.02	□□□□□ -1.77
RABGGTB-212	ENST00000491266	KIAA0087	Q14695	138 aa		4.02	□□□□□ -1.77
RABGGTB-212	ENST00000491266	UBE2DNL	Q8IWF7	75 aa		4.02	□□□□□ -1.77
RABGGTB-212	ENST00000491266	LITAF	Q99732	161 aa		4.02	□□□□□ -1.77
RABGGTB-212	ENST00000491266	CHAC1	Q9BUX1	264 aa		4.02	□□□□□ -1.77
RABGGTB-212	ENST00000491266	KRTAP2-2	Q9BYT5	123 aa		4.02	□□□□□ -1.77
RABGGTB-212	ENST00000491266		Q9HAA7	133 aa		4.02	□□□□□ -1.77
RABGGTB-212	ENST00000491266		A0A087WZ39	114 aa		4.01	□□□□□ -1.77
RABGGTB-212	ENST00000491266		A0A087X002	238 aa		4.01	□□□□□ -1.77
RABGGTB-212	ENST00000491266	LCE6A	A0A183	80 aa		4.01	□□□□□ -1.77
RABGGTB-212	ENST00000491266	IGKC	P01834	107 aa		4.01	□□□□□ -1.77
RABGGTB-212	ENST00000491266	SPINK8	P0C7L1	97 aa		4.01	□□□□□ -1.77
RABGGTB-212	ENST00000491266	CD164L2	Q6UWJ8	174 aa		4.01	□□□□□ -1.77
RABGGTB-212	ENST00000491266	LINC00518	Q8N0U6	118 aa		4.01	□□□□□ -1.77
RABGGTB-212	ENST00000491266	C15orf56	Q8N910	161 aa		4.01	□□□□□ -1.77
RABGGTB-212	ENST00000491266	LINC00526	Q96FQ7	95 aa		4.01	□□□□□ -1.77
RABGGTB-212	ENST00000491266	DNAH17	Q9UFH2	4485 aa		4	□□□□□ -1.77
RABGGTB-212	ENST00000491266	RYR3	Q15413	4870 aa		4	□□□□□ -1.77
RABGGTB-212	ENST00000491266	IGHV3-64	A0A075B6Q5	118 aa		4	□□□□□ -1.77
RABGGTB-212	ENST00000491266	TRAV9-2	A0A087WT02	112 aa		4	□□□□□ -1.77
RABGGTB-212	ENST00000491266	LRCOL1	A6NCL2	159 aa		4	□□□□□ -1.77
RABGGTB-212	ENST00000491266	RTL8C	O15255	209 aa		4	□□□□□ -1.77
RABGGTB-212	ENST00000491266	MT3	P25713	68 aa		4	□□□□□ -1.77
RABGGTB-212	ENST00000491266	PKIA	P61925	76 aa		4	□□□□□ -1.77
RABGGTB-212	ENST00000491266	MIA	Q16674	131 aa		4	□□□□□ -1.77
RABGGTB-212	ENST00000491266	PCP2	Q8IVA1	136 aa		4	□□□□□ -1.77
RABGGTB-212	ENST00000491266	C6orf223	Q8N319	242 aa		4	□□□□□ -1.77
RABGGTB-212	ENST00000491266	LINC00469	Q8N7U9	141 aa		4	□□□□□ -1.77
RABGGTB-212	ENST00000491266	C2orf88	Q9BSF0	95 aa		4	□□□□□ -1.77
RABGGTB-212	ENST00000491266	DNAH11	Q96DT5	4516 aa		3.99	□□□□□ -1.77
RABGGTB-212	ENST00000491266	IGKV2D-24	A0A075B6R9	120 aa		3.99	□□□□□ -1.77
RABGGTB-212	ENST00000491266	TRAV8-4	A0A0B4J246	113 aa		3.99	□□□□□ -1.77
RABGGTB-212	ENST00000491266	LECT2	O14960	151 aa		3.99	□□□□□ -1.77
RABGGTB-212	ENST00000491266	SMIM6	P0DI80	62 aa		3.99	□□□□□ -1.77
RABGGTB-212	ENST00000491266	PLN	P26678	52 aa		3.99	□□□□□ -1.77
RABGGTB-212	ENST00000491266	SS18	Q15532	418 aa		3.99	□□□□□ -1.77
RABGGTB-212	ENST00000491266	TMEM170B	Q5T4T1	132 aa		3.99	□□□□□ -1.77
RABGGTB-212	ENST00000491266	PRAC1	Q96KF2	57 aa		3.99	□□□□□ -1.77
RABGGTB-212	ENST00000491266		E9PLD3	99 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RABGGTB-212	ENST00000491266	COX7A2L	O14548	114 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RABGGTB-212	ENST00000491266	LEPROT	O15243	131 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RABGGTB-212	ENST00000491266	FUS	P35637	526 aa	Known RBP eCLIP	3.98	□□□□□ -1.77
RABGGTB-212	ENST00000491266	HERVK_113	P63121	156 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RABGGTB-212	ENST00000491266	SMAGP	Q0VAQ4	97 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RABGGTB-212	ENST00000491266	SRSF9	Q13242	221 aa	Known RBP eCLIP	3.98	□□□□□ -1.77
RABGGTB-212	ENST00000491266	HIGD2B	Q4VC39	106 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RABGGTB-212	ENST00000491266	C2orf82	Q6UX34	121 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RABGGTB-212	ENST00000491266	C10orf126	Q8N4M7	172 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RABGGTB-212	ENST00000491266	PLEKHB2	Q96CS7	222 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF625	Q96I27	306 aa	Predicted RBP	3.98	□□□□□ -1.77
RABGGTB-212	ENST00000491266	C14orf144	Q96I85	54 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RABGGTB-212	ENST00000491266	C12orf57	Q99622	126 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RABGGTB-212	ENST00000491266	PRO1933	Q9H354	126 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RABGGTB-212	ENST00000491266	GEMIN7	Q9H840	131 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
RABGGTB-212	ENST00000491266	IGHV1-58	A0A0C4DH39	117 aa		3.97	□□□□□ -1.77
RABGGTB-212	ENST00000491266	C20orf202	A1L168	122 aa		3.97	□□□□□ -1.77
RABGGTB-212	ENST00000491266	CRP	P02741	224 aa		3.97	□□□□□ -1.77
RABGGTB-212	ENST00000491266	SPATA45	Q537H7	98 aa		3.97	□□□□□ -1.77
RABGGTB-212	ENST00000491266	ADAMTSL4-AS1	Q5T5F5	129 aa		3.97	□□□□□ -1.77
RABGGTB-212	ENST00000491266	C2orf91	Q6ZV80	131 aa		3.97	□□□□□ -1.77
RABGGTB-212	ENST00000491266	LINC01561	Q8N1V8	128 aa		3.97	□□□□□ -1.77
RABGGTB-212	ENST00000491266	FAT2	Q9NYQ8	4349 aa		3.97	□□□□□ -1.77
RABGGTB-212	ENST00000491266		A4D1N5	150 aa		3.96	□□□□□ -1.78
RABGGTB-212	ENST00000491266		J3QQQ9	107 aa		3.96	□□□□□ -1.78
RABGGTB-212	ENST00000491266		K7EP13	123 aa		3.96	□□□□□ -1.78
RABGGTB-212	ENST00000491266	SEC11A	P67812	179 aa		3.96	□□□□□ -1.78
RABGGTB-212	ENST00000491266	C9orf116	Q5BN46	136 aa	Predicted RBP	3.96	□□□□□ -1.78
RABGGTB-212	ENST00000491266	TTC32	Q5I0X7	151 aa		3.96	□□□□□ -1.78
RABGGTB-212	ENST00000491266	UNQ6190/PRO20217	Q6UXQ8	127 aa		3.96	□□□□□ -1.78
RABGGTB-212	ENST00000491266	COX7B2	Q8TF08	81 aa		3.96	□□□□□ -1.78
RABGGTB-212	ENST00000491266	ORAOV1	Q8WV07	137 aa		3.96	□□□□□ -1.78
RABGGTB-212	ENST00000491266	VAMP8	Q9BV40	100 aa		3.96	□□□□□ -1.78
RABGGTB-212	ENST00000491266		A0A087WTM6	91 aa		3.95	□□□□□ -1.78
RABGGTB-212	ENST00000491266	GVQW2	A0A096LPI5	108 aa	Predicted RBP	3.95	□□□□□ -1.78

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 67.7 ms