RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490104.5

TSN-208, Transcript of translin, humanhuman

TSL 2

Gene TSN, Length 2,717 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSN-208ENST00000490104 WFDC2Q14508 124 aa9.25□□□□□ -0.93
TSN-208ENST00000490104 MEIG1Q5JSS6 88 aa9.25□□□□□ -0.93
TSN-208ENST00000490104 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa9.25□□□□□ -0.93
TSN-208ENST00000490104 HIST1H4GQ99525 98 aa9.25□□□□□ -0.93
TSN-208ENST00000490104 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
TSN-208ENST00000490104 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP9.25□□□□□ -0.93
TSN-208ENST00000490104 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa9.25□□□□□ -0.93
TSN-208ENST00000490104 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa9.24□□□□□ -0.93
TSN-208ENST00000490104 PSCAO43653 123 aa9.24□□□□□ -0.93
TSN-208ENST00000490104 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP9.24□□□□□ -0.93
TSN-208ENST00000490104 CKS1BP61024 79 aa9.24□□□□□ -0.93
TSN-208ENST00000490104 C15orf56Q8N910 161 aa9.24□□□□□ -0.93
TSN-208ENST00000490104 SMIM13P0DJ93 91 aa9.24□□□□□ -0.93
TSN-208ENST00000490104 SNHG12Q9BXW3 62 aa9.24□□□□□ -0.93
TSN-208ENST00000490104 PCP4P48539 62 aa9.23□□□□□ -0.93
TSN-208ENST00000490104 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
TSN-208ENST00000490104 KIAA0087Q14695 138 aa9.23□□□□□ -0.93
TSN-208ENST00000490104 FRAS1Q86XX4 4008 aa9.22□□□□□ -0.93
TSN-208ENST00000490104 NDUFA1O15239 70 aa9.22□□□□□ -0.93
TSN-208ENST00000490104 DLEU1O43261 78 aa9.22□□□□□ -0.93
TSN-208ENST00000490104 Q6ZVH6 145 aa9.22□□□□□ -0.93
TSN-208ENST00000490104 USP17L23D6RBM5 183 aa9.21□□□□□ -0.93
TSN-208ENST00000490104 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa9.21□□□□□ -0.93
TSN-208ENST00000490104 FXYD2P54710 66 aa9.21□□□□□ -0.93
TSN-208ENST00000490104 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.94
TSN-208ENST00000490104 K7ERJ3 54 aa9.2□□□□□ -0.94
TSN-208ENST00000490104 APOMO95445 188 aa9.2□□□□□ -0.94
TSN-208ENST00000490104 LINC00158P58513 81 aa9.2□□□□□ -0.94
TSN-208ENST00000490104 Q8IZM0 81 aa9.2□□□□□ -0.94
TSN-208ENST00000490104 SACSQ9NZJ4 4579 aa9.2□□□□□ -0.94
TSN-208ENST00000490104 LINC00476Q8WZB0 136 aa9.19□□□□□ -0.94
TSN-208ENST00000490104 LITAFQ99732 161 aa9.19□□□□□ -0.94
TSN-208ENST00000490104 PTTG1IPP53801 180 aa9.19□□□□□ -0.94
TSN-208ENST00000490104 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa9.18□□□□□ -0.94
TSN-208ENST00000490104 CAMK2N2Q96S95 79 aa9.18□□□□□ -0.94
TSN-208ENST00000490104 LINC01620Q4KN68 170 aa9.18□□□□□ -0.94
TSN-208ENST00000490104 Q6ZRU5 148 aa9.18□□□□□ -0.94
TSN-208ENST00000490104 MUSTN1Q8IVN3 82 aa9.18□□□□□ -0.94
TSN-208ENST00000490104 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
TSN-208ENST00000490104 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa9.17□□□□□ -0.94
TSN-208ENST00000490104 M0R143 59 aa9.17□□□□□ -0.94
TSN-208ENST00000490104 SLPIP03973 132 aa9.17□□□□□ -0.94
TSN-208ENST00000490104 RAB37Q96AX2 223 aa9.17□□□□□ -0.94
TSN-208ENST00000490104 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP9.17□□□□□ -0.94
TSN-208ENST00000490104 HSD52Q0P140 79 aa9.16□□□□□ -0.94
TSN-208ENST00000490104 CEND1Q8N111 149 aa9.16□□□□□ -0.94
TSN-208ENST00000490104 HIGD1BQ9P298 99 aa9.16□□□□□ -0.94
TSN-208ENST00000490104 C6orf48Q9UBA6 75 aa9.16□□□□□ -0.94
TSN-208ENST00000490104 ERG28Q9UKR5 140 aa9.16□□□□□ -0.94
TSN-208ENST00000490104 CBY1Q9Y3M2 126 aa9.16□□□□□ -0.94
TSN-208ENST00000490104 TMEM238C9JI98 176 aa9.15□□□□□ -0.94
TSN-208ENST00000490104 RMI2Q96E14 147 aa9.15□□□□□ -0.94
TSN-208ENST00000490104 ALMS1Q8TCU4 4167 aa9.15□□□□□ -0.95
TSN-208ENST00000490104 C3orf84H3BNL1 204 aa9.15□□□□□ -0.95
TSN-208ENST00000490104 TTC32Q5I0X7 151 aa9.15□□□□□ -0.95
TSN-208ENST00000490104 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa9.15□□□□□ -0.95
TSN-208ENST00000490104 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa9.15□□□□□ -0.95
TSN-208ENST00000490104 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
TSN-208ENST00000490104 XAGE1AQ9HD64 81 aa9.14□□□□□ -0.95
TSN-208ENST00000490104 SFTA2Q6UW10 78 aa9.14□□□□□ -0.95
TSN-208ENST00000490104 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
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TSN-208ENST00000490104 GAGE2DQ9UEU5 116 aa9.13□□□□□ -0.95
TSN-208ENST00000490104 A4D1N5 150 aa9.12□□□□□ -0.95
TSN-208ENST00000490104 H7C2G1 150 aa9.12□□□□□ -0.95
TSN-208ENST00000490104 PRR3P79522 188 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
TSN-208ENST00000490104 DNAH6Q9C0G6 4158 aa9.12□□□□□ -0.95
TSN-208ENST00000490104 HERV-K104P63124 156 aa9.11□□□□□ -0.95
TSN-208ENST00000490104 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
TSN-208ENST00000490104 TM2D2Q9BX73 214 aa9.11□□□□□ -0.95
TSN-208ENST00000490104 LINC01561Q8N1V8 128 aa9.11□□□□□ -0.95
TSN-208ENST00000490104 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
TSN-208ENST00000490104 SYCNQ0VAF6 134 aa9.11□□□□□ -0.95
TSN-208ENST00000490104 Q6ZR54 194 aa9.11□□□□□ -0.95
TSN-208ENST00000490104 LINC00308Q8TCZ7 52 aa9.11□□□□□ -0.95
TSN-208ENST00000490104 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
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TSN-208ENST00000490104 Q8NDZ9 215 aa9.08□□□□□ -0.96
TSN-208ENST00000490104 CARD19Q96LW7 228 aa9.08□□□□□ -0.96
TSN-208ENST00000490104 COX11Q9Y6N1 276 aa9.08□□□□□ -0.96
TSN-208ENST00000490104 DNAH17Q9UFH2 4485 aa9.08□□□□□ -0.96
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TSN-208ENST00000490104 LRCOL1A6NCL2 159 aa9.07□□□□□ -0.96
TSN-208ENST00000490104 SPANXDQ9BXN6 97 aa9.07□□□□□ -0.96
TSN-208ENST00000490104 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa9.07□□□□□ -0.96
TSN-208ENST00000490104 SPANXCQ9NY87 97 aa9.07□□□□□ -0.96
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TSN-208ENST00000490104 TIMM17BO60830 172 aa9.04□□□□□ -0.96
TSN-208ENST00000490104 RPL24P83731 157 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
TSN-208ENST00000490104 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa9.04□□□□□ -0.96
TSN-208ENST00000490104 A0A1B0GV90 55 aa9.04□□□□□ -0.96
TSN-208ENST00000490104 NCR3O14931 201 aa9.04□□□□□ -0.96
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