RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489770.1

SETD3-208, Transcript of SET domain containing 3, human

TSL 5

Gene SETD3, Length 855 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SETD3-208	ENST00000489770	C2orf82	Q6UX34	121 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SETD3-208	ENST00000489770	INMT-MINDY4	F8WBC2	141 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SETD3-208	ENST00000489770	LYZL1	Q6UWQ5	148 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SETD3-208	ENST00000489770	OCC1	Q8TAD7	63 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SETD3-208	ENST00000489770	FAM210A	Q96ND0	272 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SETD3-208	ENST00000489770	C7orf77	A4D0Y5	90 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SETD3-208	ENST00000489770	ATP6V0C	P27449	155 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SETD3-208	ENST00000489770	ACTR3C	Q9C0K3	210 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SETD3-208	ENST00000489770	RNASE7	Q9H1E1	156 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SETD3-208	ENST00000489770	TMEM242	Q9NWH2	141 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SETD3-208	ENST00000489770	TRBV6-5	A0A0K0K1A5	114 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SETD3-208	ENST00000489770		F2Z2F3	143 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SETD3-208	ENST00000489770	MB	P02144	154 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SETD3-208	ENST00000489770	AKR1C3	P42330	323 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SETD3-208	ENST00000489770	TMUB2	Q71RG4	321 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SETD3-208	ENST00000489770	SPRR4	Q96PI1	79 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SETD3-208	ENST00000489770	TCEAL7	Q9BRU2	100 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SETD3-208	ENST00000489770	DEFA1	P59665	94 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SETD3-208	ENST00000489770	RPL32	P62910	135 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SETD3-208	ENST00000489770	ZNF726P1	Q15940	193 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SETD3-208	ENST00000489770		Q6Q795	121 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SETD3-208	ENST00000489770		Q6ZUT4	128 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SETD3-208	ENST00000489770	BAGE2	Q86Y30	109 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SETD3-208	ENST00000489770	GNB1L	Q9BYB4	327 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SETD3-208	ENST00000489770	C9orf92	A6NGG3	77 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SETD3-208	ENST00000489770	SIX6	O95475	246 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SETD3-208	ENST00000489770	KRTAP12-2	P59991	146 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SETD3-208	ENST00000489770	KRTAP10-10	P60014	251 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SETD3-208	ENST00000489770	PSMG3	Q9BT73	122 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SETD3-208	ENST00000489770	CENPX	A8MT69	81 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SETD3-208	ENST00000489770	S100A9	P06702	114 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SETD3-208	ENST00000489770	FHIT	P49789	147 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SETD3-208	ENST00000489770	RPS20	P60866	119 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SETD3-208	ENST00000489770	SERF2	P84101	59 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SETD3-208	ENST00000489770	FAM19A1	Q7Z5A9	133 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SETD3-208	ENST00000489770	TNFSF18	Q9UNG2	199 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SETD3-208	ENST00000489770	TRBV27	A0A0K0K1C4	114 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SETD3-208	ENST00000489770	CCDC160	A6NGH7	325 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SETD3-208	ENST00000489770	POLR2K	P53803	58 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SETD3-208	ENST00000489770	TRIQK	Q629K1	86 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SETD3-208	ENST00000489770	TEX261	Q6UWH6	196 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SETD3-208	ENST00000489770	CBLN2	Q8IUK8	224 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SETD3-208	ENST00000489770	C9orf62	Q8N4C0	152 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SETD3-208	ENST00000489770	FAM104A	Q969W3	186 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SETD3-208	ENST00000489770	CCDC32	Q9BV29	185 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SETD3-208	ENST00000489770	CNFN	Q9BYD5	112 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SETD3-208	ENST00000489770	RAB19	A4D1S5	217 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SETD3-208	ENST00000489770	STOML3	Q8TAV4	291 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SETD3-208	ENST00000489770	PPP1R1C	Q8WVI7	109 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SETD3-208	ENST00000489770	IGKV2-28	A0A075B6P5	120 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SETD3-208	ENST00000489770	CTXND1	A0A1B0GTU2	59 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SETD3-208	ENST00000489770	C5orf52	A6NGY3	159 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SETD3-208	ENST00000489770	IFNA1	P01562	189 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SETD3-208	ENST00000489770	IGKV2D-28	P01615	120 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SETD3-208	ENST00000489770	RPL37	P61927	97 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SETD3-208	ENST00000489770	SMAGP	Q0VAQ4	97 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SETD3-208	ENST00000489770	TIMM21	Q9BVV7	248 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SETD3-208	ENST00000489770	TMEM126A	Q9H061	195 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SETD3-208	ENST00000489770	ST20	Q9HBF5	79 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SETD3-208	ENST00000489770	NUDT15	Q9NV35	164 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SETD3-208	ENST00000489770	PLA2G10	O15496	165 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SETD3-208	ENST00000489770	MPC2	O95563	127 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SETD3-208	ENST00000489770	ATP6V1G2	O95670	118 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SETD3-208	ENST00000489770	GEMIN7	Q9H840	131 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SETD3-208	ENST00000489770	TMEM238	C9JI98	176 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SETD3-208	ENST00000489770		M0R378	163 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SETD3-208	ENST00000489770	KRTAP5-9	P26371	169 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SETD3-208	ENST00000489770	HIGD2A	Q9BW72	106 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SETD3-208	ENST00000489770	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SETD3-208	ENST00000489770	XKRY2	A2RUG3	117 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SETD3-208	ENST00000489770	SCO1	O75880	301 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SETD3-208	ENST00000489770	SSBP3-AS1	Q7Z2R9	100 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SETD3-208	ENST00000489770	ZNF706	Q9Y5V0	76 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SETD3-208	ENST00000489770	TGIF2-C20orf24	A0A0A6YYL0	155 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SETD3-208	ENST00000489770	IGLV6-57	P01721	117 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SETD3-208	ENST00000489770	LGALS3	P17931	250 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SETD3-208	ENST00000489770	S100A5	P33763	92 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SETD3-208	ENST00000489770	H2BFS	P57053	126 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SETD3-208	ENST00000489770	KRTAP5-4	Q6L8H1	288 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SETD3-208	ENST00000489770	LINC01561	Q8N1V8	128 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SETD3-208	ENST00000489770	LYRM1	O43325	122 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SETD3-208	ENST00000489770	PET100	P0DJ07	73 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SETD3-208	ENST00000489770		Q1RN00	199 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SETD3-208	ENST00000489770	LINC00483	Q53H64	154 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SETD3-208	ENST00000489770	LINC01551	Q86U37	167 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SETD3-208	ENST00000489770	NKAPP1	Q8N9T2	125 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SETD3-208	ENST00000489770	IL7	P13232	177 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SETD3-208	ENST00000489770	FCER1G	P30273	86 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SETD3-208	ENST00000489770	CKS1B	P61024	79 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SETD3-208	ENST00000489770	MOBP	Q13875	183 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SETD3-208	ENST00000489770	HBB	P68871	147 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SETD3-208	ENST00000489770	MRPS36	P82909	103 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
SETD3-208	ENST00000489770	SMIM15	Q7Z3B0	74 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SETD3-208	ENST00000489770	KRTAP2-1	Q9BYU5	128 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SETD3-208	ENST00000489770	C20orf202	A1L168	122 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SETD3-208	ENST00000489770	MAP1LC3B2	A6NCE7	125 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SETD3-208	ENST00000489770	RPL35	P42766	123 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
SETD3-208	ENST00000489770	C6orf226	Q5I0X4	101 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SETD3-208	ENST00000489770		Q8IZM0	81 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SETD3-208	ENST00000489770	MAP1LC3B	Q9GZQ8	125 aa		4.78	□□□□□ -1.64

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