RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487507.1

SGIP1-212, Transcript of SH3 domain GRB2 like endophilin interacting protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SGIP1, Length 546 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1-212ENST00000487507 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
SGIP1-212ENST00000487507 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa6.61□□□□□ -1.35
SGIP1-212ENST00000487507 TMEM126AQ9H061 195 aa6.61□□□□□ -1.35
SGIP1-212ENST00000487507 GNG13Q9P2W3 67 aa6.61□□□□□ -1.35
SGIP1-212ENST00000487507 MBD3L1Q8WWY6 194 aa6.6□□□□□ -1.35
SGIP1-212ENST00000487507 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
SGIP1-212ENST00000487507 BIN3Q9NQY0 253 aa6.6□□□□□ -1.35
SGIP1-212ENST00000487507 NRACQ8N912 160 aa6.59□□□□□ -1.35
SGIP1-212ENST00000487507 SMIM12Q96EX1 92 aa6.59□□□□□ -1.35
SGIP1-212ENST00000487507 SPANXA1Q9NS26 97 aa6.59□□□□□ -1.35
SGIP1-212ENST00000487507 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
SGIP1-212ENST00000487507 BORCS7Q96B45 105 aa6.58□□□□□ -1.36
SGIP1-212ENST00000487507 GNB1LQ9BYB4 327 aa6.58□□□□□ -1.36
SGIP1-212ENST00000487507 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa6.57□□□□□ -1.36
SGIP1-212ENST00000487507 F8VRH5 84 aa6.57□□□□□ -1.36
SGIP1-212ENST00000487507 K7EN84 100 aa6.57□□□□□ -1.36
SGIP1-212ENST00000487507 GIPP09681 153 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
SGIP1-212ENST00000487507 H2AFB1P0C5Y9 115 aa6.57□□□□□ -1.36
SGIP1-212ENST00000487507 RAB5BP61020 215 aa6.57□□□□□ -1.36
SGIP1-212ENST00000487507 Q6ZN92 141 aa6.57□□□□□ -1.36
SGIP1-212ENST00000487507 TMEM191AQ9H0A3 160 aa6.57□□□□□ -1.36
SGIP1-212ENST00000487507 MED9Q9NWA0 146 aa6.57□□□□□ -1.36
SGIP1-212ENST00000487507 NEBP20929 6669 aa6.57□□□□□ -1.36
SGIP1-212ENST00000487507 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa6.56□□□□□ -1.36
SGIP1-212ENST00000487507 M0R378 163 aa6.56□□□□□ -1.36
SGIP1-212ENST00000487507 MOBPQ13875 183 aa6.56□□□□□ -1.36
SGIP1-212ENST00000487507 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa6.56□□□□□ -1.36
SGIP1-212ENST00000487507 Q8IZM0 81 aa6.56□□□□□ -1.36
SGIP1-212ENST00000487507 MANBALQ9NQG1 85 aa6.55□□□□□ -1.36
SGIP1-212ENST00000487507 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
SGIP1-212ENST00000487507 GATCO43716 136 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
SGIP1-212ENST00000487507 IFITM3Q01628 133 aa6.54□□□□□ -1.36
SGIP1-212ENST00000487507 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa6.54□□□□□ -1.36
SGIP1-212ENST00000487507 PPP1R2P9O14990 202 aa6.53□□□□□ -1.36
SGIP1-212ENST00000487507 TCAPO15273 167 aa6.53□□□□□ -1.36
SGIP1-212ENST00000487507 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
SGIP1-212ENST00000487507 RPS29P62273 56 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
SGIP1-212ENST00000487507 LINC01561Q8N1V8 128 aa6.53□□□□□ -1.36
SGIP1-212ENST00000487507 OCC1Q8TAD7 63 aa6.53□□□□□ -1.36
SGIP1-212ENST00000487507 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa6.52□□□□□ -1.37
SGIP1-212ENST00000487507 A0A1B0GUT8 65 aa6.52□□□□□ -1.37
SGIP1-212ENST00000487507 PPP1R17O96001 155 aa6.52□□□□□ -1.37
SGIP1-212ENST00000487507 A8MWL6 223 aa6.51□□□□□ -1.37
SGIP1-212ENST00000487507 TMEM141Q96I45 108 aa6.51□□□□□ -1.37
SGIP1-212ENST00000487507 LINC00846Q9NV44 126 aa6.51□□□□□ -1.37
SGIP1-212ENST00000487507 TEX43Q6ZNM6 134 aa6.5□□□□□ -1.37
SGIP1-212ENST00000487507 FAM231DQ6ZW35 169 aa6.5□□□□□ -1.37
SGIP1-212ENST00000487507 TIMM17AQ99595 171 aa6.5□□□□□ -1.37
SGIP1-212ENST00000487507 HIGD1CA8MV81 97 aa6.49□□□□□ -1.37
SGIP1-212ENST00000487507 UMAD1C9J7I0 102 aa6.49□□□□□ -1.37
SGIP1-212ENST00000487507 ARPC5O15511 151 aa6.49□□□□□ -1.37
SGIP1-212ENST00000487507 PDE6DO43924 150 aa6.49□□□□□ -1.37
SGIP1-212ENST00000487507 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
SGIP1-212ENST00000487507 GAGE2AQ6NT46 116 aa6.49□□□□□ -1.37
SGIP1-212ENST00000487507 C2orf88Q9BSF0 95 aa6.49□□□□□ -1.37
SGIP1-212ENST00000487507 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
SGIP1-212ENST00000487507 SCGB1D1O95968 90 aa6.48□□□□□ -1.37
SGIP1-212ENST00000487507 IGLV6-57P01721 117 aa6.48□□□□□ -1.37
SGIP1-212ENST00000487507 MT2AP02795 61 aa6.48□□□□□ -1.37
SGIP1-212ENST00000487507 SMIM2Q9BVW6 85 aa6.48□□□□□ -1.37
SGIP1-212ENST00000487507 NPSP0C0P6 89 aa6.47□□□□□ -1.37
SGIP1-212ENST00000487507 VPREB1P12018 145 aa6.47□□□□□ -1.37
SGIP1-212ENST00000487507 LINC01551Q86U37 167 aa6.47□□□□□ -1.37
SGIP1-212ENST00000487507 AKAP14Q86UN6 197 aa6.47□□□□□ -1.37
SGIP1-212ENST00000487507 SMCR5Q8TEV8 140 aa6.47□□□□□ -1.37
SGIP1-212ENST00000487507 C20orf78Q9BR46 151 aa6.47□□□□□ -1.37
SGIP1-212ENST00000487507 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
SGIP1-212ENST00000487507 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa6.47□□□□□ -1.37
SGIP1-212ENST00000487507 CXCL5P42830 114 aa6.46□□□□□ -1.38
SGIP1-212ENST00000487507 RAB14P61106 215 aa6.46□□□□□ -1.38
SGIP1-212ENST00000487507 CKS2P33552 79 aa6.45□□□□□ -1.38
SGIP1-212ENST00000487507 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa6.45□□□□□ -1.38
SGIP1-212ENST00000487507 S100ZQ8WXG8 99 aa6.45□□□□□ -1.38
SGIP1-212ENST00000487507 PFN2P35080 140 aa6.44□□□□□ -1.38
SGIP1-212ENST00000487507 RIGQ13278 110 aa6.44□□□□□ -1.38
SGIP1-212ENST00000487507 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa6.44□□□□□ -1.38
SGIP1-212ENST00000487507 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa6.44□□□□□ -1.38
SGIP1-212ENST00000487507 MT1FP04733 61 aa6.43□□□□□ -1.38
SGIP1-212ENST00000487507 RPL37P61927 97 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
SGIP1-212ENST00000487507 LINC00483Q53H64 154 aa6.43□□□□□ -1.38
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SGIP1-212ENST00000487507 Q8NDZ9 215 aa6.43□□□□□ -1.38
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SGIP1-212ENST00000487507 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa6.42□□□□□ -1.38
SGIP1-212ENST00000487507 NPYP01303 97 aa6.42□□□□□ -1.38
SGIP1-212ENST00000487507 RAB5AP20339 215 aa6.42□□□□□ -1.38
SGIP1-212ENST00000487507 FAM104BQ5XKR9 115 aa6.42□□□□□ -1.38
SGIP1-212ENST00000487507 VCX2Q9H322 139 aa6.42□□□□□ -1.38
SGIP1-212ENST00000487507 MUC12Q9UKN1 5478 aa6.41□□□□□ -1.38
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SGIP1-212ENST00000487507 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa6.41□□□□□ -1.38
SGIP1-212ENST00000487507 SMIM1B2RUZ4 78 aa6.4□□□□□ -1.38
SGIP1-212ENST00000487507 D6R8Y8 96 aa6.4□□□□□ -1.38
SGIP1-212ENST00000487507 KRTAP10-10P60014 251 aa6.4□□□□□ -1.38
SGIP1-212ENST00000487507 HERVK_113P63121 156 aa6.4□□□□□ -1.38
SGIP1-212ENST00000487507 RPL24P83731 157 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
SGIP1-212ENST00000487507 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa6.4□□□□□ -1.38
SGIP1-212ENST00000487507 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa6.39□□□□□ -1.39
SGIP1-212ENST00000487507 LINC00862A6NCI5 91 aa6.39□□□□□ -1.39
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