RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481875.1

GARNL3-217, Transcript of GTPase activating Rap/RanGAP domain like 3, humanhuman

TSL 4

Gene GARNL3, Length 639 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3-217ENST00000481875 USP17L23D6RBM5 183 aa7.42□□□□□ -1.22
GARNL3-217ENST00000481875 COX7A2LO14548 114 aa7.42□□□□□ -1.22
GARNL3-217ENST00000481875 MALP21145 153 aa7.42□□□□□ -1.22
GARNL3-217ENST00000481875 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
GARNL3-217ENST00000481875 CFAP161Q6P656 301 aa7.42□□□□□ -1.22
GARNL3-217ENST00000481875 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa7.42□□□□□ -1.22
GARNL3-217ENST00000481875 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa7.41□□□□□ -1.22
GARNL3-217ENST00000481875 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa7.41□□□□□ -1.22
GARNL3-217ENST00000481875 C5orf52A6NGY3 159 aa7.41□□□□□ -1.22
GARNL3-217ENST00000481875 KRTDAPP60985 99 aa7.41□□□□□ -1.22
GARNL3-217ENST00000481875 SDIM1Q6ZPB5 146 aa7.41□□□□□ -1.22
GARNL3-217ENST00000481875 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa7.41□□□□□ -1.22
GARNL3-217ENST00000481875 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa7.4□□□□□ -1.22
GARNL3-217ENST00000481875 APOMO95445 188 aa7.4□□□□□ -1.22
GARNL3-217ENST00000481875 IGLC3P0DOY3 106 aa7.4□□□□□ -1.22
GARNL3-217ENST00000481875 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
GARNL3-217ENST00000481875 CNBPP62633 177 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
GARNL3-217ENST00000481875 LINC00469Q8N7U9 141 aa7.4□□□□□ -1.22
GARNL3-217ENST00000481875 HIST1H2BLQ99880 126 aa7.4□□□□□ -1.22
GARNL3-217ENST00000481875 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
GARNL3-217ENST00000481875 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa7.39□□□□□ -1.23
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GARNL3-217ENST00000481875 C3orf79P0CE67 100 aa7.39□□□□□ -1.23
GARNL3-217ENST00000481875 PET117Q6UWS5 81 aa7.39□□□□□ -1.23
GARNL3-217ENST00000481875 Q6ZRU5 148 aa7.39□□□□□ -1.23
GARNL3-217ENST00000481875 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa7.39□□□□□ -1.23
GARNL3-217ENST00000481875 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa7.38□□□□□ -1.23
GARNL3-217ENST00000481875 A0A087WZ39 114 aa7.38□□□□□ -1.23
GARNL3-217ENST00000481875 C11orf86A6NJI1 115 aa7.38□□□□□ -1.23
GARNL3-217ENST00000481875 H3BRM9 83 aa7.38□□□□□ -1.23
GARNL3-217ENST00000481875 TMEM170BQ5T4T1 132 aa7.38□□□□□ -1.23
GARNL3-217ENST00000481875 PMCHL2Q9BQD1 86 aa7.38□□□□□ -1.23
GARNL3-217ENST00000481875 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
GARNL3-217ENST00000481875 UBR4Q5T4S7 5183 aa7.37□□□□□ -1.23
GARNL3-217ENST00000481875 hDV102S1A0JD36 115 aa7.37□□□□□ -1.23
GARNL3-217ENST00000481875 DPM2O94777 84 aa7.37□□□□□ -1.23
GARNL3-217ENST00000481875 MT1HL1P0DM35 61 aa7.37□□□□□ -1.23
GARNL3-217ENST00000481875 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
GARNL3-217ENST00000481875 LINC01561Q8N1V8 128 aa7.37□□□□□ -1.23
GARNL3-217ENST00000481875 ORAOV1Q8WV07 137 aa7.37□□□□□ -1.23
GARNL3-217ENST00000481875 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa7.36□□□□□ -1.23
GARNL3-217ENST00000481875 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa7.36□□□□□ -1.23
GARNL3-217ENST00000481875 C20orf202A1L168 122 aa7.36□□□□□ -1.23
GARNL3-217ENST00000481875 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
GARNL3-217ENST00000481875 PLNP26678 52 aa7.36□□□□□ -1.23
GARNL3-217ENST00000481875 HIGD2BQ4VC39 106 aa7.36□□□□□ -1.23
GARNL3-217ENST00000481875 C15orf56Q8N910 161 aa7.36□□□□□ -1.23
GARNL3-217ENST00000481875 PANO1I0J062 215 aa7.35□□□□□ -1.23
GARNL3-217ENST00000481875 IGKCP01834 107 aa7.35□□□□□ -1.23
GARNL3-217ENST00000481875 PRSS2P07478 247 aa7.35□□□□□ -1.23
GARNL3-217ENST00000481875 SPINK8P0C7L1 97 aa7.35□□□□□ -1.23
GARNL3-217ENST00000481875 LINC01545Q5VT33 79 aa7.35□□□□□ -1.23
GARNL3-217ENST00000481875 OR10D4PQ8NGN7 298 aa7.35□□□□□ -1.23
GARNL3-217ENST00000481875 TOMM7Q9P0U1 55 aa7.35□□□□□ -1.23
GARNL3-217ENST00000481875 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
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GARNL3-217ENST00000481875 LINC00526Q96FQ7 95 aa7.34□□□□□ -1.23
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GARNL3-217ENST00000481875 C6orf226Q5I0X4 101 aa7.33□□□□□ -1.24
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GARNL3-217ENST00000481875 SMIM1B2RUZ4 78 aa7.32□□□□□ -1.24
GARNL3-217ENST00000481875 SCGB1D1O95968 90 aa7.32□□□□□ -1.24
GARNL3-217ENST00000481875 SLPIP03973 132 aa7.32□□□□□ -1.24
GARNL3-217ENST00000481875 AKR1D1P51857 326 aa7.32□□□□□ -1.24
GARNL3-217ENST00000481875 PLAC8Q9NZF1 115 aa7.32□□□□□ -1.24
GARNL3-217ENST00000481875 HERVK_113P61574 105 aa7.31□□□□□ -1.24
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GARNL3-217ENST00000481875 C2orf48Q96LS8 159 aa7.31□□□□□ -1.24
GARNL3-217ENST00000481875 CAMK2N2Q96S95 79 aa7.31□□□□□ -1.24
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GARNL3-217ENST00000481875 F8WDY8 70 aa7.3□□□□□ -1.24
GARNL3-217ENST00000481875 CKS1BP61024 79 aa7.3□□□□□ -1.24
GARNL3-217ENST00000481875 SYCNQ0VAF6 134 aa7.3□□□□□ -1.24
GARNL3-217ENST00000481875 KIAA0087Q14695 138 aa7.3□□□□□ -1.24
GARNL3-217ENST00000481875 Q8IZM0 81 aa7.3□□□□□ -1.24
GARNL3-217ENST00000481875 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa7.29□□□□□ -1.24
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GARNL3-217ENST00000481875 ATOH7Q8N100 152 aa7.29□□□□□ -1.24
GARNL3-217ENST00000481875 CARD19Q96LW7 228 aa7.29□□□□□ -1.24
GARNL3-217ENST00000481875 C2orf82Q6UX34 121 aa7.28□□□□□ -1.24
GARNL3-217ENST00000481875 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa7.28□□□□□ -1.24
GARNL3-217ENST00000481875 STPG4Q8N801 248 aa7.28□□□□□ -1.24
GARNL3-217ENST00000481875 PLEKHB2Q96CS7 222 aa7.28□□□□□ -1.24
GARNL3-217ENST00000481875 LEPROTO15243 131 aa7.27□□□□□ -1.25
GARNL3-217ENST00000481875 CXCL5P42830 114 aa7.27□□□□□ -1.25
GARNL3-217ENST00000481875 HSBP1L1C9JCN9 74 aa7.26□□□□□ -1.25
GARNL3-217ENST00000481875 C10orf25Q5T742 122 aa7.26□□□□□ -1.25
GARNL3-217ENST00000481875 LINC01600Q96MT4 127 aa7.26□□□□□ -1.25
GARNL3-217ENST00000481875 E9PLD3 99 aa7.25□□□□□ -1.25
GARNL3-217ENST00000481875 CHTF8P0CG12 524 aa7.25□□□□□ -1.25
GARNL3-217ENST00000481875 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
GARNL3-217ENST00000481875 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
GARNL3-217ENST00000481875 C7orf33Q8WU49 177 aa7.25□□□□□ -1.25
GARNL3-217ENST00000481875 DPH3Q96FX2 82 aa7.25□□□□□ -1.25
GARNL3-217ENST00000481875 LRP2P98164 4655 aa7.24□□□□□ -1.25
GARNL3-217ENST00000481875 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa7.24□□□□□ -1.25
GARNL3-217ENST00000481875 J3QQQ9 107 aa7.24□□□□□ -1.25
GARNL3-217ENST00000481875 RNF151Q2KHN1 245 aa7.24□□□□□ -1.25
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