RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469694.5

GPC1-208, Transcript of glypican 1, humanhuman

TSL 2

Gene GPC1, Length 2,862 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1-208ENST00000469694 Q6JHZ5 121 aa9.86□□□□□ -0.83
GPC1-208ENST00000469694 RS1O15537 224 aa9.85□□□□□ -0.83
GPC1-208ENST00000469694 DNAL4O96015 105 aa9.85□□□□□ -0.83
GPC1-208ENST00000469694 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
GPC1-208ENST00000469694 RPL28P46779 137 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
GPC1-208ENST00000469694 DSCR8Q96T75 97 aa9.85□□□□□ -0.83
GPC1-208ENST00000469694 INSP01308 110 aa9.84□□□□□ -0.83
GPC1-208ENST00000469694 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
GPC1-208ENST00000469694 LINC00242Q5T6M2 205 aa9.84□□□□□ -0.83
GPC1-208ENST00000469694 C1orf158Q8N1D5 194 aa9.84□□□□□ -0.83
GPC1-208ENST00000469694 LINC01561Q8N1V8 128 aa9.84□□□□□ -0.83
GPC1-208ENST00000469694 LINC00846Q9NV44 126 aa9.84□□□□□ -0.83
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GPC1-208ENST00000469694 C4orf26Q17RF5 130 aa9.83□□□□□ -0.84
GPC1-208ENST00000469694 C14orf132Q9NPU4 83 aa9.83□□□□□ -0.84
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GPC1-208ENST00000469694 LINC00482Q8N8I6 264 aa9.83□□□□□ -0.84
GPC1-208ENST00000469694 C19orf73Q9NVV2 129 aa9.83□□□□□ -0.84
GPC1-208ENST00000469694 BAHCC1Q9P281 2608 aa9.82□□□□□ -0.84
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GPC1-208ENST00000469694 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa9.82□□□□□ -0.84
GPC1-208ENST00000469694 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa9.82□□□□□ -0.84
GPC1-208ENST00000469694 C11orf72Q8NBR9 251 aa9.82□□□□□ -0.84
GPC1-208ENST00000469694 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
GPC1-208ENST00000469694 Q5XG85 94 aa9.82□□□□□ -0.84
GPC1-208ENST00000469694 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa9.82□□□□□ -0.84
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GPC1-208ENST00000469694 OVOL2Q9BRP0 275 aa9.81□□□□□ -0.84
GPC1-208ENST00000469694 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa9.8□□□□□ -0.84
GPC1-208ENST00000469694 A0A087WYN8 130 aa9.8□□□□□ -0.84
GPC1-208ENST00000469694 CYSRT1A8MQ03 144 aa9.79□□□□□ -0.84
GPC1-208ENST00000469694 HRCT1Q6UXD1 115 aa9.79□□□□□ -0.84
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GPC1-208ENST00000469694 IGHV3-53P01767 116 aa9.78□□□□□ -0.84
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GPC1-208ENST00000469694 IGKV2D-28P01615 120 aa9.77□□□□□ -0.85
GPC1-208ENST00000469694 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa9.76□□□□□ -0.85
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GPC1-208ENST00000469694 FHL2Q14192 279 aa9.76□□□□□ -0.85
GPC1-208ENST00000469694 Q6ZTI0 123 aa9.76□□□□□ -0.85
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GPC1-208ENST00000469694 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa9.74□□□□□ -0.85
GPC1-208ENST00000469694 NCR3O14931 201 aa9.74□□□□□ -0.85
GPC1-208ENST00000469694 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa9.73□□□□□ -0.85
GPC1-208ENST00000469694 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa9.73□□□□□ -0.85
GPC1-208ENST00000469694 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa9.73□□□□□ -0.85
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GPC1-208ENST00000469694 NDUFC2O95298 119 aa9.72□□□□□ -0.85
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GPC1-208ENST00000469694 DEFB135Q30KP9 77 aa9.64□□□□□ -0.87
GPC1-208ENST00000469694 ENHOQ6UWT2 76 aa9.64□□□□□ -0.87
GPC1-208ENST00000469694 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa9.63□□□□□ -0.87
GPC1-208ENST00000469694 OXLD1Q5BKU9 147 aa9.63□□□□□ -0.87
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GPC1-208ENST00000469694 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa9.63□□□□□ -0.87
GPC1-208ENST00000469694 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa9.62□□□□□ -0.87
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