RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464611.1

ACTB-208, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 715 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-208ENST00000464611 CHCHD5Q9BSY4 110 aa6□□□□□ -1.45
ACTB-208ENST00000464611 PRO0255Q9UI72 69 aa6□□□□□ -1.45
ACTB-208ENST00000464611 NF1P21359 2839 aa6□□□□□ -1.45
ACTB-208ENST00000464611 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa5.99□□□□□ -1.45
ACTB-208ENST00000464611 PAX4O43316 350 aa5.99□□□□□ -1.45
ACTB-208ENST00000464611 RPL28P46779 137 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
ACTB-208ENST00000464611 APOC4P55056 127 aa5.99□□□□□ -1.45
ACTB-208ENST00000464611 MDFIQ99750 246 aa5.99□□□□□ -1.45
ACTB-208ENST00000464611 A8MZ25 164 aa5.98□□□□□ -1.45
ACTB-208ENST00000464611 SNCGO76070 127 aa5.98□□□□□ -1.45
ACTB-208ENST00000464611 CXCL5P42830 114 aa5.98□□□□□ -1.45
ACTB-208ENST00000464611 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP5.97□□□□□ -1.45
ACTB-208ENST00000464611 CRPP02741 224 aa5.97□□□□□ -1.45
ACTB-208ENST00000464611 GAGE6Q13070 117 aa5.97□□□□□ -1.45
ACTB-208ENST00000464611 COX17Q14061 63 aa5.97□□□□□ -1.45
ACTB-208ENST00000464611 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP5.96□□□□□ -1.46
ACTB-208ENST00000464611 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa5.96□□□□□ -1.46
ACTB-208ENST00000464611 INAFM2P0DMQ5 153 aa5.96□□□□□ -1.46
ACTB-208ENST00000464611 CKS1BP61024 79 aa5.96□□□□□ -1.46
ACTB-208ENST00000464611 GAGE2BQ13066 116 aa5.96□□□□□ -1.46
ACTB-208ENST00000464611 GAGE2EQ4V326 116 aa5.96□□□□□ -1.46
ACTB-208ENST00000464611 C6orf226Q5I0X4 101 aa5.96□□□□□ -1.46
ACTB-208ENST00000464611 Q8IZM0 81 aa5.96□□□□□ -1.46
ACTB-208ENST00000464611 GAGE2DQ9UEU5 116 aa5.96□□□□□ -1.46
ACTB-208ENST00000464611 ATRQ13535 2644 aa5.95□□□□□ -1.46
ACTB-208ENST00000464611 A0A1B0GX51 115 aa5.95□□□□□ -1.46
ACTB-208ENST00000464611 MIFP14174 115 aa5.95□□□□□ -1.46
ACTB-208ENST00000464611 GYPEP15421 78 aa5.95□□□□□ -1.46
ACTB-208ENST00000464611 LINC00158P58513 81 aa5.95□□□□□ -1.46
ACTB-208ENST00000464611 NPC2P61916 151 aa5.95□□□□□ -1.46
ACTB-208ENST00000464611 IMUPQ9GZP8 106 aa5.95□□□□□ -1.46
ACTB-208ENST00000464611 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa5.95□□□□□ -1.46
ACTB-208ENST00000464611 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa5.94□□□□□ -1.46
ACTB-208ENST00000464611 DEFB130BP0DP73 79 aa5.94□□□□□ -1.46
ACTB-208ENST00000464611 DEFB130AP0DP74 79 aa5.94□□□□□ -1.46
ACTB-208ENST00000464611 XGP55808 180 aa5.94□□□□□ -1.46
ACTB-208ENST00000464611 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa5.94□□□□□ -1.46
ACTB-208ENST00000464611 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa5.94□□□□□ -1.46
ACTB-208ENST00000464611 DAND5Q8N907 189 aa5.94□□□□□ -1.46
ACTB-208ENST00000464611 CLEC2BQ92478 149 aa5.94□□□□□ -1.46
ACTB-208ENST00000464611 X6R8D5 127 aa5.94□□□□□ -1.46
ACTB-208ENST00000464611 ANK2Q01484 3957 aa5.93□□□□□ -1.46
ACTB-208ENST00000464611 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa5.93□□□□□ -1.46
ACTB-208ENST00000464611 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa5.93□□□□□ -1.46
ACTB-208ENST00000464611 NDUFC2O95298 119 aa5.93□□□□□ -1.46
ACTB-208ENST00000464611 MT-ATP8P03928 68 aa5.93□□□□□ -1.46
ACTB-208ENST00000464611 BAALC-AS2P0C853 105 aa5.93□□□□□ -1.46
ACTB-208ENST00000464611 CD164L2Q6UWJ8 174 aa5.93□□□□□ -1.46
ACTB-208ENST00000464611 WFDC10AQ9H1F0 79 aa5.93□□□□□ -1.46
ACTB-208ENST00000464611 TOMM7Q9P0U1 55 aa5.93□□□□□ -1.46
ACTB-208ENST00000464611 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa5.92□□□□□ -1.46
ACTB-208ENST00000464611 H3BQ85 93 aa5.92□□□□□ -1.46
ACTB-208ENST00000464611 DNAL4O96015 105 aa5.92□□□□□ -1.46
ACTB-208ENST00000464611 ATP5G1P05496 136 aa5.92□□□□□ -1.46
ACTB-208ENST00000464611 SPART-AS1P0CW21 52 aa5.92□□□□□ -1.46
ACTB-208ENST00000464611 TTC32Q5I0X7 151 aa5.92□□□□□ -1.46
ACTB-208ENST00000464611 WFDC9Q8NEX5 89 aa5.92□□□□□ -1.46
ACTB-208ENST00000464611 CCL18P55774 89 aa5.91□□□□□ -1.46
ACTB-208ENST00000464611 DAD1P61803 113 aa5.91□□□□□ -1.46
ACTB-208ENST00000464611 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa5.91□□□□□ -1.46
ACTB-208ENST00000464611 A0A0U1RRA0 63 aa5.9□□□□□ -1.46
ACTB-208ENST00000464611 H3BNG1 76 aa5.9□□□□□ -1.46
ACTB-208ENST00000464611 CFAP161Q6P656 301 aa5.9□□□□□ -1.46
ACTB-208ENST00000464611 C5orf38Q86SI9 138 aa5.9□□□□□ -1.46
ACTB-208ENST00000464611 LINC00643Q86TS7 51 aa5.9□□□□□ -1.46
ACTB-208ENST00000464611 C15orf53Q8NAA6 179 aa5.9□□□□□ -1.46
ACTB-208ENST00000464611 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
ACTB-208ENST00000464611 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.47
ACTB-208ENST00000464611 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa5.89□□□□□ -1.47
ACTB-208ENST00000464611 MALP21145 153 aa5.89□□□□□ -1.47
ACTB-208ENST00000464611 LELP1Q5T871 98 aa5.89□□□□□ -1.47
ACTB-208ENST00000464611 ANAPC13Q9BS18 74 aa5.89□□□□□ -1.47
ACTB-208ENST00000464611 TMEM126AQ9H061 195 aa5.89□□□□□ -1.47
ACTB-208ENST00000464611 WNK1Q9H4A3 2382 aa5.89□□□□□ -1.47
ACTB-208ENST00000464611 COL6A5A8TX70 2615 aa5.88□□□□□ -1.47
ACTB-208ENST00000464611 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa5.88□□□□□ -1.47
ACTB-208ENST00000464611 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa5.88□□□□□ -1.47
ACTB-208ENST00000464611 GHRHP01286 108 aa5.88□□□□□ -1.47
ACTB-208ENST00000464611 IGKV2D-28P01615 120 aa5.88□□□□□ -1.47
ACTB-208ENST00000464611 LINC00337Q8N6G1 96 aa5.88□□□□□ -1.47
ACTB-208ENST00000464611 SMIM11BQ8TCY0 68 aa5.88□□□□□ -1.47
ACTB-208ENST00000464611 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa5.88□□□□□ -1.47
ACTB-208ENST00000464611 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa5.87□□□□□ -1.47
ACTB-208ENST00000464611 XCL1P47992 114 aa5.87□□□□□ -1.47
ACTB-208ENST00000464611 REG3AQ06141 175 aa5.87□□□□□ -1.47
ACTB-208ENST00000464611 SDIM1Q6ZPB5 146 aa5.87□□□□□ -1.47
ACTB-208ENST00000464611 F8WDY8 70 aa5.86□□□□□ -1.47
ACTB-208ENST00000464611 PFN2P35080 140 aa5.86□□□□□ -1.47
ACTB-208ENST00000464611 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
ACTB-208ENST00000464611 OR13C6PQ8NH95 151 aa5.86□□□□□ -1.47
ACTB-208ENST00000464611 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
ACTB-208ENST00000464611 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa5.86□□□□□ -1.47
ACTB-208ENST00000464611 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
ACTB-208ENST00000464611 A0A0J9YWU9 116 aa5.85□□□□□ -1.47
ACTB-208ENST00000464611 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa5.85□□□□□ -1.47
ACTB-208ENST00000464611 ANGP03950 147 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
ACTB-208ENST00000464611 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa5.85□□□□□ -1.47
ACTB-208ENST00000464611 KIAA0087Q14695 138 aa5.85□□□□□ -1.47
ACTB-208ENST00000464611 S100A7L2Q5SY68 101 aa5.85□□□□□ -1.47
ACTB-208ENST00000464611 LINC00269Q8N2A0 174 aa5.85□□□□□ -1.47
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