RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460759.1

NISCH-203, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 565 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-203ENST00000460759 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa8.64□□□□□ -1.03
NISCH-203ENST00000460759 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa8.64□□□□□ -1.03
NISCH-203ENST00000460759 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
NISCH-203ENST00000460759 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP8.64□□□□□ -1.03
NISCH-203ENST00000460759 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa8.64□□□□□ -1.03
NISCH-203ENST00000460759 CEND1Q8N111 149 aa8.64□□□□□ -1.03
NISCH-203ENST00000460759 TM2D2Q9BX73 214 aa8.64□□□□□ -1.03
NISCH-203ENST00000460759 SPANXDQ9BXN6 97 aa8.64□□□□□ -1.03
NISCH-203ENST00000460759 SPANXCQ9NY87 97 aa8.64□□□□□ -1.03
NISCH-203ENST00000460759 A6NDN8 102 aa8.63□□□□□ -1.03
NISCH-203ENST00000460759 F8WDY8 70 aa8.63□□□□□ -1.03
NISCH-203ENST00000460759 CKS1BP61024 79 aa8.63□□□□□ -1.03
NISCH-203ENST00000460759 EREGO14944 169 aa8.62□□□□□ -1.03
NISCH-203ENST00000460759 SPAG11BQ08648 103 aa8.62□□□□□ -1.03
NISCH-203ENST00000460759 BATFQ16520 125 aa8.62□□□□□ -1.03
NISCH-203ENST00000460759 MEIG1Q5JSS6 88 aa8.62□□□□□ -1.03
NISCH-203ENST00000460759 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa8.62□□□□□ -1.03
NISCH-203ENST00000460759 PPDPFQ9H3Y8 114 aa8.62□□□□□ -1.03
NISCH-203ENST00000460759 IFITM1P13164 125 aa8.61□□□□□ -1.03
NISCH-203ENST00000460759 KIAA0087Q14695 138 aa8.61□□□□□ -1.03
NISCH-203ENST00000460759 LITAFQ99732 161 aa8.61□□□□□ -1.03
NISCH-203ENST00000460759 Q9HAA7 133 aa8.61□□□□□ -1.03
NISCH-203ENST00000460759 PTTG1IPP53801 180 aa8.6□□□□□ -1.03
NISCH-203ENST00000460759 RPL24P83731 157 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
NISCH-203ENST00000460759 RYR2Q92736 4967 aa8.6□□□□□ -1.03
NISCH-203ENST00000460759 COX17Q14061 63 aa8.59□□□□□ -1.03
NISCH-203ENST00000460759 SACSQ9NZJ4 4579 aa8.59□□□□□ -1.03
NISCH-203ENST00000460759 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
NISCH-203ENST00000460759 C3orf84H3BNL1 204 aa8.58□□□□□ -1.04
NISCH-203ENST00000460759 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa8.58□□□□□ -1.04
NISCH-203ENST00000460759 C2orf48Q96LS8 159 aa8.58□□□□□ -1.04
NISCH-203ENST00000460759 DNAH1Q9P2D7 4330 aa8.58□□□□□ -1.04
NISCH-203ENST00000460759 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
NISCH-203ENST00000460759 CSMD3Q7Z407 3707 aa8.57□□□□□ -1.04
NISCH-203ENST00000460759 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa8.57□□□□□ -1.04
NISCH-203ENST00000460759 FXYD2P54710 66 aa8.57□□□□□ -1.04
NISCH-203ENST00000460759 ERG28Q9UKR5 140 aa8.57□□□□□ -1.04
NISCH-203ENST00000460759 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
NISCH-203ENST00000460759 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa8.56□□□□□ -1.04
NISCH-203ENST00000460759 C15orf56Q8N910 161 aa8.56□□□□□ -1.04
NISCH-203ENST00000460759 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
NISCH-203ENST00000460759 STARD9Q9P2P6 4700 aa8.55□□□□□ -1.04
NISCH-203ENST00000460759 A0A1B0GWB2 263 aa8.55□□□□□ -1.04
NISCH-203ENST00000460759 SMIM13P0DJ93 91 aa8.55□□□□□ -1.04
NISCH-203ENST00000460759 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa8.55□□□□□ -1.04
NISCH-203ENST00000460759 MUSTN1Q8IVN3 82 aa8.55□□□□□ -1.04
NISCH-203ENST00000460759 LINC00158P58513 81 aa8.54□□□□□ -1.04
NISCH-203ENST00000460759 C2orf82Q6UX34 121 aa8.54□□□□□ -1.04
NISCH-203ENST00000460759 CAMK2N2Q96S95 79 aa8.54□□□□□ -1.04
NISCH-203ENST00000460759 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa8.54□□□□□ -1.04
NISCH-203ENST00000460759 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
NISCH-203ENST00000460759 VPS13DQ5THJ4 4388 aa8.53□□□□□ -1.04
NISCH-203ENST00000460759 C14orf177Q52M58 125 aa8.53□□□□□ -1.04
NISCH-203ENST00000460759 CASC10Q5T4H9 136 aa8.53□□□□□ -1.04
NISCH-203ENST00000460759 LINC00308Q8TCZ7 52 aa8.53□□□□□ -1.04
NISCH-203ENST00000460759 A0A0B4J2C4 111 aa8.52□□□□□ -1.05
NISCH-203ENST00000460759 USP17L23D6RBM5 183 aa8.52□□□□□ -1.05
NISCH-203ENST00000460759 PSCAO43653 123 aa8.52□□□□□ -1.05
NISCH-203ENST00000460759 HIGD2BQ4VC39 106 aa8.52□□□□□ -1.05
NISCH-203ENST00000460759 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa8.52□□□□□ -1.05
NISCH-203ENST00000460759 TENM2Q9NT68 2774 aa8.52□□□□□ -1.05
NISCH-203ENST00000460759 A4D1N5 150 aa8.51□□□□□ -1.05
NISCH-203ENST00000460759 PFN2P35080 140 aa8.51□□□□□ -1.05
NISCH-203ENST00000460759 RNF151Q2KHN1 245 aa8.51□□□□□ -1.05
NISCH-203ENST00000460759 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa8.51□□□□□ -1.05
NISCH-203ENST00000460759 C6orf223Q8N319 242 aa8.51□□□□□ -1.05
NISCH-203ENST00000460759 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
NISCH-203ENST00000460759 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa8.5□□□□□ -1.05
NISCH-203ENST00000460759 A0A0U1RRA0 63 aa8.5□□□□□ -1.05
NISCH-203ENST00000460759 SYCNQ0VAF6 134 aa8.5□□□□□ -1.05
NISCH-203ENST00000460759 ARL17AQ8IVW1 177 aa8.5□□□□□ -1.05
NISCH-203ENST00000460759 DAND5Q8N907 189 aa8.5□□□□□ -1.05
NISCH-203ENST00000460759 TAX1BP3O14907 124 aa8.49□□□□□ -1.05
NISCH-203ENST00000460759 RAB37Q96AX2 223 aa8.49□□□□□ -1.05
NISCH-203ENST00000460759 C6orf48Q9UBA6 75 aa8.49□□□□□ -1.05
NISCH-203ENST00000460759 LYSTQ99698 3801 aa8.48□□□□□ -1.05
NISCH-203ENST00000460759 CFC1BP0CG36 223 aa8.48□□□□□ -1.05
NISCH-203ENST00000460759 CFC1P0CG37 223 aa8.48□□□□□ -1.05
NISCH-203ENST00000460759 C10orf25Q5T742 122 aa8.48□□□□□ -1.05
NISCH-203ENST00000460759 LINC00476Q8WZB0 136 aa8.48□□□□□ -1.05
NISCH-203ENST00000460759 LINC00526Q96FQ7 95 aa8.48□□□□□ -1.05
NISCH-203ENST00000460759 CARD19Q96LW7 228 aa8.48□□□□□ -1.05
NISCH-203ENST00000460759 ALMS1Q8TCU4 4167 aa8.47□□□□□ -1.05
NISCH-203ENST00000460759 DNAH6Q9C0G6 4158 aa8.47□□□□□ -1.05
NISCH-203ENST00000460759 C9orf118A6NHY6 69 aa8.47□□□□□ -1.05
NISCH-203ENST00000460759 NPC2P61916 151 aa8.47□□□□□ -1.05
NISCH-203ENST00000460759 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa8.47□□□□□ -1.05
NISCH-203ENST00000460759 Q6ZR54 194 aa8.47□□□□□ -1.05
NISCH-203ENST00000460759 Q6ZRU5 148 aa8.47□□□□□ -1.05
NISCH-203ENST00000460759 PRO1854Q9UHT4 67 aa8.47□□□□□ -1.05
NISCH-203ENST00000460759 BIRC6Q9NR09 4857 aa8.47□□□□□ -1.05
NISCH-203ENST00000460759 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa8.46□□□□□ -1.06
NISCH-203ENST00000460759 K7ERJ3 54 aa8.46□□□□□ -1.06
NISCH-203ENST00000460759 NDUFC2O95298 119 aa8.46□□□□□ -1.06
NISCH-203ENST00000460759 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa8.46□□□□□ -1.06
NISCH-203ENST00000460759 PKIGQ9Y2B9 76 aa8.46□□□□□ -1.06
NISCH-203ENST00000460759 LY6G6CO95867 125 aa8.45□□□□□ -1.06
NISCH-203ENST00000460759 TLX1NBP0CAT3 122 aa8.45□□□□□ -1.06
NISCH-203ENST00000460759 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
NISCH-203ENST00000460759 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
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