RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455134.1

GAPDHP28-201, Transcript of glyceraldehyde 3 phosphate dehydrogenase pseudogene 28, humanhuman

BASIC

Gene GAPDHP28, Length 1,003 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPDHP28-201ENST00000455134 UBE2D1P51668 147 aa5.08□□□□□ -1.6
GAPDHP28-201ENST00000455134 PEA15Q15121 130 aa5.08□□□□□ -1.6
GAPDHP28-201ENST00000455134 GAGE2EQ4V326 116 aa5.08□□□□□ -1.6
GAPDHP28-201ENST00000455134 TMEM136Q6ZRR5 245 aa5.08□□□□□ -1.6
GAPDHP28-201ENST00000455134 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa5.08□□□□□ -1.6
GAPDHP28-201ENST00000455134 ORMDL3Q8N138 153 aa5.08□□□□□ -1.6
GAPDHP28-201ENST00000455134 PRELID3AQ96N28 172 aa5.08□□□□□ -1.6
GAPDHP28-201ENST00000455134 GAGE2DQ9UEU5 116 aa5.08□□□□□ -1.6
GAPDHP28-201ENST00000455134 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa5.07□□□□□ -1.6
GAPDHP28-201ENST00000455134 F8W036 122 aa5.07□□□□□ -1.6
GAPDHP28-201ENST00000455134 S100A8P05109 93 aa5.07□□□□□ -1.6
GAPDHP28-201ENST00000455134 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
GAPDHP28-201ENST00000455134 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa5.07□□□□□ -1.6
GAPDHP28-201ENST00000455134 DIRC1Q969H9 104 aa5.07□□□□□ -1.6
GAPDHP28-201ENST00000455134 TMEM141Q96I45 108 aa5.07□□□□□ -1.6
GAPDHP28-201ENST00000455134 AMELXQ99217 191 aa5.07□□□□□ -1.6
GAPDHP28-201ENST00000455134 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa5.06□□□□□ -1.6
GAPDHP28-201ENST00000455134 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa5.06□□□□□ -1.6
GAPDHP28-201ENST00000455134 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa5.06□□□□□ -1.6
GAPDHP28-201ENST00000455134 M0QXV9 152 aa5.06□□□□□ -1.6
GAPDHP28-201ENST00000455134 LINC01561Q8N1V8 128 aa5.06□□□□□ -1.6
GAPDHP28-201ENST00000455134 IGIPA6NJ69 53 aa5.05□□□□□ -1.6
GAPDHP28-201ENST00000455134 C2orf66Q6UXQ4 117 aa5.05□□□□□ -1.6
GAPDHP28-201ENST00000455134 Q8N8P6 123 aa5.05□□□□□ -1.6
GAPDHP28-201ENST00000455134 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
GAPDHP28-201ENST00000455134 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa5.05□□□□□ -1.6
GAPDHP28-201ENST00000455134 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa5.04□□□□□ -1.6
GAPDHP28-201ENST00000455134 RAB5AP20339 215 aa5.04□□□□□ -1.6
GAPDHP28-201ENST00000455134 TEX43Q6ZNM6 134 aa5.04□□□□□ -1.6
GAPDHP28-201ENST00000455134 MAP1LC3AQ9H492 121 aa5.04□□□□□ -1.6
GAPDHP28-201ENST00000455134 CYSLTR1Q9Y271 337 aa5.04□□□□□ -1.6
GAPDHP28-201ENST00000455134 Q8IZM0 81 aa5.03□□□□□ -1.6
GAPDHP28-201ENST00000455134 UBE2BP63146 152 aa5.02□□□□□ -1.61
GAPDHP28-201ENST00000455134 Q6ZN92 141 aa5.02□□□□□ -1.61
GAPDHP28-201ENST00000455134 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
GAPDHP28-201ENST00000455134 XAGE1AQ9HD64 81 aa5.02□□□□□ -1.61
GAPDHP28-201ENST00000455134 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa5.02□□□□□ -1.61
GAPDHP28-201ENST00000455134 NPSP0C0P6 89 aa5.01□□□□□ -1.61
GAPDHP28-201ENST00000455134 ADCYAP1P18509 176 aa5.01□□□□□ -1.61
GAPDHP28-201ENST00000455134 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP5.01□□□□□ -1.61
GAPDHP28-201ENST00000455134 C2orf88Q9BSF0 95 aa5.01□□□□□ -1.61
GAPDHP28-201ENST00000455134 TOMM7Q9P0U1 55 aa5.01□□□□□ -1.61
GAPDHP28-201ENST00000455134 C22orf24Q9Y442 160 aa5.01□□□□□ -1.61
GAPDHP28-201ENST00000455134 A0A087X002 238 aa5□□□□□ -1.61
GAPDHP28-201ENST00000455134 GAGE10A6NGK3 116 aa5□□□□□ -1.61
GAPDHP28-201ENST00000455134 K7EMI3 77 aa5□□□□□ -1.61
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZNF861PO60384 105 aa5□□□□□ -1.61
GAPDHP28-201ENST00000455134 ORMDL2Q53FV1 153 aa5□□□□□ -1.61
GAPDHP28-201ENST00000455134 LINC00518Q8N0U6 118 aa5□□□□□ -1.61
GAPDHP28-201ENST00000455134 TIMM17AQ99595 171 aa5□□□□□ -1.61
GAPDHP28-201ENST00000455134 MUC2Q02817 5179 aa4.99□□□□□ -1.61
GAPDHP28-201ENST00000455134 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa4.99□□□□□ -1.61
GAPDHP28-201ENST00000455134 SMIM1B2RUZ4 78 aa4.99□□□□□ -1.61
GAPDHP28-201ENST00000455134 MT-ND4LP03901 98 aa4.99□□□□□ -1.61
GAPDHP28-201ENST00000455134 HERVK_113P63121 156 aa4.99□□□□□ -1.61
GAPDHP28-201ENST00000455134 KIAA1644Q3SXP7 199 aa4.99□□□□□ -1.61
GAPDHP28-201ENST00000455134 TOMM6Q96B49 74 aa4.99□□□□□ -1.61
GAPDHP28-201ENST00000455134 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
GAPDHP28-201ENST00000455134 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
GAPDHP28-201ENST00000455134 MUC17Q685J3 4493 aa4.98□□□□□ -1.61
GAPDHP28-201ENST00000455134 LINC01546A6NGU7 62 aa4.98□□□□□ -1.61
GAPDHP28-201ENST00000455134 F8VRH5 84 aa4.98□□□□□ -1.61
GAPDHP28-201ENST00000455134 NUPR1O60356 82 aa4.98□□□□□ -1.61
GAPDHP28-201ENST00000455134 PRSS2P07478 247 aa4.98□□□□□ -1.61
GAPDHP28-201ENST00000455134 CKS1BP61024 79 aa4.98□□□□□ -1.61
GAPDHP28-201ENST00000455134 C6orf226Q5I0X4 101 aa4.98□□□□□ -1.61
GAPDHP28-201ENST00000455134 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa4.98□□□□□ -1.61
GAPDHP28-201ENST00000455134 CTDSP1Q9GZU7 261 aa4.98□□□□□ -1.61
GAPDHP28-201ENST00000455134 TP73-AS1Q9UF72 201 aa4.98□□□□□ -1.61
GAPDHP28-201ENST00000455134 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
GAPDHP28-201ENST00000455134 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
GAPDHP28-201ENST00000455134 ERASQ7Z444 233 aa4.97□□□□□ -1.61
GAPDHP28-201ENST00000455134 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
GAPDHP28-201ENST00000455134 LINC00167Q96N53 147 aa4.97□□□□□ -1.61
GAPDHP28-201ENST00000455134 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa4.96□□□□□ -1.62
GAPDHP28-201ENST00000455134 CXCL5P42830 114 aa4.96□□□□□ -1.62
GAPDHP28-201ENST00000455134 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa4.96□□□□□ -1.62
GAPDHP28-201ENST00000455134 A0A096LNJ9 63 aa4.95□□□□□ -1.62
GAPDHP28-201ENST00000455134 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa4.95□□□□□ -1.62
GAPDHP28-201ENST00000455134 RPL37AP8A6NKH3 93 aa4.95□□□□□ -1.62
GAPDHP28-201ENST00000455134 PCP4L1A6NKN8 68 aa4.95□□□□□ -1.62
GAPDHP28-201ENST00000455134 BCE1O60756 84 aa4.95□□□□□ -1.62
GAPDHP28-201ENST00000455134 SEC11AP67812 179 aa4.95□□□□□ -1.62
GAPDHP28-201ENST00000455134 PRR4Q16378 134 aa4.95□□□□□ -1.62
GAPDHP28-201ENST00000455134 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
GAPDHP28-201ENST00000455134 PDZD11Q5EBL8 140 aa4.95□□□□□ -1.62
GAPDHP28-201ENST00000455134 CLLU1Q5K131 121 aa4.95□□□□□ -1.62
GAPDHP28-201ENST00000455134 COX7B2Q8TF08 81 aa4.95□□□□□ -1.62
GAPDHP28-201ENST00000455134 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
GAPDHP28-201ENST00000455134 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa4.94□□□□□ -1.62
GAPDHP28-201ENST00000455134 SCO1O75880 301 aa4.94□□□□□ -1.62
GAPDHP28-201ENST00000455134 SPINK8P0C7L1 97 aa4.94□□□□□ -1.62
GAPDHP28-201ENST00000455134 IFITM2Q01629 132 aa4.94□□□□□ -1.62
GAPDHP28-201ENST00000455134 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa4.94□□□□□ -1.62
GAPDHP28-201ENST00000455134 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa4.94□□□□□ -1.62
GAPDHP28-201ENST00000455134 SCGB3A1Q96QR1 104 aa4.94□□□□□ -1.62
GAPDHP28-201ENST00000455134 CST9LQ9H4G1 147 aa4.94□□□□□ -1.62
GAPDHP28-201ENST00000455134 ANAPC11Q9NYG5 84 aa4.94□□□□□ -1.62
GAPDHP28-201ENST00000455134 TSPAN13O95857 204 aa4.93□□□□□ -1.62
GAPDHP28-201ENST00000455134 RPL28P46779 137 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.5 ms