RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453727.6

LMO3-210, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 5

Gene LMO3, Length 2,403 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-210ENST00000453727 LINC00467Q9BRT7 94 aa6.09□□□□□ -1.43
LMO3-210ENST00000453727 A0A0J9YXV3 536 aa6.08□□□□□ -1.44
LMO3-210ENST00000453727 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
LMO3-210ENST00000453727 A0A0U1RQV1 116 aa6.08□□□□□ -1.44
LMO3-210ENST00000453727 F5H697 171 aa6.08□□□□□ -1.44
LMO3-210ENST00000453727 FAM222AQ5U5X8 452 aa6.08□□□□□ -1.44
LMO3-210ENST00000453727 C11orf72Q8NBR9 251 aa6.08□□□□□ -1.44
LMO3-210ENST00000453727 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa6.08□□□□□ -1.44
LMO3-210ENST00000453727 NOTCH1P46531 2555 aa6.08□□□□□ -1.44
LMO3-210ENST00000453727 MGAM2Q2M2H8 2515 aa6.07□□□□□ -1.44
LMO3-210ENST00000453727 SMIM26A0A096LP01 95 aa6.07□□□□□ -1.44
LMO3-210ENST00000453727 KRTAP10-11P60412 298 aa6.07□□□□□ -1.44
LMO3-210ENST00000453727 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa6.07□□□□□ -1.44
LMO3-210ENST00000453727 LINC01561Q8N1V8 128 aa6.07□□□□□ -1.44
LMO3-210ENST00000453727 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa6.07□□□□□ -1.44
LMO3-210ENST00000453727 BRK1Q8WUW1 75 aa6.07□□□□□ -1.44
LMO3-210ENST00000453727 CMYA5Q8N3K9 4069 aa6.07□□□□□ -1.44
LMO3-210ENST00000453727 A0A087WWL8 130 aa6.07□□□□□ -1.44
LMO3-210ENST00000453727 LINC00315P59091 139 aa6.07□□□□□ -1.44
LMO3-210ENST00000453727 GHRHP01286 108 aa6.06□□□□□ -1.44
LMO3-210ENST00000453727 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
LMO3-210ENST00000453727 C20orf197Q8N268 126 aa6.06□□□□□ -1.44
LMO3-210ENST00000453727 COPS9Q8WXC6 57 aa6.06□□□□□ -1.44
LMO3-210ENST00000453727 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa6.06□□□□□ -1.44
LMO3-210ENST00000453727 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa6.05□□□□□ -1.44
LMO3-210ENST00000453727 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa6.05□□□□□ -1.44
LMO3-210ENST00000453727 FAM74A4Q5TZK3 123 aa6.05□□□□□ -1.44
LMO3-210ENST00000453727 EPM2AB3EWF7 344 aa6.05□□□□□ -1.44
LMO3-210ENST00000453727 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa6.05□□□□□ -1.44
LMO3-210ENST00000453727 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
LMO3-210ENST00000453727 SUMO4Q6EEV6 95 aa6.05□□□□□ -1.44
LMO3-210ENST00000453727 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa6.05□□□□□ -1.44
LMO3-210ENST00000453727 NACAE9PAV3 2078 aa6.04□□□□□ -1.44
LMO3-210ENST00000453727 TIMM17BO60830 172 aa6.04□□□□□ -1.44
LMO3-210ENST00000453727 XCL1P47992 114 aa6.04□□□□□ -1.44
LMO3-210ENST00000453727 IL17DQ8TAD2 202 aa6.04□□□□□ -1.44
LMO3-210ENST00000453727 LINC00846Q9NV44 126 aa6.04□□□□□ -1.44
LMO3-210ENST00000453727 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa6.03□□□□□ -1.44
LMO3-210ENST00000453727 PLAC8L1A1L4L8 177 aa6.03□□□□□ -1.44
LMO3-210ENST00000453727 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa6.03□□□□□ -1.44
LMO3-210ENST00000453727 VSIG2Q96IQ7 327 aa6.03□□□□□ -1.44
LMO3-210ENST00000453727 C14orf132Q9NPU4 83 aa6.03□□□□□ -1.44
LMO3-210ENST00000453727 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa6.03□□□□□ -1.44
LMO3-210ENST00000453727 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa6.03□□□□□ -1.44
LMO3-210ENST00000453727 APOC4P55056 127 aa6.03□□□□□ -1.44
LMO3-210ENST00000453727 C16orf74Q96GX8 76 aa6.03□□□□□ -1.44
LMO3-210ENST00000453727 Q9HAA7 133 aa6.03□□□□□ -1.44
LMO3-210ENST00000453727 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa6.02□□□□□ -1.45
LMO3-210ENST00000453727 C20orf203Q8NBC4 194 aa6.02□□□□□ -1.45
LMO3-210ENST00000453727 C22orf24Q9Y442 160 aa6.02□□□□□ -1.45
LMO3-210ENST00000453727 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa6.01□□□□□ -1.45
LMO3-210ENST00000453727 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa6.01□□□□□ -1.45
LMO3-210ENST00000453727 S100A7L2Q5SY68 101 aa6.01□□□□□ -1.45
LMO3-210ENST00000453727 Q6ZTI0 123 aa6.01□□□□□ -1.45
LMO3-210ENST00000453727 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
LMO3-210ENST00000453727 M0QY20 66 aa6.01□□□□□ -1.45
LMO3-210ENST00000453727 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
LMO3-210ENST00000453727 DEFB135Q30KP9 77 aa6.01□□□□□ -1.45
LMO3-210ENST00000453727 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
LMO3-210ENST00000453727 LINC00308Q8TCZ7 52 aa6.01□□□□□ -1.45
LMO3-210ENST00000453727 OVOL2Q9BRP0 275 aa6.01□□□□□ -1.45
LMO3-210ENST00000453727 X6R8D5 127 aa6.01□□□□□ -1.45
LMO3-210ENST00000453727 A8MZ25 164 aa6□□□□□ -1.45
LMO3-210ENST00000453727 H7BZZ5 65 aa6□□□□□ -1.45
LMO3-210ENST00000453727 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa6□□□□□ -1.45
LMO3-210ENST00000453727 FAM218AQ96MZ4 157 aa6□□□□□ -1.45
LMO3-210ENST00000453727 RPL28P46779 137 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
LMO3-210ENST00000453727 RBM3P98179 157 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
LMO3-210ENST00000453727 Q6ZSN1 163 aa5.99□□□□□ -1.45
LMO3-210ENST00000453727 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa5.99□□□□□ -1.45
LMO3-210ENST00000453727 DNAH3Q8TD57 4116 aa5.99□□□□□ -1.45
LMO3-210ENST00000453727 A0A0U1RRA0 63 aa5.98□□□□□ -1.45
LMO3-210ENST00000453727 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
LMO3-210ENST00000453727 Q9UF83 564 aa5.98□□□□□ -1.45
LMO3-210ENST00000453727 DNHD1Q96M86 4753 aa5.98□□□□□ -1.45
LMO3-210ENST00000453727 IGHV3-53P01767 116 aa5.98□□□□□ -1.45
LMO3-210ENST00000453727 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa5.97□□□□□ -1.45
LMO3-210ENST00000453727 NDUFA1O15239 70 aa5.97□□□□□ -1.45
LMO3-210ENST00000453727 C6orf226Q5I0X4 101 aa5.97□□□□□ -1.45
LMO3-210ENST00000453727 TRGV2A0A075B6R0 118 aa5.97□□□□□ -1.45
LMO3-210ENST00000453727 K7EIL1 84 aa5.97□□□□□ -1.45
LMO3-210ENST00000453727 LYPD5Q6UWN5 251 aa5.97□□□□□ -1.45
LMO3-210ENST00000453727 DEFB4AO15263 64 aa5.96□□□□□ -1.45
LMO3-210ENST00000453727 CCKP06307 115 aa5.96□□□□□ -1.45
LMO3-210ENST00000453727 ENHOQ6UWT2 76 aa5.96□□□□□ -1.45
LMO3-210ENST00000453727 LINC00474Q9P2X8 69 aa5.96□□□□□ -1.45
LMO3-210ENST00000453727 TRAV7A0A075B6U4 112 aa5.96□□□□□ -1.46
LMO3-210ENST00000453727 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa5.96□□□□□ -1.46
LMO3-210ENST00000453727 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa5.96□□□□□ -1.46
LMO3-210ENST00000453727 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
LMO3-210ENST00000453727 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
LMO3-210ENST00000453727 DEFB130BP0DP73 79 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-210ENST00000453727 DEFB130AP0DP74 79 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-210ENST00000453727 KLKP1Q107X0 134 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-210ENST00000453727 PMAIP1Q13794 54 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-210ENST00000453727 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
LMO3-210ENST00000453727 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-210ENST00000453727 LINC00612Q8N6U2 182 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-210ENST00000453727 Q9H8V8 135 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO3-210ENST00000453727 F8WEM9 126 aa5.95□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.7 ms