RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442691.6

NR1I3-211, Transcript of nuclear receptor subfamily 1 group I member 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NR1I3, Length 1,114 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1I3-211ENST00000442691 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa6.11□□□□□ -1.43
NR1I3-211ENST00000442691 MUC7Q8TAX7 377 aa6.11□□□□□ -1.43
NR1I3-211ENST00000442691 COPS9Q8WXC6 57 aa6.11□□□□□ -1.43
NR1I3-211ENST00000442691 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa6.11□□□□□ -1.43
NR1I3-211ENST00000442691 Q9H8V8 135 aa6.11□□□□□ -1.43
NR1I3-211ENST00000442691 PRSS2P07478 247 aa6.1□□□□□ -1.43
NR1I3-211ENST00000442691 PTTG1IPP53801 180 aa6.1□□□□□ -1.43
NR1I3-211ENST00000442691 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
NR1I3-211ENST00000442691 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa6.1□□□□□ -1.43
NR1I3-211ENST00000442691 CLPSL2Q6UWE3 100 aa6.1□□□□□ -1.43
NR1I3-211ENST00000442691 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa6.1□□□□□ -1.43
NR1I3-211ENST00000442691 TM2D2Q9BX73 214 aa6.1□□□□□ -1.43
NR1I3-211ENST00000442691 TTTY13Q9BZ97 58 aa6.1□□□□□ -1.43
NR1I3-211ENST00000442691 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
NR1I3-211ENST00000442691 FBN3Q75N90 2809 aa6.09□□□□□ -1.43
NR1I3-211ENST00000442691 GAGE12HA6NDE8 117 aa6.09□□□□□ -1.43
NR1I3-211ENST00000442691 IFITM1P13164 125 aa6.09□□□□□ -1.43
NR1I3-211ENST00000442691 CFAP161Q6P656 301 aa6.09□□□□□ -1.43
NR1I3-211ENST00000442691 C5orf38Q86SI9 138 aa6.09□□□□□ -1.43
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NR1I3-211ENST00000442691 SPANXCQ9NY87 97 aa6.09□□□□□ -1.43
NR1I3-211ENST00000442691 COX17Q14061 63 aa6.08□□□□□ -1.44
NR1I3-211ENST00000442691 C6orf226Q5I0X4 101 aa6.08□□□□□ -1.44
NR1I3-211ENST00000442691 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa6.08□□□□□ -1.44
NR1I3-211ENST00000442691 HIST1H4GQ99525 98 aa6.08□□□□□ -1.44
NR1I3-211ENST00000442691 SNHG12Q9BXW3 62 aa6.08□□□□□ -1.44
NR1I3-211ENST00000442691 DNAH7Q8WXX0 4024 aa6.08□□□□□ -1.44
NR1I3-211ENST00000442691 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa6.07□□□□□ -1.44
NR1I3-211ENST00000442691 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
NR1I3-211ENST00000442691 A6NDN8 102 aa6.07□□□□□ -1.44
NR1I3-211ENST00000442691 C3orf84H3BNL1 204 aa6.07□□□□□ -1.44
NR1I3-211ENST00000442691 KIAA0087Q14695 138 aa6.07□□□□□ -1.44
NR1I3-211ENST00000442691 CEND1Q8N111 149 aa6.07□□□□□ -1.44
NR1I3-211ENST00000442691 ORAOV1Q8WV07 137 aa6.07□□□□□ -1.44
NR1I3-211ENST00000442691 C2orf48Q96LS8 159 aa6.07□□□□□ -1.44
NR1I3-211ENST00000442691 LITAFQ99732 161 aa6.07□□□□□ -1.44
NR1I3-211ENST00000442691 KRTAP23-1A1A580 65 aa6.06□□□□□ -1.44
NR1I3-211ENST00000442691 CKS1BP61024 79 aa6.06□□□□□ -1.44
NR1I3-211ENST00000442691 SPAG11BQ08648 103 aa6.06□□□□□ -1.44
NR1I3-211ENST00000442691 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP6.06□□□□□ -1.44
NR1I3-211ENST00000442691 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa6.06□□□□□ -1.44
NR1I3-211ENST00000442691 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa6.05□□□□□ -1.44
NR1I3-211ENST00000442691 A0A1B0GWB2 263 aa6.05□□□□□ -1.44
NR1I3-211ENST00000442691 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
NR1I3-211ENST00000442691 RPL24P83731 157 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
NR1I3-211ENST00000442691 TOMM7Q9P0U1 55 aa6.05□□□□□ -1.44
NR1I3-211ENST00000442691 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa6.04□□□□□ -1.44
NR1I3-211ENST00000442691 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa6.04□□□□□ -1.44
NR1I3-211ENST00000442691 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
NR1I3-211ENST00000442691 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa6.03□□□□□ -1.44
NR1I3-211ENST00000442691 MEIG1Q5JSS6 88 aa6.03□□□□□ -1.44
NR1I3-211ENST00000442691 ARL17AQ8IVW1 177 aa6.03□□□□□ -1.44
NR1I3-211ENST00000442691 C15orf56Q8N910 161 aa6.03□□□□□ -1.44
NR1I3-211ENST00000442691 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
NR1I3-211ENST00000442691 ERG28Q9UKR5 140 aa6.03□□□□□ -1.44
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NR1I3-211ENST00000442691 CASC10Q5T4H9 136 aa6.01□□□□□ -1.45
NR1I3-211ENST00000442691 LINC00308Q8TCZ7 52 aa6.01□□□□□ -1.45
NR1I3-211ENST00000442691 BATFQ16520 125 aa6□□□□□ -1.45
NR1I3-211ENST00000442691 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa6□□□□□ -1.45
NR1I3-211ENST00000442691 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa6□□□□□ -1.45
NR1I3-211ENST00000442691 PKIGQ9Y2B9 76 aa6□□□□□ -1.45
NR1I3-211ENST00000442691 CSMD3Q7Z407 3707 aa5.99□□□□□ -1.45
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NR1I3-211ENST00000442691 SMIM13P0DJ93 91 aa5.99□□□□□ -1.45
NR1I3-211ENST00000442691 LINC00158P58513 81 aa5.99□□□□□ -1.45
NR1I3-211ENST00000442691 C2orf82Q6UX34 121 aa5.99□□□□□ -1.45
NR1I3-211ENST00000442691 Q6ZR54 194 aa5.99□□□□□ -1.45
NR1I3-211ENST00000442691 MUSTN1Q8IVN3 82 aa5.99□□□□□ -1.45
NR1I3-211ENST00000442691 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa5.99□□□□□ -1.45
NR1I3-211ENST00000442691 CAMK2N2Q96S95 79 aa5.99□□□□□ -1.45
NR1I3-211ENST00000442691 STARD9Q9P2P6 4700 aa5.99□□□□□ -1.45
NR1I3-211ENST00000442691 PSCAO43653 123 aa5.98□□□□□ -1.45
NR1I3-211ENST00000442691 NDUFC2O95298 119 aa5.98□□□□□ -1.45
NR1I3-211ENST00000442691 TLX1NBP0CAT3 122 aa5.98□□□□□ -1.45
NR1I3-211ENST00000442691 SYCNQ0VAF6 134 aa5.98□□□□□ -1.45
NR1I3-211ENST00000442691 LINC00476Q8WZB0 136 aa5.98□□□□□ -1.45
NR1I3-211ENST00000442691 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
NR1I3-211ENST00000442691 A4D1N5 150 aa5.97□□□□□ -1.45
NR1I3-211ENST00000442691 CNBPP62633 177 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
NR1I3-211ENST00000442691 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa5.97□□□□□ -1.45
NR1I3-211ENST00000442691 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP5.97□□□□□ -1.45
NR1I3-211ENST00000442691 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa5.96□□□□□ -1.46
NR1I3-211ENST00000442691 TAX1BP3O14907 124 aa5.96□□□□□ -1.46
NR1I3-211ENST00000442691 TRIAP1O43715 76 aa5.96□□□□□ -1.46
NR1I3-211ENST00000442691 CFC1BP0CG36 223 aa5.96□□□□□ -1.46
NR1I3-211ENST00000442691 CFC1P0CG37 223 aa5.96□□□□□ -1.46
NR1I3-211ENST00000442691 PFN2P35080 140 aa5.96□□□□□ -1.46
NR1I3-211ENST00000442691 HIGD2BQ4VC39 106 aa5.96□□□□□ -1.46
NR1I3-211ENST00000442691 CARD19Q96LW7 228 aa5.96□□□□□ -1.46
NR1I3-211ENST00000442691 C6orf48Q9UBA6 75 aa5.96□□□□□ -1.46
NR1I3-211ENST00000442691 PRO1854Q9UHT4 67 aa5.96□□□□□ -1.46
NR1I3-211ENST00000442691 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
NR1I3-211ENST00000442691 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa5.95□□□□□ -1.46
NR1I3-211ENST00000442691 C10orf25Q5T742 122 aa5.95□□□□□ -1.46
NR1I3-211ENST00000442691 LYRM7Q5U5X0 104 aa5.95□□□□□ -1.46
NR1I3-211ENST00000442691 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa5.95□□□□□ -1.46
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