RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439415.1

CBX1P4-201, Transcript of chromobox 1 pseudogene 4, humanhuman

BASIC

Gene CBX1P4, Length 457 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P4-201ENST00000439415 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP2.47□□□□□ -2.01
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CBX1P4-201ENST00000439415 TSKUQ8WUA8 353 aa2.47□□□□□ -2.01
CBX1P4-201ENST00000439415 C14orf132Q9NPU4 83 aa2.47□□□□□ -2.01
CBX1P4-201ENST00000439415 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP2.46□□□□□ -2.02
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CBX1P4-201ENST00000439415 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP2.46□□□□□ -2.02
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CBX1P4-201ENST00000439415 SLC50A1Q9BRV3 221 aa2.46□□□□□ -2.02
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CBX1P4-201ENST00000439415 PKDREJQ9NTG1 2253 aa2.44□□□□□ -2.02
CBX1P4-201ENST00000439415 NOTCH1P46531 2555 aa2.44□□□□□ -2.02
CBX1P4-201ENST00000439415 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa2.44□□□□□ -2.02
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CBX1P4-201ENST00000439415 C2orf70A6NJV1 201 aa2.44□□□□□ -2.02
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CBX1P4-201ENST00000439415 BAGE2Q86Y30 109 aa2.44□□□□□ -2.02
CBX1P4-201ENST00000439415 C9orf163Q8N9P6 203 aa2.44□□□□□ -2.02
CBX1P4-201ENST00000439415 SMIM4Q8WVI0 70 aa2.44□□□□□ -2.02
CBX1P4-201ENST00000439415 SMR3AQ99954 134 aa2.44□□□□□ -2.02
CBX1P4-201ENST00000439415 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP2.44□□□□□ -2.02
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CBX1P4-201ENST00000439415 DEFB121Q5J5C9 76 aa2.43□□□□□ -2.02
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CBX1P4-201ENST00000439415 RYR1P21817 5038 aa2.43□□□□□ -2.02
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CBX1P4-201ENST00000439415 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP2.42□□□□□ -2.02
CBX1P4-201ENST00000439415 RHOHQ15669 191 aa2.42□□□□□ -2.02
CBX1P4-201ENST00000439415 Q1T7F1 81 aa2.42□□□□□ -2.02
CBX1P4-201ENST00000439415 TMEM170BQ5T4T1 132 aa2.42□□□□□ -2.02
CBX1P4-201ENST00000439415 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa2.42□□□□□ -2.02
CBX1P4-201ENST00000439415 HCP5Q6MZN7 132 aa2.42□□□□□ -2.02
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CBX1P4-201ENST00000439415 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa2.42□□□□□ -2.02
CBX1P4-201ENST00000439415 Q8N814 137 aa2.42□□□□□ -2.02
CBX1P4-201ENST00000439415 CCL4L1Q8NHW4 92 aa2.42□□□□□ -2.02
CBX1P4-201ENST00000439415 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa2.42□□□□□ -2.02
CBX1P4-201ENST00000439415 SPTSSAQ969W0 71 aa2.42□□□□□ -2.02
CBX1P4-201ENST00000439415 U3KQA8 63 aa2.42□□□□□ -2.02
CBX1P4-201ENST00000439415 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa2.42□□□□□ -2.02
CBX1P4-201ENST00000439415 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa2.41□□□□□ -2.02
CBX1P4-201ENST00000439415 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa2.41□□□□□ -2.02
CBX1P4-201ENST00000439415 hDV103S1A0JD37 113 aa2.41□□□□□ -2.02
CBX1P4-201ENST00000439415 CRPP02741 224 aa2.41□□□□□ -2.02
CBX1P4-201ENST00000439415 ACYP1P07311 99 aa2.41□□□□□ -2.02
CBX1P4-201ENST00000439415 UBE2D3P61077 147 aa2.41□□□□□ -2.02
CBX1P4-201ENST00000439415 UBE2D2P62837 147 aa2.41□□□□□ -2.02
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF56Q15929 161 aa2.41□□□□□ -2.02
CBX1P4-201ENST00000439415 TPRXLQ17RH7 258 aa2.41□□□□□ -2.02
CBX1P4-201ENST00000439415 LCE3EQ5T5B0 92 aa2.41□□□□□ -2.02
CBX1P4-201ENST00000439415 LINC00643Q86TS7 51 aa2.41□□□□□ -2.02
CBX1P4-201ENST00000439415 LYPD1Q8N2G4 141 aa2.41□□□□□ -2.02
CBX1P4-201ENST00000439415 TMEM254Q8TBM7 123 aa2.41□□□□□ -2.02
CBX1P4-201ENST00000439415 NABP2Q9BQ15 211 aa2.41□□□□□ -2.02
CBX1P4-201ENST00000439415 NMES1Q9C002 83 aa2.41□□□□□ -2.02
CBX1P4-201ENST00000439415 TLN2Q9Y4G6 2542 aa2.41□□□□□ -2.02
CBX1P4-201ENST00000439415 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa2.4□□□□□ -2.03
CBX1P4-201ENST00000439415 B4DSR2 109 aa2.4□□□□□ -2.03
CBX1P4-201ENST00000439415 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP2.4□□□□□ -2.03
CBX1P4-201ENST00000439415 GCHFRP30047 84 aa2.4□□□□□ -2.03
CBX1P4-201ENST00000439415 CKS2P33552 79 aa2.4□□□□□ -2.03
CBX1P4-201ENST00000439415 C1orf134Q5TEV5 83 aa2.4□□□□□ -2.03
CBX1P4-201ENST00000439415 FAM223AQ8IWN6 122 aa2.4□□□□□ -2.03
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