RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000430930.5

TNS1-207, Transcript of tensin 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TNS1, Length 5,900 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-207ENST00000430930 LINC01556Q5JQF7 62 aa9.27□□□□□ -0.93
TNS1-207ENST00000430930 FAM208BQ5VWN6 2430 aa9.25□□□□□ -0.93
TNS1-207ENST00000430930 PLCE1Q9P212 2302 aa9.25□□□□□ -0.93
TNS1-207ENST00000430930 LIMD2Q9BT23 127 aa9.24□□□□□ -0.93
TNS1-207ENST00000430930 EML5Q05BV3 1969 aa9.24□□□□□ -0.93
TNS1-207ENST00000430930 Q8N3U1 123 aa9.23□□□□□ -0.93
TNS1-207ENST00000430930 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
TNS1-207ENST00000430930 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa9.23□□□□□ -0.93
TNS1-207ENST00000430930 C11orf72Q8NBR9 251 aa9.22□□□□□ -0.93
TNS1-207ENST00000430930 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa9.22□□□□□ -0.93
TNS1-207ENST00000430930 FSHBP01225 129 aa9.22□□□□□ -0.93
TNS1-207ENST00000430930 A0A087WVE0 104 aa9.21□□□□□ -0.93
TNS1-207ENST00000430930 CXCL6P80162 114 aa9.21□□□□□ -0.93
TNS1-207ENST00000430930 TNCP24821 2201 aa9.21□□□□□ -0.93
TNS1-207ENST00000430930 Q6ZRU5 148 aa9.21□□□□□ -0.93
TNS1-207ENST00000430930 TANC2Q9HCD6 1990 aa9.21□□□□□ -0.94
TNS1-207ENST00000430930 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa9.21□□□□□ -0.94
TNS1-207ENST00000430930 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa9.21□□□□□ -0.94
TNS1-207ENST00000430930 HCG22E2RYF7 251 aa9.21□□□□□ -0.94
TNS1-207ENST00000430930 FAM19A4Q96LR4 140 aa9.21□□□□□ -0.94
TNS1-207ENST00000430930 A0A087WSZ3 146 aa9.2□□□□□ -0.94
TNS1-207ENST00000430930 H0Y9P7 68 aa9.2□□□□□ -0.94
TNS1-207ENST00000430930 FHL3Q13643 280 aa9.2□□□□□ -0.94
TNS1-207ENST00000430930 C1orf195Q5TG92 126 aa9.19□□□□□ -0.94
TNS1-207ENST00000430930 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa9.19□□□□□ -0.94
TNS1-207ENST00000430930 hDV103S1A0JD37 113 aa9.18□□□□□ -0.94
TNS1-207ENST00000430930 C22orf24Q9Y442 160 aa9.17□□□□□ -0.94
TNS1-207ENST00000430930 LINC00337Q8N6G1 96 aa9.17□□□□□ -0.94
TNS1-207ENST00000430930 H3BNG1 76 aa9.16□□□□□ -0.94
TNS1-207ENST00000430930 A0A1B0GW54 56 aa9.15□□□□□ -0.94
TNS1-207ENST00000430930 SMCR5Q8TEV8 140 aa9.15□□□□□ -0.95
TNS1-207ENST00000430930 EXPH5Q8NEV8 1989 aa9.15□□□□□ -0.95
TNS1-207ENST00000430930 TMEM254Q8TBM7 123 aa9.14□□□□□ -0.95
TNS1-207ENST00000430930 LINC00846Q9NV44 126 aa9.14□□□□□ -0.95
TNS1-207ENST00000430930 PCOTHQ58A44 107 aa9.13□□□□□ -0.95
TNS1-207ENST00000430930 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa9.13□□□□□ -0.95
TNS1-207ENST00000430930 PRR14LQ5THK1 2151 aa9.13□□□□□ -0.95
TNS1-207ENST00000430930 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa9.12□□□□□ -0.95
TNS1-207ENST00000430930 RETNLBQ9BQ08 111 aa9.12□□□□□ -0.95
TNS1-207ENST00000430930 PRLHP81277 87 aa9.12□□□□□ -0.95
TNS1-207ENST00000430930 LINC00315P59091 139 aa9.12□□□□□ -0.95
TNS1-207ENST00000430930 BCE1O60756 84 aa9.11□□□□□ -0.95
TNS1-207ENST00000430930 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa9.11□□□□□ -0.95
TNS1-207ENST00000430930 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa9.1□□□□□ -0.95
TNS1-207ENST00000430930 COL4A2P08572 1712 aa9.09□□□□□ -0.95
TNS1-207ENST00000430930 SBSPONQ8IVN8 264 aa9.09□□□□□ -0.95
TNS1-207ENST00000430930 A8MTW9 85 aa9.09□□□□□ -0.95
TNS1-207ENST00000430930 KIAA0087Q14695 138 aa9.09□□□□□ -0.95
TNS1-207ENST00000430930 MDFIQ99750 246 aa9.09□□□□□ -0.95
TNS1-207ENST00000430930 DEFB116Q30KQ4 102 aa9.08□□□□□ -0.96
TNS1-207ENST00000430930 PMAIP1Q13794 54 aa9.08□□□□□ -0.96
TNS1-207ENST00000430930 X6R8D5 127 aa9.08□□□□□ -0.96
TNS1-207ENST00000430930 PLXNB1O43157 2135 aa9.08□□□□□ -0.96
TNS1-207ENST00000430930 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa9.08□□□□□ -0.96
TNS1-207ENST00000430930 C1orf64Q8NEQ6 169 aa9.07□□□□□ -0.96
TNS1-207ENST00000430930 SPATA3Q8NHX4 192 aa9.07□□□□□ -0.96
TNS1-207ENST00000430930 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
TNS1-207ENST00000430930 C6orf48Q9UBA6 75 aa9.06□□□□□ -0.96
TNS1-207ENST00000430930 LINC00167Q96N53 147 aa9.06□□□□□ -0.96
TNS1-207ENST00000430930 CDIP1Q9H305 208 aa9.05□□□□□ -0.96
TNS1-207ENST00000430930 ACACBO00763 2458 aa9.04□□□□□ -0.96
TNS1-207ENST00000430930 SPINK1P00995 79 aa9.04□□□□□ -0.96
TNS1-207ENST00000430930 SMIM29Q86T20 159 aa9.04□□□□□ -0.96
TNS1-207ENST00000430930 NAV3Q8IVL0 2385 aa9.02□□□□□ -0.96
TNS1-207ENST00000430930 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa9.02□□□□□ -0.96
TNS1-207ENST00000430930 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa9.02□□□□□ -0.97
TNS1-207ENST00000430930 KLK9Q2XQG4 91 aa9.02□□□□□ -0.97
TNS1-207ENST00000430930 H3BPC8 53 aa9.02□□□□□ -0.97
TNS1-207ENST00000430930 PSPHP1O15172 72 aa9.02□□□□□ -0.97
TNS1-207ENST00000430930 CRYGAP11844 174 aa9.02□□□□□ -0.97
TNS1-207ENST00000430930 C7orf65Q6ZTY9 151 aa9.01□□□□□ -0.97
TNS1-207ENST00000430930 CUL9Q8IWT3 2517 aa9□□□□□ -0.97
TNS1-207ENST00000430930 Q6ZRX8 168 aa8.99□□□□□ -0.97
TNS1-207ENST00000430930 Q8NBF4 154 aa8.99□□□□□ -0.97
TNS1-207ENST00000430930 MOBPQ13875 183 aa8.99□□□□□ -0.97
TNS1-207ENST00000430930 ACYP2P14621 99 aa8.98□□□□□ -0.97
TNS1-207ENST00000430930 WNK1Q9H4A3 2382 aa8.98□□□□□ -0.97
TNS1-207ENST00000430930 Q6ZQT0 140 aa8.98□□□□□ -0.97
TNS1-207ENST00000430930 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa8.97□□□□□ -0.97
TNS1-207ENST00000430930 IGKV2-30P06310 120 aa8.97□□□□□ -0.97
TNS1-207ENST00000430930 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
TNS1-207ENST00000430930 C16orf90A8MZG2 172 aa8.97□□□□□ -0.97
TNS1-207ENST00000430930 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
TNS1-207ENST00000430930 SPG11Q96JI7 2443 aa8.97□□□□□ -0.97
TNS1-207ENST00000430930 FAM218AQ96MZ4 157 aa8.96□□□□□ -0.98
TNS1-207ENST00000430930 CSPG4Q6UVK1 2322 aa8.95□□□□□ -0.98
TNS1-207ENST00000430930 TTC28Q96AY4 2481 aa8.95□□□□□ -0.98
TNS1-207ENST00000430930 AGRNO00468 2067 aa8.95□□□□□ -0.98
TNS1-207ENST00000430930 RTL8CO15255 209 aa8.95□□□□□ -0.98
TNS1-207ENST00000430930 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
TNS1-207ENST00000430930 SPACA4Q8TDM5 124 aa8.95□□□□□ -0.98
TNS1-207ENST00000430930 Q8NAQ8 132 aa8.94□□□□□ -0.98
TNS1-207ENST00000430930 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa8.94□□□□□ -0.98
TNS1-207ENST00000430930 A0A1B0GU69 56 aa8.94□□□□□ -0.98
TNS1-207ENST00000430930 Q6ZRP5 223 aa8.94□□□□□ -0.98
TNS1-207ENST00000430930 LINC00476Q8WZB0 136 aa8.94□□□□□ -0.98
TNS1-207ENST00000430930 PRO0461Q9UI25 63 aa8.94□□□□□ -0.98
TNS1-207ENST00000430930 PTPRBP23467 1997 aa8.94□□□□□ -0.98
TNS1-207ENST00000430930 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
TNS1-207ENST00000430930 SORL1Q92673 2214 aa8.93□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.1 ms