RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429899.1

ATG4B-211, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 4

Gene ATG4B, Length 524 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-211ENST00000429899 Q8N814 137 aa6.58□□□□□ -1.36
ATG4B-211ENST00000429899 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa6.58□□□□□ -1.36
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ATG4B-211ENST00000429899 LPAP08519 4548 aa6.58□□□□□ -1.36
ATG4B-211ENST00000429899 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa6.57□□□□□ -1.36
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ATG4B-211ENST00000429899 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa6.55□□□□□ -1.36
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ATG4B-211ENST00000429899 HERVK_113P61574 105 aa6.54□□□□□ -1.36
ATG4B-211ENST00000429899 LINC01561Q8N1V8 128 aa6.54□□□□□ -1.36
ATG4B-211ENST00000429899 TP73-AS1Q9UF72 201 aa6.54□□□□□ -1.36
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ATG4B-211ENST00000429899 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
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ATG4B-211ENST00000429899 C1orf43Q9BWL3 253 aa6.52□□□□□ -1.37
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ATG4B-211ENST00000429899 PRO1933Q9H354 126 aa6.51□□□□□ -1.37
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ATG4B-211ENST00000429899 NDUFA12Q9UI09 145 aa6.47□□□□□ -1.37
ATG4B-211ENST00000429899 COX11Q9Y6N1 276 aa6.47□□□□□ -1.37
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ATG4B-211ENST00000429899 TM2D2Q9BX73 214 aa6.46□□□□□ -1.38
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ATG4B-211ENST00000429899 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
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ATG4B-211ENST00000429899 A0A0J9YXY3 114 aa6.44□□□□□ -1.38
ATG4B-211ENST00000429899 USP17L23D6RBM5 183 aa6.44□□□□□ -1.38
ATG4B-211ENST00000429899 DDTP30046 118 aa6.44□□□□□ -1.38
ATG4B-211ENST00000429899 HIGD2BQ4VC39 106 aa6.44□□□□□ -1.38
ATG4B-211ENST00000429899 SFTA2Q6UW10 78 aa6.44□□□□□ -1.38
ATG4B-211ENST00000429899 LITAFQ99732 161 aa6.44□□□□□ -1.38
ATG4B-211ENST00000429899 HIGD1BQ9P298 99 aa6.44□□□□□ -1.38
ATG4B-211ENST00000429899 PRSS2P07478 247 aa6.43□□□□□ -1.38
ATG4B-211ENST00000429899 HERV-K104P63124 156 aa6.43□□□□□ -1.38
ATG4B-211ENST00000429899 CFAP161Q6P656 301 aa6.43□□□□□ -1.38
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