RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427193.1

C9orf3-205, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 3

Gene C9orf3, Length 704 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-205ENST00000427193 RPL39P62891 51 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
C9orf3-205ENST00000427193 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
C9orf3-205ENST00000427193 C6orf226Q5I0X4 101 aa3.59□□□□□ -1.83
C9orf3-205ENST00000427193 LINC01556Q5JQF7 62 aa3.59□□□□□ -1.83
C9orf3-205ENST00000427193 C2orf66Q6UXQ4 117 aa3.59□□□□□ -1.83
C9orf3-205ENST00000427193 LINC00173Q6ZV60 143 aa3.59□□□□□ -1.83
C9orf3-205ENST00000427193 SPATA12Q7Z6I5 190 aa3.59□□□□□ -1.83
C9orf3-205ENST00000427193 BAGE3Q86Y29 109 aa3.59□□□□□ -1.83
C9orf3-205ENST00000427193 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa3.59□□□□□ -1.83
C9orf3-205ENST00000427193 AMELXQ99217 191 aa3.59□□□□□ -1.83
C9orf3-205ENST00000427193 TIMM17AQ99595 171 aa3.59□□□□□ -1.83
C9orf3-205ENST00000427193 HIST1H2BLQ99880 126 aa3.59□□□□□ -1.83
C9orf3-205ENST00000427193 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa3.58□□□□□ -1.84
C9orf3-205ENST00000427193 FGF6P10767 208 aa3.58□□□□□ -1.84
C9orf3-205ENST00000427193 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
C9orf3-205ENST00000427193 NDUFA6P56556 154 aa3.58□□□□□ -1.84
C9orf3-205ENST00000427193 C5orf47Q569G3 176 aa3.58□□□□□ -1.84
C9orf3-205ENST00000427193 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa3.58□□□□□ -1.84
C9orf3-205ENST00000427193 FA2HQ7L5A8 372 aa3.58□□□□□ -1.84
C9orf3-205ENST00000427193 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa3.58□□□□□ -1.84
C9orf3-205ENST00000427193 WFDC10BQ8IUB3 73 aa3.58□□□□□ -1.84
C9orf3-205ENST00000427193 FAM19A2Q8N3H0 131 aa3.58□□□□□ -1.84
C9orf3-205ENST00000427193 TYMSOSQ8TAI1 123 aa3.58□□□□□ -1.84
C9orf3-205ENST00000427193 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa3.58□□□□□ -1.84
C9orf3-205ENST00000427193 CHCHD5Q9BSY4 110 aa3.58□□□□□ -1.84
C9orf3-205ENST00000427193 TMEM243Q9BU79 118 aa3.58□□□□□ -1.84
C9orf3-205ENST00000427193 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa3.58□□□□□ -1.84
C9orf3-205ENST00000427193 SPANXA1Q9NS26 97 aa3.58□□□□□ -1.84
C9orf3-205ENST00000427193 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa3.57□□□□□ -1.84
C9orf3-205ENST00000427193 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa3.57□□□□□ -1.84
C9orf3-205ENST00000427193 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
C9orf3-205ENST00000427193 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
C9orf3-205ENST00000427193 K7EP13 123 aa3.57□□□□□ -1.84
C9orf3-205ENST00000427193 HSBP1O75506 76 aa3.57□□□□□ -1.84
C9orf3-205ENST00000427193 RBX1P62877 108 aa3.57□□□□□ -1.84
C9orf3-205ENST00000427193 PMCHL1Q16048 86 aa3.57□□□□□ -1.84
C9orf3-205ENST00000427193 MPV17L2Q567V2 206 aa3.57□□□□□ -1.84
C9orf3-205ENST00000427193 CD164L2Q6UWJ8 174 aa3.57□□□□□ -1.84
C9orf3-205ENST00000427193 Q8N976 141 aa3.57□□□□□ -1.84
C9orf3-205ENST00000427193 TMEM141Q96I45 108 aa3.57□□□□□ -1.84
C9orf3-205ENST00000427193 CYSLTR1Q9Y271 337 aa3.57□□□□□ -1.84
C9orf3-205ENST00000427193 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa3.56□□□□□ -1.84
C9orf3-205ENST00000427193 C16orf90A8MZG2 172 aa3.56□□□□□ -1.84
C9orf3-205ENST00000427193 TMEM238C9JI98 176 aa3.56□□□□□ -1.84
C9orf3-205ENST00000427193 INAFM2P0DMQ5 153 aa3.56□□□□□ -1.84
C9orf3-205ENST00000427193 CCL18P55774 89 aa3.56□□□□□ -1.84
C9orf3-205ENST00000427193 PKIAP61925 76 aa3.56□□□□□ -1.84
C9orf3-205ENST00000427193 BOD1L2Q8IYS8 172 aa3.56□□□□□ -1.84
C9orf3-205ENST00000427193 BAALCQ8WXS3 180 aa3.56□□□□□ -1.84
C9orf3-205ENST00000427193 Q9H8V8 135 aa3.56□□□□□ -1.84
C9orf3-205ENST00000427193 DNAH8Q96JB1 4490 aa3.56□□□□□ -1.84
C9orf3-205ENST00000427193 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa3.55□□□□□ -1.84
C9orf3-205ENST00000427193 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa3.55□□□□□ -1.84
C9orf3-205ENST00000427193 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa3.55□□□□□ -1.84
C9orf3-205ENST00000427193 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa3.55□□□□□ -1.84
C9orf3-205ENST00000427193 SIVA1O15304 175 aa3.55□□□□□ -1.84
C9orf3-205ENST00000427193 ATP5LO75964 103 aa3.55□□□□□ -1.84
C9orf3-205ENST00000427193 LEPROTL1O95214 131 aa3.55□□□□□ -1.84
C9orf3-205ENST00000427193 UBE2D1P51668 147 aa3.55□□□□□ -1.84
C9orf3-205ENST00000427193 LINC01545Q5VT33 79 aa3.55□□□□□ -1.84
C9orf3-205ENST00000427193 ENHOQ6UWT2 76 aa3.55□□□□□ -1.84
C9orf3-205ENST00000427193 Q6ZUT4 128 aa3.55□□□□□ -1.84
C9orf3-205ENST00000427193 LINC00518Q8N0U6 118 aa3.55□□□□□ -1.84
C9orf3-205ENST00000427193 ZNF664Q8N3J9 261 aa3.55□□□□□ -1.84
C9orf3-205ENST00000427193 IFI27L1Q96BM0 104 aa3.55□□□□□ -1.84
C9orf3-205ENST00000427193 CST9LQ9H4G1 147 aa3.55□□□□□ -1.84
C9orf3-205ENST00000427193 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa3.54□□□□□ -1.84
C9orf3-205ENST00000427193 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
C9orf3-205ENST00000427193 CCL25O15444 150 aa3.54□□□□□ -1.84
C9orf3-205ENST00000427193 C3orf79P0CE67 100 aa3.54□□□□□ -1.84
C9orf3-205ENST00000427193 HERV-K104P63124 156 aa3.54□□□□□ -1.84
C9orf3-205ENST00000427193 LINC00242Q5T6M2 205 aa3.54□□□□□ -1.84
C9orf3-205ENST00000427193 LCE1CQ5T751 118 aa3.54□□□□□ -1.84
C9orf3-205ENST00000427193 LCE1BQ5T7P3 118 aa3.54□□□□□ -1.84
C9orf3-205ENST00000427193 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
C9orf3-205ENST00000427193 OR5A1Q8NGJ0 315 aa3.54□□□□□ -1.84
C9orf3-205ENST00000427193 FAM218AQ96MZ4 157 aa3.54□□□□□ -1.84
C9orf3-205ENST00000427193 SCGB3A1Q96QR1 104 aa3.54□□□□□ -1.84
C9orf3-205ENST00000427193 HSPB8Q9UJY1 196 aa3.54□□□□□ -1.84
C9orf3-205ENST00000427193 A0A087WX48 190 aa3.53□□□□□ -1.84
C9orf3-205ENST00000427193 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa3.53□□□□□ -1.84
C9orf3-205ENST00000427193 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa3.53□□□□□ -1.84
C9orf3-205ENST00000427193 IGLC3P0DOY3 106 aa3.53□□□□□ -1.84
C9orf3-205ENST00000427193 FABP4P15090 132 aa3.53□□□□□ -1.84
C9orf3-205ENST00000427193 SMAGPQ0VAQ4 97 aa3.53□□□□□ -1.84
C9orf3-205ENST00000427193 PMVKQ15126 192 aa3.53□□□□□ -1.84
C9orf3-205ENST00000427193 LINC00269Q8N2A0 174 aa3.53□□□□□ -1.84
C9orf3-205ENST00000427193 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa3.52□□□□□ -1.85
C9orf3-205ENST00000427193 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa3.52□□□□□ -1.85
C9orf3-205ENST00000427193 F8VRH5 84 aa3.52□□□□□ -1.85
C9orf3-205ENST00000427193 UBE2L6O14933 153 aa3.52□□□□□ -1.85
C9orf3-205ENST00000427193 KRTAP10-1P60331 282 aa3.52□□□□□ -1.85
C9orf3-205ENST00000427193 COX6A2Q02221 97 aa3.52□□□□□ -1.85
C9orf3-205ENST00000427193 REG3AQ06141 175 aa3.52□□□□□ -1.85
C9orf3-205ENST00000427193 MIAQ16674 131 aa3.52□□□□□ -1.85
C9orf3-205ENST00000427193 LINC01620Q4KN68 170 aa3.52□□□□□ -1.85
C9orf3-205ENST00000427193 PYY3Q5JQD4 70 aa3.52□□□□□ -1.85
C9orf3-205ENST00000427193 LINC01561Q8N1V8 128 aa3.52□□□□□ -1.85
C9orf3-205ENST00000427193 C10orf126Q8N4M7 172 aa3.52□□□□□ -1.85
C9orf3-205ENST00000427193 C2orf48Q96LS8 159 aa3.52□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.2 ms