RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426965.1

HOXD-AS2-201, HOXD cluster antisense RNA 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD-AS2, Length 927 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TOMM7Q9P0U1 55 aa15.64■□□□□ 0.09
HOXD-AS2-201ENST00000426965 Q8IZM0 81 aa15.63■□□□□ 0.09
HOXD-AS2-201ENST00000426965 C7orf33Q8WU49 177 aa15.63■□□□□ 0.09
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa15.62■□□□□ 0.09
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SMIM1B2RUZ4 78 aa15.61■□□□□ 0.09
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TRGC2P03986 189 aa15.61■□□□□ 0.09
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PRSS2P07478 247 aa15.61■□□□□ 0.09
HOXD-AS2-201ENST00000426965 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
HOXD-AS2-201ENST00000426965 C6orf226Q5I0X4 101 aa15.6■□□□□ 0.09
HOXD-AS2-201ENST00000426965 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
HOXD-AS2-201ENST00000426965 COLCA2A8K830 154 aa15.59■□□□□ 0.09
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NDUFA6P56556 154 aa15.59■□□□□ 0.09
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
HOXD-AS2-201ENST00000426965 IGLC3P0DOY3 106 aa15.58■□□□□ 0.08
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CKS1BP61024 79 aa15.58■□□□□ 0.08
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ATP5LO75964 103 aa15.56■□□□□ 0.08
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SPINK8P0C7L1 97 aa15.56■□□□□ 0.08
HOXD-AS2-201ENST00000426965 GAGE2EQ4V326 116 aa15.56■□□□□ 0.08
HOXD-AS2-201ENST00000426965 GAGE2DQ9UEU5 116 aa15.56■□□□□ 0.08
HOXD-AS2-201ENST00000426965 FAM168BA1KXE4 195 aa15.55■□□□□ 0.08
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP15.55■□□□□ 0.08
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa15.55■□□□□ 0.08
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PRR3P79522 188 aaKnown RBP15.55■□□□□ 0.08
HOXD-AS2-201ENST00000426965 COX7B2Q8TF08 81 aa15.53■□□□□ 0.08
HOXD-AS2-201ENST00000426965 F8VRH5 84 aa15.52■□□□□ 0.08
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP15.52■□□□□ 0.08
HOXD-AS2-201ENST00000426965 BAGE3Q86Y29 109 aa15.52■□□□□ 0.08
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa15.52■□□□□ 0.08
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HOXD-AS2-201ENST00000426965 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
HOXD-AS2-201ENST00000426965 H3BRM9 83 aa15.5■□□□□ 0.07
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SCO1O75880 301 aa15.5■□□□□ 0.07
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CXCL5P42830 114 aa15.5■□□□□ 0.07
HOXD-AS2-201ENST00000426965 FAM19A2Q8N3H0 131 aa15.5■□□□□ 0.07
HOXD-AS2-201ENST00000426965 C11orf86A6NJI1 115 aa15.49■□□□□ 0.07
HOXD-AS2-201ENST00000426965 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa15.48■□□□□ 0.07
HOXD-AS2-201ENST00000426965 HSBP1O75506 76 aa15.48■□□□□ 0.07
HOXD-AS2-201ENST00000426965 J3QL48 77 aa15.47■□□□□ 0.07
HOXD-AS2-201ENST00000426965 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
HOXD-AS2-201ENST00000426965 IFI27L1Q96BM0 104 aa15.47■□□□□ 0.07
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SERF1AO75920 110 aa15.46■□□□□ 0.07
HOXD-AS2-201ENST00000426965 OXTP01178 125 aa15.46■□□□□ 0.07
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa15.44■□□□□ 0.06
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NUPR1O60356 82 aa15.44■□□□□ 0.06
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa15.43■□□□□ 0.06
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa15.43■□□□□ 0.06
HOXD-AS2-201ENST00000426965 XAGE1AQ9HD64 81 aa15.42■□□□□ 0.06
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TMEM170BQ5T4T1 132 aa15.41■□□□□ 0.06
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa15.4■□□□□ 0.06
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP15.39■□□□□ 0.05
HOXD-AS2-201ENST00000426965 M0QXV9 152 aa15.38■□□□□ 0.05
HOXD-AS2-201ENST00000426965 LEPROTL1O95214 131 aa15.36■□□□□ 0.05
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HOXD-AS2-201ENST00000426965 TMEM223A0PJW6 202 aa15.35■□□□□ 0.05
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SPINK6Q6UWN8 80 aa15.35■□□□□ 0.05
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ODF1Q14990 250 aa15.34■□□□□ 0.05
HOXD-AS2-201ENST00000426965 C1orf137Q5JT78 98 aa15.34■□□□□ 0.05
HOXD-AS2-201ENST00000426965 H0Y8G0 127 aa15.33■□□□□ 0.04
HOXD-AS2-201ENST00000426965 C22orf24Q9Y442 160 aa15.33■□□□□ 0.04
HOXD-AS2-201ENST00000426965 HIST1H2BKO60814 126 aa15.32■□□□□ 0.04
HOXD-AS2-201ENST00000426965 HIST1H2BJP06899 126 aa15.32■□□□□ 0.04
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MT1HL1P0DM35 61 aa15.32■□□□□ 0.04
HOXD-AS2-201ENST00000426965 HIST1H2BOP23527 126 aa15.32■□□□□ 0.04
HOXD-AS2-201ENST00000426965 HIST1H2BBP33778 126 aa15.32■□□□□ 0.04
HOXD-AS2-201ENST00000426965 HIST1H2BDP58876 126 aa15.32■□□□□ 0.04
HOXD-AS2-201ENST00000426965 HIST1H2BCP62807 126 aa15.32■□□□□ 0.04
HOXD-AS2-201ENST00000426965 HIST2H2BEQ16778 126 aa15.32■□□□□ 0.04
HOXD-AS2-201ENST00000426965 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP15.32■□□□□ 0.04
HOXD-AS2-201ENST00000426965 HIST1H2BHQ93079 126 aa15.32■□□□□ 0.04
HOXD-AS2-201ENST00000426965 HIST1H2BNQ99877 126 aa15.32■□□□□ 0.04
HOXD-AS2-201ENST00000426965 HIST1H2BMQ99879 126 aa15.32■□□□□ 0.04
HOXD-AS2-201ENST00000426965 FABP4P15090 132 aa15.31■□□□□ 0.04
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP15.31■□□□□ 0.04
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PFN2P35080 140 aa15.3■□□□□ 0.04
HOXD-AS2-201ENST00000426965 UBE2BP63146 152 aa15.29■□□□□ 0.04
HOXD-AS2-201ENST00000426965 HSPB8Q9UJY1 196 aa15.29■□□□□ 0.04
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ERG28Q9UKR5 140 aa15.28■□□□□ 0.04
HOXD-AS2-201ENST00000426965 IGLV7-43P04211 117 aa15.27■□□□□ 0.04
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa15.26■□□□□ 0.03
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TP73-AS1Q9UF72 201 aa15.25■□□□□ 0.03
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SFTA2Q6UW10 78 aa15.24■□□□□ 0.03
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP15.24■□□□□ 0.03
HOXD-AS2-201ENST00000426965 LINC01600Q96MT4 127 aa15.24■□□□□ 0.03
HOXD-AS2-201ENST00000426965 COX17Q14061 63 aa15.23■□□□□ 0.03
HOXD-AS2-201ENST00000426965 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP15.23■□□□□ 0.03
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PMCHL2Q9BQD1 86 aa15.23■□□□□ 0.03
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa15.23■□□□□ 0.03
HOXD-AS2-201ENST00000426965 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa15.21■□□□□ 0.03
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PLNP26678 52 aa15.2■□□□□ 0.02
HOXD-AS2-201ENST00000426965 REG3GQ6UW15 175 aa15.2■□□□□ 0.02
HOXD-AS2-201ENST00000426965 LINC00167Q96N53 147 aa15.2■□□□□ 0.02
HOXD-AS2-201ENST00000426965 HMCN2Q8NDA2 5059 aa15.18■□□□□ 0.02
HOXD-AS2-201ENST00000426965 DPM2O94777 84 aa15.18■□□□□ 0.02
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa15.18■□□□□ 0.02
HOXD-AS2-201ENST00000426965 GAGE10A6NGK3 116 aa15.17■□□□□ 0.02
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TSPEAR-AS2P59090 65 aa15.17■□□□□ 0.02
HOXD-AS2-201ENST00000426965 Q8NDZ9 215 aa15.17■□□□□ 0.02
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