RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426304.5

NHEJ1-204, Transcript of non-homologous end joining factor 1, human

TSL 3

Gene NHEJ1, Length 753 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NHEJ1-204	ENST00000426304	CHCHD1	Q96BP2	118 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
NHEJ1-204	ENST00000426304	LINC00474	Q9P2X8	69 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NHEJ1-204	ENST00000426304	LINC01546	A6NGU7	62 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NHEJ1-204	ENST00000426304		I3L3M4	83 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NHEJ1-204	ENST00000426304	TCAP	O15273	167 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NHEJ1-204	ENST00000426304	RNASEK	Q6P5S7	137 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NHEJ1-204	ENST00000426304	C20orf203	Q8NBC4	194 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NHEJ1-204	ENST00000426304	KIR2DL4	Q99706	377 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NHEJ1-204	ENST00000426304	CHTOP	Q9Y3Y2	248 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NHEJ1-204	ENST00000426304	LOC100996750	A0A140TA64	210 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NHEJ1-204	ENST00000426304	HSBP1	O75506	76 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NHEJ1-204	ENST00000426304	SERF1A	O75920	110 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NHEJ1-204	ENST00000426304	ESD	P10768	282 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NHEJ1-204	ENST00000426304	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NHEJ1-204	ENST00000426304	KRTAP4-6	Q9BYQ5	205 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NHEJ1-204	ENST00000426304	LPA	P08519	4548 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NHEJ1-204	ENST00000426304	NUPR1	O60356	82 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NHEJ1-204	ENST00000426304	G0S2	P27469	103 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NHEJ1-204	ENST00000426304	FCER1G	P30273	86 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NHEJ1-204	ENST00000426304	COX6A2	Q02221	97 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NHEJ1-204	ENST00000426304	COTL1	Q14019	142 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NHEJ1-204	ENST00000426304	ORMDL2	Q53FV1	153 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NHEJ1-204	ENST00000426304	C6orf226	Q5I0X4	101 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NHEJ1-204	ENST00000426304	C15orf56	Q8N910	161 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NHEJ1-204	ENST00000426304	TMEM243	Q9BU79	118 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NHEJ1-204	ENST00000426304	LINC01549	A6NIU2	74 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NHEJ1-204	ENST00000426304	UBE2L6	O14933	153 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NHEJ1-204	ENST00000426304		Q6ZRP5	223 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NHEJ1-204	ENST00000426304	IGLV4-60	A0A075B6I1	120 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NHEJ1-204	ENST00000426304		A0A096LNJ9	63 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NHEJ1-204	ENST00000426304	GVQW2	A0A096LPI5	108 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NHEJ1-204	ENST00000426304	IGKV2-24	A0A0C4DH68	120 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NHEJ1-204	ENST00000426304	HBD	P02042	147 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NHEJ1-204	ENST00000426304	S100A2	P29034	98 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NHEJ1-204	ENST00000426304	LINC01547	P58512	204 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NHEJ1-204	ENST00000426304	SMIM29	Q86T20	159 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NHEJ1-204	ENST00000426304	HIST3H2BB	Q8N257	126 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NHEJ1-204	ENST00000426304	FAM19A2	Q8N3H0	131 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NHEJ1-204	ENST00000426304	PACRG	Q96M98	296 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NHEJ1-204	ENST00000426304		A0A0U1RQV1	116 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NHEJ1-204	ENST00000426304		H7C423	109 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NHEJ1-204	ENST00000426304	PMCHL1	Q16048	86 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NHEJ1-204	ENST00000426304	PDZD11	Q5EBL8	140 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NHEJ1-204	ENST00000426304	C2orf66	Q6UXQ4	117 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NHEJ1-204	ENST00000426304	LINC01561	Q8N1V8	128 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NHEJ1-204	ENST00000426304	CYSLTR1	Q9Y271	337 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NHEJ1-204	ENST00000426304	MUC2	Q02817	5179 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NHEJ1-204	ENST00000426304		A0A096LNI7	61 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NHEJ1-204	ENST00000426304	LEPROTL1	O95214	131 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NHEJ1-204	ENST00000426304	IGKV2-30	P06310	120 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NHEJ1-204	ENST00000426304	HIGD2B	Q4VC39	106 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NHEJ1-204	ENST00000426304	ZNF664	Q8N3J9	261 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NHEJ1-204	ENST00000426304	TOMM6	Q96B49	74 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NHEJ1-204	ENST00000426304	HIST1H2BL	Q99880	126 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NHEJ1-204	ENST00000426304	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NHEJ1-204	ENST00000426304	IFITM10	A6NMD0	228 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NHEJ1-204	ENST00000426304	ATP5L	O75964	103 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NHEJ1-204	ENST00000426304	RPL39	P62891	51 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
NHEJ1-204	ENST00000426304	SMAGP	Q0VAQ4	97 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NHEJ1-204	ENST00000426304	CHCHD10	Q8WYQ3	142 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
NHEJ1-204	ENST00000426304	TIMM21	Q9BVV7	248 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NHEJ1-204	ENST00000426304	SPANXA1	Q9NS26	97 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NHEJ1-204	ENST00000426304	PSORS1C2	Q9UIG4	136 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NHEJ1-204	ENST00000426304	HSPB8	Q9UJY1	196 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NHEJ1-204	ENST00000426304	PYGO1	Q9Y3Y4	419 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NHEJ1-204	ENST00000426304	FAT4	Q6V0I7	4981 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NHEJ1-204	ENST00000426304	IGKV2D-29	A0A075B6S2	120 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
NHEJ1-204	ENST00000426304	IGHV1-58	A0A0C4DH39	117 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NHEJ1-204	ENST00000426304	IGKV2-29	A2NJV5	120 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
NHEJ1-204	ENST00000426304	IGIP	A6NJ69	53 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NHEJ1-204	ENST00000426304	FGF6	P10767	208 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NHEJ1-204	ENST00000426304	FABP4	P15090	132 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NHEJ1-204	ENST00000426304	RPL13A	P40429	203 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
NHEJ1-204	ENST00000426304	LINC00242	Q5T6M2	205 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NHEJ1-204	ENST00000426304	MRPL52	Q86TS9	123 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
NHEJ1-204	ENST00000426304	IFI27L1	Q96BM0	104 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NHEJ1-204	ENST00000426304	TMEM141	Q96I45	108 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NHEJ1-204	ENST00000426304	CARD19	Q96LW7	228 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NHEJ1-204	ENST00000426304	SCGB3A1	Q96QR1	104 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NHEJ1-204	ENST00000426304	TIMM17A	Q99595	171 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NHEJ1-204	ENST00000426304	UBE2D4	Q9Y2X8	147 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NHEJ1-204	ENST00000426304	CSDC2	Q9Y534	153 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
NHEJ1-204	ENST00000426304	BORCS8-MEF2B	H3BNR1	382 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
NHEJ1-204	ENST00000426304	ZNF25	P17030	456 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
NHEJ1-204	ENST00000426304	AMMECR1L	Q6DCA0	310 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NHEJ1-204	ENST00000426304	LINC00173	Q6ZV60	143 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NHEJ1-204	ENST00000426304	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NHEJ1-204	ENST00000426304	IGKV3OR2-268	A0A0C4DH90	116 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NHEJ1-204	ENST00000426304	MRPS36	P82909	103 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
NHEJ1-204	ENST00000426304	ADAMTSL4-AS1	Q5T5F5	129 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NHEJ1-204	ENST00000426304		Q6ZN92	141 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NHEJ1-204	ENST00000426304	OR5A1	Q8NGJ0	315 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NHEJ1-204	ENST00000426304	OR10D4P	Q8NGN7	298 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NHEJ1-204	ENST00000426304	TMEM101	Q96IK0	257 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NHEJ1-204	ENST00000426304	MAP1LC3C	Q9BXW4	147 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NHEJ1-204	ENST00000426304	KRTAP9-2	Q9BYQ4	174 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NHEJ1-204	ENST00000426304	IGLV4-3	A0A075B6K6	122 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NHEJ1-204	ENST00000426304	LOC107984640	A0A0U1RRK4	108 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NHEJ1-204	ENST00000426304	LOC105371267	A0A1B0GV96	52 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NHEJ1-204	ENST00000426304	SYS1-DBNDD2	H3BUS1	97 aa		4.8	□□□□□ -1.64

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.7 ms