RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423112.2

RFX3-AS1-201, RFX3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene RFX3-AS1, Length 552 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DAND5Q8N907 189 aa9.27□□□□□ -0.93
RFX3-AS1-201ENST00000423112 C2orf88Q9BSF0 95 aa9.27□□□□□ -0.93
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NDUFA12Q9UI09 145 aa9.26□□□□□ -0.93
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CXCL5P42830 114 aa9.25□□□□□ -0.93
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PRLHP81277 87 aa9.25□□□□□ -0.93
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa9.25□□□□□ -0.93
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PLEKHB2Q96CS7 222 aa9.25□□□□□ -0.93
RFX3-AS1-201ENST00000423112 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
RFX3-AS1-201ENST00000423112 OSTCQ9NRP0 149 aa9.25□□□□□ -0.93
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RAB5AP20339 215 aa9.24□□□□□ -0.93
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa9.24□□□□□ -0.93
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GNB1LQ9BYB4 327 aa9.24□□□□□ -0.93
RFX3-AS1-201ENST00000423112 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa9.23□□□□□ -0.93
RFX3-AS1-201ENST00000423112 IGKV2D-28P01615 120 aa9.23□□□□□ -0.93
RFX3-AS1-201ENST00000423112 XP32Q5T750 250 aa9.23□□□□□ -0.93
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SPINK1P00995 79 aa9.22□□□□□ -0.93
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RFX3-AS1-201ENST00000423112 A0A1B0GW15 77 aa9.2□□□□□ -0.94
RFX3-AS1-201ENST00000423112 D6R8Y8 96 aa9.2□□□□□ -0.94
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CEBPGP53567 150 aa9.2□□□□□ -0.94
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CBLN2Q8IUK8 224 aa9.2□□□□□ -0.94
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FAM19A2Q8N3H0 131 aa9.2□□□□□ -0.94
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TMEM126AQ9H061 195 aa9.2□□□□□ -0.94
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NPYP01303 97 aa9.19□□□□□ -0.94
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SEC11AP67812 179 aa9.19□□□□□ -0.94
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa9.19□□□□□ -0.94
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SMIM7Q9BQ49 75 aa9.19□□□□□ -0.94
RFX3-AS1-201ENST00000423112 VCX2Q9H322 139 aa9.19□□□□□ -0.94
RFX3-AS1-201ENST00000423112 V9GYV3 84 aa9.19□□□□□ -0.94
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PPBPP02775 128 aa9.18□□□□□ -0.94
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HERVK_113P63121 156 aa9.18□□□□□ -0.94
RFX3-AS1-201ENST00000423112 Q8NBF4 154 aa9.18□□□□□ -0.94
RFX3-AS1-201ENST00000423112 AMELXQ99217 191 aa9.18□□□□□ -0.94
RFX3-AS1-201ENST00000423112 C2orf66Q6UXQ4 117 aa9.17□□□□□ -0.94
RFX3-AS1-201ENST00000423112 F8W036 122 aa9.16□□□□□ -0.94
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FAM74A3Q4VXF1 159 aa9.16□□□□□ -0.94
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SPRR4Q96PI1 79 aa9.16□□□□□ -0.94
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HIGD2AQ9BW72 106 aa9.16□□□□□ -0.94
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa9.16□□□□□ -0.94
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TMEM238C9JI98 176 aa9.15□□□□□ -0.94
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NPSP0C0P6 89 aa9.15□□□□□ -0.94
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa9.15□□□□□ -0.94
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CYSLTR1Q9Y271 337 aa9.15□□□□□ -0.94
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.94
RFX3-AS1-201ENST00000423112 M0R2T5 61 aa9.14□□□□□ -0.95
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SCO1O75880 301 aa9.14□□□□□ -0.95
RFX3-AS1-201ENST00000423112 S100A8P05109 93 aa9.14□□□□□ -0.95
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
RFX3-AS1-201ENST00000423112 M0R378 163 aa9.13□□□□□ -0.95
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RAB5BP61020 215 aa9.13□□□□□ -0.95
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RFX3-AS1-201ENST00000423112 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa9.11□□□□□ -0.95
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RFX3-AS1-201ENST00000423112 SLC25A20O43772 301 aa9.1□□□□□ -0.95
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RGS21Q2M5E4 152 aa9.1□□□□□ -0.95
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PDZD11Q5EBL8 140 aa9.1□□□□□ -0.95
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SLC51BQ86UW2 128 aa9.1□□□□□ -0.95
RFX3-AS1-201ENST00000423112 Q8N377 158 aa9.1□□□□□ -0.95
RFX3-AS1-201ENST00000423112 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa9.09□□□□□ -0.95
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RFX3-AS1-201ENST00000423112 TMEM136Q6ZRR5 245 aa9.09□□□□□ -0.95
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PRELID3AQ96N28 172 aa9.09□□□□□ -0.95
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PRSS47A8MTI9 375 aa9.08□□□□□ -0.96
RFX3-AS1-201ENST00000423112 VPREB1P12018 145 aa9.08□□□□□ -0.96
RFX3-AS1-201ENST00000423112 BLOC1S1P78537 153 aa9.08□□□□□ -0.96
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RFX3-AS1-201ENST00000423112 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ORMDL2Q53FV1 153 aa9.06□□□□□ -0.96
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PCOTHQ58A44 107 aa9.06□□□□□ -0.96
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RFX3-AS1-201ENST00000423112 A0A1B0GXF2 115 aa9.05□□□□□ -0.96
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ATP5LO75964 103 aa9.05□□□□□ -0.96
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MAP1LC3AQ9H492 121 aa9.05□□□□□ -0.96
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RFX3-AS1-201ENST00000423112 K7EMI3 77 aa9.03□□□□□ -0.96
RFX3-AS1-201ENST00000423112 Q8N8P6 123 aa9.03□□□□□ -0.96
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RFX3-AS1-201ENST00000423112 G0S2P27469 103 aa9.01□□□□□ -0.97
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ADIRFQ15847 76 aa9.01□□□□□ -0.97
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa9.01□□□□□ -0.97
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TIMM17AQ99595 171 aa9.01□□□□□ -0.97
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa9.01□□□□□ -0.97
RFX3-AS1-201ENST00000423112 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa9□□□□□ -0.97
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa9□□□□□ -0.97
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RAB14P61106 215 aa9□□□□□ -0.97
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LINC00483Q53H64 154 aa8.99□□□□□ -0.97
RFX3-AS1-201ENST00000423112 COX6B2Q6YFQ2 88 aa8.99□□□□□ -0.97
RFX3-AS1-201ENST00000423112 AKAP14Q86UN6 197 aa8.99□□□□□ -0.97
RFX3-AS1-201ENST00000423112 BATF3Q9NR55 127 aa8.99□□□□□ -0.97
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MOBPQ13875 183 aa8.98□□□□□ -0.97
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa8.98□□□□□ -0.97
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SPINK8P0C7L1 97 aa8.97□□□□□ -0.97
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