RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000359315.6

TPGS1-201, Transcript of tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TPGS1, Length 1,114 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1-201ENST00000359315 Q8IZM0 81 aa16.89■□□□□ 0.29
TPGS1-201ENST00000359315 PRSS2P07478 247 aa16.88■□□□□ 0.29
TPGS1-201ENST00000359315 NDUFA6P56556 154 aa16.88■□□□□ 0.29
TPGS1-201ENST00000359315 TLX1NBP0CAT3 122 aa16.87■□□□□ 0.29
TPGS1-201ENST00000359315 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa16.86■□□□□ 0.29
TPGS1-201ENST00000359315 COLCA2A8K830 154 aa16.86■□□□□ 0.29
TPGS1-201ENST00000359315 C7orf33Q8WU49 177 aa16.86■□□□□ 0.29
TPGS1-201ENST00000359315 SPINK8P0C7L1 97 aa16.85■□□□□ 0.29
TPGS1-201ENST00000359315 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
TPGS1-201ENST00000359315 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa16.85■□□□□ 0.29
TPGS1-201ENST00000359315 SCO1O75880 301 aa16.84■□□□□ 0.29
TPGS1-201ENST00000359315 IGLC3P0DOY3 106 aa16.84■□□□□ 0.29
TPGS1-201ENST00000359315 GAGE2EQ4V326 116 aa16.84■□□□□ 0.29
TPGS1-201ENST00000359315 C6orf226Q5I0X4 101 aa16.84■□□□□ 0.29
TPGS1-201ENST00000359315 GAGE2DQ9UEU5 116 aa16.84■□□□□ 0.29
TPGS1-201ENST00000359315 FAM168BA1KXE4 195 aa16.83■□□□□ 0.28
TPGS1-201ENST00000359315 CKS1BP61024 79 aa16.83■□□□□ 0.28
TPGS1-201ENST00000359315 ATP5LO75964 103 aa16.82■□□□□ 0.28
TPGS1-201ENST00000359315 LINC00310P59036 64 aa16.82■□□□□ 0.28
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP16.8■□□□□ 0.28
TPGS1-201ENST00000359315 PRR3P79522 188 aaKnown RBP16.8■□□□□ 0.28
TPGS1-201ENST00000359315 BAGE3Q86Y29 109 aa16.8■□□□□ 0.28
TPGS1-201ENST00000359315 FAM19A2Q8N3H0 131 aa16.8■□□□□ 0.28
TPGS1-201ENST00000359315 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa16.79■□□□□ 0.28
TPGS1-201ENST00000359315 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa16.79■□□□□ 0.28
TPGS1-201ENST00000359315 COX7B2Q8TF08 81 aa16.79■□□□□ 0.28
TPGS1-201ENST00000359315 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
TPGS1-201ENST00000359315 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
TPGS1-201ENST00000359315 C11orf86A6NJI1 115 aa16.77■□□□□ 0.28
TPGS1-201ENST00000359315 F8VRH5 84 aa16.77■□□□□ 0.28
TPGS1-201ENST00000359315 HSBP1O75506 76 aa16.77■□□□□ 0.28
TPGS1-201ENST00000359315 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.28
TPGS1-201ENST00000359315 HERC1Q15751 4861 aa16.77■□□□□ 0.27
TPGS1-201ENST00000359315 SERF1AO75920 110 aa16.76■□□□□ 0.27
TPGS1-201ENST00000359315 FAT3Q8TDW7 4589 aa16.75■□□□□ 0.27
TPGS1-201ENST00000359315 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
TPGS1-201ENST00000359315 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
TPGS1-201ENST00000359315 H3BRM9 83 aa16.74■□□□□ 0.27
TPGS1-201ENST00000359315 CXCL5P42830 114 aa16.74■□□□□ 0.27
TPGS1-201ENST00000359315 IFI27L1Q96BM0 104 aa16.74■□□□□ 0.27
TPGS1-201ENST00000359315 NUPR1O60356 82 aa16.73■□□□□ 0.27
TPGS1-201ENST00000359315 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa16.72■□□□□ 0.27
TPGS1-201ENST00000359315 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
TPGS1-201ENST00000359315 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa16.71■□□□□ 0.27
TPGS1-201ENST00000359315 J3QL48 77 aa16.7■□□□□ 0.26
TPGS1-201ENST00000359315 XAGE1AQ9HD64 81 aa16.7■□□□□ 0.26
TPGS1-201ENST00000359315 TMEM170BQ5T4T1 132 aa16.69■□□□□ 0.26
TPGS1-201ENST00000359315 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa16.68■□□□□ 0.26
TPGS1-201ENST00000359315 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa16.67■□□□□ 0.26
TPGS1-201ENST00000359315 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa16.67■□□□□ 0.26
TPGS1-201ENST00000359315 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
TPGS1-201ENST00000359315 M0QXV9 152 aa16.65■□□□□ 0.26
TPGS1-201ENST00000359315 H0Y8G0 127 aa16.63■□□□□ 0.25
TPGS1-201ENST00000359315 OXTP01178 125 aa16.63■□□□□ 0.25
TPGS1-201ENST00000359315 LEPROTL1O95214 131 aa16.62■□□□□ 0.25
TPGS1-201ENST00000359315 TMEM223A0PJW6 202 aa16.6■□□□□ 0.25
TPGS1-201ENST00000359315 HIST1H2BKO60814 126 aa16.6■□□□□ 0.25
TPGS1-201ENST00000359315 HIST1H2BJP06899 126 aa16.6■□□□□ 0.25
TPGS1-201ENST00000359315 HIST1H2BOP23527 126 aa16.6■□□□□ 0.25
TPGS1-201ENST00000359315 HIST1H2BBP33778 126 aa16.6■□□□□ 0.25
TPGS1-201ENST00000359315 HIST1H2BDP58876 126 aa16.6■□□□□ 0.25
TPGS1-201ENST00000359315 HIST1H2BCP62807 126 aa16.6■□□□□ 0.25
TPGS1-201ENST00000359315 ODF1Q14990 250 aa16.6■□□□□ 0.25
TPGS1-201ENST00000359315 HIST2H2BEQ16778 126 aa16.6■□□□□ 0.25
TPGS1-201ENST00000359315 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP16.6■□□□□ 0.25
TPGS1-201ENST00000359315 HIST1H2BHQ93079 126 aa16.6■□□□□ 0.25
TPGS1-201ENST00000359315 HIST1H2BNQ99877 126 aa16.6■□□□□ 0.25
TPGS1-201ENST00000359315 HIST1H2BMQ99879 126 aa16.6■□□□□ 0.25
TPGS1-201ENST00000359315 FABP4P15090 132 aa16.59■□□□□ 0.25
TPGS1-201ENST00000359315 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP16.59■□□□□ 0.25
TPGS1-201ENST00000359315 C1orf137Q5JT78 98 aa16.58■□□□□ 0.24
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
TPGS1-201ENST00000359315 PFN2P35080 140 aa16.55■□□□□ 0.24
TPGS1-201ENST00000359315 C22orf24Q9Y442 160 aa16.55■□□□□ 0.24
TPGS1-201ENST00000359315 MT1HL1P0DM35 61 aa16.54■□□□□ 0.24
TPGS1-201ENST00000359315 UBE2BP63146 152 aa16.54■□□□□ 0.24
TPGS1-201ENST00000359315 SPINK6Q6UWN8 80 aa16.54■□□□□ 0.24
TPGS1-201ENST00000359315 PMCHL2Q9BQD1 86 aa16.53■□□□□ 0.24
TPGS1-201ENST00000359315 HSPB8Q9UJY1 196 aa16.53■□□□□ 0.24
TPGS1-201ENST00000359315 ERG28Q9UKR5 140 aa16.53■□□□□ 0.24
TPGS1-201ENST00000359315 IGLV7-43P04211 117 aa16.48■□□□□ 0.23
TPGS1-201ENST00000359315 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
TPGS1-201ENST00000359315 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa16.46■□□□□ 0.23
TPGS1-201ENST00000359315 TSPEAR-AS2P59090 65 aa16.45■□□□□ 0.22
TPGS1-201ENST00000359315 TP73-AS1Q9UF72 201 aa16.45■□□□□ 0.22
TPGS1-201ENST00000359315 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa16.45■□□□□ 0.22
TPGS1-201ENST00000359315 SFTA2Q6UW10 78 aa16.43■□□□□ 0.22
TPGS1-201ENST00000359315 Q8NDZ9 215 aa16.43■□□□□ 0.22
TPGS1-201ENST00000359315 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa16.42■□□□□ 0.22
TPGS1-201ENST00000359315 A0A0U1RRA0 63 aa16.42■□□□□ 0.22
TPGS1-201ENST00000359315 GAGE10A6NGK3 116 aa16.42■□□□□ 0.22
TPGS1-201ENST00000359315 DPM2O94777 84 aa16.42■□□□□ 0.22
TPGS1-201ENST00000359315 PLNP26678 52 aa16.42■□□□□ 0.22
TPGS1-201ENST00000359315 COX17Q14061 63 aa16.42■□□□□ 0.22
TPGS1-201ENST00000359315 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP16.42■□□□□ 0.22
TPGS1-201ENST00000359315 LINC01600Q96MT4 127 aa16.42■□□□□ 0.22
TPGS1-201ENST00000359315 LINC00167Q96N53 147 aa16.42■□□□□ 0.22
TPGS1-201ENST00000359315 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa16.42■□□□□ 0.22
TPGS1-201ENST00000359315 RPL37AP8A6NKH3 93 aa16.4■□□□□ 0.22
TPGS1-201ENST00000359315 IGKCP01834 107 aa16.39■□□□□ 0.21
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