RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000301886.3

ARL2-SNX15-201, Transcript of ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene ARL2-SNX15, Length 2,392 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PRR3P79522 188 aaKnown RBP15.72■□□□□ 0.11
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP15.71■□□□□ 0.11
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 RBM3P98179 157 aaKnown RBP15.71■□□□□ 0.11
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP15.71■□□□□ 0.11
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 Q6YL49 198 aa15.7■□□□□ 0.1
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa15.7■□□□□ 0.1
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 LINC01356Q8N9X3 169 aa15.7■□□□□ 0.1
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TRAV10A0A0B4J240 114 aa15.69■□□□□ 0.1
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa15.69■□□□□ 0.1
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 RMI2Q96E14 147 aa15.68■□□□□ 0.1
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 C16orf74Q96GX8 76 aa15.68■□□□□ 0.1
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 C2CD3Q4AC94 2353 aa15.68■□□□□ 0.1
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PLAC8L1A1L4L8 177 aa15.68■□□□□ 0.1
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 J3QLI3 93 aa15.68■□□□□ 0.1
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa15.68■□□□□ 0.1
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 C6orf223Q8N319 242 aa15.68■□□□□ 0.1
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SNURFQ9Y675 71 aa15.67■□□□□ 0.1
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ARL2-SNX15-201ENST00000301886 C6orf99Q4VX62 202 aa15.66■□□□□ 0.1
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 EPG5Q9HCE0 2579 aa15.66■□□□□ 0.1
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 NDUFC1O43677 76 aa15.65■□□□□ 0.1
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CXCL6P80162 114 aa15.65■□□□□ 0.1
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 HAMPP81172 84 aa15.64■□□□□ 0.09
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 COX17Q14061 63 aa15.64■□□□□ 0.09
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP15.63■□□□□ 0.09
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 DSCR9P59020 149 aa15.63■□□□□ 0.09
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 M0R2N4 97 aa15.63■□□□□ 0.09
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 USP24Q9UPU5 2620 aa15.63■□□□□ 0.09
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa15.62■□□□□ 0.09
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 C1orf43Q9BWL3 253 aa15.62■□□□□ 0.09
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PDE6GP18545 87 aa15.6■□□□□ 0.09
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 C9orf66Q5T8R8 295 aa15.6■□□□□ 0.09
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa15.6■□□□□ 0.09
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 GNLYP22749 145 aa15.6■□□□□ 0.09
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa15.58■□□□□ 0.08
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PKD1L2Q7Z442 2459 aa15.58■□□□□ 0.08
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 FSHBP01225 129 aa15.57■□□□□ 0.08
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 A0A1B0GUV1 79 aa15.57■□□□□ 0.08
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP15.56■□□□□ 0.08
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 KIAA0087Q14695 138 aa15.56■□□□□ 0.08
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 Q8N3U1 123 aa15.56■□□□□ 0.08
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 H3BQ85 93 aa15.55■□□□□ 0.08
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 LINC00474Q9P2X8 69 aa15.55■□□□□ 0.08
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SPG11Q96JI7 2443 aa15.54■□□□□ 0.08
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa15.54■□□□□ 0.08
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 WFDC11Q8NEX6 87 aa15.54■□□□□ 0.08
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TM2D3Q9BRN9 247 aa15.54■□□□□ 0.08
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 Q8NDZ9 215 aa15.53■□□□□ 0.08
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 NOTCH3Q9UM47 2321 aa15.53■□□□□ 0.08
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MIFP14174 115 aa15.53■□□□□ 0.08
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP15.52■□□□□ 0.08
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 F8WDY8 70 aa15.52■□□□□ 0.08
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ITPR1Q14643 2758 aa15.52■□□□□ 0.08
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ZNF843Q8N446 348 aa15.51■□□□□ 0.07
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PLA2G2AP14555 144 aa15.51■□□□□ 0.07
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CLPSL2Q6UWE3 100 aa15.5■□□□□ 0.07
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PKIGQ9Y2B9 76 aa15.5■□□□□ 0.07
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ERC2-IT1O76042 136 aa15.49■□□□□ 0.07
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa15.49■□□□□ 0.07
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MUC7Q8TAX7 377 aa15.49■□□□□ 0.07
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CD164L2Q6UWJ8 174 aa15.48■□□□□ 0.07
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa15.48■□□□□ 0.07
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 Q6ZQY7 126 aa15.47■□□□□ 0.07
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 NREPQ16612 68 aa15.47■□□□□ 0.07
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SPATA3Q8NHX4 192 aa15.47■□□□□ 0.07
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CELSR2Q9HCU4 2923 aa15.46■□□□□ 0.07
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 LINC00269Q8N2A0 174 aa15.45■□□□□ 0.06
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TMEM254Q8TBM7 123 aa15.45■□□□□ 0.06
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa15.45■□□□□ 0.06
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 GYPEP15421 78 aa15.44■□□□□ 0.06
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 IGLV6-57P01721 117 aa15.44■□□□□ 0.06
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CCL24O00175 119 aa15.42■□□□□ 0.06
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 BRK1Q8WUW1 75 aa15.42■□□□□ 0.06
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP15.42■□□□□ 0.06
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 WFDC10AQ9H1F0 79 aa15.42■□□□□ 0.06
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SCXQ7RTU7 201 aa15.41■□□□□ 0.06
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 BPY2O14599 106 aa15.4■□□□□ 0.06
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CSMD2Q7Z408 3487 aa15.4■□□□□ 0.06
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 IGHV4-31P0DP07 118 aa15.39■□□□□ 0.05
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 DEFB130BP0DP73 79 aa15.39■□□□□ 0.05
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 DEFB130AP0DP74 79 aa15.39■□□□□ 0.05
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 FAM229BQ4G0N7 80 aa15.38■□□□□ 0.05
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CHD6Q8TD26 2715 aa15.38■□□□□ 0.05
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CR1P17927 2039 aa15.38■□□□□ 0.05
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 C19orf73Q9NVV2 129 aa15.37■□□□□ 0.05
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 WNK1Q9H4A3 2382 aa15.36■□□□□ 0.05
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 IGSF10Q6WRI0 2623 aa15.36■□□□□ 0.05
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MXRA5Q9NR99 2828 aa15.35■□□□□ 0.05
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa15.35■□□□□ 0.05
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 C1orf195Q5TG92 126 aa15.35■□□□□ 0.05
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 LINC00612Q8N6U2 182 aa15.35■□□□□ 0.05
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 LINC01006Q8NI28 216 aa15.35■□□□□ 0.05
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 A0A0U1RQV1 116 aa15.34■□□□□ 0.05
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