RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000294304.11

LRP5-201, Transcript of LDL receptor related protein 5, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRP5, Length 5,159 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP5-201ENST00000294304 SCXQ7RTU7 201 aa14.99□□□□□ -0.01
LRP5-201ENST00000294304 LINC00474Q9P2X8 69 aa14.99□□□□□ -0.01
LRP5-201ENST00000294304 CHD9Q3L8U1 2897 aa14.98□□□□□ -0.01
LRP5-201ENST00000294304 KLK9Q2XQG4 91 aa14.98□□□□□ -0.01
LRP5-201ENST00000294304 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa14.97□□□□□ -0.01
LRP5-201ENST00000294304 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
LRP5-201ENST00000294304 USP17L23D6RBM5 183 aa14.97□□□□□ -0.01
LRP5-201ENST00000294304 CELA1Q9UNI1 258 aa14.97□□□□□ -0.01
LRP5-201ENST00000294304 TMEM258P61165 79 aa14.96□□□□□ -0.01
LRP5-201ENST00000294304 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.02
LRP5-201ENST00000294304 ENHOQ6UWT2 76 aa14.95□□□□□ -0.02
LRP5-201ENST00000294304 SS18L2Q9UHA2 77 aa14.95□□□□□ -0.02
LRP5-201ENST00000294304 C3orf84H3BNL1 204 aa14.95□□□□□ -0.02
LRP5-201ENST00000294304 C6orf223Q8N319 242 aa14.95□□□□□ -0.02
LRP5-201ENST00000294304 F8P00451 2351 aa14.94□□□□□ -0.02
LRP5-201ENST00000294304 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa14.94□□□□□ -0.02
LRP5-201ENST00000294304 PRR3P79522 188 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
LRP5-201ENST00000294304 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
LRP5-201ENST00000294304 RPL28P46779 137 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
LRP5-201ENST00000294304 PLAC8L1A1L4L8 177 aa14.92□□□□□ -0.02
LRP5-201ENST00000294304 LINC01546A6NGU7 62 aa14.92□□□□□ -0.02
LRP5-201ENST00000294304 WFDC9Q8NEX5 89 aa14.92□□□□□ -0.02
LRP5-201ENST00000294304 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
LRP5-201ENST00000294304 M0QXV9 152 aa14.91□□□□□ -0.02
LRP5-201ENST00000294304 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa14.91□□□□□ -0.02
LRP5-201ENST00000294304 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa14.9□□□□□ -0.02
LRP5-201ENST00000294304 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
LRP5-201ENST00000294304 LINC01561Q8N1V8 128 aa14.89□□□□□ -0.03
LRP5-201ENST00000294304 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa14.89□□□□□ -0.03
LRP5-201ENST00000294304 C2orf48Q96LS8 159 aa14.88□□□□□ -0.03
LRP5-201ENST00000294304 HECTD1Q9ULT8 2610 aa14.88□□□□□ -0.03
LRP5-201ENST00000294304 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa14.87□□□□□ -0.03
LRP5-201ENST00000294304 X6R8D5 127 aa14.86□□□□□ -0.03
LRP5-201ENST00000294304 F8WDY8 70 aa14.86□□□□□ -0.03
LRP5-201ENST00000294304 Q8N814 137 aa14.85□□□□□ -0.03
LRP5-201ENST00000294304 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
LRP5-201ENST00000294304 IGKV4-1P06312 121 aa14.84□□□□□ -0.03
LRP5-201ENST00000294304 NDUFC2O95298 119 aa14.84□□□□□ -0.03
LRP5-201ENST00000294304 C20orf197Q8N268 126 aa14.82□□□□□ -0.04
LRP5-201ENST00000294304 Q9UF83 564 aa14.82□□□□□ -0.04
LRP5-201ENST00000294304 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa14.81□□□□□ -0.04
LRP5-201ENST00000294304 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa14.81□□□□□ -0.04
LRP5-201ENST00000294304 A0A087WYN8 130 aa14.81□□□□□ -0.04
LRP5-201ENST00000294304 A0A096LNT2 108 aa14.81□□□□□ -0.04
LRP5-201ENST00000294304 REG3GQ6UW15 175 aa14.8□□□□□ -0.04
LRP5-201ENST00000294304 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa14.8□□□□□ -0.04
LRP5-201ENST00000294304 Q6ZRU5 148 aa14.8□□□□□ -0.04
LRP5-201ENST00000294304 MUC4Q99102 2169 aa14.79□□□□□ -0.04
LRP5-201ENST00000294304 SPINK6Q6UWN8 80 aa14.79□□□□□ -0.04
LRP5-201ENST00000294304 HRCT1Q6UXD1 115 aa14.79□□□□□ -0.04
LRP5-201ENST00000294304 UQCRQO14949 82 aa14.78□□□□□ -0.04
LRP5-201ENST00000294304 ESRGQ1W209 222 aa14.78□□□□□ -0.04
LRP5-201ENST00000294304 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa14.78□□□□□ -0.04
LRP5-201ENST00000294304 IMUPQ9GZP8 106 aa14.77□□□□□ -0.05
LRP5-201ENST00000294304 LINC01556Q5JQF7 62 aa14.76□□□□□ -0.05
LRP5-201ENST00000294304 SBSPONQ8IVN8 264 aa14.75□□□□□ -0.05
LRP5-201ENST00000294304 C1orf134Q5TEV5 83 aa14.74□□□□□ -0.05
LRP5-201ENST00000294304 XGP55808 180 aa14.74□□□□□ -0.05
LRP5-201ENST00000294304 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
LRP5-201ENST00000294304 LINC00337Q8N6G1 96 aa14.73□□□□□ -0.05
LRP5-201ENST00000294304 C5orf47Q569G3 176 aa14.73□□□□□ -0.05
LRP5-201ENST00000294304 J3KT08 172 aa14.72□□□□□ -0.05
LRP5-201ENST00000294304 C10orf25Q5T742 122 aa14.72□□□□□ -0.05
LRP5-201ENST00000294304 H3BNG1 76 aa14.72□□□□□ -0.05
LRP5-201ENST00000294304 WFDC13Q8IUB5 93 aa14.71□□□□□ -0.05
LRP5-201ENST00000294304 C1orf137Q5JT78 98 aa14.71□□□□□ -0.06
LRP5-201ENST00000294304 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa14.7□□□□□ -0.06
LRP5-201ENST00000294304 Q8NAQ8 132 aa14.7□□□□□ -0.06
LRP5-201ENST00000294304 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa14.7□□□□□ -0.06
LRP5-201ENST00000294304 TRANK1O15050 2925 aa14.69□□□□□ -0.06
LRP5-201ENST00000294304 PRYO14603 147 aa14.68□□□□□ -0.06
LRP5-201ENST00000294304 Q6JHZ5 121 aa14.68□□□□□ -0.06
LRP5-201ENST00000294304 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
LRP5-201ENST00000294304 C3orf22Q8N5N4 141 aa14.67□□□□□ -0.06
LRP5-201ENST00000294304 LAMA3Q16787 3333 aa14.67□□□□□ -0.06
LRP5-201ENST00000294304 A8MTW9 85 aa14.66□□□□□ -0.06
LRP5-201ENST00000294304 LINC00575Q6W349 94 aa14.65□□□□□ -0.06
LRP5-201ENST00000294304 MDFIQ99750 246 aa14.65□□□□□ -0.06
LRP5-201ENST00000294304 SERP2Q8N6R1 65 aa14.64□□□□□ -0.07
LRP5-201ENST00000294304 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa14.63□□□□□ -0.07
LRP5-201ENST00000294304 C22orf24Q9Y442 160 aa14.61□□□□□ -0.07
LRP5-201ENST00000294304 Q8N3U1 123 aa14.6□□□□□ -0.07
LRP5-201ENST00000294304 C6orf48Q9UBA6 75 aa14.59□□□□□ -0.07
LRP5-201ENST00000294304 Q9BRP9 147 aa14.59□□□□□ -0.07
LRP5-201ENST00000294304 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa14.58□□□□□ -0.07
LRP5-201ENST00000294304 FAM236CP0DP71 79 aa14.58□□□□□ -0.07
LRP5-201ENST00000294304 CASC2Q6XLA1 102 aa14.57□□□□□ -0.08
LRP5-201ENST00000294304 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa14.56□□□□□ -0.08
LRP5-201ENST00000294304 PRLHP81277 87 aa14.56□□□□□ -0.08
LRP5-201ENST00000294304 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa14.55□□□□□ -0.08
LRP5-201ENST00000294304 SNURFQ9Y675 71 aa14.54□□□□□ -0.08
LRP5-201ENST00000294304 Q6Q795 121 aa14.54□□□□□ -0.08
LRP5-201ENST00000294304 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa14.53□□□□□ -0.08
LRP5-201ENST00000294304 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa14.53□□□□□ -0.08
LRP5-201ENST00000294304 COX7CP15954 63 aa14.53□□□□□ -0.08
LRP5-201ENST00000294304 BRCA2P51587 3418 aa14.51□□□□□ -0.09
LRP5-201ENST00000294304 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
LRP5-201ENST00000294304 LINC00588Q9Y4M8 146 aa14.5□□□□□ -0.09
LRP5-201ENST00000294304 A0A087WVE0 104 aa14.5□□□□□ -0.09
LRP5-201ENST00000294304 NDUFC1O43677 76 aa14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.8 ms