RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262963.10

PTPRS-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type S, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRS, Length 4,766 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRS-201ENST00000262963 CYSRT1A8MQ03 144 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRS-201ENST00000262963 SCXQ7RTU7 201 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRS-201ENST00000262963 C16orf95Q9H693 158 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRS-201ENST00000262963 C7orf33Q8WU49 177 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRS-201ENST00000262963 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
PTPRS-201ENST00000262963 A0A0J9YWU9 116 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRS-201ENST00000262963 SMIM1B2RUZ4 78 aa8.71□□□□□ -1.01
PTPRS-201ENST00000262963 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.01
PTPRS-201ENST00000262963 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
PTPRS-201ENST00000262963 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
PTPRS-201ENST00000262963 LRCOL1A6NCL2 159 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRS-201ENST00000262963 IMUPQ9GZP8 106 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRS-201ENST00000262963 BEAN1Q3B7T3 259 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRS-201ENST00000262963 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
PTPRS-201ENST00000262963 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRS-201ENST00000262963 NDUFC2O95298 119 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRS-201ENST00000262963 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRS-201ENST00000262963 C3orf84H3BNL1 204 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRS-201ENST00000262963 FHL2Q14192 279 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRS-201ENST00000262963 AMELXQ99217 191 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRS-201ENST00000262963 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
PTPRS-201ENST00000262963 USP17L23D6RBM5 183 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRS-201ENST00000262963 LINC00474Q9P2X8 69 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRS-201ENST00000262963 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRS-201ENST00000262963 M0R2N4 97 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRS-201ENST00000262963 LINC00694P0DN24 101 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRS-201ENST00000262963 PPDPFQ9H3Y8 114 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRS-201ENST00000262963 DSPP15924 2871 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
PTPRS-201ENST00000262963 F8P00451 2351 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRS-201ENST00000262963 RPL37AP8A6NKH3 93 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRS-201ENST00000262963 C3orf22Q8N5N4 141 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRS-201ENST00000262963 USP24Q9UPU5 2620 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRS-201ENST00000262963 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRS-201ENST00000262963 FAM236CP0DP71 79 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRS-201ENST00000262963 RPL28P46779 137 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
PTPRS-201ENST00000262963 SEC61GP60059 68 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRS-201ENST00000262963 MUC4Q99102 2169 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRS-201ENST00000262963 TSPEAR-AS2P59090 65 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRS-201ENST00000262963 COX6A2Q02221 97 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRS-201ENST00000262963 SERP2Q8N6R1 65 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRS-201ENST00000262963 RETNQ9HD89 108 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRS-201ENST00000262963 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
PTPRS-201ENST00000262963 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRS-201ENST00000262963 Q6ZTC4 211 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRS-201ENST00000262963 WFDC10BQ8IUB3 73 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRS-201ENST00000262963 A0A1B0GUV1 79 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRS-201ENST00000262963 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRS-201ENST00000262963 XGP55808 180 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRS-201ENST00000262963 CASC2Q6XLA1 102 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRS-201ENST00000262963 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRS-201ENST00000262963 LY6G6CO95867 125 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRS-201ENST00000262963 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRS-201ENST00000262963 NUPR2A6NF83 97 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRS-201ENST00000262963 PLAC8L1A1L4L8 177 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRS-201ENST00000262963 Q6ZSN1 163 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRS-201ENST00000262963 NDUFC1O43677 76 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRS-201ENST00000262963 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
PTPRS-201ENST00000262963 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRS-201ENST00000262963 SPINK6Q6UWN8 80 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRS-201ENST00000262963 Q6JHZ5 121 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRS-201ENST00000262963 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRS-201ENST00000262963 WFDC13Q8IUB5 93 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRS-201ENST00000262963 Q8N2B8 174 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRS-201ENST00000262963 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
PTPRS-201ENST00000262963 CFAP46Q8IYW2 2715 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRS-201ENST00000262963 Q8N814 137 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRS-201ENST00000262963 FRYQ5TBA9 3013 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRS-201ENST00000262963 M0QXV9 152 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRS-201ENST00000262963 F8WDY8 70 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRS-201ENST00000262963 AKAP13Q12802 2813 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRS-201ENST00000262963 LINC00315P59091 139 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRS-201ENST00000262963 LINC01561Q8N1V8 128 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRS-201ENST00000262963 C6orf223Q8N319 242 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRS-201ENST00000262963 SPEGQ15772 3267 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRS-201ENST00000262963 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRS-201ENST00000262963 CCDC179H3BU77 68 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRS-201ENST00000262963 SVIPQ8NHG7 77 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRS-201ENST00000262963 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
PTPRS-201ENST00000262963 COX7CP15954 63 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRS-201ENST00000262963 C2orf48Q96LS8 159 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRS-201ENST00000262963 FAM19A4Q96LR4 140 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRS-201ENST00000262963 ITPR3Q14573 2671 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRS-201ENST00000262963 NBEAQ8NFP9 2946 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRS-201ENST00000262963 Q6Q795 121 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRS-201ENST00000262963 LYPD5Q6UWN5 251 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRS-201ENST00000262963 PRR3P79522 188 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
PTPRS-201ENST00000262963 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRS-201ENST00000262963 C11orf72Q8NBR9 251 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRS-201ENST00000262963 COL6A3P12111 3177 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRS-201ENST00000262963 BRK1Q8WUW1 75 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRS-201ENST00000262963 C1orf137Q5JT78 98 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRS-201ENST00000262963 C10orf25Q5T742 122 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRS-201ENST00000262963 FRYLO94915 3013 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRS-201ENST00000262963 REG3GQ6UW15 175 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRS-201ENST00000262963 ATRQ13535 2644 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRS-201ENST00000262963 HRCT1Q6UXD1 115 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRS-201ENST00000262963 MGAM2Q2M2H8 2515 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRS-201ENST00000262963 MPLKIPQ8TAP9 179 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRS-201ENST00000262963 A0A087WYN8 130 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRS-201ENST00000262963 SNURFQ9Y675 71 aa8.52□□□□□ -1.05
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