RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233072.9

CPS1-201, Transcript of carbamoyl-phosphate synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CPS1, Length 5,821 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1-201ENST00000233072 MDFIQ99750 246 aa5.01□□□□□ -1.61
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CPS1-201ENST00000233072 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa5□□□□□ -1.61
CPS1-201ENST00000233072 KIAA0087Q14695 138 aa5□□□□□ -1.61
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CPS1-201ENST00000233072 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
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CPS1-201ENST00000233072 CACNA1BQ00975 2339 aa4.94□□□□□ -1.62
CPS1-201ENST00000233072 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa4.93□□□□□ -1.62
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CPS1-201ENST00000233072 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
CPS1-201ENST00000233072 IGKV2-30P06310 120 aa4.93□□□□□ -1.62
CPS1-201ENST00000233072 LINC00476Q8WZB0 136 aa4.93□□□□□ -1.62
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CPS1-201ENST00000233072 Q8NAQ8 132 aa4.93□□□□□ -1.62
CPS1-201ENST00000233072 A8MTW9 85 aa4.92□□□□□ -1.62
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CPS1-201ENST00000233072 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
CPS1-201ENST00000233072 CEP250Q9BV73 2442 aa4.91□□□□□ -1.62
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CPS1-201ENST00000233072 PRO0461Q9UI25 63 aa4.9□□□□□ -1.62
CPS1-201ENST00000233072 FREM1Q5H8C1 2179 aa4.9□□□□□ -1.62
CPS1-201ENST00000233072 A8MWP4 228 aa4.9□□□□□ -1.62
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CPS1-201ENST00000233072 LINC00588Q9Y4M8 146 aa4.9□□□□□ -1.63
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CPS1-201ENST00000233072 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa4.89□□□□□ -1.63
CPS1-201ENST00000233072 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa4.89□□□□□ -1.63
CPS1-201ENST00000233072 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa4.89□□□□□ -1.63
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CPS1-201ENST00000233072 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa4.88□□□□□ -1.63
CPS1-201ENST00000233072 ABCA4P78363 2273 aa4.88□□□□□ -1.63
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CPS1-201ENST00000233072 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa4.86□□□□□ -1.63
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CPS1-201ENST00000233072 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa4.85□□□□□ -1.63
CPS1-201ENST00000233072 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
CPS1-201ENST00000233072 TLX1NBP0CAT3 122 aa4.85□□□□□ -1.63
CPS1-201ENST00000233072 Q96NJ1 140 aa4.84□□□□□ -1.63
CPS1-201ENST00000233072 COA5Q86WW8 74 aa4.84□□□□□ -1.63
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