RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640421.1

SPIN3-238, Transcript of spindlin family member 3, human

TSL 5

Gene SPIN3, Length 1,872 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPIN3-238	ENST00000640421	XCL1	P47992	114 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SPIN3-238	ENST00000640421	NFE4	Q86UQ8	179 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SPIN3-238	ENST00000640421	CHCHD10	Q8WYQ3	142 aa	Predicted RBP	11.89	□□□□□ -0.51
SPIN3-238	ENST00000640421	DPM2	O94777	84 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SPIN3-238	ENST00000640421	SS18	Q15532	418 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SPIN3-238	ENST00000640421	MIA	Q16674	131 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SPIN3-238	ENST00000640421	CDPF1	Q6NVV7	123 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SPIN3-238	ENST00000640421	C20orf202	A1L168	122 aa		11.87	□□□□□ -0.51
SPIN3-238	ENST00000640421		K7EP13	123 aa		11.87	□□□□□ -0.51
SPIN3-238	ENST00000640421		M0R2N4	97 aa		11.87	□□□□□ -0.51
SPIN3-238	ENST00000640421	IGKC	P01834	107 aa		11.87	□□□□□ -0.51
SPIN3-238	ENST00000640421	KRTAP26-1	Q6PEX3	210 aa		11.87	□□□□□ -0.51
SPIN3-238	ENST00000640421	FRAS1	Q86XX4	4008 aa		11.87	□□□□□ -0.51
SPIN3-238	ENST00000640421	CDKN2A-AS1	Q9UH64	79 aa		11.87	□□□□□ -0.51
SPIN3-238	ENST00000640421	IGHV3OR16-9	A0A0B4J2B5	98 aa		11.86	□□□□□ -0.51
SPIN3-238	ENST00000640421	ZNF22	P17026	224 aa	Predicted RBP	11.86	□□□□□ -0.51
SPIN3-238	ENST00000640421	PLN	P26678	52 aa		11.86	□□□□□ -0.51
SPIN3-238	ENST00000640421	HERVK_113	P63121	156 aa		11.85	□□□□□ -0.51
SPIN3-238	ENST00000640421	GEMIN7	Q9H840	131 aa	Known RBP	11.85	□□□□□ -0.51
SPIN3-238	ENST00000640421	IGLV5-45	A0A087WSX0	123 aa		11.85	□□□□□ -0.51
SPIN3-238	ENST00000640421	TRAV8-3	A0A0A6YYJ7	113 aa		11.85	□□□□□ -0.51
SPIN3-238	ENST00000640421	TRAV8-4	A0A0B4J246	113 aa		11.85	□□□□□ -0.51
SPIN3-238	ENST00000640421	MAJIN	Q3KP22	176 aa		11.85	□□□□□ -0.51
SPIN3-238	ENST00000640421	TTC32	Q5I0X7	151 aa		11.85	□□□□□ -0.51
SPIN3-238	ENST00000640421	RYR2	Q92736	4967 aa		11.84	□□□□□ -0.51
SPIN3-238	ENST00000640421	IGKV2D-24	A0A075B6R9	120 aa		11.84	□□□□□ -0.51
SPIN3-238	ENST00000640421	GAGE12H	A6NDE8	117 aa		11.84	□□□□□ -0.51
SPIN3-238	ENST00000640421	FOXI1	Q12951	378 aa		11.84	□□□□□ -0.51
SPIN3-238	ENST00000640421		Q6ZR54	194 aa		11.84	□□□□□ -0.51
SPIN3-238	ENST00000640421	LINC00469	Q8N7U9	141 aa		11.84	□□□□□ -0.51
SPIN3-238	ENST00000640421	TMEM170B	Q5T4T1	132 aa		11.83	□□□□□ -0.52
SPIN3-238	ENST00000640421	CD164L2	Q6UWJ8	174 aa		11.83	□□□□□ -0.52
SPIN3-238	ENST00000640421	C1orf43	Q9BWL3	253 aa		11.83	□□□□□ -0.52
SPIN3-238	ENST00000640421	SEC11A	P67812	179 aa		11.83	□□□□□ -0.52
SPIN3-238	ENST00000640421	C5orf38	Q86SI9	138 aa		11.83	□□□□□ -0.52
SPIN3-238	ENST00000640421	hDV102S1	A0JD36	115 aa		11.82	□□□□□ -0.52
SPIN3-238	ENST00000640421	STPG4	Q8N801	248 aa		11.82	□□□□□ -0.52
SPIN3-238	ENST00000640421	DNAH17	Q9UFH2	4485 aa		11.81	□□□□□ -0.52
SPIN3-238	ENST00000640421	MAPKAPK5-AS1	Q8N8E1	139 aa		11.81	□□□□□ -0.52
SPIN3-238	ENST00000640421		A0A087WZ39	114 aa		11.8	□□□□□ -0.52
SPIN3-238	ENST00000640421	SPINK8	P0C7L1	97 aa		11.8	□□□□□ -0.52
SPIN3-238	ENST00000640421	S100A12	P80511	92 aa		11.8	□□□□□ -0.52
SPIN3-238	ENST00000640421	TMEM223	A0PJW6	202 aa		11.79	□□□□□ -0.52
SPIN3-238	ENST00000640421	IGHV3-64	A0A075B6Q5	118 aa		11.78	□□□□□ -0.52
SPIN3-238	ENST00000640421	LCE6A	A0A183	80 aa		11.78	□□□□□ -0.52
SPIN3-238	ENST00000640421	SMIM1	B2RUZ4	78 aa		11.78	□□□□□ -0.52
SPIN3-238	ENST00000640421	COX7A2L	O14548	114 aa		11.78	□□□□□ -0.52
SPIN3-238	ENST00000640421	ANKRD39	Q53RE8	183 aa		11.78	□□□□□ -0.52
SPIN3-238	ENST00000640421		Q6ZRN7	208 aa	Predicted RBP	11.78	□□□□□ -0.52
SPIN3-238	ENST00000640421	RMI2	Q96E14	147 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SPIN3-238	ENST00000640421	FAT2	Q9NYQ8	4349 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SPIN3-238	ENST00000640421		H3BRM9	83 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SPIN3-238	ENST00000640421	IGKV2D-26	A0A0A0MRZ7	120 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SPIN3-238	ENST00000640421	IGLV5-39	A0A0G2JS06	123 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SPIN3-238	ENST00000640421	TSPEAR-AS2	P59090	65 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SPIN3-238	ENST00000640421	C6orf223	Q8N319	242 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SPIN3-238	ENST00000640421	C15orf56	Q8N910	161 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SPIN3-238	ENST00000640421	PAM16	Q9Y3D7	125 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SPIN3-238	ENST00000640421	MAL	P21145	153 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SPIN3-238	ENST00000640421	VAMP8	Q9BV40	100 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SPIN3-238	ENST00000640421	IGHV1-58	A0A0C4DH39	117 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SPIN3-238	ENST00000640421		E9PLD3	99 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SPIN3-238	ENST00000640421	WFDC2	Q14508	124 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SPIN3-238	ENST00000640421	TM2D2	Q9BX73	214 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SPIN3-238	ENST00000640421	COX11	Q9Y6N1	276 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SPIN3-238	ENST00000640421	HECTD4	Q9Y4D8	3996 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SPIN3-238	ENST00000640421	RYR3	Q15413	4870 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SPIN3-238	ENST00000640421	LECT2	O14960	151 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SPIN3-238	ENST00000640421	LINC01561	Q8N1V8	128 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SPIN3-238	ENST00000640421	TTTY13	Q9BZ97	58 aa		11.71	□□□□□ -0.53
SPIN3-238	ENST00000640421	HSBP1L1	C9JCN9	74 aa		11.7	□□□□□ -0.54
SPIN3-238	ENST00000640421	PSCA	O43653	123 aa		11.7	□□□□□ -0.54
SPIN3-238	ENST00000640421	HERVK_113	P61574	105 aa		11.7	□□□□□ -0.54
SPIN3-238	ENST00000640421	SPATA45	Q537H7	98 aa		11.7	□□□□□ -0.54
SPIN3-238	ENST00000640421	C1orf134	Q5TEV5	83 aa		11.7	□□□□□ -0.54
SPIN3-238	ENST00000640421	ORAOV1	Q8WV07	137 aa		11.7	□□□□□ -0.54
SPIN3-238	ENST00000640421	LINC00526	Q96FQ7	95 aa		11.7	□□□□□ -0.54
SPIN3-238	ENST00000640421	DNAH11	Q96DT5	4516 aa		11.7	□□□□□ -0.54
SPIN3-238	ENST00000640421	LINC00587	B1AMM8	73 aa		11.7	□□□□□ -0.54
SPIN3-238	ENST00000640421	USP17L23	D6RBM5	183 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SPIN3-238	ENST00000640421	LEPROT	O15243	131 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SPIN3-238	ENST00000640421	KIAA0087	Q14695	138 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SPIN3-238	ENST00000640421	TOMM7	Q9P0U1	55 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SPIN3-238	ENST00000640421	NMU	P48645	174 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SPIN3-238	ENST00000640421	HIGD2B	Q4VC39	106 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SPIN3-238	ENST00000640421		J3QQQ9	107 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SPIN3-238	ENST00000640421	TP73-AS1	Q9UF72	201 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SPIN3-238	ENST00000640421	LRCOL1	A6NCL2	159 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SPIN3-238	ENST00000640421	APOM	O95445	188 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SPIN3-238	ENST00000640421	PCP2	Q8IVA1	136 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SPIN3-238	ENST00000640421	COX7B2	Q8TF08	81 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SPIN3-238	ENST00000640421	SPAG11B	Q08648	103 aa		11.66	□□□□□ -0.54
SPIN3-238	ENST00000640421	CTAG1A	P78358	180 aa		11.66	□□□□□ -0.54
SPIN3-238	ENST00000640421		Q8IZM0	81 aa		11.66	□□□□□ -0.54
SPIN3-238	ENST00000640421	GVQW2	A0A096LPI5	108 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
SPIN3-238	ENST00000640421	RTL8C	O15255	209 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SPIN3-238	ENST00000640421	C2orf82	Q6UX34	121 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SPIN3-238	ENST00000640421	PLEKHB2	Q96CS7	222 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SPIN3-238	ENST00000640421	C14orf144	Q96I85	54 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SPIN3-238	ENST00000640421	PKD1	P98161	4303 aa		11.63	□□□□□ -0.55

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