RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636120.1

PDE4D-228, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PDE4D, Length 6,659 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-228ENST00000636120 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
PDE4D-228ENST00000636120 POM121L12Q8N7R1 296 aa4.63□□□□□ -1.67
PDE4D-228ENST00000636120 J3KT08 172 aa4.63□□□□□ -1.67
PDE4D-228ENST00000636120 SLPIP03973 132 aa4.63□□□□□ -1.67
PDE4D-228ENST00000636120 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa4.62□□□□□ -1.67
PDE4D-228ENST00000636120 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP4.62□□□□□ -1.67
PDE4D-228ENST00000636120 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP4.62□□□□□ -1.67
PDE4D-228ENST00000636120 A0A096LNJ9 63 aa4.62□□□□□ -1.67
PDE4D-228ENST00000636120 CYSRT1A8MQ03 144 aa4.62□□□□□ -1.67
PDE4D-228ENST00000636120 COX6A2Q02221 97 aa4.62□□□□□ -1.67
PDE4D-228ENST00000636120 WFDC9Q8NEX5 89 aa4.62□□□□□ -1.67
PDE4D-228ENST00000636120 RPL28P46779 137 aaKnown RBP4.61□□□□□ -1.67
PDE4D-228ENST00000636120 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa4.61□□□□□ -1.67
PDE4D-228ENST00000636120 UQCRQO14949 82 aa4.61□□□□□ -1.67
PDE4D-228ENST00000636120 C2orf48Q96LS8 159 aa4.61□□□□□ -1.67
PDE4D-228ENST00000636120 MT-ATP8P03928 68 aa4.61□□□□□ -1.67
PDE4D-228ENST00000636120 C11orf72Q8NBR9 251 aa4.61□□□□□ -1.67
PDE4D-228ENST00000636120 FHL3Q13643 280 aa4.6□□□□□ -1.67
PDE4D-228ENST00000636120 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
PDE4D-228ENST00000636120 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa4.6□□□□□ -1.67
PDE4D-228ENST00000636120 LINC00694P0DN24 101 aa4.6□□□□□ -1.67
PDE4D-228ENST00000636120 SDIM1Q6ZPB5 146 aa4.6□□□□□ -1.67
PDE4D-228ENST00000636120 TNCP24821 2201 aa4.6□□□□□ -1.67
PDE4D-228ENST00000636120 Q6ZSN1 163 aa4.6□□□□□ -1.67
PDE4D-228ENST00000636120 RETNQ9HD89 108 aa4.6□□□□□ -1.67
PDE4D-228ENST00000636120 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
PDE4D-228ENST00000636120 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa4.6□□□□□ -1.67
PDE4D-228ENST00000636120 CACNA1GO43497 2377 aa4.6□□□□□ -1.67
PDE4D-228ENST00000636120 M0QXV9 152 aa4.6□□□□□ -1.67
PDE4D-228ENST00000636120 CCKP06307 115 aa4.6□□□□□ -1.67
PDE4D-228ENST00000636120 TSPEAR-AS2P59090 65 aa4.6□□□□□ -1.67
PDE4D-228ENST00000636120 Q6ZQY7 126 aa4.6□□□□□ -1.67
PDE4D-228ENST00000636120 ABCA1O95477 2261 aa4.59□□□□□ -1.67
PDE4D-228ENST00000636120 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa4.59□□□□□ -1.67
PDE4D-228ENST00000636120 IGKV2D-28P01615 120 aa4.59□□□□□ -1.67
PDE4D-228ENST00000636120 ENHOQ6UWT2 76 aa4.59□□□□□ -1.67
PDE4D-228ENST00000636120 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP4.59□□□□□ -1.67
PDE4D-228ENST00000636120 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa4.59□□□□□ -1.67
PDE4D-228ENST00000636120 C3orf22Q8N5N4 141 aa4.59□□□□□ -1.67
PDE4D-228ENST00000636120 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.68
PDE4D-228ENST00000636120 Q6JHZ5 121 aa4.59□□□□□ -1.68
PDE4D-228ENST00000636120 LYPD5Q6UWN5 251 aa4.59□□□□□ -1.68
PDE4D-228ENST00000636120 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
PDE4D-228ENST00000636120 Q8N814 137 aa4.58□□□□□ -1.68
PDE4D-228ENST00000636120 FSHBP01225 129 aa4.58□□□□□ -1.68
PDE4D-228ENST00000636120 PLAC8L1A1L4L8 177 aa4.58□□□□□ -1.68
PDE4D-228ENST00000636120 Q6ZTC4 211 aa4.58□□□□□ -1.68
PDE4D-228ENST00000636120 NDUFC1O43677 76 aa4.58□□□□□ -1.68
PDE4D-228ENST00000636120 Q6Q795 121 aa4.58□□□□□ -1.68
PDE4D-228ENST00000636120 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa4.58□□□□□ -1.68
PDE4D-228ENST00000636120 LINC00526Q96FQ7 95 aa4.57□□□□□ -1.68
PDE4D-228ENST00000636120 REG3GQ6UW15 175 aa4.57□□□□□ -1.68
PDE4D-228ENST00000636120 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa4.57□□□□□ -1.68
PDE4D-228ENST00000636120 H3BNG1 76 aa4.57□□□□□ -1.68
PDE4D-228ENST00000636120 PRYO14603 147 aa4.57□□□□□ -1.68
PDE4D-228ENST00000636120 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa4.56□□□□□ -1.68
PDE4D-228ENST00000636120 LINC00315P59091 139 aa4.56□□□□□ -1.68
PDE4D-228ENST00000636120 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa4.56□□□□□ -1.68
PDE4D-228ENST00000636120 HIVEP2P31629 2446 aa4.56□□□□□ -1.68
PDE4D-228ENST00000636120 RPL37AP8A6NKH3 93 aa4.56□□□□□ -1.68
PDE4D-228ENST00000636120 C10orf25Q5T742 122 aa4.56□□□□□ -1.68
PDE4D-228ENST00000636120 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
PDE4D-228ENST00000636120 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa4.56□□□□□ -1.68
PDE4D-228ENST00000636120 LY6G6CO95867 125 aa4.56□□□□□ -1.68
PDE4D-228ENST00000636120 IGKV4-1P06312 121 aa4.56□□□□□ -1.68
PDE4D-228ENST00000636120 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa4.55□□□□□ -1.68
PDE4D-228ENST00000636120 USP17L23D6RBM5 183 aa4.55□□□□□ -1.68
PDE4D-228ENST00000636120 SERP2Q8N6R1 65 aa4.55□□□□□ -1.68
PDE4D-228ENST00000636120 BRK1Q8WUW1 75 aa4.55□□□□□ -1.68
PDE4D-228ENST00000636120 PLXNB1O43157 2135 aa4.55□□□□□ -1.68
PDE4D-228ENST00000636120 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa4.55□□□□□ -1.68
PDE4D-228ENST00000636120 M0R2N4 97 aa4.55□□□□□ -1.68
PDE4D-228ENST00000636120 FAM236CP0DP71 79 aa4.55□□□□□ -1.68
PDE4D-228ENST00000636120 NBASA2RRP1 2371 aa4.55□□□□□ -1.68
PDE4D-228ENST00000636120 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa4.55□□□□□ -1.68
PDE4D-228ENST00000636120 C3orf84H3BNL1 204 aa4.54□□□□□ -1.68
PDE4D-228ENST00000636120 SEC61GP60059 68 aa4.54□□□□□ -1.68
PDE4D-228ENST00000636120 SCXQ7RTU7 201 aa4.54□□□□□ -1.68
PDE4D-228ENST00000636120 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa4.54□□□□□ -1.68
PDE4D-228ENST00000636120 A0A087WYN8 130 aa4.54□□□□□ -1.68
PDE4D-228ENST00000636120 C1orf195Q5TG92 126 aa4.54□□□□□ -1.68
PDE4D-228ENST00000636120 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
PDE4D-228ENST00000636120 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
PDE4D-228ENST00000636120 WFDC10BQ8IUB3 73 aa4.53□□□□□ -1.68
PDE4D-228ENST00000636120 LINC01556Q5JQF7 62 aa4.53□□□□□ -1.68
PDE4D-228ENST00000636120 C20orf197Q8N268 126 aa4.53□□□□□ -1.68
PDE4D-228ENST00000636120 C6orf223Q8N319 242 aa4.53□□□□□ -1.68
PDE4D-228ENST00000636120 A0A096LNI7 61 aa4.52□□□□□ -1.69
PDE4D-228ENST00000636120 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa4.52□□□□□ -1.69
PDE4D-228ENST00000636120 CELA1Q9UNI1 258 aa4.52□□□□□ -1.69
PDE4D-228ENST00000636120 COX7CP15954 63 aa4.52□□□□□ -1.69
PDE4D-228ENST00000636120 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa4.52□□□□□ -1.69
PDE4D-228ENST00000636120 A0A0U1RQV1 116 aa4.52□□□□□ -1.69
PDE4D-228ENST00000636120 LRCOL1A6NCL2 159 aa4.52□□□□□ -1.69
PDE4D-228ENST00000636120 LINC00575Q6W349 94 aa4.52□□□□□ -1.69
PDE4D-228ENST00000636120 PPDPFQ9H3Y8 114 aa4.52□□□□□ -1.69
PDE4D-228ENST00000636120 NAV3Q8IVL0 2385 aa4.51□□□□□ -1.69
PDE4D-228ENST00000636120 XGP55808 180 aa4.51□□□□□ -1.69
PDE4D-228ENST00000636120 MED13LQ71F56 2210 aa4.51□□□□□ -1.69
PDE4D-228ENST00000636120 C1orf137Q5JT78 98 aa4.51□□□□□ -1.69
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