RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626874.2

CHD2-208, Transcript of chromodomain helicase DNA binding protein 2, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene CHD2, Length 7,764 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CHD2-208	ENST00000626874	EDN2	P20800	178 aa		5.1	□□□□□ -1.59
CHD2-208	ENST00000626874	HRCT1	Q6UXD1	115 aa		5.1	□□□□□ -1.59
CHD2-208	ENST00000626874	C3orf84	H3BNL1	204 aa		5.1	□□□□□ -1.59
CHD2-208	ENST00000626874	C19orf84	I3L1E1	186 aa		5.1	□□□□□ -1.59
CHD2-208	ENST00000626874	C16orf95	Q9H693	158 aa		5.1	□□□□□ -1.59
CHD2-208	ENST00000626874	PPDPF	Q9H3Y8	114 aa		5.1	□□□□□ -1.59
CHD2-208	ENST00000626874	LINC00959	A0A1B0GUT2	108 aa		5.1	□□□□□ -1.59
CHD2-208	ENST00000626874	ENHO	Q6UWT2	76 aa		5.1	□□□□□ -1.59
CHD2-208	ENST00000626874	NDUFV3	P56181	108 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
CHD2-208	ENST00000626874		Q8N2B8	174 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CHD2-208	ENST00000626874	TP53TG3	Q9ULZ0	132 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CHD2-208	ENST00000626874	C2CD3	Q4AC94	2353 aa		5.09	□□□□□ -1.6
CHD2-208	ENST00000626874	ESRG	Q1W209	222 aa		5.09	□□□□□ -1.6
CHD2-208	ENST00000626874	ZFAND3	Q9H8U3	227 aa		5.09	□□□□□ -1.6
CHD2-208	ENST00000626874	CPAMD8	Q8IZJ3	1885 aa		5.09	□□□□□ -1.6
CHD2-208	ENST00000626874	ZNF580	Q9UK33	172 aa		5.09	□□□□□ -1.6
CHD2-208	ENST00000626874	ZNF22	P17026	224 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
CHD2-208	ENST00000626874	C2orf48	Q96LS8	159 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CHD2-208	ENST00000626874	LINC01561	Q8N1V8	128 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CHD2-208	ENST00000626874	CEMP1	Q6PRD7	247 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
CHD2-208	ENST00000626874		Q6ZQY7	126 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CHD2-208	ENST00000626874	FN1	P02751	2386 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
CHD2-208	ENST00000626874	IGLV1-40	P01703	118 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CHD2-208	ENST00000626874	TP73-AS1	Q9UF72	201 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CHD2-208	ENST00000626874	FRMD6-AS1	P0C7T7	363 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CHD2-208	ENST00000626874	WFDC2	Q14508	124 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CHD2-208	ENST00000626874	WFDC13	Q8IUB5	93 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CHD2-208	ENST00000626874	MPLKIP	Q8TAP9	179 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CHD2-208	ENST00000626874	C1orf137	Q5JT78	98 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CHD2-208	ENST00000626874	KLLN	B2CW77	178 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CHD2-208	ENST00000626874	SDIM1	Q6ZPB5	146 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CHD2-208	ENST00000626874	RPL37AP8	A6NKH3	93 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CHD2-208	ENST00000626874	WFDC10A	Q9H1F0	79 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CHD2-208	ENST00000626874	TRBV7-6	A0A0J9YX20	115 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CHD2-208	ENST00000626874	LOC100131303	A0A0U1RQF7	123 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CHD2-208	ENST00000626874	LINC01556	Q5JQF7	62 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CHD2-208	ENST00000626874	NRAC	Q8N912	160 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CHD2-208	ENST00000626874	C20orf173	Q96LM9	149 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CHD2-208	ENST00000626874	IGLV1-51	P01701	117 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CHD2-208	ENST00000626874	IGLV2-14	P01704	120 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CHD2-208	ENST00000626874	CYSRT1	A8MQ03	144 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CHD2-208	ENST00000626874	BRI3	O95415	125 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CHD2-208	ENST00000626874		X6R8D5	127 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CHD2-208	ENST00000626874	EIF4EBP1	Q13541	118 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
CHD2-208	ENST00000626874	OXLD1	Q5BKU9	147 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CHD2-208	ENST00000626874		A0A1W2PNU3	283 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
CHD2-208	ENST00000626874	DEFB1	P60022	68 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CHD2-208	ENST00000626874	C1orf229	Q6ZS94	237 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
CHD2-208	ENST00000626874		Q8N6K4	173 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CHD2-208	ENST00000626874	ZNF80	P51504	273 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
CHD2-208	ENST00000626874	CSDC2	Q9Y534	153 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
CHD2-208	ENST00000626874	PLA2G1B	P04054	148 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
CHD2-208	ENST00000626874	TSHB	P01222	138 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CHD2-208	ENST00000626874	CDC42SE2	Q9NRR3	84 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CHD2-208	ENST00000626874	hDV103S1	A0JD37	113 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CHD2-208	ENST00000626874	TRIAP1	O43715	76 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CHD2-208	ENST00000626874	SCX	Q7RTU7	201 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CHD2-208	ENST00000626874		A0A1B0GUV1	79 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CHD2-208	ENST00000626874	LINC00173	Q6ZV60	143 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CHD2-208	ENST00000626874		Q9BRP9	147 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CHD2-208	ENST00000626874	IGHV6-1	A0A0B4J1U7	121 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CHD2-208	ENST00000626874	RNASE8	Q8TDE3	154 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
CHD2-208	ENST00000626874	SMIM11B	Q8TCY0	68 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CHD2-208	ENST00000626874	TP53AIP1	Q9HCN2	124 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CHD2-208	ENST00000626874	NUPR1	O60356	82 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CHD2-208	ENST00000626874	C6orf223	Q8N319	242 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CHD2-208	ENST00000626874	TRAV7	A0A075B6U4	112 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CHD2-208	ENST00000626874	SLPI	P03973	132 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CHD2-208	ENST00000626874	ABCA12	Q86UK0	2595 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CHD2-208	ENST00000626874	NTM-AS1	Q6ZSK4	140 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CHD2-208	ENST00000626874	JMJD1C	Q15652	2540 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CHD2-208	ENST00000626874		A0A1B0GW54	56 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CHD2-208	ENST00000626874	PTH2	Q96A98	100 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CHD2-208	ENST00000626874	GDF5OS	Q5U4N7	250 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CHD2-208	ENST00000626874	FAM30A	Q9NZY2	134 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CHD2-208	ENST00000626874	CRIP2	P52943	208 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
CHD2-208	ENST00000626874	MSMP	Q1L6U9	139 aa		5	□□□□□ -1.61
CHD2-208	ENST00000626874		J3QL48	77 aa		5	□□□□□ -1.61
CHD2-208	ENST00000626874	IGLV2-8	P01709	118 aa		5	□□□□□ -1.61
CHD2-208	ENST00000626874	RNASE3	P12724	160 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
CHD2-208	ENST00000626874	C11orf1	Q9H5F2	150 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CHD2-208	ENST00000626874	PLA2G2E	Q9NZK7	142 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CHD2-208	ENST00000626874	CELA1	Q9UNI1	258 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CHD2-208	ENST00000626874		Q8N814	137 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CHD2-208	ENST00000626874	CNFN	Q9BYD5	112 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CHD2-208	ENST00000626874		Q6ZTC4	211 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CHD2-208	ENST00000626874	TLN2	Q9Y4G6	2542 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CHD2-208	ENST00000626874	SMIM26	A0A096LP01	95 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CHD2-208	ENST00000626874	POLR2K	P53803	58 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
CHD2-208	ENST00000626874	POM121L12	Q8N7R1	296 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CHD2-208	ENST00000626874	LINC00208	Q96KT6	92 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CHD2-208	ENST00000626874	RETN	Q9HD89	108 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CHD2-208	ENST00000626874	IGLV2-11	P01706	119 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CHD2-208	ENST00000626874	PRO3102	Q9H379	93 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CHD2-208	ENST00000626874	FHL3	Q13643	280 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CHD2-208	ENST00000626874	LINC01547	P58512	204 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CHD2-208	ENST00000626874	COX7C	P15954	63 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CHD2-208	ENST00000626874		H3BNG1	76 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CHD2-208	ENST00000626874	USP9X	Q93008	2570 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CHD2-208	ENST00000626874	PTPRB	P23467	1997 aa		4.97	□□□□□ -1.61

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