RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620410.1

PTPRT-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 940 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-212ENST00000620410 SMDT1Q9H4I9 107 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRT-212ENST00000620410 C10orf25Q5T742 122 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRT-212ENST00000620410 REG3GQ6UW15 175 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRT-212ENST00000620410 SPINK6Q6UWN8 80 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRT-212ENST00000620410 CAMK2N2Q96S95 79 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRT-212ENST00000620410 APOMO95445 188 aa7□□□□□ -1.29
PTPRT-212ENST00000620410 HBBP68871 147 aa7□□□□□ -1.29
PTPRT-212ENST00000620410 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
PTPRT-212ENST00000620410 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
PTPRT-212ENST00000620410 Q6ZRP5 223 aa7□□□□□ -1.29
PTPRT-212ENST00000620410 TMEM18Q96B42 140 aa7□□□□□ -1.29
PTPRT-212ENST00000620410 SPAG11BQ08648 103 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRT-212ENST00000620410 SMAGPQ0VAQ4 97 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRT-212ENST00000620410 KIAA0087Q14695 138 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRT-212ENST00000620410 RNF151Q2KHN1 245 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRT-212ENST00000620410 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRT-212ENST00000620410 A0A0U1RQV1 116 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRT-212ENST00000620410 F8W036 122 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRT-212ENST00000620410 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRT-212ENST00000620410 TMEM136Q6ZRR5 245 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRT-212ENST00000620410 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
PTPRT-212ENST00000620410 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRT-212ENST00000620410 OR10D4PQ8NGN7 298 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRT-212ENST00000620410 ORAOV1Q8WV07 137 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRT-212ENST00000620410 SPANXA1Q9NS26 97 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRT-212ENST00000620410 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRT-212ENST00000620410 PKIGQ9Y2B9 76 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRT-212ENST00000620410 FAM168BA1KXE4 195 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRT-212ENST00000620410 PRSS47A8MTI9 375 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRT-212ENST00000620410 PPBPP02775 128 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRT-212ENST00000620410 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
PTPRT-212ENST00000620410 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRT-212ENST00000620410 PRELID3AQ96N28 172 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRT-212ENST00000620410 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
PTPRT-212ENST00000620410 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRT-212ENST00000620410 IFITM10A6NMD0 228 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRT-212ENST00000620410 S100A8P05109 93 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRT-212ENST00000620410 LINC00242Q5T6M2 205 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRT-212ENST00000620410 ORMDL3Q8N138 153 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRT-212ENST00000620410 C6orf48Q9UBA6 75 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRT-212ENST00000620410 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRT-212ENST00000620410 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRT-212ENST00000620410 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRT-212ENST00000620410 A0A087WZ39 114 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRT-212ENST00000620410 TLX1NBP0CAT3 122 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRT-212ENST00000620410 C2orf82Q6UX34 121 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRT-212ENST00000620410 LINC00173Q6ZV60 143 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRT-212ENST00000620410 F8WDY8 70 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRT-212ENST00000620410 NDUFA1O15239 70 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRT-212ENST00000620410 RAB5AP20339 215 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRT-212ENST00000620410 UBE2D1P51668 147 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRT-212ENST00000620410 C1orf137Q5JT78 98 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRT-212ENST00000620410 MT-ND6P03923 174 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRT-212ENST00000620410 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
PTPRT-212ENST00000620410 Q8N8P6 123 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRT-212ENST00000620410 TMEM141Q96I45 108 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRT-212ENST00000620410 IMMP2LQ96T52 175 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRT-212ENST00000620410 AMELXQ99217 191 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRT-212ENST00000620410 IGIPA6NJ69 53 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRT-212ENST00000620410 GAGE2EQ4V326 116 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRT-212ENST00000620410 GAGE2DQ9UEU5 116 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRT-212ENST00000620410 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRT-212ENST00000620410 IGLV7-43P04211 117 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRT-212ENST00000620410 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
PTPRT-212ENST00000620410 C2orf66Q6UXQ4 117 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRT-212ENST00000620410 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
PTPRT-212ENST00000620410 ANAPC16Q96DE5 110 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRT-212ENST00000620410 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRT-212ENST00000620410 MT-ND4LP03901 98 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRT-212ENST00000620410 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
PTPRT-212ENST00000620410 TEX43Q6ZNM6 134 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRT-212ENST00000620410 MAP1LC3AQ9H492 121 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRT-212ENST00000620410 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRT-212ENST00000620410 LINC01561Q8N1V8 128 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRT-212ENST00000620410 PRR26Q8N8Z3 221 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRT-212ENST00000620410 CYSLTR1Q9Y271 337 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRT-212ENST00000620410 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRT-212ENST00000620410 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRT-212ENST00000620410 ADCYAP1P18509 176 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRT-212ENST00000620410 KIAA1644Q3SXP7 199 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRT-212ENST00000620410 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
PTPRT-212ENST00000620410 VCX2Q9H322 139 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRT-212ENST00000620410 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRT-212ENST00000620410 IFITM2Q01629 132 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRT-212ENST00000620410 ORMDL2Q53FV1 153 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRT-212ENST00000620410 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRT-212ENST00000620410 H0Y9J4 135 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRT-212ENST00000620410 M0QXV9 152 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRT-212ENST00000620410 CLLU1Q5K131 121 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRT-212ENST00000620410 Q6ZN92 141 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRT-212ENST00000620410 LINC00469Q8N7U9 141 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRT-212ENST00000620410 DIRC1Q969H9 104 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRT-212ENST00000620410 NPSP0C0P6 89 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-212ENST00000620410 RAB14P61106 215 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-212ENST00000620410 TOMM6Q96B49 74 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-212ENST00000620410 C2orf88Q9BSF0 95 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-212ENST00000620410 CTDSP1Q9GZU7 261 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-212ENST00000620410 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-212ENST00000620410 TOMM7Q9P0U1 55 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-212ENST00000620410 K7EMI3 77 aa6.83□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69.7 ms