RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618610.1

PTPRT-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 3,230 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-211ENST00000618610 SPANXCQ9NY87 97 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRT-211ENST00000618610 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
PTPRT-211ENST00000618610 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRT-211ENST00000618610 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRT-211ENST00000618610 A0A0J9YX75 114 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRT-211ENST00000618610 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
PTPRT-211ENST00000618610 CXCL5P42830 114 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRT-211ENST00000618610 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRT-211ENST00000618610 C20orf197Q8N268 126 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRT-211ENST00000618610 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRT-211ENST00000618610 KNCNA6PVL3 124 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRT-211ENST00000618610 IGHV1-69P01742 117 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRT-211ENST00000618610 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRT-211ENST00000618610 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRT-211ENST00000618610 C9orf139Q6ZV77 190 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRT-211ENST00000618610 C5orf56Q8N8D9 126 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRT-211ENST00000618610 VSIG2Q96IQ7 327 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRT-211ENST00000618610 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRT-211ENST00000618610 M0QY20 66 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRT-211ENST00000618610 DEFB136Q30KP8 78 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRT-211ENST00000618610 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP5.97□□□□□ -1.45
PTPRT-211ENST00000618610 LINC00308Q8TCZ7 52 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRT-211ENST00000618610 Q9H8V8 135 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRT-211ENST00000618610 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRT-211ENST00000618610 MOB4Q9Y3A3 225 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRT-211ENST00000618610 SLPIP03973 132 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRT-211ENST00000618610 PRIMA1Q86XR5 153 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRT-211ENST00000618610 FAM104AQ969W3 186 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRT-211ENST00000618610 NCR3O14931 201 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRT-211ENST00000618610 UCNP55089 124 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRT-211ENST00000618610 LMO4P61968 165 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRT-211ENST00000618610 TMEM243Q9BU79 118 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRT-211ENST00000618610 COL6A5A8TX70 2615 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRT-211ENST00000618610 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRT-211ENST00000618610 IGHG2P01859 326 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRT-211ENST00000618610 FAM236CP0DP71 79 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRT-211ENST00000618610 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
PTPRT-211ENST00000618610 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRT-211ENST00000618610 F8P00451 2351 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRT-211ENST00000618610 A0A1W2PRX2 142 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRT-211ENST00000618610 H3BUX3 64 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRT-211ENST00000618610 GHRHP01286 108 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRT-211ENST00000618610 MALP21145 153 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRT-211ENST00000618610 BEAN1Q3B7T3 259 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRT-211ENST00000618610 MRAPQ8TCY5 172 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRT-211ENST00000618610 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
PTPRT-211ENST00000618610 C18orf65Q6ZTR6 163 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRT-211ENST00000618610 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRT-211ENST00000618610 PRORYQ9H606 182 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRT-211ENST00000618610 A0A087WYN8 130 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRT-211ENST00000618610 RPL28P46779 137 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
PTPRT-211ENST00000618610 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
PTPRT-211ENST00000618610 INAFM2P0DMQ5 153 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRT-211ENST00000618610 COX6A2Q02221 97 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRT-211ENST00000618610 U3KQE9 123 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRT-211ENST00000618610 PRO0628Q9UI54 55 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRT-211ENST00000618610 NDUFA4O00483 81 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRT-211ENST00000618610 LINC00474Q9P2X8 69 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRT-211ENST00000618610 LENEPQ9Y5L5 61 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRT-211ENST00000618610 SNURFQ9Y675 71 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRT-211ENST00000618610 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRT-211ENST00000618610 BRK1Q8WUW1 75 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRT-211ENST00000618610 SPINK13Q1W4C9 94 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRT-211ENST00000618610 IGHV4-59P01825 116 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRT-211ENST00000618610 MED14OSP0DP75 135 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRT-211ENST00000618610 ENHOQ6UWT2 76 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRT-211ENST00000618610 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRT-211ENST00000618610 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
PTPRT-211ENST00000618610 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
PTPRT-211ENST00000618610 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
PTPRT-211ENST00000618610 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
PTPRT-211ENST00000618610 RBMY1CP0DJD4 496 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRT-211ENST00000618610 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
PTPRT-211ENST00000618610 CCL19Q99731 98 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRT-211ENST00000618610 LINC00467Q9BRT7 94 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRT-211ENST00000618610 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
PTPRT-211ENST00000618610 Q6JHZ5 121 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRT-211ENST00000618610 SMR3AQ99954 134 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRT-211ENST00000618610 SOCS3O14543 225 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRT-211ENST00000618610 LECT2O14960 151 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRT-211ENST00000618610 USMG5Q96IX5 58 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRT-211ENST00000618610 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRT-211ENST00000618610 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF415Q09FC8 603 aa5.9□□□□□ -1.47
PTPRT-211ENST00000618610 TMEM86BQ8N661 226 aa5.9□□□□□ -1.47
PTPRT-211ENST00000618610 XCL1P47992 114 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRT-211ENST00000618610 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRT-211ENST00000618610 XCL2Q9UBD3 114 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRT-211ENST00000618610 NDUFA1O15239 70 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRT-211ENST00000618610 SEC61GP60059 68 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRT-211ENST00000618610 Q6ZSN1 163 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRT-211ENST00000618610 LINC00337Q8N6G1 96 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRT-211ENST00000618610 C9orf85Q96MD7 179 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRT-211ENST00000618610 SS18Q15532 418 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRT-211ENST00000618610 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
PTPRT-211ENST00000618610 RMI2Q96E14 147 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRT-211ENST00000618610 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRT-211ENST00000618610 KLLNB2CW77 178 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRT-211ENST00000618610 TOMM7Q9P0U1 55 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRT-211ENST00000618610 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa5.87□□□□□ -1.47
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