RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602338.1

TTLL3-233, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

Gene TTLL3, Length 693 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-233	ENST00000602338	C6orf48	Q9UBA6	75 aa		7.18	□□□□□ -1.26
TTLL3-233	ENST00000602338		V9GYV3	84 aa		7.18	□□□□□ -1.26
TTLL3-233	ENST00000602338	SMAGP	Q0VAQ4	97 aa		7.17	□□□□□ -1.26
TTLL3-233	ENST00000602338	UNQ6190/PRO20217	Q6UXQ8	127 aa		7.17	□□□□□ -1.26
TTLL3-233	ENST00000602338	IGLV1-50	A0A075B6I6	118 aa		7.16	□□□□□ -1.26
TTLL3-233	ENST00000602338	NDUFA1	O15239	70 aa		7.16	□□□□□ -1.26
TTLL3-233	ENST00000602338	TLX1NB	P0CAT3	122 aa		7.16	□□□□□ -1.26
TTLL3-233	ENST00000602338	RIG	Q13278	110 aa		7.16	□□□□□ -1.26
TTLL3-233	ENST00000602338	CLLU1	Q5K131	121 aa		7.16	□□□□□ -1.26
TTLL3-233	ENST00000602338	FAM104B	Q5XKR9	115 aa		7.16	□□□□□ -1.26
TTLL3-233	ENST00000602338	IMMP2L	Q96T52	175 aa		7.16	□□□□□ -1.26
TTLL3-233	ENST00000602338	SMDT1	Q9H4I9	107 aa		7.16	□□□□□ -1.26
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF727	A8MUV8	499 aa		7.15	□□□□□ -1.26
TTLL3-233	ENST00000602338	PPP1R2P9	O14990	202 aa		7.15	□□□□□ -1.26
TTLL3-233	ENST00000602338	PPP1R17	O96001	155 aa		7.15	□□□□□ -1.26
TTLL3-233	ENST00000602338	BLOC1S1	P78537	153 aa		7.15	□□□□□ -1.26
TTLL3-233	ENST00000602338	GAGE2E	Q4V326	116 aa		7.15	□□□□□ -1.26
TTLL3-233	ENST00000602338	GAGE2D	Q9UEU5	116 aa		7.15	□□□□□ -1.26
TTLL3-233	ENST00000602338		M0QXV9	152 aa		7.14	□□□□□ -1.27
TTLL3-233	ENST00000602338	SRP19	P09132	144 aa	Known RBP	7.14	□□□□□ -1.27
TTLL3-233	ENST00000602338	KIAA0087	Q14695	138 aa		7.14	□□□□□ -1.27
TTLL3-233	ENST00000602338	TMEM18	Q96B42	140 aa		7.14	□□□□□ -1.27
TTLL3-233	ENST00000602338	TRBV24-1	A0A075B6N3	115 aa		7.13	□□□□□ -1.27
TTLL3-233	ENST00000602338	LOC105371267	A0A1B0GV96	52 aa		7.13	□□□□□ -1.27
TTLL3-233	ENST00000602338	IFITM10	A6NMD0	228 aa		7.13	□□□□□ -1.27
TTLL3-233	ENST00000602338		F8WDY8	70 aa		7.13	□□□□□ -1.27
TTLL3-233	ENST00000602338	RPL32	P62910	135 aa	Known RBP	7.13	□□□□□ -1.27
TTLL3-233	ENST00000602338	PRR4	Q16378	134 aa		7.13	□□□□□ -1.27
TTLL3-233	ENST00000602338	C20orf78	Q9BR46	151 aa		7.13	□□□□□ -1.27
TTLL3-233	ENST00000602338	SMIM2	Q9BVW6	85 aa		7.13	□□□□□ -1.27
TTLL3-233	ENST00000602338	EIF5A2	Q9GZV4	153 aa	Known RBP	7.13	□□□□□ -1.27
TTLL3-233	ENST00000602338	SPANXA1	Q9NS26	97 aa		7.13	□□□□□ -1.27
TTLL3-233	ENST00000602338	NAT8B	Q9UHF3	227 aa		7.13	□□□□□ -1.27
TTLL3-233	ENST00000602338	TNFRSF6B	O95407	300 aa		7.12	□□□□□ -1.27
TTLL3-233	ENST00000602338	UBE2B	P63146	152 aa		7.12	□□□□□ -1.27
TTLL3-233	ENST00000602338	HBB	P68871	147 aa		7.12	□□□□□ -1.27
TTLL3-233	ENST00000602338	MRPS36	P82909	103 aa	Known RBP	7.12	□□□□□ -1.27
TTLL3-233	ENST00000602338	C9orf129	Q5T035	196 aa	Known RBP	7.12	□□□□□ -1.27
TTLL3-233	ENST00000602338	C2orf82	Q6UX34	121 aa		7.12	□□□□□ -1.27
TTLL3-233	ENST00000602338		D6R8Y8	96 aa		7.11	□□□□□ -1.27
TTLL3-233	ENST00000602338	TCAP	O15273	167 aa		7.11	□□□□□ -1.27
TTLL3-233	ENST00000602338	NPY	P01303	97 aa		7.11	□□□□□ -1.27
TTLL3-233	ENST00000602338	CKS2	P33552	79 aa		7.11	□□□□□ -1.27
TTLL3-233	ENST00000602338	UBE2D1	P51668	147 aa		7.11	□□□□□ -1.27
TTLL3-233	ENST00000602338	RAB14	P61106	215 aa		7.11	□□□□□ -1.27
TTLL3-233	ENST00000602338	RPL23	P62829	140 aa	Known RBP	7.11	□□□□□ -1.27
TTLL3-233	ENST00000602338	TMEM241	Q24JQ0	296 aa		7.11	□□□□□ -1.27
TTLL3-233	ENST00000602338	FAM74A3	Q4VXF1	159 aa		7.11	□□□□□ -1.27
TTLL3-233	ENST00000602338	SMIM27	A0A1W2PRY6	76 aa		7.1	□□□□□ -1.27
TTLL3-233	ENST00000602338	KRTAP9-2	Q9BYQ4	174 aa		7.1	□□□□□ -1.27
TTLL3-233	ENST00000602338	TGIF2-C20orf24	A0A0A6YYL0	155 aa		7.09	□□□□□ -1.27
TTLL3-233	ENST00000602338	NDUFC2-KCTD14	E9PQ53	114 aa		7.09	□□□□□ -1.27
TTLL3-233	ENST00000602338	RPL13A	P40429	203 aa	Known RBP	7.09	□□□□□ -1.27
TTLL3-233	ENST00000602338	ADIRF	Q15847	76 aa		7.09	□□□□□ -1.27
TTLL3-233	ENST00000602338	LINC00242	Q5T6M2	205 aa		7.09	□□□□□ -1.27
TTLL3-233	ENST00000602338	IGLV4-3	A0A075B6K6	122 aa		7.08	□□□□□ -1.28
TTLL3-233	ENST00000602338	TRBV30	A0A0K0K1B3	111 aa		7.08	□□□□□ -1.28
TTLL3-233	ENST00000602338		C9JQL5	133 aa		7.08	□□□□□ -1.28
TTLL3-233	ENST00000602338	MRPL54	Q6P161	138 aa	Known RBP	7.08	□□□□□ -1.28
TTLL3-233	ENST00000602338	FAT4	Q6V0I7	4981 aa		7.08	□□□□□ -1.28
TTLL3-233	ENST00000602338		A0A1B0GW15	77 aa		7.07	□□□□□ -1.28
TTLL3-233	ENST00000602338		A0A1B0GXF2	115 aa		7.07	□□□□□ -1.28
TTLL3-233	ENST00000602338	COMMD7	Q86VX2	200 aa		7.07	□□□□□ -1.28
TTLL3-233	ENST00000602338		A0A087X002	238 aa		7.06	□□□□□ -1.28
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF861P	O60384	105 aa		7.06	□□□□□ -1.28
TTLL3-233	ENST00000602338	IFI27	P40305	119 aa	Predicted RBP	7.06	□□□□□ -1.28
TTLL3-233	ENST00000602338	ZC2HC1B	Q5TFG8	222 aa		7.06	□□□□□ -1.28
TTLL3-233	ENST00000602338	TMA7	Q9Y2S6	64 aa	Known RBP	7.06	□□□□□ -1.28
TTLL3-233	ENST00000602338	CARHSP1	Q9Y2V2	147 aa	Known RBP	7.06	□□□□□ -1.28
TTLL3-233	ENST00000602338	TSPAN13	O95857	204 aa		7.05	□□□□□ -1.28
TTLL3-233	ENST00000602338	LCE2A	Q5TA79	106 aa	Predicted RBP	7.05	□□□□□ -1.28
TTLL3-233	ENST00000602338	LINC00173	Q6ZV60	143 aa		7.05	□□□□□ -1.28
TTLL3-233	ENST00000602338	LINC00469	Q8N7U9	141 aa		7.05	□□□□□ -1.28
TTLL3-233	ENST00000602338	PACRG	Q96M98	296 aa	Predicted RBP	7.05	□□□□□ -1.28
TTLL3-233	ENST00000602338	NAT8	Q9UHE5	227 aa		7.05	□□□□□ -1.28
TTLL3-233	ENST00000602338	PYGO1	Q9Y3Y4	419 aa		7.05	□□□□□ -1.28
TTLL3-233	ENST00000602338	SRSF3	P84103	164 aa	Known RBP	7.04	□□□□□ -1.28
TTLL3-233	ENST00000602338	TMEM141	Q96I45	108 aa		7.04	□□□□□ -1.28
TTLL3-233	ENST00000602338	XAGE1A	Q9HD64	81 aa		7.04	□□□□□ -1.28
TTLL3-233	ENST00000602338	C22orf24	Q9Y442	160 aa		7.04	□□□□□ -1.28
TTLL3-233	ENST00000602338	MUC17	Q685J3	4493 aa		7.04	□□□□□ -1.28
TTLL3-233	ENST00000602338		A0A0U1RQV1	116 aa		7.03	□□□□□ -1.28
TTLL3-233	ENST00000602338		F8W036	122 aa		7.03	□□□□□ -1.28
TTLL3-233	ENST00000602338	PPBP	P02775	128 aa		7.03	□□□□□ -1.28
TTLL3-233	ENST00000602338	ORMDL3	Q8N138	153 aa		7.03	□□□□□ -1.28
TTLL3-233	ENST00000602338	S100A8	P05109	93 aa		7.02	□□□□□ -1.29
TTLL3-233	ENST00000602338	TEX43	Q6ZNM6	134 aa		7.02	□□□□□ -1.29
TTLL3-233	ENST00000602338	LINC01561	Q8N1V8	128 aa		7.02	□□□□□ -1.29
TTLL3-233	ENST00000602338	PRELID3A	Q96N28	172 aa		7.02	□□□□□ -1.29
TTLL3-233	ENST00000602338	CTDSP1	Q9GZU7	261 aa		7.02	□□□□□ -1.29
TTLL3-233	ENST00000602338	TOMM7	Q9P0U1	55 aa		7.02	□□□□□ -1.29
TTLL3-233	ENST00000602338	NUPR1	O60356	82 aa		7.01	□□□□□ -1.29
TTLL3-233	ENST00000602338	RAB5A	P20339	215 aa		7.01	□□□□□ -1.29
TTLL3-233	ENST00000602338	TMEM136	Q6ZRR5	245 aa		7.01	□□□□□ -1.29
TTLL3-233	ENST00000602338	LOC389332	A0A1B0GUA5	103 aa		7	□□□□□ -1.29
TTLL3-233	ENST00000602338	UQCC3	Q6UW78	93 aa		7	□□□□□ -1.29
TTLL3-233	ENST00000602338		Q8IZM0	81 aa		7	□□□□□ -1.29
TTLL3-233	ENST00000602338	AMELX	Q99217	191 aa		7	□□□□□ -1.29
TTLL3-233	ENST00000602338	C2orf88	Q9BSF0	95 aa		7	□□□□□ -1.29
TTLL3-233	ENST00000602338	PRSS2	P07478	247 aa		6.99	□□□□□ -1.29

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