RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589706.1

SMAD4-208, Transcript of SMAD family member 4, human

TSL 3

Gene SMAD4, Length 563 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SMAD4-208	ENST00000589706	TRBV10-3	A0A0K0K1G6	114 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SMAD4-208	ENST00000589706	SMKR1	H3BMG3	65 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SMAD4-208	ENST00000589706	LEPROT	O15243	131 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SMAD4-208	ENST00000589706	IGF1	P05019	195 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SMAD4-208	ENST00000589706	LGALS3	P17931	250 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
SMAD4-208	ENST00000589706	CRIP1	P50238	77 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SMAD4-208	ENST00000589706	RUSC1-AS1	Q66K80	236 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SMAD4-208	ENST00000589706	CD177	Q8N6Q3	437 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SMAD4-208	ENST00000589706	ZNF491	Q8N8L2	437 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SMAD4-208	ENST00000589706	TMEM141	Q96I45	108 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SMAD4-208	ENST00000589706	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SMAD4-208	ENST00000589706	BPESC1	Q9GZL8	116 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SMAD4-208	ENST00000589706	DAZ1	Q9NQZ3	744 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
SMAD4-208	ENST00000589706	GNG12	Q9UBI6	72 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SMAD4-208	ENST00000589706	IGLV4-3	A0A075B6K6	122 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SMAD4-208	ENST00000589706	IGKV1D-37	A0A075B6S9	117 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SMAD4-208	ENST00000589706		E7EQL1	145 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SMAD4-208	ENST00000589706	SH2D1A	O60880	128 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SMAD4-208	ENST00000589706	XCL1	P47992	114 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SMAD4-208	ENST00000589706	KLKP1	Q107X0	134 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SMAD4-208	ENST00000589706	DAZ2	Q13117	558 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
SMAD4-208	ENST00000589706	PDE6H	Q13956	83 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SMAD4-208	ENST00000589706	PVRIG	Q6DKI7	326 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SMAD4-208	ENST00000589706	MUSTN1	Q8IVN3	82 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SMAD4-208	ENST00000589706		Q8NBF4	154 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SMAD4-208	ENST00000589706	SMIM2	Q9BVW6	85 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SMAD4-208	ENST00000589706	OCR1	Q9BZK8	76 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SMAD4-208	ENST00000589706	XCL2	Q9UBD3	114 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SMAD4-208	ENST00000589706	UBE2D4	Q9Y2X8	147 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SMAD4-208	ENST00000589706	COL7A1	Q02388	2944 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SMAD4-208	ENST00000589706	TRAV7	A0A075B6U4	112 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SMAD4-208	ENST00000589706	IGHV1-58	A0A0C4DH39	117 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SMAD4-208	ENST00000589706		A0A0J9YXY3	114 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SMAD4-208	ENST00000589706	KRTAP29-1	A8MX34	341 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
SMAD4-208	ENST00000589706		H7BZZ5	65 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SMAD4-208	ENST00000589706		M0R381	172 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SMAD4-208	ENST00000589706		M0R3E3	92 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SMAD4-208	ENST00000589706	COX7A2L	O14548	114 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SMAD4-208	ENST00000589706	VKORC1L1	Q8N0U8	176 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SMAD4-208	ENST00000589706	DYNAP	Q8N1N2	210 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SMAD4-208	ENST00000589706	KLF14	Q8TD94	323 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
SMAD4-208	ENST00000589706	AMELX	Q99217	191 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SMAD4-208	ENST00000589706	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SMAD4-208	ENST00000589706	TENM2	Q9NT68	2774 aa		4.15	□□□□□ -1.74
SMAD4-208	ENST00000589706	IBA57-AS1	B1ANH7	110 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SMAD4-208	ENST00000589706		B4DSR2	109 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SMAD4-208	ENST00000589706	SOCS3	O14543	225 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SMAD4-208	ENST00000589706	TIMM17B	O60830	172 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SMAD4-208	ENST00000589706	CCK	P06307	115 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SMAD4-208	ENST00000589706	GATA1	P15976	413 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
SMAD4-208	ENST00000589706	UBE2E1	P51965	193 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SMAD4-208	ENST00000589706	ZNF826P	Q6ZT77	177 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SMAD4-208	ENST00000589706	DAZ4	Q86SG3	579 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
SMAD4-208	ENST00000589706	KLHL30-AS1	Q8NEE0	82 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SMAD4-208	ENST00000589706	EEF1AKMT3	Q96AZ1	226 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SMAD4-208	ENST00000589706	TIMM17A	Q99595	171 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SMAD4-208	ENST00000589706	NDUFA4L2	Q9NRX3	87 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SMAD4-208	ENST00000589706	IGLV4-69	A0A075B6H9	119 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SMAD4-208	ENST00000589706	IGHV3OR16-10	A0A075B7F0	116 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SMAD4-208	ENST00000589706	TRAV8-3	A0A0A6YYJ7	113 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SMAD4-208	ENST00000589706	LYRM9	A8MSI8	78 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SMAD4-208	ENST00000589706		H7C2G1	150 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SMAD4-208	ENST00000589706		I3L3M4	83 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SMAD4-208	ENST00000589706	NDUFB3	O43676	98 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SMAD4-208	ENST00000589706	DNAL4	O96015	105 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SMAD4-208	ENST00000589706	NSUN5P1	Q3KNT7	163 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SMAD4-208	ENST00000589706	KPRP	Q5T749	579 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
SMAD4-208	ENST00000589706	C2orf66	Q6UXQ4	117 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SMAD4-208	ENST00000589706	OPRPN	Q99935	248 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
SMAD4-208	ENST00000589706	TANC2	Q9HCD6	1990 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SMAD4-208	ENST00000589706		A0A087WYN8	130 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SMAD4-208	ENST00000589706	TRAV13-2	A0A0B4J235	113 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SMAD4-208	ENST00000589706	IGIP	A6NJ69	53 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SMAD4-208	ENST00000589706	FAM223B	A6NKX1	122 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SMAD4-208	ENST00000589706		M0R1B8	84 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SMAD4-208	ENST00000589706	IGHV3-9	P01782	118 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SMAD4-208	ENST00000589706	ZNF80	P51504	273 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
SMAD4-208	ENST00000589706	MIA	Q16674	131 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SMAD4-208	ENST00000589706	C20orf197	Q8N268	126 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SMAD4-208	ENST00000589706	TMEM167A	Q8TBQ9	72 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SMAD4-208	ENST00000589706	DAZ3	Q9NR90	486 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
SMAD4-208	ENST00000589706	CTSZ	Q9UBR2	303 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SMAD4-208	ENST00000589706	PLCE1	Q9P212	2302 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SMAD4-208	ENST00000589706	PCLO	Q9Y6V0	5065 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SMAD4-208	ENST00000589706	ARFGEF3	Q5TH69	2177 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SMAD4-208	ENST00000589706	IGHV3OR16-12	A0A075B7B8	117 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SMAD4-208	ENST00000589706	RPL37AP8	A6NKH3	93 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SMAD4-208	ENST00000589706	IGHV1-69	P01742	117 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SMAD4-208	ENST00000589706	MSMB	P08118	114 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SMAD4-208	ENST00000589706	BAALC-AS2	P0C853	105 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SMAD4-208	ENST00000589706	SNRPD3	P62318	126 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
SMAD4-208	ENST00000589706	RBM3	P98179	157 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
SMAD4-208	ENST00000589706	C17orf58	Q2M2W7	97 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SMAD4-208	ENST00000589706	C9orf66	Q5T8R8	295 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SMAD4-208	ENST00000589706	FAM223A	Q8IWN6	122 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SMAD4-208	ENST00000589706	TMEM61	Q8N0U2	210 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SMAD4-208	ENST00000589706	C14orf178	Q8N769	122 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
SMAD4-208	ENST00000589706	HYDIN	Q4G0P3	5121 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SMAD4-208	ENST00000589706	NOTCH3	Q9UM47	2321 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SMAD4-208	ENST00000589706	RYR2	Q92736	4967 aa		4.11	□□□□□ -1.75

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