RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP15.56■□□□□ 0.08
PTPRM-211ENST00000580170 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa15.56■□□□□ 0.08
PTPRM-211ENST00000580170 RETNQ9HD89 108 aa15.56■□□□□ 0.08
PTPRM-211ENST00000580170 FAM208BQ5VWN6 2430 aa15.56■□□□□ 0.08
PTPRM-211ENST00000580170 COX17Q14061 63 aa15.56■□□□□ 0.08
PTPRM-211ENST00000580170 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa15.55■□□□□ 0.08
PTPRM-211ENST00000580170 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP15.55■□□□□ 0.08
PTPRM-211ENST00000580170 UBE2D3P61077 147 aa15.55■□□□□ 0.08
PTPRM-211ENST00000580170 UBE2D2P62837 147 aa15.55■□□□□ 0.08
PTPRM-211ENST00000580170 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa15.55■□□□□ 0.08
PTPRM-211ENST00000580170 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP15.54■□□□□ 0.08
PTPRM-211ENST00000580170 RPL37AP8A6NKH3 93 aa15.54■□□□□ 0.08
PTPRM-211ENST00000580170 LY6G6DO95868 133 aa15.54■□□□□ 0.08
PTPRM-211ENST00000580170 SHISA2Q6UWI4 295 aa15.54■□□□□ 0.08
PTPRM-211ENST00000580170 EDN2P20800 178 aa15.53■□□□□ 0.08
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF843Q8N446 348 aa15.53■□□□□ 0.08
PTPRM-211ENST00000580170 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa15.53■□□□□ 0.08
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP15.52■□□□□ 0.08
PTPRM-211ENST00000580170 CELA1Q9UNI1 258 aa15.52■□□□□ 0.08
PTPRM-211ENST00000580170 Q8IZM0 81 aa15.52■□□□□ 0.07
PTPRM-211ENST00000580170 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa15.51■□□□□ 0.07
PTPRM-211ENST00000580170 HCFC1P51610 2035 aa15.5■□□□□ 0.07
PTPRM-211ENST00000580170 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa15.49■□□□□ 0.07
PTPRM-211ENST00000580170 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa15.49■□□□□ 0.07
PTPRM-211ENST00000580170 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa15.49■□□□□ 0.07
PTPRM-211ENST00000580170 DSCAMO60469 2012 aa15.48■□□□□ 0.07
PTPRM-211ENST00000580170 CEP192Q8TEP8 1941 aa15.48■□□□□ 0.07
PTPRM-211ENST00000580170 PRO3102Q9H379 93 aa15.48■□□□□ 0.07
PTPRM-211ENST00000580170 LINC00242Q5T6M2 205 aa15.48■□□□□ 0.07
PTPRM-211ENST00000580170 SPINK6Q6UWN8 80 aa15.47■□□□□ 0.07
PTPRM-211ENST00000580170 PRYO14603 147 aa15.47■□□□□ 0.07
PTPRM-211ENST00000580170 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
PTPRM-211ENST00000580170 CDSNQ15517 529 aa15.47■□□□□ 0.07
PTPRM-211ENST00000580170 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa15.46■□□□□ 0.07
PTPRM-211ENST00000580170 C7orf33Q8WU49 177 aa15.46■□□□□ 0.07
PTPRM-211ENST00000580170 CYSRT1A8MQ03 144 aa15.46■□□□□ 0.06
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
PTPRM-211ENST00000580170 MUC6Q6W4X9 2439 aa15.44■□□□□ 0.06
PTPRM-211ENST00000580170 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
PTPRM-211ENST00000580170 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
PTPRM-211ENST00000580170 COX6A2Q02221 97 aa15.44■□□□□ 0.06
PTPRM-211ENST00000580170 PSPHP1O15172 72 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRM-211ENST00000580170 CHCHD7Q9BUK0 85 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRM-211ENST00000580170 HIVEP2P31629 2446 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRM-211ENST00000580170 PRR14LQ5THK1 2151 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRM-211ENST00000580170 AVPP01185 164 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRM-211ENST00000580170 M0R2N4 97 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRM-211ENST00000580170 TSPEAR-AS2P59090 65 aa15.42■□□□□ 0.06
PTPRM-211ENST00000580170 SMIM1B2RUZ4 78 aa15.42■□□□□ 0.06
PTPRM-211ENST00000580170 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa15.42■□□□□ 0.06
PTPRM-211ENST00000580170 MUC7Q8TAX7 377 aa15.41■□□□□ 0.06
PTPRM-211ENST00000580170 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa15.41■□□□□ 0.06
PTPRM-211ENST00000580170 PLAC8L1A1L4L8 177 aa15.4■□□□□ 0.06
PTPRM-211ENST00000580170 LINC00208Q96KT6 92 aa15.4■□□□□ 0.06
PTPRM-211ENST00000580170 ODF3L2Q3SX64 289 aa15.39■□□□□ 0.05
PTPRM-211ENST00000580170 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa15.39■□□□□ 0.05
PTPRM-211ENST00000580170 Q8N814 137 aa15.38■□□□□ 0.05
PTPRM-211ENST00000580170 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
PTPRM-211ENST00000580170 PLXNB1O43157 2135 aa15.38■□□□□ 0.05
PTPRM-211ENST00000580170 RPL28P46779 137 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
PTPRM-211ENST00000580170 A0A087WYN8 130 aa15.37■□□□□ 0.05
PTPRM-211ENST00000580170 Q8N3U1 123 aa15.37■□□□□ 0.05
PTPRM-211ENST00000580170 C10orf142B7Z368 130 aa15.36■□□□□ 0.05
PTPRM-211ENST00000580170 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa15.36■□□□□ 0.05
PTPRM-211ENST00000580170 PRO0628Q9UI54 55 aa15.36■□□□□ 0.05
PTPRM-211ENST00000580170 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa15.35■□□□□ 0.05
PTPRM-211ENST00000580170 CDIP1Q9H305 208 aa15.34■□□□□ 0.05
PTPRM-211ENST00000580170 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa15.34■□□□□ 0.05
PTPRM-211ENST00000580170 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa15.33■□□□□ 0.05
PTPRM-211ENST00000580170 PRR3P79522 188 aaKnown RBP15.33■□□□□ 0.05
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF580Q9UK33 172 aa15.32■□□□□ 0.04
PTPRM-211ENST00000580170 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa15.32■□□□□ 0.04
PTPRM-211ENST00000580170 LRP4O75096 1905 aa15.32■□□□□ 0.04
PTPRM-211ENST00000580170 A0A096LNJ9 63 aa15.32■□□□□ 0.04
PTPRM-211ENST00000580170 COX8CQ7Z4L0 72 aa15.31■□□□□ 0.04
PTPRM-211ENST00000580170 AMELXQ99217 191 aa15.31■□□□□ 0.04
PTPRM-211ENST00000580170 C10orf25Q5T742 122 aa15.31■□□□□ 0.04
PTPRM-211ENST00000580170 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa15.3■□□□□ 0.04
PTPRM-211ENST00000580170 OXLD1Q5BKU9 147 aa15.3■□□□□ 0.04
PTPRM-211ENST00000580170 LINC00474Q9P2X8 69 aa15.3■□□□□ 0.04
PTPRM-211ENST00000580170 SPG11Q96JI7 2443 aa15.29■□□□□ 0.04
PTPRM-211ENST00000580170 EML5Q05BV3 1969 aa15.29■□□□□ 0.04
PTPRM-211ENST00000580170 FHL2Q14192 279 aa15.28■□□□□ 0.04
PTPRM-211ENST00000580170 PTPRSQ13332 1948 aa15.28■□□□□ 0.04
PTPRM-211ENST00000580170 TMEM254Q8TBM7 123 aa15.28■□□□□ 0.04
PTPRM-211ENST00000580170 BEAN1Q3B7T3 259 aa15.27■□□□□ 0.04
PTPRM-211ENST00000580170 WNK1Q9H4A3 2382 aa15.27■□□□□ 0.04
PTPRM-211ENST00000580170 C1orf137Q5JT78 98 aa15.26■□□□□ 0.03
PTPRM-211ENST00000580170 Q6ZSN1 163 aa15.26■□□□□ 0.03
PTPRM-211ENST00000580170 IGLV1-51P01701 117 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRM-211ENST00000580170 REG3GQ6UW15 175 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRM-211ENST00000580170 LY6G6CO95867 125 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRM-211ENST00000580170 LINC00846Q9NV44 126 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRM-211ENST00000580170 SMR3AQ99954 134 aa15.23■□□□□ 0.03
PTPRM-211ENST00000580170 BDP1A6H8Y1 2624 aa15.23■□□□□ 0.03
PTPRM-211ENST00000580170 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa15.23■□□□□ 0.03
PTPRM-211ENST00000580170 C6orf223Q8N319 242 aa15.23■□□□□ 0.03
PTPRM-211ENST00000580170 ESRGQ1W209 222 aa15.22■□□□□ 0.03
PTPRM-211ENST00000580170 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP15.22■□□□□ 0.03
PTPRM-211ENST00000580170 CSPG4Q6UVK1 2322 aa15.21■□□□□ 0.03
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