RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551931.5

LETMD1-231, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

TSL 3

Gene LETMD1, Length 705 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-231	ENST00000551931	FAM19A5	Q7Z5A7	132 aa	Predicted RBP	7.58	□□□□□ -1.2
LETMD1-231	ENST00000551931	KRTAP7-1	Q8IUC3	87 aa		7.58	□□□□□ -1.2
LETMD1-231	ENST00000551931		V9GYV3	84 aa		7.58	□□□□□ -1.2
LETMD1-231	ENST00000551931	PPP1R17	O96001	155 aa		7.57	□□□□□ -1.2
LETMD1-231	ENST00000551931	TLX1NB	P0CAT3	122 aa		7.57	□□□□□ -1.2
LETMD1-231	ENST00000551931	LOR	P23490	312 aa	Predicted RBP	7.57	□□□□□ -1.2
LETMD1-231	ENST00000551931	BLOC1S1	P78537	153 aa		7.57	□□□□□ -1.2
LETMD1-231	ENST00000551931	UNQ6190/PRO20217	Q6UXQ8	127 aa		7.57	□□□□□ -1.2
LETMD1-231	ENST00000551931	IMMP2L	Q96T52	175 aa		7.57	□□□□□ -1.2
LETMD1-231	ENST00000551931	C6orf48	Q9UBA6	75 aa		7.57	□□□□□ -1.2
LETMD1-231	ENST00000551931	IGLV1-50	A0A075B6I6	118 aa		7.56	□□□□□ -1.2
LETMD1-231	ENST00000551931	ZNF727	A8MUV8	499 aa		7.56	□□□□□ -1.2
LETMD1-231	ENST00000551931	PPP1R2P9	O14990	202 aa		7.56	□□□□□ -1.2
LETMD1-231	ENST00000551931	NDUFA1	O15239	70 aa		7.56	□□□□□ -1.2
LETMD1-231	ENST00000551931	FAM104B	Q5XKR9	115 aa		7.56	□□□□□ -1.2
LETMD1-231	ENST00000551931	TMEM18	Q96B42	140 aa		7.56	□□□□□ -1.2
LETMD1-231	ENST00000551931		F8WDY8	70 aa		7.55	□□□□□ -1.2
LETMD1-231	ENST00000551931	GAGE2E	Q4V326	116 aa		7.55	□□□□□ -1.2
LETMD1-231	ENST00000551931	EIF5A2	Q9GZV4	153 aa	Known RBP	7.55	□□□□□ -1.2
LETMD1-231	ENST00000551931	SMDT1	Q9H4I9	107 aa		7.55	□□□□□ -1.2
LETMD1-231	ENST00000551931	GAGE2D	Q9UEU5	116 aa		7.55	□□□□□ -1.2
LETMD1-231	ENST00000551931	TRBV24-1	A0A075B6N3	115 aa		7.54	□□□□□ -1.2
LETMD1-231	ENST00000551931	SRP19	P09132	144 aa	Known RBP	7.54	□□□□□ -1.2
LETMD1-231	ENST00000551931	C20orf78	Q9BR46	151 aa		7.54	□□□□□ -1.2
LETMD1-231	ENST00000551931	NAT8B	Q9UHF3	227 aa		7.54	□□□□□ -1.2
LETMD1-231	ENST00000551931	IFITM10	A6NMD0	228 aa		7.53	□□□□□ -1.2
LETMD1-231	ENST00000551931		M0QXV9	152 aa		7.53	□□□□□ -1.2
LETMD1-231	ENST00000551931	TNFRSF6B	O95407	300 aa		7.53	□□□□□ -1.2
LETMD1-231	ENST00000551931	RPL32	P62910	135 aa	Known RBP	7.53	□□□□□ -1.2
LETMD1-231	ENST00000551931	MRPS36	P82909	103 aa	Known RBP	7.53	□□□□□ -1.2
LETMD1-231	ENST00000551931	KIAA0087	Q14695	138 aa		7.53	□□□□□ -1.2
LETMD1-231	ENST00000551931	PRR4	Q16378	134 aa		7.53	□□□□□ -1.2
LETMD1-231	ENST00000551931	TMEM241	Q24JQ0	296 aa		7.53	□□□□□ -1.2
LETMD1-231	ENST00000551931	SMIM2	Q9BVW6	85 aa		7.53	□□□□□ -1.2
LETMD1-231	ENST00000551931	LINC00862	A6NCI5	91 aa		7.52	□□□□□ -1.21
LETMD1-231	ENST00000551931	CKS2	P33552	79 aa		7.52	□□□□□ -1.21
LETMD1-231	ENST00000551931	HBB	P68871	147 aa		7.52	□□□□□ -1.21
LETMD1-231	ENST00000551931	SPANXA1	Q9NS26	97 aa		7.52	□□□□□ -1.21
LETMD1-231	ENST00000551931	SMIM27	A0A1W2PRY6	76 aa		7.51	□□□□□ -1.21
LETMD1-231	ENST00000551931	TCAP	O15273	167 aa		7.51	□□□□□ -1.21
LETMD1-231	ENST00000551931	NPY	P01303	97 aa		7.51	□□□□□ -1.21
LETMD1-231	ENST00000551931	UBE2D1	P51668	147 aa		7.51	□□□□□ -1.21
LETMD1-231	ENST00000551931	RPL23	P62829	140 aa	Known RBP	7.51	□□□□□ -1.21
LETMD1-231	ENST00000551931	UBE2B	P63146	152 aa		7.51	□□□□□ -1.21
LETMD1-231	ENST00000551931	FAM74A3	Q4VXF1	159 aa		7.51	□□□□□ -1.21
LETMD1-231	ENST00000551931	C9orf129	Q5T035	196 aa	Known RBP	7.51	□□□□□ -1.21
LETMD1-231	ENST00000551931	TGIF2-C20orf24	A0A0A6YYL0	155 aa		7.5	□□□□□ -1.21
LETMD1-231	ENST00000551931		D6R8Y8	96 aa		7.5	□□□□□ -1.21
LETMD1-231	ENST00000551931	C2orf82	Q6UX34	121 aa		7.5	□□□□□ -1.21
LETMD1-231	ENST00000551931	RPL13A	P40429	203 aa	Known RBP	7.49	□□□□□ -1.21
LETMD1-231	ENST00000551931	ADIRF	Q15847	76 aa		7.49	□□□□□ -1.21
LETMD1-231	ENST00000551931	LINC00242	Q5T6M2	205 aa		7.49	□□□□□ -1.21
LETMD1-231	ENST00000551931	TRBV30	A0A0K0K1B3	111 aa		7.48	□□□□□ -1.21
LETMD1-231	ENST00000551931	NDUFC2-KCTD14	E9PQ53	114 aa		7.48	□□□□□ -1.21
LETMD1-231	ENST00000551931	IGLV4-3	A0A075B6K6	122 aa		7.47	□□□□□ -1.21
LETMD1-231	ENST00000551931		A0A1B0GW15	77 aa		7.47	□□□□□ -1.21
LETMD1-231	ENST00000551931		C9JQL5	133 aa		7.47	□□□□□ -1.21
LETMD1-231	ENST00000551931	MRPL54	Q6P161	138 aa	Known RBP	7.47	□□□□□ -1.21
LETMD1-231	ENST00000551931	AKAP14	Q86UN6	197 aa		7.47	□□□□□ -1.21
LETMD1-231	ENST00000551931		A0A1B0GXF2	115 aa		7.46	□□□□□ -1.22
LETMD1-231	ENST00000551931	IFI27	P40305	119 aa	Predicted RBP	7.46	□□□□□ -1.22
LETMD1-231	ENST00000551931	KRTAP9-2	Q9BYQ4	174 aa		7.46	□□□□□ -1.22
LETMD1-231	ENST00000551931	NAT8	Q9UHE5	227 aa		7.46	□□□□□ -1.22
LETMD1-231	ENST00000551931	CARHSP1	Q9Y2V2	147 aa	Known RBP	7.46	□□□□□ -1.22
LETMD1-231	ENST00000551931	ZNF861P	O60384	105 aa		7.45	□□□□□ -1.22
LETMD1-231	ENST00000551931	PACRG	Q96M98	296 aa	Predicted RBP	7.45	□□□□□ -1.22
LETMD1-231	ENST00000551931	PYGO1	Q9Y3Y4	419 aa		7.45	□□□□□ -1.22
LETMD1-231	ENST00000551931		F8W036	122 aa		7.44	□□□□□ -1.22
LETMD1-231	ENST00000551931	TSPAN13	O95857	204 aa		7.44	□□□□□ -1.22
LETMD1-231	ENST00000551931	PPBP	P02775	128 aa		7.44	□□□□□ -1.22
LETMD1-231	ENST00000551931	ZC2HC1B	Q5TFG8	222 aa		7.44	□□□□□ -1.22
LETMD1-231	ENST00000551931	LINC00469	Q8N7U9	141 aa		7.44	□□□□□ -1.22
LETMD1-231	ENST00000551931	TMEM141	Q96I45	108 aa		7.44	□□□□□ -1.22
LETMD1-231	ENST00000551931		A0A087X002	238 aa		7.43	□□□□□ -1.22
LETMD1-231	ENST00000551931	S100A8	P05109	93 aa		7.43	□□□□□ -1.22
LETMD1-231	ENST00000551931	RAB5A	P20339	215 aa		7.43	□□□□□ -1.22
LETMD1-231	ENST00000551931	SRSF3	P84103	164 aa	Known RBP	7.43	□□□□□ -1.22
LETMD1-231	ENST00000551931	LINC00173	Q6ZV60	143 aa		7.43	□□□□□ -1.22
LETMD1-231	ENST00000551931	ORMDL3	Q8N138	153 aa		7.43	□□□□□ -1.22
LETMD1-231	ENST00000551931	C22orf24	Q9Y442	160 aa		7.43	□□□□□ -1.22
LETMD1-231	ENST00000551931	FAT4	Q6V0I7	4981 aa		7.43	□□□□□ -1.22
LETMD1-231	ENST00000551931	hCG_2014768	A0A024R1R8	64 aa		7.42	□□□□□ -1.22
LETMD1-231	ENST00000551931		A0A0U1RQV1	116 aa		7.42	□□□□□ -1.22
LETMD1-231	ENST00000551931	TEX43	Q6ZNM6	134 aa		7.42	□□□□□ -1.22
LETMD1-231	ENST00000551931	TMEM136	Q6ZRR5	245 aa		7.42	□□□□□ -1.22
LETMD1-231	ENST00000551931	LINC01561	Q8N1V8	128 aa		7.42	□□□□□ -1.22
LETMD1-231	ENST00000551931	PRELID3A	Q96N28	172 aa		7.42	□□□□□ -1.22
LETMD1-231	ENST00000551931	XAGE1A	Q9HD64	81 aa		7.42	□□□□□ -1.22
LETMD1-231	ENST00000551931	TOMM7	Q9P0U1	55 aa		7.42	□□□□□ -1.22
LETMD1-231	ENST00000551931	NUPR1	O60356	82 aa		7.41	□□□□□ -1.22
LETMD1-231	ENST00000551931	CTDSP1	Q9GZU7	261 aa		7.41	□□□□□ -1.22
LETMD1-231	ENST00000551931	LOC389332	A0A1B0GUA5	103 aa		7.4	□□□□□ -1.22
LETMD1-231	ENST00000551931	PRSS2	P07478	247 aa		7.4	□□□□□ -1.22
LETMD1-231	ENST00000551931	AMELX	Q99217	191 aa		7.4	□□□□□ -1.22
LETMD1-231	ENST00000551931	C2orf88	Q9BSF0	95 aa		7.4	□□□□□ -1.22
LETMD1-231	ENST00000551931	PRSS47	A8MTI9	375 aa		7.39	□□□□□ -1.23
LETMD1-231	ENST00000551931	CKS1B	P61024	79 aa		7.39	□□□□□ -1.23
LETMD1-231	ENST00000551931		Q6ZN92	141 aa		7.39	□□□□□ -1.23
LETMD1-231	ENST00000551931		Q8IZM0	81 aa		7.39	□□□□□ -1.23
LETMD1-231	ENST00000551931	LBH	Q53QV2	105 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23

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