RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550700.1

CS-220, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 559 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-220ENST00000550700 FAM104AQ969W3 186 aa6.29□□□□□ -1.4
CS-220ENST00000550700 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
CS-220ENST00000550700 CSMD3Q7Z407 3707 aa6.29□□□□□ -1.4
CS-220ENST00000550700 LCE6AA0A183 80 aa6.28□□□□□ -1.4
CS-220ENST00000550700 C3orf79P0CE67 100 aa6.28□□□□□ -1.4
CS-220ENST00000550700 IGLC3P0DOY3 106 aa6.28□□□□□ -1.4
CS-220ENST00000550700 LINC01545Q5VT33 79 aa6.28□□□□□ -1.4
CS-220ENST00000550700 ENHOQ6UWT2 76 aa6.28□□□□□ -1.4
CS-220ENST00000550700 LINC00173Q6ZV60 143 aa6.28□□□□□ -1.4
CS-220ENST00000550700 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa6.27□□□□□ -1.41
CS-220ENST00000550700 DPM2O94777 84 aa6.27□□□□□ -1.41
CS-220ENST00000550700 APOMO95445 188 aa6.27□□□□□ -1.41
CS-220ENST00000550700 ODF1Q14990 250 aa6.27□□□□□ -1.41
CS-220ENST00000550700 LINC00242Q5T6M2 205 aa6.27□□□□□ -1.41
CS-220ENST00000550700 CFAP161Q6P656 301 aa6.27□□□□□ -1.41
CS-220ENST00000550700 Q6ZR54 194 aa6.27□□□□□ -1.41
CS-220ENST00000550700 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa6.27□□□□□ -1.41
CS-220ENST00000550700 OR10D4PQ8NGN7 298 aa6.27□□□□□ -1.41
CS-220ENST00000550700 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
CS-220ENST00000550700 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
CS-220ENST00000550700 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa6.26□□□□□ -1.41
CS-220ENST00000550700 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa6.26□□□□□ -1.41
CS-220ENST00000550700 H0Y8G0 127 aa6.26□□□□□ -1.41
CS-220ENST00000550700 FAM229AH3BQW9 127 aa6.26□□□□□ -1.41
CS-220ENST00000550700 IGKCP01834 107 aa6.26□□□□□ -1.41
CS-220ENST00000550700 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
CS-220ENST00000550700 CHAC1Q9BUX1 264 aa6.26□□□□□ -1.41
CS-220ENST00000550700 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa6.26□□□□□ -1.41
CS-220ENST00000550700 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa6.25□□□□□ -1.41
CS-220ENST00000550700 A0A0J9YXV3 536 aa6.25□□□□□ -1.41
CS-220ENST00000550700 COX7A2LO14548 114 aa6.25□□□□□ -1.41
CS-220ENST00000550700 PSCAO43653 123 aa6.25□□□□□ -1.41
CS-220ENST00000550700 SCGB1D1O95968 90 aa6.25□□□□□ -1.41
CS-220ENST00000550700 XCL1P47992 114 aa6.25□□□□□ -1.41
CS-220ENST00000550700 HERVK_113P61574 105 aa6.25□□□□□ -1.41
CS-220ENST00000550700 C1orf134Q5TEV5 83 aa6.25□□□□□ -1.41
CS-220ENST00000550700 CLPSL2Q6UWE3 100 aa6.25□□□□□ -1.41
CS-220ENST00000550700 C6orf223Q8N319 242 aa6.25□□□□□ -1.41
CS-220ENST00000550700 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
CS-220ENST00000550700 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa6.24□□□□□ -1.41
CS-220ENST00000550700 A0A087WZ39 114 aa6.24□□□□□ -1.41
CS-220ENST00000550700 GAGE12HA6NDE8 117 aa6.24□□□□□ -1.41
CS-220ENST00000550700 C11orf86A6NJI1 115 aa6.24□□□□□ -1.41
CS-220ENST00000550700 HSBP1L1C9JCN9 74 aa6.24□□□□□ -1.41
CS-220ENST00000550700 F8WDY8 70 aa6.24□□□□□ -1.41
CS-220ENST00000550700 MALP21145 153 aa6.24□□□□□ -1.41
CS-220ENST00000550700 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
CS-220ENST00000550700 C14orf177Q52M58 125 aa6.24□□□□□ -1.41
CS-220ENST00000550700 SFTA2Q6UW10 78 aa6.24□□□□□ -1.41
CS-220ENST00000550700 LINC00469Q8N7U9 141 aa6.24□□□□□ -1.41
CS-220ENST00000550700 Q9HAA7 133 aa6.24□□□□□ -1.41
CS-220ENST00000550700 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa6.23□□□□□ -1.41
CS-220ENST00000550700 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa6.23□□□□□ -1.41
CS-220ENST00000550700 GHRHP01286 108 aa6.23□□□□□ -1.41
CS-220ENST00000550700 FOXI1Q12951 378 aa6.23□□□□□ -1.41
CS-220ENST00000550700 TMEM170BQ5T4T1 132 aa6.23□□□□□ -1.41
CS-220ENST00000550700 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa6.23□□□□□ -1.41
CS-220ENST00000550700 M0R2N4 97 aa6.22□□□□□ -1.41
CS-220ENST00000550700 EREGO14944 169 aa6.22□□□□□ -1.41
CS-220ENST00000550700 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa6.22□□□□□ -1.41
CS-220ENST00000550700 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa6.22□□□□□ -1.41
CS-220ENST00000550700 STARD9Q9P2P6 4700 aa6.21□□□□□ -1.41
CS-220ENST00000550700 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
CS-220ENST00000550700 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa6.21□□□□□ -1.42
CS-220ENST00000550700 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa6.2□□□□□ -1.42
CS-220ENST00000550700 TMEM223A0PJW6 202 aa6.2□□□□□ -1.42
CS-220ENST00000550700 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa6.2□□□□□ -1.42
CS-220ENST00000550700 PRSS2P07478 247 aa6.2□□□□□ -1.42
CS-220ENST00000550700 CXCL5P42830 114 aa6.2□□□□□ -1.42
CS-220ENST00000550700 COX6A2Q02221 97 aa6.2□□□□□ -1.42
CS-220ENST00000550700 C5orf38Q86SI9 138 aa6.2□□□□□ -1.42
CS-220ENST00000550700 PLEKHB2Q96CS7 222 aa6.2□□□□□ -1.42
CS-220ENST00000550700 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa6.19□□□□□ -1.42
CS-220ENST00000550700 SMIM6P0DI80 62 aa6.19□□□□□ -1.42
CS-220ENST00000550700 NMUP48645 174 aa6.19□□□□□ -1.42
CS-220ENST00000550700 S100A12P80511 92 aa6.19□□□□□ -1.42
CS-220ENST00000550700 LINC00336Q6ZUF6 198 aa6.19□□□□□ -1.42
CS-220ENST00000550700 Q8IZM0 81 aa6.19□□□□□ -1.42
CS-220ENST00000550700 PMCHL2Q9BQD1 86 aa6.19□□□□□ -1.42
CS-220ENST00000550700 PKIGQ9Y2B9 76 aa6.19□□□□□ -1.42
CS-220ENST00000550700 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
CS-220ENST00000550700 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
CS-220ENST00000550700 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa6.18□□□□□ -1.42
CS-220ENST00000550700 LINC00587B1AMM8 73 aa6.18□□□□□ -1.42
CS-220ENST00000550700 SMIM1B2RUZ4 78 aa6.18□□□□□ -1.42
CS-220ENST00000550700 E9PLD3 99 aa6.18□□□□□ -1.42
CS-220ENST00000550700 LEPROTO15243 131 aa6.18□□□□□ -1.42
CS-220ENST00000550700 C6orf226Q5I0X4 101 aa6.18□□□□□ -1.42
CS-220ENST00000550700 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
CS-220ENST00000550700 ORAOV1Q8WV07 137 aa6.18□□□□□ -1.42
CS-220ENST00000550700 C2orf48Q96LS8 159 aa6.18□□□□□ -1.42
CS-220ENST00000550700 USP17L23D6RBM5 183 aa6.17□□□□□ -1.42
CS-220ENST00000550700 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
CS-220ENST00000550700 CKS1BP61024 79 aa6.17□□□□□ -1.42
CS-220ENST00000550700 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa6.17□□□□□ -1.42
CS-220ENST00000550700 COX7B2Q8TF08 81 aa6.17□□□□□ -1.42
CS-220ENST00000550700 VAMP8Q9BV40 100 aa6.17□□□□□ -1.42
CS-220ENST00000550700 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
CS-220ENST00000550700 SPINK8P0C7L1 97 aa6.16□□□□□ -1.42
CS-220ENST00000550700 SPAG11BQ08648 103 aa6.16□□□□□ -1.42
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