RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549355.1

PTPRQ-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type Q, humanhuman

TSL 4

Gene PTPRQ, Length 567 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRQ-204ENST00000549355 NAT8Q9UHE5 227 aa2.8□□□□□ -1.96
PTPRQ-204ENST00000549355 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa2.8□□□□□ -1.96
PTPRQ-204ENST00000549355 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP2.8□□□□□ -1.96
PTPRQ-204ENST00000549355 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
PTPRQ-204ENST00000549355 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa2.79□□□□□ -1.96
PTPRQ-204ENST00000549355 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa2.79□□□□□ -1.96
PTPRQ-204ENST00000549355 MUC21A0A140T8X8 626 aa2.79□□□□□ -1.96
PTPRQ-204ENST00000549355 PRSS1P07477 247 aa2.79□□□□□ -1.96
PTPRQ-204ENST00000549355 FGF6P10767 208 aa2.79□□□□□ -1.96
PTPRQ-204ENST00000549355 RAB5AP20339 215 aa2.79□□□□□ -1.96
PTPRQ-204ENST00000549355 CEBPGP53567 150 aa2.79□□□□□ -1.96
PTPRQ-204ENST00000549355 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP2.79□□□□□ -1.96
PTPRQ-204ENST00000549355 CD164L2Q6UWJ8 174 aa2.79□□□□□ -1.96
PTPRQ-204ENST00000549355 Q6ZRU5 148 aa2.79□□□□□ -1.96
PTPRQ-204ENST00000549355 SCXQ7RTU7 201 aa2.79□□□□□ -1.96
PTPRQ-204ENST00000549355 GATD1Q8NB37 220 aa2.79□□□□□ -1.96
PTPRQ-204ENST00000549355 C20orf203Q8NBC4 194 aa2.79□□□□□ -1.96
PTPRQ-204ENST00000549355 TIMM21Q9BVV7 248 aa2.79□□□□□ -1.96
PTPRQ-204ENST00000549355 Q9UF83 564 aa2.79□□□□□ -1.96
PTPRQ-204ENST00000549355 APOBP04114 4563 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
PTPRQ-204ENST00000549355 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa2.78□□□□□ -1.96
PTPRQ-204ENST00000549355 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP2.78□□□□□ -1.96
PTPRQ-204ENST00000549355 K7EN84 100 aa2.78□□□□□ -1.96
PTPRQ-204ENST00000549355 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP2.78□□□□□ -1.96
PTPRQ-204ENST00000549355 CKS2P33552 79 aa2.78□□□□□ -1.96
PTPRQ-204ENST00000549355 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
PTPRQ-204ENST00000549355 SEC11AP67812 179 aa2.78□□□□□ -1.96
PTPRQ-204ENST00000549355 HBBP68871 147 aa2.78□□□□□ -1.96
PTPRQ-204ENST00000549355 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
PTPRQ-204ENST00000549355 SDIM1Q6ZPB5 146 aa2.78□□□□□ -1.96
PTPRQ-204ENST00000549355 ZNF664Q8N3J9 261 aa2.78□□□□□ -1.96
PTPRQ-204ENST00000549355 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa2.78□□□□□ -1.96
PTPRQ-204ENST00000549355 GTSF1Q8WW33 167 aa2.78□□□□□ -1.96
PTPRQ-204ENST00000549355 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP2.78□□□□□ -1.96
PTPRQ-204ENST00000549355 SPANXA1Q9NS26 97 aa2.78□□□□□ -1.96
PTPRQ-204ENST00000549355 HSPG2P98160 4391 aa2.77□□□□□ -1.97
PTPRQ-204ENST00000549355 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa2.77□□□□□ -1.97
PTPRQ-204ENST00000549355 COX7A2LO14548 114 aa2.77□□□□□ -1.97
PTPRQ-204ENST00000549355 MT-ND4LP03901 98 aa2.77□□□□□ -1.97
PTPRQ-204ENST00000549355 SRP19P09132 144 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
PTPRQ-204ENST00000549355 ESDP10768 282 aa2.77□□□□□ -1.97
PTPRQ-204ENST00000549355 RAB4AP20338 218 aa2.77□□□□□ -1.97
PTPRQ-204ENST00000549355 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
PTPRQ-204ENST00000549355 ADIRFQ15847 76 aa2.77□□□□□ -1.97
PTPRQ-204ENST00000549355 FAM104BQ5XKR9 115 aa2.77□□□□□ -1.97
PTPRQ-204ENST00000549355 Q6ZN92 141 aa2.77□□□□□ -1.97
PTPRQ-204ENST00000549355 ORMDL3Q8N138 153 aa2.77□□□□□ -1.97
PTPRQ-204ENST00000549355 OR10D4PQ8NGN7 298 aa2.77□□□□□ -1.97
PTPRQ-204ENST00000549355 C2orf48Q96LS8 159 aa2.77□□□□□ -1.97
PTPRQ-204ENST00000549355 IMMP2LQ96T52 175 aa2.77□□□□□ -1.97
PTPRQ-204ENST00000549355 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa2.77□□□□□ -1.97
PTPRQ-204ENST00000549355 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa2.76□□□□□ -1.97
PTPRQ-204ENST00000549355 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa2.76□□□□□ -1.97
PTPRQ-204ENST00000549355 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa2.76□□□□□ -1.97
PTPRQ-204ENST00000549355 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa2.76□□□□□ -1.97
PTPRQ-204ENST00000549355 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
PTPRQ-204ENST00000549355 XCL1P47992 114 aa2.76□□□□□ -1.97
PTPRQ-204ENST00000549355 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
PTPRQ-204ENST00000549355 SYCNQ0VAF6 134 aa2.76□□□□□ -1.97
PTPRQ-204ENST00000549355 WFDC2Q14508 124 aa2.76□□□□□ -1.97
PTPRQ-204ENST00000549355 COX19Q49B96 90 aa2.76□□□□□ -1.97
PTPRQ-204ENST00000549355 ORMDL2Q53FV1 153 aa2.76□□□□□ -1.97
PTPRQ-204ENST00000549355 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa2.76□□□□□ -1.97
PTPRQ-204ENST00000549355 REG3GQ6UW15 175 aa2.76□□□□□ -1.97
PTPRQ-204ENST00000549355 CLPSL2Q6UWE3 100 aa2.76□□□□□ -1.97
PTPRQ-204ENST00000549355 NUP35Q8NFH5 326 aa2.76□□□□□ -1.97
PTPRQ-204ENST00000549355 SPACA4Q8TDM5 124 aa2.76□□□□□ -1.97
PTPRQ-204ENST00000549355 CARD19Q96LW7 228 aa2.76□□□□□ -1.97
PTPRQ-204ENST00000549355 C2orf88Q9BSF0 95 aa2.76□□□□□ -1.97
PTPRQ-204ENST00000549355 PLAC8Q9NZF1 115 aa2.76□□□□□ -1.97
PTPRQ-204ENST00000549355 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa2.76□□□□□ -1.97
PTPRQ-204ENST00000549355 V9GYV3 84 aa2.76□□□□□ -1.97
PTPRQ-204ENST00000549355 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
PTPRQ-204ENST00000549355 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa2.75□□□□□ -1.97
PTPRQ-204ENST00000549355 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa2.75□□□□□ -1.97
PTPRQ-204ENST00000549355 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa2.75□□□□□ -1.97
PTPRQ-204ENST00000549355 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa2.75□□□□□ -1.97
PTPRQ-204ENST00000549355 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
PTPRQ-204ENST00000549355 GAGE10A6NGK3 116 aa2.75□□□□□ -1.97
PTPRQ-204ENST00000549355 TSHBP01222 138 aa2.75□□□□□ -1.97
PTPRQ-204ENST00000549355 CAMPP49913 170 aa2.75□□□□□ -1.97
PTPRQ-204ENST00000549355 RPL23P62829 140 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
PTPRQ-204ENST00000549355 UQCC3Q6UW78 93 aa2.75□□□□□ -1.97
PTPRQ-204ENST00000549355 Q6ZRP5 223 aa2.75□□□□□ -1.97
PTPRQ-204ENST00000549355 AMN1Q8IY45 258 aa2.75□□□□□ -1.97
PTPRQ-204ENST00000549355 LINC01561Q8N1V8 128 aa2.75□□□□□ -1.97
PTPRQ-204ENST00000549355 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
PTPRQ-204ENST00000549355 SMIM2Q9BVW6 85 aa2.75□□□□□ -1.97
PTPRQ-204ENST00000549355 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
PTPRQ-204ENST00000549355 TMEM242Q9NWH2 141 aa2.75□□□□□ -1.97
PTPRQ-204ENST00000549355 NDUFA1O15239 70 aa2.74□□□□□ -1.97
PTPRQ-204ENST00000549355 S100PP25815 95 aa2.74□□□□□ -1.97
PTPRQ-204ENST00000549355 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP2.74□□□□□ -1.97
PTPRQ-204ENST00000549355 COX6A2Q02221 97 aa2.74□□□□□ -1.97
PTPRQ-204ENST00000549355 MAJINQ3KP22 176 aa2.74□□□□□ -1.97
PTPRQ-204ENST00000549355 SPINK6Q6UWN8 80 aa2.74□□□□□ -1.97
PTPRQ-204ENST00000549355 TMEM136Q6ZRR5 245 aa2.74□□□□□ -1.97
PTPRQ-204ENST00000549355 C15orf56Q8N910 161 aa2.74□□□□□ -1.97
PTPRQ-204ENST00000549355 CAMK2N2Q96S95 79 aa2.74□□□□□ -1.97
PTPRQ-204ENST00000549355 MAP1LC3AQ9H492 121 aa2.74□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.1 ms