RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540101.2

C16orf62-211, Transcript of UPF0505 protein C16orf62, humanhuman

TSL 3

Gene C16orf62, Length 461 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf62-211ENST00000540101 CRPP02741 224 aa5.19□□□□□ -1.58
C16orf62-211ENST00000540101 PRSS1P07477 247 aa5.19□□□□□ -1.58
C16orf62-211ENST00000540101 S100A2P29034 98 aa5.19□□□□□ -1.58
C16orf62-211ENST00000540101 COX6A2Q02221 97 aa5.19□□□□□ -1.58
C16orf62-211ENST00000540101 FOXI1Q12951 378 aa5.19□□□□□ -1.58
C16orf62-211ENST00000540101 LINC01545Q5VT33 79 aa5.19□□□□□ -1.58
C16orf62-211ENST00000540101 NFE4Q86UQ8 179 aa5.19□□□□□ -1.58
C16orf62-211ENST00000540101 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP5.19□□□□□ -1.58
C16orf62-211ENST00000540101 C2orf88Q9BSF0 95 aa5.19□□□□□ -1.58
C16orf62-211ENST00000540101 Q9HAA7 133 aa5.19□□□□□ -1.58
C16orf62-211ENST00000540101 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
C16orf62-211ENST00000540101 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa5.18□□□□□ -1.58
C16orf62-211ENST00000540101 C11orf86A6NJI1 115 aa5.18□□□□□ -1.58
C16orf62-211ENST00000540101 RTL8CO15255 209 aa5.18□□□□□ -1.58
C16orf62-211ENST00000540101 XCL1P47992 114 aa5.18□□□□□ -1.58
C16orf62-211ENST00000540101 CD164L2Q6UWJ8 174 aa5.18□□□□□ -1.58
C16orf62-211ENST00000540101 PET117Q6UWS5 81 aa5.18□□□□□ -1.58
C16orf62-211ENST00000540101 C6orf223Q8N319 242 aa5.18□□□□□ -1.58
C16orf62-211ENST00000540101 C1orf43Q9BWL3 253 aa5.18□□□□□ -1.58
C16orf62-211ENST00000540101 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa5.18□□□□□ -1.58
C16orf62-211ENST00000540101 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP5.18□□□□□ -1.58
C16orf62-211ENST00000540101 DNAH11Q96DT5 4516 aa5.17□□□□□ -1.58
C16orf62-211ENST00000540101 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa5.17□□□□□ -1.58
C16orf62-211ENST00000540101 A0A087WZ39 114 aa5.17□□□□□ -1.58
C16orf62-211ENST00000540101 A0A1B0GVY2 172 aa5.17□□□□□ -1.58
C16orf62-211ENST00000540101 LRCOL1A6NCL2 159 aa5.17□□□□□ -1.58
C16orf62-211ENST00000540101 GAGE12HA6NDE8 117 aa5.17□□□□□ -1.58
C16orf62-211ENST00000540101 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP5.17□□□□□ -1.58
C16orf62-211ENST00000540101 KRTDAPP60985 99 aa5.17□□□□□ -1.58
C16orf62-211ENST00000540101 WFDC2Q14508 124 aa5.17□□□□□ -1.58
C16orf62-211ENST00000540101 SS18Q15532 418 aa5.17□□□□□ -1.58
C16orf62-211ENST00000540101 OR10D4PQ8NGN7 298 aa5.17□□□□□ -1.58
C16orf62-211ENST00000540101 PMCHL2Q9BQD1 86 aa5.17□□□□□ -1.58
C16orf62-211ENST00000540101 CHAC1Q9BUX1 264 aa5.17□□□□□ -1.58
C16orf62-211ENST00000540101 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa5.17□□□□□ -1.58
C16orf62-211ENST00000540101 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP5.17□□□□□ -1.58
C16orf62-211ENST00000540101 RYR1P21817 5038 aa5.16□□□□□ -1.58
C16orf62-211ENST00000540101 H0Y8G0 127 aa5.16□□□□□ -1.58
C16orf62-211ENST00000540101 HERVK_113P63121 156 aa5.16□□□□□ -1.58
C16orf62-211ENST00000540101 SEC11AP67812 179 aa5.16□□□□□ -1.58
C16orf62-211ENST00000540101 C1orf134Q5TEV5 83 aa5.16□□□□□ -1.58
C16orf62-211ENST00000540101 LINC00336Q6ZUF6 198 aa5.16□□□□□ -1.58
C16orf62-211ENST00000540101 RMI2Q96E14 147 aa5.16□□□□□ -1.58
C16orf62-211ENST00000540101 COX11Q9Y6N1 276 aa5.16□□□□□ -1.58
C16orf62-211ENST00000540101 DNAH17Q9UFH2 4485 aa5.15□□□□□ -1.58
C16orf62-211ENST00000540101 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa5.15□□□□□ -1.59
C16orf62-211ENST00000540101 SMIM1B2RUZ4 78 aa5.15□□□□□ -1.59
C16orf62-211ENST00000540101 DPM2O94777 84 aa5.15□□□□□ -1.59
C16orf62-211ENST00000540101 PLNP26678 52 aa5.15□□□□□ -1.59
C16orf62-211ENST00000540101 LINC01561Q8N1V8 128 aa5.15□□□□□ -1.59
C16orf62-211ENST00000540101 C15orf56Q8N910 161 aa5.15□□□□□ -1.59
C16orf62-211ENST00000540101 TM2D2Q9BX73 214 aa5.15□□□□□ -1.59
C16orf62-211ENST00000540101 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa5.14□□□□□ -1.59
C16orf62-211ENST00000540101 TMEM223A0PJW6 202 aa5.14□□□□□ -1.59
C16orf62-211ENST00000540101 COX7A2LO14548 114 aa5.14□□□□□ -1.59
C16orf62-211ENST00000540101 IGKCP01834 107 aa5.14□□□□□ -1.59
C16orf62-211ENST00000540101 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP5.14□□□□□ -1.59
C16orf62-211ENST00000540101 C5orf38Q86SI9 138 aa5.14□□□□□ -1.59
C16orf62-211ENST00000540101 LINC00469Q8N7U9 141 aa5.14□□□□□ -1.59
C16orf62-211ENST00000540101 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
C16orf62-211ENST00000540101 PKD1P98161 4303 aa5.14□□□□□ -1.59
C16orf62-211ENST00000540101 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa5.13□□□□□ -1.59
C16orf62-211ENST00000540101 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
C16orf62-211ENST00000540101 C20orf202A1L168 122 aa5.13□□□□□ -1.59
C16orf62-211ENST00000540101 USP17L23D6RBM5 183 aa5.13□□□□□ -1.59
C16orf62-211ENST00000540101 KIAA0087Q14695 138 aa5.13□□□□□ -1.59
C16orf62-211ENST00000540101 PYY3Q5JQD4 70 aa5.13□□□□□ -1.59
C16orf62-211ENST00000540101 ABCA13Q86UQ4 5058 aa5.12□□□□□ -1.59
C16orf62-211ENST00000540101 A0A087WTM6 91 aa5.12□□□□□ -1.59
C16orf62-211ENST00000540101 SPINK8P0C7L1 97 aa5.12□□□□□ -1.59
C16orf62-211ENST00000540101 TNP2Q05952 138 aa5.12□□□□□ -1.59
C16orf62-211ENST00000540101 TMEM170BQ5T4T1 132 aa5.12□□□□□ -1.59
C16orf62-211ENST00000540101 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa5.11□□□□□ -1.59
C16orf62-211ENST00000540101 H3BRM9 83 aa5.11□□□□□ -1.59
C16orf62-211ENST00000540101 LECT2O14960 151 aa5.11□□□□□ -1.59
C16orf62-211ENST00000540101 PSCAO43653 123 aa5.11□□□□□ -1.59
C16orf62-211ENST00000540101 SLPIP03973 132 aa5.11□□□□□ -1.59
C16orf62-211ENST00000540101 TSPEAR-AS2P59090 65 aa5.11□□□□□ -1.59
C16orf62-211ENST00000540101 MAJINQ3KP22 176 aa5.11□□□□□ -1.59
C16orf62-211ENST00000540101 ATOH7Q8N100 152 aa5.11□□□□□ -1.59
C16orf62-211ENST00000540101 STPG4Q8N801 248 aa5.11□□□□□ -1.59
C16orf62-211ENST00000540101 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa5.1□□□□□ -1.59
C16orf62-211ENST00000540101 E9PLD3 99 aa5.1□□□□□ -1.59
C16orf62-211ENST00000540101 MALP21145 153 aa5.1□□□□□ -1.59
C16orf62-211ENST00000540101 AKR1D1P51857 326 aa5.1□□□□□ -1.59
C16orf62-211ENST00000540101 ANKRD39Q53RE8 183 aa5.1□□□□□ -1.59
C16orf62-211ENST00000540101 CDPF1Q6NVV7 123 aa5.1□□□□□ -1.59
C16orf62-211ENST00000540101 Q8IZM0 81 aa5.1□□□□□ -1.59
C16orf62-211ENST00000540101 Q8N814 137 aa5.1□□□□□ -1.59
C16orf62-211ENST00000540101 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP5.1□□□□□ -1.59
C16orf62-211ENST00000540101 ORAOV1Q8WV07 137 aa5.1□□□□□ -1.59
C16orf62-211ENST00000540101 HSPG2P98160 4391 aa5.09□□□□□ -1.59
C16orf62-211ENST00000540101 hDV102S1A0JD36 115 aa5.09□□□□□ -1.59
C16orf62-211ENST00000540101 APOMO95445 188 aa5.09□□□□□ -1.59
C16orf62-211ENST00000540101 SCGB1D1O95968 90 aa5.09□□□□□ -1.59
C16orf62-211ENST00000540101 CNBPP62633 177 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
C16orf62-211ENST00000540101 SPAG11BQ08648 103 aa5.09□□□□□ -1.59
C16orf62-211ENST00000540101 HIGD2BQ4VC39 106 aa5.09□□□□□ -1.59
C16orf62-211ENST00000540101 CFAP161Q6P656 301 aa5.09□□□□□ -1.59
C16orf62-211ENST00000540101 LINC00526Q96FQ7 95 aa5.09□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49 ms