RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530579.6

NEDD8-MDP1-201, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

TSL 2

Gene NEDD8-MDP1, Length 471 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 C5orf38Q86SI9 138 aa5.71□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NFE4Q86UQ8 179 aa5.71□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa5.71□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 COX7A2LO14548 114 aa5.7□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MALP21145 153 aa5.7□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PYY3Q5JQD4 70 aa5.7□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TM2D2Q9BX73 214 aa5.7□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa5.7□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa5.69□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 hDV102S1A0JD36 115 aa5.69□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 HSBP1L1C9JCN9 74 aa5.69□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PSCAO43653 123 aa5.69□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SPINK8P0C7L1 97 aa5.69□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 HERVK_113P61574 105 aa5.69□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FOXI1Q12951 378 aa5.69□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 STPG4Q8N801 248 aa5.69□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 COX11Q9Y6N1 276 aa5.69□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TGP01266 2768 aa5.68□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa5.68□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa5.68□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MAJINQ3KP22 176 aa5.68□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 A0A087WZ39 114 aa5.67□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TMEM223A0PJW6 202 aa5.67□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 APOMO95445 188 aa5.67□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SMIM6P0DI80 62 aa5.67□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 S100A12P80511 92 aa5.67□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa5.67□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 Q6ZR54 194 aa5.67□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 C6orf223Q8N319 242 aa5.67□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 VAMP8Q9BV40 100 aa5.67□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 DNAH7Q8WXX0 4024 aa5.66□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 LCE6AA0A183 80 aa5.66□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SMIM1B2RUZ4 78 aa5.66□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 C1orf134Q5TEV5 83 aa5.66□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CDPF1Q6NVV7 123 aa5.66□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CFAP161Q6P656 301 aa5.66□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 LINC01561Q8N1V8 128 aa5.66□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TOMM7Q9P0U1 55 aa5.66□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PAM16Q9Y3D7 125 aa5.66□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa5.65□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 LEPROTO15243 131 aa5.65□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PRSS2P07478 247 aa5.65□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NMUP48645 174 aa5.65□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SPATA45Q537H7 98 aa5.65□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ANKRD39Q53RE8 183 aa5.65□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 C6orf226Q5I0X4 101 aa5.65□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa5.65□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ORAOV1Q8WV07 137 aa5.65□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PLEKHB2Q96CS7 222 aa5.65□□□□□ -1.5
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 E9PLD3 99 aa5.64□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 LECT2O14960 151 aa5.64□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 HIGD2BQ4VC39 106 aa5.64□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 COX7B2Q8TF08 81 aa5.64□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 C12orf57Q99622 126 aa5.64□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 STARD9Q9P2P6 4700 aa5.64□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CSMD3Q7Z407 3707 aa5.63□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa5.63□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa5.63□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 USP17L23D6RBM5 183 aa5.63□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 J3QQQ9 107 aa5.63□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa5.63□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SPAG11BQ08648 103 aa5.63□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 LINC00518Q8N0U6 118 aa5.63□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CKS1BP61024 79 aa5.62□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP5.62□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 C15orf56Q8N910 161 aa5.62□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 LINC00526Q96FQ7 95 aa5.62□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TSPEAR-AS2P59090 65 aa5.61□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PCP2Q8IVA1 136 aa5.61□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 Q8IZM0 81 aa5.61□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 C14orf144Q96I85 54 aa5.61□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TTTY13Q9BZ97 58 aa5.61□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NDUFA12Q9UI09 145 aa5.61□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP5.6□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa5.6□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZNF815PA8K554 130 aa5.6□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 WFDC2Q14508 124 aa5.6□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 KIAA0087Q14695 138 aa5.6□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 C14orf177Q52M58 125 aa5.6□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 C2orf82Q6UX34 121 aa5.6□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP5.6□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CAMK2N2Q96S95 79 aa5.6□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PRO1933Q9H354 126 aa5.6□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TENM2Q9NT68 2774 aa5.59□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 A0A087WTM6 91 aa5.59□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 LRCOL1A6NCL2 159 aa5.59□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 EREGO14944 169 aa5.59□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 COX8AP10176 69 aa5.59□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CXCL5P42830 114 aa5.59□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SLC25A34Q6PIV7 304 aa5.59□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa5.59□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 C2orf48Q96LS8 159 aa5.59□□□□□ -1.51
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP5.58□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 F8WDY8 70 aa5.58□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NDUFA1O15239 70 aa5.58□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 98.1 ms