RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527136.1

SIGIRR-208, Transcript of single Ig and TIR domain containing, humanhuman

TSL 4

Gene SIGIRR, Length 571 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIGIRR-208ENST00000527136 K7EP13 123 aa7.26□□□□□ -1.25
SIGIRR-208ENST00000527136 CCL25O15444 150 aa7.26□□□□□ -1.25
SIGIRR-208ENST00000527136 ATP5LO75964 103 aa7.26□□□□□ -1.25
SIGIRR-208ENST00000527136 LEPROTL1O95214 131 aa7.26□□□□□ -1.25
SIGIRR-208ENST00000527136 SCGB1D1O95968 90 aa7.26□□□□□ -1.25
SIGIRR-208ENST00000527136 PRSS1P07477 247 aa7.26□□□□□ -1.25
SIGIRR-208ENST00000527136 SS18Q15532 418 aa7.26□□□□□ -1.25
SIGIRR-208ENST00000527136 MIAQ16674 131 aa7.26□□□□□ -1.25
SIGIRR-208ENST00000527136 BAALCQ8WXS3 180 aa7.26□□□□□ -1.25
SIGIRR-208ENST00000527136 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
SIGIRR-208ENST00000527136 IFI27L1Q96BM0 104 aa7.26□□□□□ -1.25
SIGIRR-208ENST00000527136 RMI2Q96E14 147 aa7.26□□□□□ -1.25
SIGIRR-208ENST00000527136 C2orf88Q9BSF0 95 aa7.26□□□□□ -1.25
SIGIRR-208ENST00000527136 ALMS1Q8TCU4 4167 aa7.26□□□□□ -1.25
SIGIRR-208ENST00000527136 LINC01549A6NIU2 74 aa7.25□□□□□ -1.25
SIGIRR-208ENST00000527136 LECT2O14960 151 aa7.25□□□□□ -1.25
SIGIRR-208ENST00000527136 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
SIGIRR-208ENST00000527136 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
SIGIRR-208ENST00000527136 TM2D2Q9BX73 214 aa7.25□□□□□ -1.25
SIGIRR-208ENST00000527136 PMVKQ15126 192 aa7.24□□□□□ -1.25
SIGIRR-208ENST00000527136 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa7.24□□□□□ -1.25
SIGIRR-208ENST00000527136 NFE4Q86UQ8 179 aa7.24□□□□□ -1.25
SIGIRR-208ENST00000527136 AMELXQ99217 191 aa7.24□□□□□ -1.25
SIGIRR-208ENST00000527136 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa7.24□□□□□ -1.25
SIGIRR-208ENST00000527136 CST9LQ9H4G1 147 aa7.24□□□□□ -1.25
SIGIRR-208ENST00000527136 HSPB8Q9UJY1 196 aa7.24□□□□□ -1.25
SIGIRR-208ENST00000527136 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa7.23□□□□□ -1.25
SIGIRR-208ENST00000527136 A0A0J9YXV3 536 aa7.23□□□□□ -1.25
SIGIRR-208ENST00000527136 RTL8CO15255 209 aa7.23□□□□□ -1.25
SIGIRR-208ENST00000527136 S100A2P29034 98 aa7.23□□□□□ -1.25
SIGIRR-208ENST00000527136 UBE2D1P51668 147 aa7.23□□□□□ -1.25
SIGIRR-208ENST00000527136 C5orf38Q86SI9 138 aa7.23□□□□□ -1.25
SIGIRR-208ENST00000527136 COX6A2Q02221 97 aa7.22□□□□□ -1.25
SIGIRR-208ENST00000527136 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
SIGIRR-208ENST00000527136 HIST3H2BBQ8N257 126 aa7.22□□□□□ -1.25
SIGIRR-208ENST00000527136 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa7.22□□□□□ -1.25
SIGIRR-208ENST00000527136 PMCHL2Q9BQD1 86 aa7.22□□□□□ -1.25
SIGIRR-208ENST00000527136 SACSQ9NZJ4 4579 aa7.22□□□□□ -1.25
SIGIRR-208ENST00000527136 KRTDAPP60985 99 aa7.21□□□□□ -1.26
SIGIRR-208ENST00000527136 LINC00242Q5T6M2 205 aa7.21□□□□□ -1.26
SIGIRR-208ENST00000527136 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa7.21□□□□□ -1.26
SIGIRR-208ENST00000527136 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa7.21□□□□□ -1.26
SIGIRR-208ENST00000527136 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
SIGIRR-208ENST00000527136 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
SIGIRR-208ENST00000527136 WFDC2Q14508 124 aa7.2□□□□□ -1.26
SIGIRR-208ENST00000527136 CD164L2Q6UWJ8 174 aa7.2□□□□□ -1.26
SIGIRR-208ENST00000527136 COX11Q9Y6N1 276 aa7.2□□□□□ -1.26
SIGIRR-208ENST00000527136 DNAH1Q9P2D7 4330 aa7.2□□□□□ -1.26
SIGIRR-208ENST00000527136 COX7A2LO14548 114 aa7.19□□□□□ -1.26
SIGIRR-208ENST00000527136 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP7.19□□□□□ -1.26
SIGIRR-208ENST00000527136 HIGD2BQ4VC39 106 aa7.19□□□□□ -1.26
SIGIRR-208ENST00000527136 Q8N1X5 172 aa7.19□□□□□ -1.26
SIGIRR-208ENST00000527136 HIST1H2BLQ99880 126 aa7.19□□□□□ -1.26
SIGIRR-208ENST00000527136 VPS13DQ5THJ4 4388 aa7.19□□□□□ -1.26
SIGIRR-208ENST00000527136 RYR2Q92736 4967 aa7.19□□□□□ -1.26
SIGIRR-208ENST00000527136 C5orf52A6NGY3 159 aa7.18□□□□□ -1.26
SIGIRR-208ENST00000527136 USP17L23D6RBM5 183 aa7.18□□□□□ -1.26
SIGIRR-208ENST00000527136 C3orf79P0CE67 100 aa7.18□□□□□ -1.26
SIGIRR-208ENST00000527136 SPATA12Q7Z6I5 190 aa7.18□□□□□ -1.26
SIGIRR-208ENST00000527136 LINC00469Q8N7U9 141 aa7.18□□□□□ -1.26
SIGIRR-208ENST00000527136 CHAC1Q9BUX1 264 aa7.18□□□□□ -1.26
SIGIRR-208ENST00000527136 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
SIGIRR-208ENST00000527136 RYR3Q15413 4870 aa7.18□□□□□ -1.26
SIGIRR-208ENST00000527136 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa7.17□□□□□ -1.26
SIGIRR-208ENST00000527136 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
SIGIRR-208ENST00000527136 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa7.17□□□□□ -1.26
SIGIRR-208ENST00000527136 A0A087WTM6 91 aa7.17□□□□□ -1.26
SIGIRR-208ENST00000527136 A0A0A0MQY5 61 aa7.17□□□□□ -1.26
SIGIRR-208ENST00000527136 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa7.17□□□□□ -1.26
SIGIRR-208ENST00000527136 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa7.17□□□□□ -1.26
SIGIRR-208ENST00000527136 C11orf86A6NJI1 115 aa7.17□□□□□ -1.26
SIGIRR-208ENST00000527136 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa7.17□□□□□ -1.26
SIGIRR-208ENST00000527136 KRTAP10-2P60368 255 aa7.17□□□□□ -1.26
SIGIRR-208ENST00000527136 TMEM170BQ5T4T1 132 aa7.17□□□□□ -1.26
SIGIRR-208ENST00000527136 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa7.17□□□□□ -1.26
SIGIRR-208ENST00000527136 LINC00526Q96FQ7 95 aa7.17□□□□□ -1.26
SIGIRR-208ENST00000527136 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa7.17□□□□□ -1.26
SIGIRR-208ENST00000527136 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa7.16□□□□□ -1.26
SIGIRR-208ENST00000527136 LRCOL1A6NCL2 159 aa7.16□□□□□ -1.26
SIGIRR-208ENST00000527136 SPINK8P0C7L1 97 aa7.16□□□□□ -1.26
SIGIRR-208ENST00000527136 IGLC3P0DOY3 106 aa7.16□□□□□ -1.26
SIGIRR-208ENST00000527136 HERVK_113P63121 156 aa7.16□□□□□ -1.26
SIGIRR-208ENST00000527136 SEC11AP67812 179 aa7.16□□□□□ -1.26
SIGIRR-208ENST00000527136 hDV102S1A0JD36 115 aa7.15□□□□□ -1.26
SIGIRR-208ENST00000527136 F8VRH5 84 aa7.15□□□□□ -1.26
SIGIRR-208ENST00000527136 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
SIGIRR-208ENST00000527136 C15orf56Q8N910 161 aa7.15□□□□□ -1.26
SIGIRR-208ENST00000527136 OR10D4PQ8NGN7 298 aa7.15□□□□□ -1.26
SIGIRR-208ENST00000527136 ORAOV1Q8WV07 137 aa7.15□□□□□ -1.26
SIGIRR-208ENST00000527136 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
SIGIRR-208ENST00000527136 TOMM7Q9P0U1 55 aa7.15□□□□□ -1.26
SIGIRR-208ENST00000527136 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa7.14□□□□□ -1.27
SIGIRR-208ENST00000527136 PET117Q6UWS5 81 aa7.14□□□□□ -1.27
SIGIRR-208ENST00000527136 LINC00336Q6ZUF6 198 aa7.14□□□□□ -1.27
SIGIRR-208ENST00000527136 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa7.14□□□□□ -1.27
SIGIRR-208ENST00000527136 HYDINQ4G0P3 5121 aa7.14□□□□□ -1.27
SIGIRR-208ENST00000527136 KMT2AQ03164 3969 aa7.13□□□□□ -1.27
SIGIRR-208ENST00000527136 A0A087WZ39 114 aa7.13□□□□□ -1.27
SIGIRR-208ENST00000527136 H3BRM9 83 aa7.13□□□□□ -1.27
SIGIRR-208ENST00000527136 DPM2O94777 84 aa7.13□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.4 ms