RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525151.5

TRAF3IP2-AS1-208, TRAF3IP2 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAF3IP2-AS1, Length 609 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 TEX261Q6UWH6 196 aa9.43□□□□□ -0.9
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 MBD3L1Q8WWY6 194 aa9.43□□□□□ -0.9
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 ST20Q9HBF5 79 aa9.43□□□□□ -0.9
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 CYTL1Q9NRR1 136 aa9.43□□□□□ -0.9
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 NUDT10Q8NFP7 164 aa9.42□□□□□ -0.9
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 SFT2D1Q8WV19 159 aa9.42□□□□□ -0.9
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 NUDT11Q96G61 164 aa9.42□□□□□ -0.9
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 C3orf22Q8N5N4 141 aa9.41□□□□□ -0.9
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa9.4□□□□□ -0.9
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 UPK1BO75841 260 aa9.4□□□□□ -0.9
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 KCNRGQ8N5I3 272 aa9.4□□□□□ -0.9
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 LINC00469Q8N7U9 141 aa9.4□□□□□ -0.9
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 FAM210AQ96ND0 272 aa9.4□□□□□ -0.9
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa9.39□□□□□ -0.91
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP9.38□□□□□ -0.91
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 XAGE1AQ9HD64 81 aa9.38□□□□□ -0.91
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 RPL37AP8A6NKH3 93 aa9.37□□□□□ -0.91
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 CCL20P78556 96 aa9.37□□□□□ -0.91
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP9.37□□□□□ -0.91
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP9.37□□□□□ -0.91
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 XP32Q5T750 250 aa9.36□□□□□ -0.91
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 FAM213BQ8TBF2 198 aa9.36□□□□□ -0.91
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 SMIM12Q96EX1 92 aa9.36□□□□□ -0.91
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 LINC00167Q96N53 147 aa9.36□□□□□ -0.91
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 TIMM21Q9BVV7 248 aa9.36□□□□□ -0.91
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 TP73-AS1Q9UF72 201 aa9.36□□□□□ -0.91
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 GNG4P50150 75 aa9.35□□□□□ -0.91
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 ZNF727A8MUV8 499 aa9.34□□□□□ -0.91
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa9.33□□□□□ -0.92
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 RPL39P62891 51 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 SMIM15Q7Z3B0 74 aa9.33□□□□□ -0.92
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 SMKR1H3BMG3 65 aa9.32□□□□□ -0.92
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 K7EN84 100 aa9.32□□□□□ -0.92
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 FCER1GP30273 86 aa9.32□□□□□ -0.92
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 VCYO14598 125 aa9.31□□□□□ -0.92
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 RAB4AP20338 218 aa9.31□□□□□ -0.92
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 TNFRSF6BO95407 300 aa9.3□□□□□ -0.92
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 SPAG11AQ6PDA7 123 aa9.3□□□□□ -0.92
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 NRACQ8N912 160 aa9.3□□□□□ -0.92
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 GAGE10A6NGK3 116 aa9.29□□□□□ -0.92
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 UBE2AP49459 152 aa9.29□□□□□ -0.92
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 GNG13Q9P2W3 67 aa9.29□□□□□ -0.92
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 H2AFB1P0C5Y9 115 aa9.28□□□□□ -0.92
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 SMAGPQ0VAQ4 97 aa9.28□□□□□ -0.92
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 S100ZQ8WXG8 99 aa9.28□□□□□ -0.92
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 PRLHP81277 87 aa9.27□□□□□ -0.93
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 LINC00299Q6ZSB3 139 aa9.27□□□□□ -0.93
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 AMN1Q8IY45 258 aa9.27□□□□□ -0.93
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 IFITM10A6NMD0 228 aa9.26□□□□□ -0.93
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 M0R2T5 61 aa9.26□□□□□ -0.93
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 GIPP09681 153 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 TMEM191AQ9H0A3 160 aa9.26□□□□□ -0.93
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 MANBALQ9NQG1 85 aa9.26□□□□□ -0.93
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa9.25□□□□□ -0.93
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 RPL32P62910 135 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 OCC1Q8TAD7 63 aa9.25□□□□□ -0.93
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 PLEKHB2Q96CS7 222 aa9.25□□□□□ -0.93
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 BIN3Q9NQY0 253 aa9.25□□□□□ -0.93
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 UMAD1C9J7I0 102 aa9.24□□□□□ -0.93
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 DAND5Q8N907 189 aa9.24□□□□□ -0.93
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 KIR2DL4Q99706 377 aa9.24□□□□□ -0.93
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 HBBP68871 147 aa9.23□□□□□ -0.93
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 MED9Q9NWA0 146 aa9.23□□□□□ -0.93
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 ARPC5O15511 151 aa9.22□□□□□ -0.93
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 SCO1O75880 301 aa9.22□□□□□ -0.93
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa9.21□□□□□ -0.94
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 PCOTHQ58A44 107 aa9.21□□□□□ -0.94
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 TMEM18Q96B42 140 aa9.21□□□□□ -0.94
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 SPANXA1Q9NS26 97 aa9.21□□□□□ -0.94
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 Q8NBF4 154 aa9.2□□□□□ -0.94
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa9.19□□□□□ -0.94
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa9.18□□□□□ -0.94
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 A0A1B0GVG6 124 aa9.18□□□□□ -0.94
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 PDE6DO43924 150 aa9.18□□□□□ -0.94
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 IGKV2D-28P01615 120 aa9.18□□□□□ -0.94
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 LINC01561Q8N1V8 128 aa9.18□□□□□ -0.94
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 GATCO43716 136 aaKnown RBP9.17□□□□□ -0.94
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 C4orf48Q5BLP8 95 aa9.17□□□□□ -0.94
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 Q8N377 158 aa9.17□□□□□ -0.94
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 TOMM7Q9P0U1 55 aa9.17□□□□□ -0.94
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 A0A1B0GUT8 65 aa9.16□□□□□ -0.94
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 A8MWL6 223 aa9.16□□□□□ -0.94
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 TMEM238C9JI98 176 aa9.16□□□□□ -0.94
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 CKS1BP61024 79 aa9.16□□□□□ -0.94
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa9.15□□□□□ -0.94
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa9.15□□□□□ -0.94
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 Q8IZM0 81 aa9.15□□□□□ -0.94
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa9.14□□□□□ -0.95
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 SPINK1P00995 79 aa9.14□□□□□ -0.95
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 C6orf226Q5I0X4 101 aa9.14□□□□□ -0.95
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 FAM231DQ6ZW35 169 aa9.14□□□□□ -0.95
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa9.14□□□□□ -0.95
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 SPRR4Q96PI1 79 aa9.14□□□□□ -0.95
TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 TMEM126AQ9H061 195 aa9.14□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.6 ms