RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519068.2

MSC-AS1-205, MSC antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene MSC-AS1, Length 569 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSC-AS1-205ENST00000519068 A0A087WX48 190 aa3.61□□□□□ -1.83
MSC-AS1-205ENST00000519068 H7C423 109 aa3.61□□□□□ -1.83
MSC-AS1-205ENST00000519068 K7EMI3 77 aa3.61□□□□□ -1.83
MSC-AS1-205ENST00000519068 M0R2N4 97 aa3.61□□□□□ -1.83
MSC-AS1-205ENST00000519068 FGF6P10767 208 aa3.61□□□□□ -1.83
MSC-AS1-205ENST00000519068 G0S2P27469 103 aa3.61□□□□□ -1.83
MSC-AS1-205ENST00000519068 RBX1P62877 108 aa3.61□□□□□ -1.83
MSC-AS1-205ENST00000519068 C5orf47Q569G3 176 aa3.61□□□□□ -1.83
MSC-AS1-205ENST00000519068 C2orf66Q6UXQ4 117 aa3.61□□□□□ -1.83
MSC-AS1-205ENST00000519068 Q8N976 141 aa3.61□□□□□ -1.83
MSC-AS1-205ENST00000519068 BAALCQ8WXS3 180 aa3.61□□□□□ -1.83
MSC-AS1-205ENST00000519068 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP3.61□□□□□ -1.83
MSC-AS1-205ENST00000519068 SCGB3A1Q96QR1 104 aa3.61□□□□□ -1.83
MSC-AS1-205ENST00000519068 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa3.61□□□□□ -1.83
MSC-AS1-205ENST00000519068 OCR1Q9BZK8 76 aa3.61□□□□□ -1.83
MSC-AS1-205ENST00000519068 CSMD3Q7Z407 3707 aa3.6□□□□□ -1.83
MSC-AS1-205ENST00000519068 TENM2Q9NT68 2774 aa3.6□□□□□ -1.83
MSC-AS1-205ENST00000519068 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa3.6□□□□□ -1.83
MSC-AS1-205ENST00000519068 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa3.6□□□□□ -1.83
MSC-AS1-205ENST00000519068 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa3.6□□□□□ -1.83
MSC-AS1-205ENST00000519068 A0A1B0GUV1 79 aa3.6□□□□□ -1.83
MSC-AS1-205ENST00000519068 DNAH10OSP0CZ25 163 aa3.6□□□□□ -1.83
MSC-AS1-205ENST00000519068 FABP4P15090 132 aa3.6□□□□□ -1.83
MSC-AS1-205ENST00000519068 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
MSC-AS1-205ENST00000519068 MPV17L2Q567V2 206 aa3.6□□□□□ -1.83
MSC-AS1-205ENST00000519068 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
MSC-AS1-205ENST00000519068 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa3.6□□□□□ -1.83
MSC-AS1-205ENST00000519068 LINC00269Q8N2A0 174 aa3.6□□□□□ -1.83
MSC-AS1-205ENST00000519068 ZNF664Q8N3J9 261 aa3.6□□□□□ -1.83
MSC-AS1-205ENST00000519068 OR5A1Q8NGJ0 315 aa3.6□□□□□ -1.83
MSC-AS1-205ENST00000519068 FAM104AQ969W3 186 aa3.6□□□□□ -1.83
MSC-AS1-205ENST00000519068 TOMM6Q96B49 74 aa3.6□□□□□ -1.83
MSC-AS1-205ENST00000519068 TMEM101Q96IK0 257 aa3.6□□□□□ -1.83
MSC-AS1-205ENST00000519068 UPK3BQ9BT76 320 aa3.6□□□□□ -1.83
MSC-AS1-205ENST00000519068 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa3.6□□□□□ -1.83
MSC-AS1-205ENST00000519068 KLK12Q9UKR0 248 aa3.6□□□□□ -1.83
MSC-AS1-205ENST00000519068 CYSLTR1Q9Y271 337 aa3.6□□□□□ -1.83
MSC-AS1-205ENST00000519068 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa3.6□□□□□ -1.83
MSC-AS1-205ENST00000519068 SACSQ9NZJ4 4579 aa3.59□□□□□ -1.83
MSC-AS1-205ENST00000519068 A0A096LNJ9 63 aa3.59□□□□□ -1.83
MSC-AS1-205ENST00000519068 IGIPA6NJ69 53 aa3.59□□□□□ -1.83
MSC-AS1-205ENST00000519068 ANGP03950 147 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
MSC-AS1-205ENST00000519068 PDZD11Q5EBL8 140 aa3.59□□□□□ -1.83
MSC-AS1-205ENST00000519068 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
MSC-AS1-205ENST00000519068 LINC01556Q5JQF7 62 aa3.59□□□□□ -1.83
MSC-AS1-205ENST00000519068 ENHOQ6UWT2 76 aa3.59□□□□□ -1.83
MSC-AS1-205ENST00000519068 LINC00173Q6ZV60 143 aa3.59□□□□□ -1.83
MSC-AS1-205ENST00000519068 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
MSC-AS1-205ENST00000519068 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa3.59□□□□□ -1.83
MSC-AS1-205ENST00000519068 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
MSC-AS1-205ENST00000519068 UBE2WQ96B02 151 aa3.59□□□□□ -1.83
MSC-AS1-205ENST00000519068 TIMM21Q9BVV7 248 aa3.59□□□□□ -1.83
MSC-AS1-205ENST00000519068 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa3.59□□□□□ -1.83
MSC-AS1-205ENST00000519068 ALMS1Q8TCU4 4167 aa3.59□□□□□ -1.84
MSC-AS1-205ENST00000519068 DNAH2Q9P225 4427 aa3.58□□□□□ -1.84
MSC-AS1-205ENST00000519068 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa3.58□□□□□ -1.84
MSC-AS1-205ENST00000519068 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa3.58□□□□□ -1.84
MSC-AS1-205ENST00000519068 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa3.58□□□□□ -1.84
MSC-AS1-205ENST00000519068 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
MSC-AS1-205ENST00000519068 LEPROTL1O95214 131 aa3.58□□□□□ -1.84
MSC-AS1-205ENST00000519068 HBDP02042 147 aa3.58□□□□□ -1.84
MSC-AS1-205ENST00000519068 PKIAP61925 76 aa3.58□□□□□ -1.84
MSC-AS1-205ENST00000519068 REG3AQ06141 175 aa3.58□□□□□ -1.84
MSC-AS1-205ENST00000519068 SMAGPQ0VAQ4 97 aa3.58□□□□□ -1.84
MSC-AS1-205ENST00000519068 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa3.58□□□□□ -1.84
MSC-AS1-205ENST00000519068 TMEM141Q96I45 108 aa3.58□□□□□ -1.84
MSC-AS1-205ENST00000519068 CST9LQ9H4G1 147 aa3.58□□□□□ -1.84
MSC-AS1-205ENST00000519068 SPANXA1Q9NS26 97 aa3.58□□□□□ -1.84
MSC-AS1-205ENST00000519068 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa3.57□□□□□ -1.84
MSC-AS1-205ENST00000519068 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa3.57□□□□□ -1.84
MSC-AS1-205ENST00000519068 LINC01549A6NIU2 74 aa3.57□□□□□ -1.84
MSC-AS1-205ENST00000519068 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
MSC-AS1-205ENST00000519068 S100A2P29034 98 aa3.57□□□□□ -1.84
MSC-AS1-205ENST00000519068 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
MSC-AS1-205ENST00000519068 CLPSL2Q6UWE3 100 aa3.57□□□□□ -1.84
MSC-AS1-205ENST00000519068 Q6ZN92 141 aa3.57□□□□□ -1.84
MSC-AS1-205ENST00000519068 IFI27L1Q96BM0 104 aa3.57□□□□□ -1.84
MSC-AS1-205ENST00000519068 TIMM17AQ99595 171 aa3.57□□□□□ -1.84
MSC-AS1-205ENST00000519068 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa3.57□□□□□ -1.84
MSC-AS1-205ENST00000519068 DNAH10Q8IVF4 4471 aa3.57□□□□□ -1.84
MSC-AS1-205ENST00000519068 DNAH6Q9C0G6 4158 aa3.56□□□□□ -1.84
MSC-AS1-205ENST00000519068 KMT2AQ03164 3969 aa3.56□□□□□ -1.84
MSC-AS1-205ENST00000519068 HYDINQ4G0P3 5121 aa3.56□□□□□ -1.84
MSC-AS1-205ENST00000519068 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa3.56□□□□□ -1.84
MSC-AS1-205ENST00000519068 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa3.56□□□□□ -1.84
MSC-AS1-205ENST00000519068 LCE6AA0A183 80 aa3.56□□□□□ -1.84
MSC-AS1-205ENST00000519068 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa3.56□□□□□ -1.84
MSC-AS1-205ENST00000519068 IFITM10A6NMD0 228 aa3.56□□□□□ -1.84
MSC-AS1-205ENST00000519068 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
MSC-AS1-205ENST00000519068 COX6A2Q02221 97 aa3.56□□□□□ -1.84
MSC-AS1-205ENST00000519068 PMVKQ15126 192 aa3.56□□□□□ -1.84
MSC-AS1-205ENST00000519068 SS18Q15532 418 aa3.56□□□□□ -1.84
MSC-AS1-205ENST00000519068 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa3.56□□□□□ -1.84
MSC-AS1-205ENST00000519068 TEX43Q6ZNM6 134 aa3.56□□□□□ -1.84
MSC-AS1-205ENST00000519068 Q6ZR54 194 aa3.56□□□□□ -1.84
MSC-AS1-205ENST00000519068 Q6ZUT4 128 aa3.56□□□□□ -1.84
MSC-AS1-205ENST00000519068 SMIM29Q86T20 159 aa3.56□□□□□ -1.84
MSC-AS1-205ENST00000519068 HIST3H2BBQ8N257 126 aa3.56□□□□□ -1.84
MSC-AS1-205ENST00000519068 C10orf126Q8N4M7 172 aa3.56□□□□□ -1.84
MSC-AS1-205ENST00000519068 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 1378 ms