RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509368.6

PDE4D-218, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,809 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-218ENST00000509368 HIGD2AQ9BW72 106 aa1.31□□□□□ -2.2
PDE4D-218ENST00000509368 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP1.31□□□□□ -2.2
PDE4D-218ENST00000509368 TANC2Q9HCD6 1990 aa1.31□□□□□ -2.2
PDE4D-218ENST00000509368 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa1.3□□□□□ -2.2
PDE4D-218ENST00000509368 IGHV3-7P01780 117 aa1.3□□□□□ -2.2
PDE4D-218ENST00000509368 IGKCP01834 107 aa1.3□□□□□ -2.2
PDE4D-218ENST00000509368 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP1.3□□□□□ -2.2
PDE4D-218ENST00000509368 SPANXN1Q5VSR9 72 aa1.3□□□□□ -2.2
PDE4D-218ENST00000509368 SLC48A1Q6P1K1 146 aa1.3□□□□□ -2.2
PDE4D-218ENST00000509368 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa1.3□□□□□ -2.2
PDE4D-218ENST00000509368 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP1.3□□□□□ -2.2
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PDE4D-218ENST00000509368 Q96M85 177 aa1.3□□□□□ -2.2
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PDE4D-218ENST00000509368 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa1.3□□□□□ -2.2
PDE4D-218ENST00000509368 SONP18583 2426 aaKnown RBP1.3□□□□□ -2.2
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PDE4D-218ENST00000509368 J3QLW9 94 aa1.3□□□□□ -2.2
PDE4D-218ENST00000509368 PIRTP0C851 137 aa1.3□□□□□ -2.2
PDE4D-218ENST00000509368 SPTBP11277 2137 aa1.3□□□□□ -2.2
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PDE4D-218ENST00000509368 ZNF826PQ6ZT77 177 aa1.3□□□□□ -2.2
PDE4D-218ENST00000509368 SPATA12Q7Z6I5 190 aa1.3□□□□□ -2.2
PDE4D-218ENST00000509368 CMTM2Q8TAZ6 248 aa1.3□□□□□ -2.2
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PDE4D-218ENST00000509368 PROK2Q9HC23 129 aa1.3□□□□□ -2.2
PDE4D-218ENST00000509368 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP1.3□□□□□ -2.2
PDE4D-218ENST00000509368 SPCS1Q9Y6A9 102 aa1.3□□□□□ -2.2
PDE4D-218ENST00000509368 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa1.3□□□□□ -2.2
PDE4D-218ENST00000509368 TGP01266 2768 aa1.3□□□□□ -2.2
PDE4D-218ENST00000509368 A0A087WSZ3 146 aa1.3□□□□□ -2.2
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PDE4D-218ENST00000509368 NAP1L6A6NFF2 107 aa1.3□□□□□ -2.2
PDE4D-218ENST00000509368 A6NN06 94 aa1.3□□□□□ -2.2
PDE4D-218ENST00000509368 LEPROTO15243 131 aa1.3□□□□□ -2.2
PDE4D-218ENST00000509368 OR1I1O60431 355 aa1.3□□□□□ -2.2
PDE4D-218ENST00000509368 SHBGP04278 402 aa1.3□□□□□ -2.2
PDE4D-218ENST00000509368 CXCL1P09341 107 aa1.3□□□□□ -2.2
PDE4D-218ENST00000509368 BLCAPP62952 87 aa1.3□□□□□ -2.2
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PDE4D-218ENST00000509368 LINC00471Q8N535 108 aa1.3□□□□□ -2.2
PDE4D-218ENST00000509368 SERP2Q8N6R1 65 aa1.3□□□□□ -2.2
PDE4D-218ENST00000509368 Q8N8P6 123 aa1.3□□□□□ -2.2
PDE4D-218ENST00000509368 SPTSSAQ969W0 71 aa1.3□□□□□ -2.2
PDE4D-218ENST00000509368 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa1.3□□□□□ -2.2
PDE4D-218ENST00000509368 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP1.29□□□□□ -2.2
PDE4D-218ENST00000509368 MGAM2Q2M2H8 2515 aa1.29□□□□□ -2.2
PDE4D-218ENST00000509368 TLN2Q9Y4G6 2542 aa1.29□□□□□ -2.2
PDE4D-218ENST00000509368 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa1.29□□□□□ -2.2
PDE4D-218ENST00000509368 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa1.29□□□□□ -2.2
PDE4D-218ENST00000509368 C7orf77A4D0Y5 90 aa1.29□□□□□ -2.2
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PDE4D-218ENST00000509368 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP1.29□□□□□ -2.2
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PDE4D-218ENST00000509368 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP1.29□□□□□ -2.2
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PDE4D-218ENST00000509368 LY6EQ16553 131 aa1.28□□□□□ -2.2
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PDE4D-218ENST00000509368 TMEM170BQ5T4T1 132 aa1.28□□□□□ -2.2
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PDE4D-218ENST00000509368 C14orf132Q9NPU4 83 aa1.28□□□□□ -2.2
PDE4D-218ENST00000509368 CR1P17927 2039 aa1.28□□□□□ -2.2
PDE4D-218ENST00000509368 AKAP6Q13023 2319 aa1.28□□□□□ -2.2
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PDE4D-218ENST00000509368 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP1.28□□□□□ -2.2
PDE4D-218ENST00000509368 SNRPGP15A8MWD9 76 aa1.28□□□□□ -2.2
PDE4D-218ENST00000509368 F2Z2F3 143 aa1.28□□□□□ -2.2
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PDE4D-218ENST00000509368 EFNA4P52798 201 aa1.28□□□□□ -2.2
PDE4D-218ENST00000509368 UBE2G1P62253 170 aa1.28□□□□□ -2.2
PDE4D-218ENST00000509368 ELOBQ15370 118 aa1.28□□□□□ -2.2
PDE4D-218ENST00000509368 MPV17LQ2QL34 196 aa1.28□□□□□ -2.2
PDE4D-218ENST00000509368 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa1.28□□□□□ -2.2
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PDE4D-218ENST00000509368 DNAH3Q8TD57 4116 aa1.28□□□□□ -2.21
PDE4D-218ENST00000509368 ARID1AO14497 2285 aa1.27□□□□□ -2.21
PDE4D-218ENST00000509368 NOTCH1P46531 2555 aa1.27□□□□□ -2.21
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